MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Frankia alni ACN14a chromosome

Total Repeats: 230577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_008278	CGAC	2	8	623044	623051	25 %	0 %	25 %	50 %	111220054
19002	NC_008278	TCT	2	6	623070	623075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111220054
19003	NC_008278	GGT	2	6	623103	623108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111220054
19004	NC_008278	GGAG	2	8	623173	623180	25 %	0 %	75 %	0 %	111220054
19005	NC_008278	CG	3	6	623239	623244	0 %	0 %	50 %	50 %	111220054
19006	NC_008278	GCC	2	6	623245	623250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111220054
19007	NC_008278	GCC	2	6	623270	623275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111220054
19008	NC_008278	GGT	2	6	623294	623299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111220054
19009	NC_008278	CGG	2	6	623358	623363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220054
19010	NC_008278	CGT	2	6	623394	623399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220054
19011	NC_008278	AGGC	2	8	623406	623413	25 %	0 %	50 %	25 %	111220054
19012	NC_008278	CAC	2	6	623440	623445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111220054
19013	NC_008278	CTTC	2	8	623478	623485	0 %	50 %	0 %	50 %	111220054
19014	NC_008278	AGC	2	6	623490	623495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111220054
19015	NC_008278	CGG	2	6	623537	623542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220054
19016	NC_008278	CCG	2	6	623616	623621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111220054
19017	NC_008278	GC	3	6	623690	623695	0 %	0 %	50 %	50 %	111220054
19018	NC_008278	CTG	2	6	623833	623838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220054
19019	NC_008278	ATT	2	6	623880	623885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19020	NC_008278	GGC	2	6	623889	623894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19021	NC_008278	TCGG	2	8	623918	623925	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19022	NC_008278	CGT	2	6	623972	623977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19023	NC_008278	GGT	2	6	623997	624002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19024	NC_008278	CGG	2	6	624014	624019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19025	NC_008278	GCG	2	6	624049	624054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19026	NC_008278	AGGCC	2	10	624201	624210	20 %	0 %	40 %	40 %	111220055
19027	NC_008278	CGG	2	6	624221	624226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220055
19028	NC_008278	CTCGG	2	10	624232	624241	0 %	20 %	40 %	40 %	111220055
19029	NC_008278	CTGG	2	8	624243	624250	0 %	25 %	50 %	25 %	111220055
19030	NC_008278	CAG	2	6	624253	624258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111220055
19031	NC_008278	CGC	2	6	624285	624290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111220055
19032	NC_008278	CCG	2	6	624326	624331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111220055
19033	NC_008278	GGC	2	6	624390	624395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220055
19034	NC_008278	GGT	2	6	624400	624405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111220055
19035	NC_008278	CTCGGC	2	12	624415	624426	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	111220055
19036	NC_008278	CG	3	6	624447	624452	0 %	0 %	50 %	50 %	111220055
19037	NC_008278	GATC	2	8	624462	624469	25 %	25 %	25 %	25 %	111220055
19038	NC_008278	GCT	2	6	624519	624524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220055
19039	NC_008278	GTC	2	6	624538	624543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220055
19040	NC_008278	CGT	2	6	624612	624617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220055
19041	NC_008278	TCG	2	6	624620	624625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220055
19042	NC_008278	TGC	2	6	624644	624649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220055
19043	NC_008278	GGCC	2	8	624690	624697	0 %	0 %	50 %	50 %	111220055
19044	NC_008278	CCG	3	9	624734	624742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111220055
19045	NC_008278	GCG	2	6	624743	624748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220055
19046	NC_008278	GAG	2	6	624805	624810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111220055
19047	NC_008278	CGC	3	9	624814	624822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111220055
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19049	NC_008278	CCTCC	2	10	624852	624861	0 %	20 %	0 %	80 %	111220055
19050	NC_008278	AGG	2	6	624881	624886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111220055
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19053	NC_008278	CGA	2	6	624921	624926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111220055
19054	NC_008278	CAC	2	6	625002	625007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111220055
19055	NC_008278	CGC	2	6	625008	625013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111220055
19056	NC_008278	CGG	2	6	625041	625046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220055
19057	NC_008278	GCC	2	6	625065	625070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19058	NC_008278	CCG	2	6	625086	625091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19059	NC_008278	GGC	2	6	625172	625177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220056
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19063	NC_008278	TGC	2	6	625339	625344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220056
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19065	NC_008278	TCG	2	6	625397	625402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220056
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19067	NC_008278	ACG	2	6	625454	625459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111220056
19068	NC_008278	CCAG	2	8	625467	625474	25 %	0 %	25 %	50 %	111220056
19069	NC_008278	GTC	2	6	625499	625504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220056
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19072	NC_008278	CCT	2	6	625542	625547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111220056
19073	NC_008278	CGA	2	6	625560	625565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111220056
19074	NC_008278	CGGCG	2	10	625617	625626	0 %	0 %	60 %	40 %	111220056
19075	NC_008278	TCG	2	6	625634	625639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220056
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19080	NC_008278	CG	4	8	625738	625745	0 %	0 %	50 %	50 %	111220056
19081	NC_008278	CGG	2	6	625779	625784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220056
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19085	NC_008278	CGA	2	6	625923	625928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111220057
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19087	NC_008278	CTG	2	6	626012	626017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220057
19088	NC_008278	GGC	2	6	626067	626072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220057
19089	NC_008278	ATCCG	2	10	626074	626083	20 %	20 %	20 %	40 %	111220057
19090	NC_008278	GGCGA	2	10	626098	626107	20 %	0 %	60 %	20 %	111220057
19091	NC_008278	CAC	2	6	626119	626124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111220057
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19093	NC_008278	ACG	2	6	626225	626230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111220057
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19098	NC_008278	CGG	2	6	626301	626306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220057
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19102	NC_008278	CGC	3	9	626433	626441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19103	NC_008278	GGT	2	6	626442	626447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19104	NC_008278	GGA	2	6	626463	626468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19105	NC_008278	TCG	2	6	626481	626486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19106	NC_008278	GTC	2	6	626487	626492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19108	NC_008278	GCGT	2	8	626523	626530	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19109	NC_008278	GTT	2	6	626534	626539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111220058
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19116	NC_008278	CGAT	2	8	626767	626774	25 %	25 %	25 %	25 %	111220058
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19121	NC_008278	CGG	2	6	627081	627086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220058
19122	NC_008278	CGG	2	6	627124	627129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220058
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19242	NC_008278	GGCCTG	2	12	630877	630888	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111220062
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19245	NC_008278	CGG	2	6	630981	630986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220062
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19481	NC_008278	CGC	2	6	638373	638378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19482	NC_008278	TCA	2	6	638461	638466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19483	NC_008278	TCG	2	6	638498	638503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19484	NC_008278	GCG	2	6	638519	638524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19485	NC_008278	GC	3	6	638532	638537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19486	NC_008278	GTC	2	6	638615	638620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19487	NC_008278	CGCT	2	8	638635	638642	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
19488	NC_008278	GCT	2	6	638647	638652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19489	NC_008278	CTG	2	6	638698	638703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220069
19490	NC_008278	TCG	2	6	638718	638723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220069
19491	NC_008278	ACA	2	6	638730	638735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111220069
19492	NC_008278	CGT	2	6	638757	638762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220069
19493	NC_008278	CGCCTC	2	12	638779	638790	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	111220069
19494	NC_008278	CGG	2	6	638848	638853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220069
19495	NC_008278	GCT	2	6	638923	638928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220069
19496	NC_008278	CGG	2	6	638986	638991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220069
19497	NC_008278	CAT	2	6	639019	639024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111220069
19498	NC_008278	CGG	2	6	639118	639123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111220069
19499	NC_008278	TCG	2	6	639129	639134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111220069
19500	NC_008278	GCGA	2	8	639148	639155	25 %	0 %	50 %	25 %	111220069

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