MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Frankia alni ACN14a chromosome

Total Repeats: 230577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008278	GTG	2	6	129177	129182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219629
4002	NC_008278	TCG	2	6	129199	129204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219629
4003	NC_008278	CGA	2	6	129215	129220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219629
4004	NC_008278	CGA	2	6	129274	129279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219629
4005	NC_008278	CTC	2	6	129284	129289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111219629
4006	NC_008278	CGG	2	6	129332	129337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219629
4007	NC_008278	CG	3	6	129386	129391	0 %	0 %	50 %	50 %	111219629
4008	NC_008278	GC	3	6	129419	129424	0 %	0 %	50 %	50 %	111219629
4009	NC_008278	ACC	2	6	129426	129431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111219629
4010	NC_008278	TCA	2	6	129442	129447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111219629
4011	NC_008278	TGC	2	6	129502	129507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219629
4012	NC_008278	TCT	2	6	129535	129540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111219629
4013	NC_008278	CATC	2	8	129581	129588	25 %	25 %	0 %	50 %	111219629
4014	NC_008278	CGA	2	6	129608	129613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219629
4015	NC_008278	TCG	2	6	129634	129639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219629
4016	NC_008278	GCC	2	6	129651	129656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219629
4017	NC_008278	TCG	2	6	129664	129669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219629
4018	NC_008278	GAT	2	6	129704	129709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111219629
4019	NC_008278	CGCC	2	8	129791	129798	0 %	0 %	25 %	75 %	111219629
4020	NC_008278	GCCG	2	8	129813	129820	0 %	0 %	50 %	50 %	111219629
4021	NC_008278	CACGC	2	10	129828	129837	20 %	0 %	20 %	60 %	111219629
4022	NC_008278	GCC	2	6	129850	129855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219629
4023	NC_008278	CGC	2	6	129920	129925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219629
4024	NC_008278	GCC	3	9	130075	130083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219629
4025	NC_008278	GTC	2	6	130086	130091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219629
4026	NC_008278	GAC	2	6	130095	130100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219629
4027	NC_008278	TGC	2	6	130141	130146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219629
4028	NC_008278	GCC	2	6	130158	130163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219629
4029	NC_008278	GAG	2	6	130266	130271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219629
4030	NC_008278	CGC	2	6	130328	130333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219629
4031	NC_008278	GCCG	2	8	130343	130350	0 %	0 %	50 %	50 %	111219629
4032	NC_008278	GC	3	6	130444	130449	0 %	0 %	50 %	50 %	111219629
4033	NC_008278	GAC	2	6	130451	130456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219629
4034	NC_008278	GAC	2	6	130527	130532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219629
4035	NC_008278	GAC	2	6	130536	130541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219629
4036	NC_008278	CGC	2	6	130571	130576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219629
4037	NC_008278	GCC	2	6	130590	130595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219629
4038	NC_008278	CGC	2	6	130607	130612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219629
4039	NC_008278	TGC	2	6	130643	130648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219629
4040	NC_008278	GC	3	6	130681	130686	0 %	0 %	50 %	50 %	111219629
4041	NC_008278	GCG	2	6	130688	130693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219629
4042	NC_008278	GCCG	2	8	130697	130704	0 %	0 %	50 %	50 %	111219629
4043	NC_008278	CGC	2	6	130807	130812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219630
4044	NC_008278	CG	3	6	130849	130854	0 %	0 %	50 %	50 %	111219630
4045	NC_008278	GGT	2	6	130870	130875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219630
4046	NC_008278	GC	3	6	130919	130924	0 %	0 %	50 %	50 %	111219630
4047	NC_008278	GCT	2	6	130936	130941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219630
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4049	NC_008278	TGG	2	6	131022	131027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219630
4050	NC_008278	TGG	2	6	131031	131036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219630
4051	NC_008278	CGA	2	6	131038	131043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219630
4052	NC_008278	TCG	2	6	131046	131051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219630
4053	NC_008278	CGG	2	6	131176	131181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219630
4054	NC_008278	CCG	2	6	131187	131192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219630
4055	NC_008278	CGA	2	6	131215	131220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219630
4056	NC_008278	GGGGTC	2	12	131240	131251	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	111219630
4057	NC_008278	GTG	2	6	131300	131305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219630
4058	NC_008278	CAT	2	6	131316	131321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111219630
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4060	NC_008278	AC	3	6	131451	131456	50 %	0 %	0 %	50 %	111219630
4061	NC_008278	GGC	3	9	131512	131520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219630
4062	NC_008278	CGG	3	9	131551	131559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219630
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4065	NC_008278	GCGCG	2	10	131659	131668	0 %	0 %	60 %	40 %	111219630
4066	NC_008278	TGC	2	6	131724	131729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219630
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4069	NC_008278	GTC	2	6	131789	131794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219630
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4076	NC_008278	CGG	3	9	131984	131992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_008278	CCGG	2	8	132001	132008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_008278	GCCCG	2	10	132010	132019	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4079	NC_008278	CCG	2	6	132030	132035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_008278	GCCCG	2	10	132075	132084	0 %	0 %	40 %	60 %	111219631
4081	NC_008278	GCC	2	6	132112	132117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219631
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4085	NC_008278	GAG	2	6	132166	132171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219631
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4087	NC_008278	TCGG	2	8	132240	132247	0 %	25 %	50 %	25 %	111219631
4088	NC_008278	GC	3	6	132265	132270	0 %	0 %	50 %	50 %	111219631
4089	NC_008278	CG	3	6	132272	132277	0 %	0 %	50 %	50 %	111219631
4090	NC_008278	GGT	2	6	132324	132329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_008278	ACG	2	6	132344	132349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_008278	ACG	2	6	132405	132410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_008278	GCA	2	6	132437	132442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_008278	GCC	2	6	132477	132482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_008278	CGA	2	6	132491	132496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_008278	CCG	2	6	132497	132502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4097	NC_008278	CGG	2	6	132517	132522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_008278	CGG	2	6	132560	132565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219632
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4101	NC_008278	CGT	2	6	132618	132623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219632
4102	NC_008278	TGT	2	6	132627	132632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111219632
4103	NC_008278	CG	3	6	132636	132641	0 %	0 %	50 %	50 %	111219632
4104	NC_008278	GAC	2	6	132774	132779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_008278	CTG	2	6	132912	132917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_008278	CGG	2	6	132920	132925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_008278	GCG	2	6	132964	132969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_008278	CCG	2	6	132974	132979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_008278	CGGCC	2	10	133039	133048	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4110	NC_008278	GCCG	2	8	133055	133062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_008278	CGC	2	6	133070	133075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_008278	GCA	3	9	133113	133121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219633
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4118	NC_008278	GCC	2	6	133244	133249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219633
4119	NC_008278	CGGGCC	2	12	133250	133261	0 %	0 %	50 %	50 %	111219633
4120	NC_008278	GCG	2	6	133266	133271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219633
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4123	NC_008278	GCC	2	6	133359	133364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219633
4124	NC_008278	GTT	2	6	133390	133395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111219633
4125	NC_008278	CGC	2	6	133401	133406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219633
4126	NC_008278	CGCA	2	8	133417	133424	25 %	0 %	25 %	50 %	111219633
4127	NC_008278	GCCG	2	8	133425	133432	0 %	0 %	50 %	50 %	111219633
4128	NC_008278	GC	3	6	133461	133466	0 %	0 %	50 %	50 %	111219633
4129	NC_008278	TCG	2	6	133502	133507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219633
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4131	NC_008278	GCC	2	6	133559	133564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219633
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4160	NC_008278	GTC	2	6	134387	134392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4199	NC_008278	CGGG	2	8	135924	135931	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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4233	NC_008278	CGA	2	6	136957	136962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219636
4234	NC_008278	CGATCG	2	12	137028	137039	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111219636
4235	NC_008278	CGGC	2	8	137041	137048	0 %	0 %	50 %	50 %	111219636
4236	NC_008278	GC	3	6	137053	137058	0 %	0 %	50 %	50 %	111219636
4237	NC_008278	TTC	2	6	137060	137065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111219636
4238	NC_008278	GC	3	6	137104	137109	0 %	0 %	50 %	50 %	111219636
4239	NC_008278	CGA	2	6	137201	137206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4240	NC_008278	TCG	2	6	137327	137332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4241	NC_008278	CCGG	2	8	137387	137394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4242	NC_008278	GGT	2	6	137423	137428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_008278	CGG	2	6	137453	137458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4244	NC_008278	GCCC	2	8	137482	137489	0 %	0 %	25 %	75 %	111219637
4245	NC_008278	GGCC	2	8	137500	137507	0 %	0 %	50 %	50 %	111219637
4246	NC_008278	TCT	2	6	137524	137529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111219637
4247	NC_008278	CTC	2	6	137552	137557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111219637
4248	NC_008278	TTG	2	6	137583	137588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111219637
4249	NC_008278	TCC	2	6	137589	137594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111219637
4250	NC_008278	CGC	2	6	137599	137604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219637
4251	NC_008278	CGG	2	6	137693	137698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219638
4252	NC_008278	CGG	2	6	137777	137782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219638
4253	NC_008278	GAG	2	6	137808	137813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219638
4254	NC_008278	CTG	2	6	137847	137852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219638
4255	NC_008278	GC	3	6	137924	137929	0 %	0 %	50 %	50 %	111219638
4256	NC_008278	AGG	2	6	138053	138058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219638
4257	NC_008278	CCGA	2	8	138095	138102	25 %	0 %	25 %	50 %	111219639
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4261	NC_008278	GTG	2	6	138155	138160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219639
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4269	NC_008278	TCT	2	6	138350	138355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111219639
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4274	NC_008278	GAT	2	6	138641	138646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111219640
4275	NC_008278	AGT	2	6	138682	138687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111219640
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4278	NC_008278	CGA	2	6	138863	138868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219641
4279	NC_008278	CCA	2	6	138881	138886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111219641
4280	NC_008278	GCTGG	2	10	138898	138907	0 %	20 %	60 %	20 %	111219641
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4282	NC_008278	CCTC	2	8	138964	138971	0 %	25 %	0 %	75 %	111219641
4283	NC_008278	GTC	2	6	139008	139013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219641
4284	NC_008278	CTG	2	6	139066	139071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219641
4285	NC_008278	TCCG	2	8	139133	139140	0 %	25 %	25 %	50 %	111219641
4286	NC_008278	CA	4	8	139150	139157	50 %	0 %	0 %	50 %	111219641
4287	NC_008278	ATG	2	6	139231	139236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111219641
4288	NC_008278	CGT	2	6	139245	139250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219641
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4290	NC_008278	GTC	2	6	139349	139354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4291	NC_008278	GTG	2	6	139357	139362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4292	NC_008278	TGC	2	6	139393	139398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4293	NC_008278	CGA	2	6	139412	139417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4294	NC_008278	GTCC	2	8	139425	139432	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4295	NC_008278	GCT	2	6	139442	139447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4296	NC_008278	CGG	3	9	139485	139493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219642
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4298	NC_008278	GCGG	2	8	139520	139527	0 %	0 %	75 %	25 %	111219642
4299	NC_008278	GGA	2	6	139565	139570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219642
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4305	NC_008278	TGC	2	6	139803	139808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219642
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4307	NC_008278	TGA	2	6	139846	139851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111219642
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4311	NC_008278	GCCT	2	8	139994	140001	0 %	25 %	25 %	50 %	111219642
4312	NC_008278	TCA	2	6	140005	140010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111219642
4313	NC_008278	GGC	2	6	140036	140041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219642
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4319	NC_008278	G	6	6	140170	140175	0 %	0 %	100 %	0 %	111219642
4320	NC_008278	AGGT	2	8	140184	140191	25 %	25 %	50 %	0 %	111219642
4321	NC_008278	CGA	2	6	140209	140214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219642
4322	NC_008278	CGG	2	6	140215	140220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219642
4323	NC_008278	GCG	2	6	140233	140238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4324	NC_008278	GGC	2	6	140266	140271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4325	NC_008278	GCG	2	6	140276	140281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4326	NC_008278	GCC	2	6	140292	140297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4327	NC_008278	GCC	2	6	140351	140356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219643
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4329	NC_008278	CGG	2	6	140403	140408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219643
4330	NC_008278	GAC	3	9	140470	140478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219643
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4332	NC_008278	TCG	2	6	140591	140596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219643
4333	NC_008278	GC	3	6	140598	140603	0 %	0 %	50 %	50 %	111219643
4334	NC_008278	TCG	2	6	140612	140617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219643
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4336	NC_008278	GCC	2	6	140677	140682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219643
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4339	NC_008278	CCCGAA	2	12	140936	140947	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4340	NC_008278	ACC	2	6	140954	140959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4341	NC_008278	CGT	2	6	141036	141041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4342	NC_008278	CGT	2	6	141181	141186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4343	NC_008278	GCC	2	6	141224	141229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4344	NC_008278	TG	3	6	141249	141254	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4345	NC_008278	CAT	3	9	141277	141285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4346	NC_008278	GGGTC	2	10	141476	141485	0 %	20 %	60 %	20 %	111219644
4347	NC_008278	CGC	2	6	141553	141558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219644
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4350	NC_008278	GGT	2	6	141625	141630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219644
4351	NC_008278	GGA	2	6	141650	141655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219644
4352	NC_008278	GCG	2	6	141657	141662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219644
4353	NC_008278	CCT	2	6	141701	141706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111219644
4354	NC_008278	AGGC	2	8	141801	141808	25 %	0 %	50 %	25 %	111219644
4355	NC_008278	GGC	2	6	141857	141862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219644
4356	NC_008278	GCCGG	2	10	141879	141888	0 %	0 %	60 %	40 %	111219644
4357	NC_008278	CCG	2	6	141982	141987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219644
4358	NC_008278	GAC	2	6	142086	142091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219644
4359	NC_008278	ACG	2	6	142137	142142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219644
4360	NC_008278	CGA	2	6	142145	142150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219644
4361	NC_008278	A	6	6	142168	142173	100 %	0 %	0 %	0 %	111219644
4362	NC_008278	GCA	2	6	142181	142186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219644
4363	NC_008278	CCGA	2	8	142206	142213	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4364	NC_008278	CA	3	6	142244	142249	50 %	0 %	0 %	50 %	111219645
4365	NC_008278	GTC	2	6	142251	142256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219645
4366	NC_008278	GCC	2	6	142289	142294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219645
4367	NC_008278	CGA	2	6	142322	142327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219645
4368	NC_008278	CTCGTG	2	12	142389	142400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219645
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4370	NC_008278	TCG	2	6	142519	142524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219645
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4494	NC_008278	CTG	2	6	147558	147563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219652
4495	NC_008278	CGA	2	6	147602	147607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219652
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