MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 chromosome

Total Repeats: 14103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018650	TCA	2	6	1560657	1560662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_018650	TAT	2	6	1560672	1560677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_018650	CTT	2	6	1560739	1560744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_018650	CT	4	8	1560778	1560785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_018650	TTC	2	6	1560813	1560818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_018650	ACT	2	6	1560830	1560835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_018650	ACG	2	6	1560918	1560923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_018650	TTAT	2	8	1560936	1560943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_018650	AGA	2	6	1560944	1560949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_018650	TAAA	2	8	1560960	1560967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_018650	TTAA	2	8	1560986	1560993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_018650	TTA	2	6	1562304	1562309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_018650	T	6	6	1565075	1565080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_018650	ATT	2	6	1570511	1570516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_018650	GTA	2	6	1570548	1570553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_018650	AAATG	2	10	1570654	1570663	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_018650	CAA	2	6	1570665	1570670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_018650	GAT	2	6	1570690	1570695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_018650	TCT	2	6	1570722	1570727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_018650	TGT	2	6	1570781	1570786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_018650	T	8	8	1570786	1570793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_018650	GAA	2	6	1570862	1570867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_018650	ATTCA	2	10	1570882	1570891	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4024	NC_018650	GA	3	6	1570913	1570918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_018650	AGG	2	6	1573633	1573638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_018650	GCA	2	6	1573683	1573688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_018650	TGC	2	6	1573715	1573720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_018650	ATATTT	2	12	1575306	1575317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_018650	TCT	2	6	1575318	1575323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_018650	TACT	2	8	1575353	1575360	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_018650	ATT	2	6	1575420	1575425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_018650	T	6	6	1575430	1575435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_018650	ATC	2	6	1577969	1577974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_018650	GTTAAC	2	12	1577999	1578010	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4035	NC_018650	GTTAAC	2	12	1578063	1578074	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4036	NC_018650	T	6	6	1579142	1579147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_018650	CAGG	2	8	1579153	1579160	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_018650	GTT	2	6	1580430	1580435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_018650	ATA	3	9	1580466	1580474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_018650	TAA	2	6	1580494	1580499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_018650	TCAT	2	8	1580518	1580525	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_018650	GTC	2	6	1580586	1580591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_018650	TCA	2	6	1580630	1580635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_018650	TG	3	6	1580692	1580697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_018650	TCA	2	6	1580730	1580735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_018650	TGC	2	6	1580801	1580806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_018650	GGC	2	6	1580882	1580887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_018650	GATT	2	8	1580892	1580899	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_018650	T	6	6	1580909	1580914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_018650	A	6	6	1581189	1581194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_018650	GGC	2	6	1581204	1581209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_018650	TTC	2	6	1581225	1581230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_018650	AT	3	6	1581258	1581263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_018650	AATA	2	8	1581265	1581272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_018650	TGAG	2	8	1581473	1581480	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_018650	ATTG	2	8	1581494	1581501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_018650	ACG	2	6	1581595	1581600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_018650	CAT	2	6	1581619	1581624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_018650	CAA	2	6	1581697	1581702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_018650	ATTT	2	8	1581847	1581854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_018650	AGC	2	6	1581860	1581865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_018650	AGT	2	6	1582408	1582413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_018650	CAA	2	6	1582449	1582454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_018650	TGC	2	6	1582600	1582605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_018650	TCG	2	6	1582606	1582611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4066	NC_018650	GGC	2	6	1582632	1582637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_018650	GAT	2	6	1582651	1582656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_018650	TGTT	2	8	1585192	1585199	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_018650	AAT	2	6	1585392	1585397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_018650	GAAT	2	8	1585411	1585418	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_018650	GGT	2	6	1585717	1585722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_018650	TAG	2	6	1585741	1585746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_018650	TTG	2	6	1585754	1585759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_018650	TCT	2	6	1585807	1585812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_018650	CTT	2	6	1585856	1585861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_018650	TGC	2	6	1585895	1585900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_018650	ATG	2	6	1585920	1585925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_018650	AAT	2	6	1590386	1590391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_018650	TCA	2	6	1590449	1590454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_018650	CAT	2	6	1590463	1590468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_018650	CTT	2	6	1590488	1590493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_018650	GTGA	2	8	1590507	1590514	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_018650	TTTG	2	8	1590518	1590525	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_018650	ATT	2	6	1591762	1591767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_018650	TGG	2	6	1591883	1591888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_018650	AGG	2	6	1591940	1591945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_018650	TCTCT	2	10	1592986	1592995	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4088	NC_018650	T	6	6	1593028	1593033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_018650	GCG	2	6	1593121	1593126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_018650	ATGG	2	8	1593232	1593239	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_018650	A	7	7	1593257	1593263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_018650	A	6	6	1594042	1594047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_018650	T	6	6	1594068	1594073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_018650	GTT	2	6	1594074	1594079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_018650	ATG	2	6	1594133	1594138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_018650	A	6	6	1594194	1594199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_018650	AAT	2	6	1594207	1594212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_018650	TGAT	2	8	1595288	1595295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_018650	AT	4	8	1595305	1595312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_018650	A	6	6	1595334	1595339	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_018650	ATTT	2	8	1595345	1595352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_018650	G	7	7	1595395	1595401	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_018650	AGG	2	6	1595547	1595552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_018650	ACT	2	6	1595567	1595572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_018650	ATTT	2	8	1596995	1597002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_018650	T	6	6	1597130	1597135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_018650	AAC	2	6	1597264	1597269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_018650	AGC	2	6	1597273	1597278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_018650	TTTTC	2	10	1597679	1597688	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4110	NC_018650	CTTT	2	8	1597721	1597728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4111	NC_018650	T	6	6	1597726	1597731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_018650	A	7	7	1597750	1597756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_018650	TTTA	2	8	1597786	1597793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_018650	T	7	7	1597794	1597800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_018650	A	6	6	1601357	1601362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_018650	TTTC	2	8	1601409	1601416	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4117	NC_018650	GAAA	2	8	1601430	1601437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_018650	TCA	2	6	1602005	1602010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_018650	ACT	2	6	1602034	1602039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_018650	TAAA	2	8	1602061	1602068	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_018650	CATT	2	8	1602079	1602086	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4122	NC_018650	ATT	2	6	1602092	1602097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_018650	AAT	2	6	1602143	1602148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_018650	TTA	2	6	1602172	1602177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_018650	ATA	2	6	1602184	1602189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_018650	AAT	2	6	1602196	1602201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_018650	CAGG	2	8	1602202	1602209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4128	NC_018650	TA	3	6	1602248	1602253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_018650	TTGT	2	8	1602299	1602306	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_018650	T	6	6	1602306	1602311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_018650	ATT	2	6	1602327	1602332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_018650	T	6	6	1602346	1602351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_018650	T	6	6	1602370	1602375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_018650	TCT	2	6	1602399	1602404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4136	NC_018650	AAATT	2	10	1602443	1602452	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4138	NC_018650	ATT	2	6	1602606	1602611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4260	NC_018650	CAA	2	6	1654306	1654311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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