MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 15174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017656	GCC	2	6	1213286	1213291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_017656	TCT	2	6	1214861	1214866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_017656	CT	3	6	1217541	1217546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_017656	TTGTT	2	10	1217565	1217574	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_017656	GA	3	6	1217605	1217610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_017656	AAAG	2	8	1217661	1217668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_017656	TA	3	6	1217674	1217679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_017656	ATT	2	6	1217819	1217824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_017656	TTA	3	9	1217826	1217834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_017656	GAT	2	6	1217881	1217886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_017656	ATTA	2	8	1218451	1218458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_017656	T	6	6	1218493	1218498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_017656	AG	3	6	1219229	1219234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_017656	ACA	2	6	1219256	1219261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_017656	TGG	2	6	1219277	1219282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_017656	TGG	2	6	1219298	1219303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_017656	TGG	2	6	1219306	1219311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_017656	GAT	2	6	1219374	1219379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_017656	TGG	2	6	1219387	1219392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_017656	A	6	6	1219420	1219425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_017656	TTG	2	6	1219495	1219500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_017656	GCC	2	6	1219524	1219529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3523	NC_017656	GAC	2	6	1219535	1219540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_017656	AAC	2	6	1219591	1219596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_017656	ACAA	2	8	1219600	1219607	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_017656	ATT	2	6	1219629	1219634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_017656	AGC	2	6	1219802	1219807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_017656	CAA	2	6	1219882	1219887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_017656	GTA	2	6	1219902	1219907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_017656	GAA	2	6	1219927	1219932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_017656	CAG	2	6	1219936	1219941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_017656	TGA	2	6	1219990	1219995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_017656	T	6	6	1220011	1220016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_017656	GTG	2	6	1220034	1220039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_017656	ACA	2	6	1220058	1220063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_017656	TGC	2	6	1220064	1220069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_017656	CGT	2	6	1220211	1220216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_017656	AAG	2	6	1220244	1220249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_017656	CAG	2	6	1220366	1220371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_017656	TGG	3	9	1220431	1220439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_017656	GCC	2	6	1220462	1220467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_017656	TTCG	2	8	1220509	1220516	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3543	NC_017656	GTCA	2	8	1220565	1220572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_017656	ATGG	2	8	1220687	1220694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_017656	TGA	3	9	1220713	1220721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_017656	TTA	2	6	1220743	1220748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_017656	TTTA	2	8	1220820	1220827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_017656	TC	3	6	1220908	1220913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3549	NC_017656	A	8	8	1221038	1221045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_017656	ACT	2	6	1221121	1221126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_017656	CAA	3	9	1221266	1221274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_017656	GCA	2	6	1221362	1221367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_017656	ACTG	2	8	1221413	1221420	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3554	NC_017656	GTT	2	6	1221434	1221439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_017656	CTT	2	6	1221450	1221455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_017656	AATCG	2	10	1221464	1221473	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3557	NC_017656	GCG	2	6	1221482	1221487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_017656	AACGT	2	10	1221495	1221504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3559	NC_017656	AGT	2	6	1221520	1221525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_017656	CCA	2	6	1221537	1221542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_017656	TGA	3	9	1221679	1221687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_017656	GCTC	2	8	1221690	1221697	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3563	NC_017656	AAC	2	6	1221789	1221794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_017656	GAA	2	6	1222913	1222918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_017656	A	8	8	1222917	1222924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_017656	T	8	8	1224704	1224711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_017656	ATA	2	6	1224748	1224753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_017656	GTT	2	6	1225856	1225861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_017656	TTG	2	6	1225905	1225910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_017656	TTA	2	6	1225914	1225919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_017656	AGCGA	2	10	1225920	1225929	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3572	NC_017656	TGC	2	6	1225943	1225948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_017656	TAGGG	2	10	1225956	1225965	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_017656	ATGAC	2	10	1227660	1227669	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3575	NC_017656	TTA	2	6	1227674	1227679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3577	NC_017656	TATTT	2	10	1227723	1227732	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_017656	TGTCCA	2	12	1227799	1227810	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3579	NC_017656	GACT	2	8	1227811	1227818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3580	NC_017656	CAA	2	6	1227820	1227825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_017656	TGA	2	6	1231945	1231950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_017656	AAAC	2	8	1231971	1231978	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3583	NC_017656	CAT	2	6	1232006	1232011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_017656	T	7	7	1235532	1235538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_017656	T	6	6	1235575	1235580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_017656	TTTTC	2	10	1235698	1235707	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3587	NC_017656	TTATT	2	10	1236508	1236517	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_017656	T	6	6	1238331	1238336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_017656	TGT	2	6	1238341	1238346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_017656	TTCTT	2	10	1238441	1238450	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3591	NC_017656	A	8	8	1238992	1238999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_017656	GCA	2	6	1239004	1239009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_017656	ATC	2	6	1240092	1240097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3594	NC_017656	A	8	8	1240268	1240275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_017656	T	6	6	1240300	1240305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_017656	AGA	2	6	1240322	1240327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_017656	A	7	7	1240401	1240407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_017656	AATC	2	8	1240943	1240950	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3599	NC_017656	GTACA	2	10	1240977	1240986	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3600	NC_017656	ACA	2	6	1240994	1240999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_017656	TTATG	2	10	1241134	1241143	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_017656	GGC	2	6	1244404	1244409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_017656	T	7	7	1244420	1244426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_017656	AAT	2	6	1244467	1244472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_017656	AAT	3	9	1247824	1247832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_017656	TACT	2	8	1247856	1247863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3607	NC_017656	TCAT	2	8	1247894	1247901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3608	NC_017656	GGA	2	6	1247959	1247964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_017656	TAAGGA	2	12	1250067	1250078	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_017656	AGC	2	6	1250080	1250085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_017656	ATT	2	6	1250693	1250698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_017656	A	6	6	1250730	1250735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_017656	CT	3	6	1251449	1251454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_017656	TAAT	2	8	1251465	1251472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_017656	AGC	2	6	1251475	1251480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_017656	ATAATG	2	12	1251481	1251492	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_017656	AGT	2	6	1251506	1251511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_017656	CTTAT	2	10	1251637	1251646	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3619	NC_017656	GCG	2	6	1251765	1251770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_017656	TGTT	2	8	1251786	1251793	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_017656	A	6	6	1251799	1251804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_017656	TCA	2	6	1251852	1251857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3623	NC_017656	CA	3	6	1251958	1251963	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3624	NC_017656	TTA	2	6	1251999	1252004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_017656	ATC	2	6	1255082	1255087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_017656	TC	3	6	1257737	1257742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3627	NC_017656	GCG	2	6	1260576	1260581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_017656	CGT	2	6	1260588	1260593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_017656	CAAT	2	8	1260600	1260607	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3630	NC_017656	A	6	6	1261949	1261954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3632	NC_017656	GAA	2	6	1261996	1262001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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