MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 chromosome

Total Repeats: 14103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_018650	T	6	6	5205229	5205234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_018650	TAA	2	6	5205295	5205300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_018650	AAC	2	6	5205828	5205833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_018650	GTT	2	6	5205835	5205840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_018650	GTT	2	6	5205931	5205936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14006	NC_018650	TAA	2	6	5205982	5205987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_018650	TAAA	2	8	5206011	5206018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_018650	TCT	2	6	5206023	5206028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14009	NC_018650	A	7	7	5208720	5208726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_018650	A	6	6	5208731	5208736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_018650	AAC	3	9	5208755	5208763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_018650	T	7	7	5208837	5208843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_018650	CAT	2	6	5208905	5208910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14014	NC_018650	ATT	2	6	5208924	5208929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_018650	GGT	2	6	5208943	5208948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_018650	TGT	2	6	5208952	5208957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_018650	TTA	2	6	5208969	5208974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_018650	CAT	2	6	5209020	5209025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14019	NC_018650	TAAA	2	8	5209034	5209041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_018650	AAAG	2	8	5209270	5209277	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_018650	ACT	2	6	5210542	5210547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14022	NC_018650	AAAC	2	8	5210560	5210567	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14023	NC_018650	TTTA	2	8	5210830	5210837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_018650	GGC	2	6	5213458	5213463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14025	NC_018650	GAG	2	6	5213491	5213496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_018650	GGCT	2	8	5216253	5216260	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14027	NC_018650	T	8	8	5216260	5216267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14028	NC_018650	CTG	2	6	5216304	5216309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_018650	A	7	7	5216500	5216506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_018650	T	6	6	5216512	5216517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_018650	GAG	2	6	5217967	5217972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14032	NC_018650	TCCC	2	8	5217984	5217991	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14033	NC_018650	CT	3	6	5218020	5218025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14034	NC_018650	A	6	6	5218045	5218050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_018650	A	6	6	5219942	5219947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14036	NC_018650	T	6	6	5219968	5219973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_018650	ATCT	2	8	5219995	5220002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14038	NC_018650	TA	3	6	5220006	5220011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_018650	AT	3	6	5220013	5220018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_018650	T	6	6	5220054	5220059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_018650	ATA	2	6	5220069	5220074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_018650	TATTT	2	10	5220092	5220101	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_018650	TAAT	2	8	5220107	5220114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_018650	ATT	2	6	5220115	5220120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_018650	TTA	2	6	5220173	5220178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_018650	TGA	2	6	5220186	5220191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_018650	AT	3	6	5220205	5220210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_018650	TCA	2	6	5225231	5225236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_018650	CAT	2	6	5225278	5225283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_018650	CAA	2	6	5225421	5225426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14051	NC_018650	TCC	2	6	5225442	5225447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14052	NC_018650	CGC	2	6	5226529	5226534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14053	NC_018650	GCG	2	6	5228449	5228454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14054	NC_018650	ATT	2	6	5230066	5230071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_018650	TA	4	8	5230081	5230088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_018650	TAA	2	6	5230119	5230124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_018650	AATTA	2	10	5230179	5230188	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_018650	TAA	2	6	5230223	5230228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_018650	T	7	7	5230296	5230302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14060	NC_018650	A	6	6	5230309	5230314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_018650	ATT	2	6	5231165	5231170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_018650	A	7	7	5231213	5231219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_018650	T	7	7	5231242	5231248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_018650	T	9	9	5231253	5231261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_018650	TCG	2	6	5234606	5234611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14066	NC_018650	TTCT	2	8	5234643	5234650	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14067	NC_018650	GAA	2	6	5238224	5238229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_018650	ATT	2	6	5238269	5238274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_018650	TTAC	2	8	5239404	5239411	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14070	NC_018650	GAA	2	6	5239452	5239457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_018650	A	7	7	5240205	5240211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_018650	CCT	2	6	5240268	5240273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14073	NC_018650	CATG	2	8	5241653	5241660	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14074	NC_018650	T	6	6	5241673	5241678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_018650	ATG	2	6	5243074	5243079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_018650	TTA	2	6	5243118	5243123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_018650	T	6	6	5243128	5243133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_018650	GTG	2	6	5245325	5245330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_018650	AAG	2	6	5245382	5245387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_018650	TGGC	2	8	5245397	5245404	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14081	NC_018650	AG	3	6	5246714	5246719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_018650	GTA	2	6	5246745	5246750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_018650	ATTT	2	8	5248184	5248191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_018650	TA	4	8	5248247	5248254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_018650	CAT	2	6	5248262	5248267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14086	NC_018650	TAAA	2	8	5248281	5248288	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_018650	GA	3	6	5248290	5248295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_018650	GAATC	2	10	5248544	5248553	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14089	NC_018650	T	8	8	5248583	5248590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14090	NC_018650	A	7	7	5248624	5248630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_018650	GAAGC	2	10	5248661	5248670	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14092	NC_018650	TG	3	6	5250089	5250094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_018650	GAAAA	2	10	5250123	5250132	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_018650	A	6	6	5250129	5250134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14095	NC_018650	CCG	2	6	5252613	5252618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14096	NC_018650	TAA	2	6	5252671	5252676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14097	NC_018650	GC	3	6	5252777	5252782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14098	NC_018650	GGA	2	6	5252788	5252793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_018650	TTA	2	6	5252837	5252842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_018650	GCG	2	6	5252890	5252895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_018650	AGA	2	6	5252984	5252989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_018650	ACGT	2	8	5253103	5253110	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14103	NC_018650	CAA	2	6	5253111	5253116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.