MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 15174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017656	CTT	2	6	5209207	5209212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15002	NC_017656	TGA	2	6	5209259	5209264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_017656	AGA	2	6	5209286	5209291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_017656	GAAT	2	8	5209292	5209299	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_017656	ACA	2	6	5209361	5209366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_017656	ATT	2	6	5209386	5209391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_017656	A	7	7	5209403	5209409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_017656	GAT	2	6	5209433	5209438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_017656	A	6	6	5209443	5209448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_017656	TGA	2	6	5209474	5209479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_017656	A	7	7	5209507	5209513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_017656	TA	3	6	5209535	5209540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_017656	ATT	2	6	5209623	5209628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_017656	TGA	2	6	5209645	5209650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_017656	TTGC	2	8	5209658	5209665	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15016	NC_017656	AT	3	6	5209669	5209674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_017656	TA	3	6	5209686	5209691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_017656	GAT	2	6	5209709	5209714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_017656	CAT	3	9	5209719	5209727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_017656	A	6	6	5209786	5209791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_017656	ATA	2	6	5209818	5209823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_017656	A	6	6	5209823	5209828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_017656	A	6	6	5209922	5209927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_017656	CAG	2	6	5209979	5209984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15025	NC_017656	TGCTAT	2	12	5209999	5210010	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15026	NC_017656	A	6	6	5210035	5210040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_017656	ACG	2	6	5210083	5210088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15028	NC_017656	TCC	2	6	5210131	5210136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15029	NC_017656	AGA	2	6	5210170	5210175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_017656	GAT	2	6	5210186	5210191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_017656	TTA	2	6	5210202	5210207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_017656	TA	3	6	5210223	5210228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_017656	A	7	7	5210242	5210248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_017656	AATA	2	8	5210296	5210303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_017656	GCT	2	6	5210369	5210374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15036	NC_017656	TAA	2	6	5210418	5210423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_017656	CAA	2	6	5210453	5210458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15038	NC_017656	TTC	2	6	5210508	5210513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15039	NC_017656	TTC	2	6	5210716	5210721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15040	NC_017656	CTGAA	2	10	5210736	5210745	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15041	NC_017656	A	6	6	5210757	5210762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15042	NC_017656	GAA	2	6	5210776	5210781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_017656	TGGT	2	8	5210786	5210793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15044	NC_017656	TAA	2	6	5210820	5210825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15045	NC_017656	CT	3	6	5211824	5211829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15046	NC_017656	CCG	2	6	5212062	5212067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15047	NC_017656	TGCGT	2	10	5214288	5214297	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15048	NC_017656	GAG	2	6	5214300	5214305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_017656	ATG	2	6	5214328	5214333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_017656	CG	4	8	5214346	5214353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15051	NC_017656	TTAT	2	8	5214442	5214449	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_017656	TGA	3	9	5214451	5214459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15053	NC_017656	A	7	7	5215141	5215147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_017656	AAGAA	2	10	5215149	5215158	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15055	NC_017656	A	7	7	5215200	5215206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15056	NC_017656	TAC	2	6	5218465	5218470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15057	NC_017656	TCC	2	6	5219508	5219513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15058	NC_017656	GT	3	6	5219554	5219559	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15059	NC_017656	TTCCG	2	10	5219576	5219585	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15060	NC_017656	TTTTCA	2	12	5219593	5219604	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15061	NC_017656	CAA	2	6	5219618	5219623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15062	NC_017656	A	6	6	5219622	5219627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_017656	ATT	2	6	5220673	5220678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_017656	T	7	7	5220718	5220724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_017656	TAA	2	6	5220731	5220736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_017656	TGT	2	6	5220739	5220744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_017656	GT	3	6	5220757	5220762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15068	NC_017656	TCAG	2	8	5220789	5220796	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15069	NC_017656	TGC	2	6	5223171	5223176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15070	NC_017656	A	7	7	5223189	5223195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15071	NC_017656	TGT	2	6	5223201	5223206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15072	NC_017656	T	6	6	5223230	5223235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_017656	GA	3	6	5223296	5223301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15074	NC_017656	AC	3	6	5225221	5225226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15075	NC_017656	GGA	2	6	5225227	5225232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15076	NC_017656	GAG	2	6	5225233	5225238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15077	NC_017656	TC	3	6	5225243	5225248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15078	NC_017656	TGC	2	6	5226531	5226536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15079	NC_017656	GTT	2	6	5226580	5226585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_017656	TC	3	6	5226662	5226667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15081	NC_017656	CAAA	2	8	5226672	5226679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15082	NC_017656	ATA	2	6	5226738	5226743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_017656	T	6	6	5226758	5226763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_017656	ATC	2	6	5226781	5226786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15085	NC_017656	AATA	2	8	5226798	5226805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_017656	TG	3	6	5226811	5226816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_017656	TAAAT	2	10	5226854	5226863	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_017656	AAC	2	6	5226897	5226902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15089	NC_017656	GTT	2	6	5226983	5226988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15091	NC_017656	GAAT	2	8	5227073	5227080	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_017656	CAT	2	6	5227094	5227099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15094	NC_017656	ATG	2	6	5228495	5228500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_017656	AATGAT	2	12	5229334	5229345	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_017656	TTATCA	2	12	5229427	5229438	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15097	NC_017656	GAA	2	6	5229702	5229707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15099	NC_017656	T	7	7	5229831	5229837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_017656	G	8	8	5229860	5229867	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_017656	G	8	8	5229975	5229982	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_017656	CGC	2	6	5230211	5230216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15103	NC_017656	CTC	2	6	5231281	5231286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15104	NC_017656	GGC	2	6	5231297	5231302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15105	NC_017656	CGA	2	6	5231330	5231335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15106	NC_017656	ACA	2	6	5231358	5231363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15107	NC_017656	C	7	7	5232904	5232910	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15108	NC_017656	CAA	2	6	5232945	5232950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15109	NC_017656	GCGCG	2	10	5232951	5232960	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15110	NC_017656	AAG	2	6	5232974	5232979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_017656	TTA	2	6	5234628	5234633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15112	NC_017656	TGA	2	6	5234728	5234733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_017656	TAA	2	6	5234811	5234816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_017656	TCA	2	6	5234845	5234850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15115	NC_017656	TC	3	6	5234898	5234903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15116	NC_017656	TCG	2	6	5235577	5235582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15117	NC_017656	TCC	2	6	5235590	5235595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15118	NC_017656	CAC	2	6	5235622	5235627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15119	NC_017656	AAT	2	6	5235930	5235935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15120	NC_017656	CAA	2	6	5235963	5235968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15121	NC_017656	GCA	2	6	5237852	5237857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15122	NC_017656	CGC	2	6	5237952	5237957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15123	NC_017656	AAG	2	6	5240475	5240480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_017656	CCA	2	6	5240515	5240520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15125	NC_017656	CATT	2	8	5240527	5240534	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15126	NC_017656	ATT	2	6	5240544	5240549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15127	NC_017656	GT	3	6	5240617	5240622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15128	NC_017656	TGCGC	2	10	5241494	5241503	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15129	NC_017656	GCC	2	6	5241567	5241572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15130	NC_017656	CTGAT	2	10	5242930	5242939	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15131	NC_017656	TCA	2	6	5245045	5245050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15132	NC_017656	TAT	2	6	5245075	5245080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15133	NC_017656	AAAAT	2	10	5245096	5245105	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15134	NC_017656	TCCT	2	8	5245401	5245408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15135	NC_017656	GTA	2	6	5246462	5246467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15136	NC_017656	CGCC	2	8	5248197	5248204	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15137	NC_017656	GCGG	2	8	5248210	5248217	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15138	NC_017656	GGAG	2	8	5249633	5249640	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15139	NC_017656	TGA	2	6	5250879	5250884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15140	NC_017656	CGC	2	6	5251160	5251165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15141	NC_017656	TGA	3	9	5252877	5252885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15142	NC_017656	AGTAAA	2	12	5252948	5252959	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15143	NC_017656	A	6	6	5252957	5252962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15144	NC_017656	GCG	2	6	5255470	5255475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15145	NC_017656	CAG	2	6	5256103	5256108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15146	NC_017656	A	7	7	5256116	5256122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15147	NC_017656	CAA	2	6	5257657	5257662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15148	NC_017656	ATA	2	6	5257688	5257693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15149	NC_017656	T	6	6	5257697	5257702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15150	NC_017656	T	7	7	5257722	5257728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15151	NC_017656	TAG	2	6	5257731	5257736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15152	NC_017656	TTC	2	6	5260456	5260461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15153	NC_017656	CTG	2	6	5260480	5260485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15154	NC_017656	T	8	8	5261893	5261900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15155	NC_017656	GGT	2	6	5261904	5261909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15156	NC_017656	CCTG	2	8	5262689	5262696	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15157	NC_017656	ATGC	2	8	5262697	5262704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15158	NC_017656	CAA	2	6	5262777	5262782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15159	NC_017656	CAT	2	6	5262783	5262788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15160	NC_017656	AT	3	6	5262917	5262922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15161	NC_017656	TGA	2	6	5262951	5262956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15162	NC_017656	ATC	2	6	5262958	5262963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15163	NC_017656	ATT	2	6	5262989	5262994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15164	NC_017656	TAA	2	6	5262996	5263001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15165	NC_017656	CAT	2	6	5263014	5263019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15166	NC_017656	TAA	2	6	5263025	5263030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15167	NC_017656	GTG	2	6	5263033	5263038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15168	NC_017656	ATTT	2	8	5263054	5263061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15169	NC_017656	T	6	6	5263059	5263064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15170	NC_017656	T	6	6	5263102	5263107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15171	NC_017656	T	6	6	5263148	5263153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15172	NC_017656	TAA	2	6	5263213	5263218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15173	NC_017656	AAG	2	6	5263255	5263260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15174	NC_017656	AGTA	2	8	5263967	5263974	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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