MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Frankia alni ACN14a chromosome

Total Repeats: 230577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_008278	TGA	2	6	98206	98211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111219599
3003	NC_008278	CGC	2	6	98282	98287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219599
3004	NC_008278	GAC	2	6	98324	98329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219599
3005	NC_008278	ACC	2	6	98349	98354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111219599
3006	NC_008278	ACG	2	6	98413	98418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219599
3007	NC_008278	C	6	6	98421	98426	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3008	NC_008278	GGA	2	6	98449	98454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_008278	CCGGC	2	10	98477	98486	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3010	NC_008278	CGG	2	6	98498	98503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3011	NC_008278	TGT	2	6	98506	98511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_008278	GC	4	8	98519	98526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3013	NC_008278	ACGA	2	8	98560	98567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3014	NC_008278	TGCG	2	8	98569	98576	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3015	NC_008278	GTC	2	6	98594	98599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_008278	GACG	2	8	98604	98611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3017	NC_008278	GAC	2	6	98632	98637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_008278	GCCC	2	8	98646	98653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3019	NC_008278	CGC	2	6	98678	98683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_008278	GGT	2	6	98767	98772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_008278	CGG	2	6	98784	98789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_008278	CGC	2	6	98805	98810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3023	NC_008278	GGC	2	6	98821	98826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_008278	GGT	2	6	98866	98871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_008278	GCCC	2	8	98879	98886	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3026	NC_008278	GGC	2	6	98887	98892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_008278	CGG	2	6	98919	98924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_008278	TCA	2	6	98931	98936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_008278	GTCG	2	8	98940	98947	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3030	NC_008278	CCG	2	6	98989	98994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_008278	GGC	2	6	99022	99027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_008278	GC	3	6	99047	99052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3033	NC_008278	GCC	2	6	99074	99079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3034	NC_008278	CGGC	2	8	99110	99117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3035	NC_008278	CGG	2	6	99156	99161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_008278	GGCG	2	8	99171	99178	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_008278	GAC	2	6	99219	99224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3039	NC_008278	GCCG	2	8	99328	99335	0 %	0 %	50 %	50 %	111219600
3040	NC_008278	CCG	2	6	99352	99357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219600
3041	NC_008278	CGG	2	6	99372	99377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219600
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3043	NC_008278	GC	3	6	99489	99494	0 %	0 %	50 %	50 %	111219600
3044	NC_008278	CGG	2	6	99522	99527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219600
3045	NC_008278	CG	3	6	99534	99539	0 %	0 %	50 %	50 %	111219600
3046	NC_008278	GCCG	2	8	99599	99606	0 %	0 %	50 %	50 %	111219600
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3050	NC_008278	CGC	2	6	99755	99760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219600
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3054	NC_008278	CGG	2	6	99845	99850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219600
3055	NC_008278	CGA	2	6	99876	99881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219600
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3058	NC_008278	CGA	2	6	99912	99917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219600
3059	NC_008278	CGC	2	6	99919	99924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219600
3060	NC_008278	CGGTGG	2	12	99927	99938	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	111219600
3061	NC_008278	TCCT	2	8	99949	99956	0 %	50 %	0 %	50 %	111219600
3062	NC_008278	TGG	2	6	99977	99982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219600
3063	NC_008278	CGT	2	6	100020	100025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219600
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3075	NC_008278	CCGAC	2	10	100349	100358	20 %	0 %	20 %	60 %	111219600
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3078	NC_008278	GGCG	2	8	100380	100387	0 %	0 %	75 %	25 %	111219600
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3083	NC_008278	CCG	2	6	100640	100645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_008278	CAG	2	6	100685	100690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219601
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3094	NC_008278	GCTG	2	8	101026	101033	0 %	25 %	50 %	25 %	111219601
3095	NC_008278	CG	3	6	101054	101059	0 %	0 %	50 %	50 %	111219601
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3099	NC_008278	GCC	2	6	101181	101186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219601
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3109	NC_008278	CGT	2	6	101512	101517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219601
3110	NC_008278	G	6	6	101557	101562	0 %	0 %	100 %	0 %	111219601
3111	NC_008278	GGC	2	6	101571	101576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219601
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3117	NC_008278	CGA	2	6	101766	101771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3119	NC_008278	CGC	2	6	101799	101804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3120	NC_008278	CCGGTG	2	12	101822	101833	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111219602
3121	NC_008278	ACT	2	6	101852	101857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111219602
3122	NC_008278	CGAG	2	8	101859	101866	25 %	0 %	50 %	25 %	111219602
3123	NC_008278	CCG	2	6	101908	101913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219602
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3125	NC_008278	GCG	2	6	101944	101949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219602
3126	NC_008278	CGG	2	6	101971	101976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219602
3127	NC_008278	CCT	2	6	101995	102000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111219602
3128	NC_008278	GTC	2	6	102017	102022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219602
3129	NC_008278	CGG	2	6	102067	102072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219602
3130	NC_008278	GACA	2	8	102084	102091	50 %	0 %	25 %	25 %	111219602
3131	NC_008278	CG	3	6	102101	102106	0 %	0 %	50 %	50 %	111219602
3132	NC_008278	CGC	2	6	102110	102115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219602
3133	NC_008278	CAGC	2	8	102116	102123	25 %	0 %	25 %	50 %	111219602
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3138	NC_008278	CTGG	2	8	102253	102260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3139	NC_008278	GTCCGG	2	12	102294	102305	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3140	NC_008278	G	6	6	102313	102318	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3141	NC_008278	CCCA	2	8	102365	102372	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3142	NC_008278	CGG	2	6	102481	102486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219603
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3156	NC_008278	CGG	2	6	102826	102831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219603
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3237	NC_008278	CGG	2	6	105338	105343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3238	NC_008278	CAGGG	2	10	105367	105376	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3239	NC_008278	GT	3	6	105378	105383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3240	NC_008278	CCG	2	6	105429	105434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3241	NC_008278	GGT	2	6	105437	105442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3242	NC_008278	GCG	2	6	105477	105482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3243	NC_008278	CGG	2	6	105497	105502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3244	NC_008278	GTG	2	6	105556	105561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3245	NC_008278	C	6	6	105562	105567	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3246	NC_008278	GCG	4	12	105592	105603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3247	NC_008278	GC	3	6	105669	105674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3248	NC_008278	TGG	3	9	105680	105688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219605
3249	NC_008278	AGC	2	6	105695	105700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219605
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3251	NC_008278	TCG	2	6	105734	105739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219605
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3495	NC_008278	GTC	2	6	113514	113519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219613
3496	NC_008278	GC	3	6	113552	113557	0 %	0 %	50 %	50 %	111219613
3497	NC_008278	CGT	2	6	113591	113596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219613
3498	NC_008278	CTT	2	6	113616	113621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111219613
3499	NC_008278	GTG	2	6	113643	113648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219613
3500	NC_008278	TCG	2	6	113677	113682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219613

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