MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Francisella novicida U112 chromosome

Total Repeats: 46367

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008601	AGA	2	6	120035	120040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118496723
3002	NC_008601	TGA	2	6	120068	120073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496723
3003	NC_008601	TAA	2	6	120074	120079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496723
3004	NC_008601	T	6	6	120092	120097	0 %	100 %	0 %	0 %	118496723
3005	NC_008601	AGAC	2	8	120123	120130	50 %	0 %	25 %	25 %	118496723
3006	NC_008601	A	6	6	120207	120212	100 %	0 %	0 %	0 %	118496723
3007	NC_008601	ATG	2	6	120298	120303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496723
3008	NC_008601	ATG	2	6	120328	120333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496723
3009	NC_008601	TAT	2	6	120342	120347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496723
3010	NC_008601	A	6	6	120420	120425	100 %	0 %	0 %	0 %	118496723
3011	NC_008601	ATC	2	6	120466	120471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496723
3012	NC_008601	CAG	2	6	120532	120537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496723
3013	NC_008601	GCA	2	6	120552	120557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496723
3014	NC_008601	CAGT	2	8	120663	120670	25 %	25 %	25 %	25 %	118496723
3015	NC_008601	TGA	2	6	120683	120688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496723
3016	NC_008601	ATT	2	6	120711	120716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496723
3017	NC_008601	TATT	2	8	120738	120745	25 %	75 %	0 %	0 %	118496724
3018	NC_008601	GTT	2	6	120759	120764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496724
3019	NC_008601	TAC	2	6	120826	120831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496724
3020	NC_008601	ACT	2	6	120833	120838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496724
3021	NC_008601	TAC	3	9	120874	120882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496724
3022	NC_008601	TTA	2	6	120931	120936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496724
3023	NC_008601	ACT	2	6	120959	120964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496724
3024	NC_008601	T	6	6	120995	121000	0 %	100 %	0 %	0 %	118496724
3025	NC_008601	ACA	2	6	121011	121016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496724
3026	NC_008601	TCA	2	6	121029	121034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496724
3027	NC_008601	CTTT	2	8	121036	121043	0 %	75 %	0 %	25 %	118496724
3028	NC_008601	TTTG	2	8	121050	121057	0 %	75 %	25 %	0 %	118496724
3029	NC_008601	TC	3	6	121071	121076	0 %	50 %	0 %	50 %	118496724
3030	NC_008601	AAT	2	6	121139	121144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496724
3031	NC_008601	CTT	2	6	121225	121230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118496724
3032	NC_008601	AAC	2	6	121238	121243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118496724
3033	NC_008601	TTG	2	6	121295	121300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496724
3034	NC_008601	T	6	6	121343	121348	0 %	100 %	0 %	0 %	118496724
3035	NC_008601	TGT	2	6	121370	121375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496724
3036	NC_008601	GTC	2	6	121418	121423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496724
3037	NC_008601	AT	3	6	121464	121469	50 %	50 %	0 %	0 %	118496724
3038	NC_008601	ATC	2	6	121520	121525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496724
3039	NC_008601	ATA	2	6	121583	121588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496724
3040	NC_008601	AAAC	2	8	121627	121634	75 %	0 %	0 %	25 %	118496724
3041	NC_008601	ATG	2	6	121657	121662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496724
3042	NC_008601	TAA	2	6	121679	121684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496724
3043	NC_008601	TAA	2	6	121688	121693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118496724
3044	NC_008601	T	7	7	121696	121702	0 %	100 %	0 %	0 %	118496724
3045	NC_008601	AT	3	6	121705	121710	50 %	50 %	0 %	0 %	118496724
3046	NC_008601	TAA	2	6	121735	121740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_008601	TGC	2	6	121768	121773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_008601	AAAGT	2	10	121777	121786	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_008601	AAT	2	6	121800	121805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_008601	T	6	6	121839	121844	0 %	100 %	0 %	0 %	118496725
3051	NC_008601	AAAG	2	8	121890	121897	75 %	0 %	25 %	0 %	118496725
3052	NC_008601	GAT	2	6	121910	121915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496725
3053	NC_008601	TCAATT	2	12	121957	121968	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	118496725
3054	NC_008601	TCA	2	6	121969	121974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496725
3055	NC_008601	AAAG	2	8	122041	122048	75 %	0 %	25 %	0 %	118496725
3056	NC_008601	CTT	2	6	122054	122059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118496725
3057	NC_008601	ATT	2	6	122065	122070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496725
3058	NC_008601	ATT	2	6	122086	122091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496725
3059	NC_008601	ATT	2	6	122110	122115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496725
3060	NC_008601	T	7	7	122159	122165	0 %	100 %	0 %	0 %	118496725
3061	NC_008601	TGC	2	6	122181	122186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496725
3062	NC_008601	ATC	2	6	122247	122252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496725
3063	NC_008601	CTT	2	6	122273	122278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118496725
3064	NC_008601	AT	3	6	122350	122355	50 %	50 %	0 %	0 %	118496726
3065	NC_008601	T	6	6	122357	122362	0 %	100 %	0 %	0 %	118496726
3066	NC_008601	T	6	6	122414	122419	0 %	100 %	0 %	0 %	118496726
3067	NC_008601	TGT	2	6	122449	122454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496726
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3069	NC_008601	TAG	2	6	122576	122581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496726
3070	NC_008601	TGC	2	6	122621	122626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496726
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3073	NC_008601	T	7	7	122818	122824	0 %	100 %	0 %	0 %	118496727
3074	NC_008601	AGT	2	6	122833	122838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496727
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3078	NC_008601	CTT	2	6	123103	123108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118496727
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3080	NC_008601	A	6	6	123122	123127	100 %	0 %	0 %	0 %	118496727
3081	NC_008601	ATT	2	6	123242	123247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496727
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3085	NC_008601	TAG	2	6	123343	123348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496727
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3088	NC_008601	TCA	2	6	123529	123534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118496727
3089	NC_008601	AT	3	6	123601	123606	50 %	50 %	0 %	0 %	118496727
3090	NC_008601	TTC	2	6	123623	123628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118496727
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3092	NC_008601	CAG	2	6	123760	123765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496727
3093	NC_008601	CTTT	2	8	123796	123803	0 %	75 %	0 %	25 %	118496727
3094	NC_008601	CAAA	2	8	123815	123822	75 %	0 %	0 %	25 %	118496727
3095	NC_008601	TCT	2	6	123861	123866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118496727
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3099	NC_008601	TA	3	6	124014	124019	50 %	50 %	0 %	0 %	118496728
3100	NC_008601	AT	3	6	124027	124032	50 %	50 %	0 %	0 %	118496728
3101	NC_008601	T	6	6	124081	124086	0 %	100 %	0 %	0 %	118496728
3102	NC_008601	TTA	2	6	124148	124153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496728
3103	NC_008601	CTTT	2	8	124187	124194	0 %	75 %	0 %	25 %	118496728
3104	NC_008601	CAC	2	6	124244	124249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118496728
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3107	NC_008601	T	7	7	124385	124391	0 %	100 %	0 %	0 %	118496728
3108	NC_008601	TAT	2	6	124505	124510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496728
3109	NC_008601	GTT	2	6	124546	124551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496728
3110	NC_008601	T	7	7	124553	124559	0 %	100 %	0 %	0 %	118496728
3111	NC_008601	TAT	3	9	124621	124629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118496729
3112	NC_008601	CT	3	6	124633	124638	0 %	50 %	0 %	50 %	118496729
3113	NC_008601	GCT	2	6	124662	124667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118496729
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3115	NC_008601	GTAT	2	8	124705	124712	25 %	50 %	25 %	0 %	118496729
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3119	NC_008601	TCT	2	6	124803	124808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118496729
3120	NC_008601	AAAC	2	8	124823	124830	75 %	0 %	0 %	25 %	118496729
3121	NC_008601	AACA	2	8	124911	124918	75 %	0 %	0 %	25 %	118496729
3122	NC_008601	TTG	2	6	124968	124973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496729
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3251	NC_008601	TGA	2	6	129776	129781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496733
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3369	NC_008601	ATT	2	6	134370	134375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3370	NC_008601	ATA	2	6	134378	134383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3371	NC_008601	T	6	6	134403	134408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3468	NC_008601	ATGGT	2	10	138978	138987	20 %	40 %	40 %	0 %	118496742
3469	NC_008601	AG	3	6	139058	139063	50 %	0 %	50 %	0 %	118496742
3470	NC_008601	TGA	2	6	139069	139074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496742
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3472	NC_008601	TAA	2	6	139138	139143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3473	NC_008601	ATTT	2	8	139144	139151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3474	NC_008601	AT	3	6	139224	139229	50 %	50 %	0 %	0 %	118496743
3475	NC_008601	TTTGC	2	10	139238	139247	0 %	60 %	20 %	20 %	118496743
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3481	NC_008601	AGC	2	6	139560	139565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118496743
3482	NC_008601	T	6	6	139602	139607	0 %	100 %	0 %	0 %	118496743
3483	NC_008601	GAT	2	6	139621	139626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118496743
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3487	NC_008601	TTCAA	2	10	139753	139762	40 %	40 %	0 %	20 %	118496743
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3494	NC_008601	TTG	2	6	140175	140180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496743
3495	NC_008601	TGTT	2	8	140328	140335	0 %	75 %	25 %	0 %	118496743
3496	NC_008601	GTT	2	6	140359	140364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118496743
3497	NC_008601	ATC	2	6	140393	140398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3498	NC_008601	TAGCT	2	10	140406	140415	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3499	NC_008601	TTTG	2	8	140434	140441	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_008601	GTT	2	6	140446	140451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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