MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Frankia alni ACN14a chromosome

Total Repeats: 230577

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008278	CAC	2	6	16661	16666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111219521
502	NC_008278	TG	3	6	16697	16702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008278	CGG	2	6	16727	16732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_008278	GAG	2	6	16739	16744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_008278	CCG	2	6	16767	16772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219522
506	NC_008278	CCG	2	6	16803	16808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219522
507	NC_008278	GAG	2	6	16835	16840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219522
508	NC_008278	CG	3	6	16850	16855	0 %	0 %	50 %	50 %	111219522
509	NC_008278	GAG	3	9	16856	16864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219522
510	NC_008278	TGG	2	6	16874	16879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219522
511	NC_008278	GCC	3	9	16908	16916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219522
512	NC_008278	CGC	3	9	16934	16942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_008278	CCG	2	6	16956	16961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_008278	GCT	2	6	16968	16973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_008278	CGC	2	6	16978	16983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_008278	CGT	2	6	17003	17008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_008278	CCCG	2	8	17025	17032	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
518	NC_008278	CG	3	6	17068	17073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_008278	CGG	2	6	17125	17130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_008278	CGG	2	6	17150	17155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_008278	GCCG	2	8	17160	17167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
522	NC_008278	GCC	3	9	17175	17183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_008278	CG	3	6	17184	17189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_008278	GC	3	6	17191	17196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
525	NC_008278	CGG	2	6	17197	17202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_008278	CGGA	2	8	17204	17211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
527	NC_008278	CG	3	6	17240	17245	0 %	0 %	50 %	50 %	111219523
528	NC_008278	CGGGTC	2	12	17277	17288	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	111219523
529	NC_008278	CCCG	2	8	17321	17328	0 %	0 %	25 %	75 %	111219523
530	NC_008278	GTC	2	6	17361	17366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219523
531	NC_008278	CGC	2	6	17426	17431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219523
532	NC_008278	CGA	2	6	17438	17443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219523
533	NC_008278	CGC	2	6	17483	17488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219523
534	NC_008278	TCGACG	2	12	17497	17508	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	111219523
535	NC_008278	GGA	2	6	17582	17587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219523
536	NC_008278	CCG	2	6	17596	17601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219523
537	NC_008278	GAG	2	6	17622	17627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219523
538	NC_008278	CGC	2	6	17678	17683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219523
539	NC_008278	C	6	6	17710	17715	0 %	0 %	0 %	100 %	111219523
540	NC_008278	CTGC	2	8	17747	17754	0 %	25 %	25 %	50 %	111219523
541	NC_008278	ATC	2	6	17767	17772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111219523
542	NC_008278	CGG	2	6	17777	17782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219523
543	NC_008278	AAG	2	6	17817	17822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111219523
544	NC_008278	GGA	2	6	17837	17842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219523
545	NC_008278	GAG	2	6	17850	17855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219523
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547	NC_008278	GCC	2	6	17900	17905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219523
548	NC_008278	CGG	3	9	17916	17924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_008278	TCG	3	9	17930	17938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_008278	CGT	2	6	17949	17954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_008278	CGT	2	6	17967	17972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_008278	GGC	2	6	17992	17997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_008278	CGG	2	6	18010	18015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_008278	TGG	2	6	18018	18023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008278	CCCG	2	8	18030	18037	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
556	NC_008278	CGT	2	6	18045	18050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_008278	GGC	2	6	18051	18056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_008278	CGG	2	6	18070	18075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_008278	CCG	2	6	18083	18088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_008278	CCG	2	6	18100	18105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_008278	CGG	2	6	18122	18127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219524
562	NC_008278	CCCGG	2	10	18194	18203	0 %	0 %	40 %	60 %	111219524
563	NC_008278	CGC	2	6	18236	18241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219524
564	NC_008278	CCG	2	6	18244	18249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219524
565	NC_008278	ACG	2	6	18253	18258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219524
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568	NC_008278	GGCCG	2	10	18373	18382	0 %	0 %	60 %	40 %	111219524
569	NC_008278	CGGG	2	8	18384	18391	0 %	0 %	75 %	25 %	111219524
570	NC_008278	GCT	2	6	18422	18427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219524
571	NC_008278	GCC	2	6	18434	18439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219524
572	NC_008278	CGG	2	6	18440	18445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219524
573	NC_008278	CGG	2	6	18450	18455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219524
574	NC_008278	CG	3	6	18465	18470	0 %	0 %	50 %	50 %	111219524
575	NC_008278	TCGGGA	2	12	18481	18492	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	111219524
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578	NC_008278	ACG	2	6	18579	18584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008278	GC	3	6	18642	18647	0 %	0 %	50 %	50 %	111219525
580	NC_008278	GAG	2	6	18648	18653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219525
581	NC_008278	CAG	2	6	18676	18681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219525
582	NC_008278	GA	3	6	18761	18766	50 %	0 %	50 %	0 %	111219525
583	NC_008278	CGC	2	6	18779	18784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219525
584	NC_008278	CGG	2	6	18787	18792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219525
585	NC_008278	CGGG	3	12	18851	18862	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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589	NC_008278	CGGC	2	8	18945	18952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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591	NC_008278	CCGG	2	8	19005	19012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_008278	CGG	2	6	19035	19040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_008278	CGG	2	6	19049	19054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_008278	ACG	2	6	19056	19061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_008278	CGG	2	6	19078	19083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219526
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598	NC_008278	CGGC	2	8	19177	19184	0 %	0 %	50 %	50 %	111219526
599	NC_008278	GCC	4	12	19236	19247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219526
600	NC_008278	GCG	2	6	19251	19256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219526
601	NC_008278	GGA	2	6	19295	19300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111219526
602	NC_008278	CACGA	2	10	19323	19332	40 %	0 %	20 %	40 %	111219526
603	NC_008278	GCC	2	6	19354	19359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219526
604	NC_008278	GTG	2	6	19413	19418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111219526
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610	NC_008278	CAGGCC	2	12	19509	19520	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	111219526
611	NC_008278	ACT	2	6	19522	19527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111219526
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614	NC_008278	ACG	2	6	19573	19578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219526
615	NC_008278	CGG	2	6	19598	19603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111219526
616	NC_008278	CTG	2	6	19623	19628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219526
617	NC_008278	CG	3	6	19629	19634	0 %	0 %	50 %	50 %	111219526
618	NC_008278	CGA	2	6	19637	19642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111219526
619	NC_008278	CGC	2	6	19686	19691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219526
620	NC_008278	GACT	2	8	19695	19702	25 %	25 %	25 %	25 %	111219526
621	NC_008278	GCC	2	6	19726	19731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111219527
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627	NC_008278	GC	3	6	19854	19859	0 %	0 %	50 %	50 %	111219527
628	NC_008278	C	6	6	19862	19867	0 %	0 %	0 %	100 %	111219527
629	NC_008278	CGGCGC	2	12	19877	19888	0 %	0 %	50 %	50 %	111219527
630	NC_008278	CGGCG	2	10	19895	19904	0 %	0 %	60 %	40 %	111219527
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632	NC_008278	CGGC	2	8	19925	19932	0 %	0 %	50 %	50 %	111219527
633	NC_008278	GTC	2	6	19935	19940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111219527
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