MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 15174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_017656	GAAAA	2	10	3205669	3205678	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_017656	CTT	2	6	3207428	3207433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_017656	T	7	7	3208332	3208338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_017656	TCA	2	6	3208383	3208388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_017656	A	7	7	3208420	3208426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_017656	A	6	6	3208450	3208455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_017656	CA	3	6	3208496	3208501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9008	NC_017656	T	6	6	3208945	3208950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_017656	GTACT	2	10	3208975	3208984	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9010	NC_017656	AAAC	2	8	3208999	3209006	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9011	NC_017656	AC	4	8	3209012	3209019	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9012	NC_017656	TTC	2	6	3209025	3209030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_017656	T	6	6	3209037	3209042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_017656	TCG	2	6	3209067	3209072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_017656	GAA	3	9	3209088	3209096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_017656	G	6	6	3209116	3209121	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_017656	T	6	6	3209124	3209129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_017656	GAT	2	6	3210327	3210332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_017656	ATC	2	6	3210337	3210342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_017656	TAAAG	2	10	3212627	3212636	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_017656	ACC	2	6	3212722	3212727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9022	NC_017656	AAAT	2	8	3213146	3213153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_017656	ATG	2	6	3213193	3213198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_017656	AAT	2	6	3213211	3213216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_017656	A	6	6	3213238	3213243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_017656	TGG	2	6	3213267	3213272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_017656	AT	3	6	3215022	3215027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_017656	A	7	7	3215532	3215538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_017656	GCCA	2	8	3215541	3215548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9030	NC_017656	CTT	2	6	3215560	3215565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9031	NC_017656	GGT	2	6	3216772	3216777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_017656	ACC	2	6	3217331	3217336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9033	NC_017656	TG	3	6	3217604	3217609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_017656	AAC	2	6	3217615	3217620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_017656	CAG	2	6	3217698	3217703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_017656	TAA	2	6	3217705	3217710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_017656	TC	3	6	3219094	3219099	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9038	NC_017656	CAT	2	6	3219135	3219140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9039	NC_017656	TGT	2	6	3219176	3219181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_017656	CTA	3	9	3220084	3220092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9041	NC_017656	ATT	2	6	3220101	3220106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_017656	ATC	2	6	3220110	3220115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9043	NC_017656	TGG	2	6	3220117	3220122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_017656	ATT	2	6	3221393	3221398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_017656	T	7	7	3222019	3222025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_017656	TTA	2	6	3222049	3222054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_017656	TCA	2	6	3222096	3222101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_017656	CAA	2	6	3222109	3222114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9049	NC_017656	TA	3	6	3223029	3223034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_017656	T	7	7	3224756	3224762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_017656	TGA	2	6	3224825	3224830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_017656	TAT	2	6	3224837	3224842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_017656	AATCA	2	10	3224890	3224899	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9054	NC_017656	A	6	6	3225269	3225274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_017656	T	6	6	3225292	3225297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_017656	CAA	2	6	3226035	3226040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_017656	CAA	2	6	3226046	3226051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_017656	ATA	2	6	3226052	3226057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_017656	A	8	8	3226074	3226081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_017656	GAT	2	6	3226176	3226181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_017656	ACG	2	6	3226184	3226189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_017656	CCTC	2	8	3226712	3226719	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9063	NC_017656	CGG	2	6	3226722	3226727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9064	NC_017656	A	6	6	3226968	3226973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_017656	ACG	2	6	3226983	3226988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_017656	AGC	2	6	3227002	3227007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9067	NC_017656	TAA	2	6	3227009	3227014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_017656	CT	3	6	3227028	3227033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9069	NC_017656	AG	3	6	3227064	3227069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_017656	CCTG	2	8	3227099	3227106	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9071	NC_017656	GTCC	2	8	3227152	3227159	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9072	NC_017656	GACT	2	8	3227182	3227189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9073	NC_017656	GTA	2	6	3227196	3227201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9075	NC_017656	GTT	2	6	3227260	3227265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9077	NC_017656	GCACA	2	10	3227293	3227302	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9078	NC_017656	T	6	6	3227315	3227320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9079	NC_017656	GTC	2	6	3227330	3227335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9082	NC_017656	ATA	2	6	3229163	3229168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_017656	GTA	2	6	3229175	3229180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_017656	CA	3	6	3229197	3229202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9085	NC_017656	AT	4	8	3230917	3230924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9087	NC_017656	TAAT	2	8	3234431	3234438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9089	NC_017656	AAT	2	6	3234502	3234507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_017656	ATC	2	6	3234522	3234527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9092	NC_017656	AGG	2	6	3234552	3234557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9093	NC_017656	TCC	2	6	3234650	3234655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9094	NC_017656	GCT	2	6	3234857	3234862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9096	NC_017656	ATA	2	6	3239240	3239245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_017656	TA	3	6	3239283	3239288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_017656	T	7	7	3240151	3240157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_017656	AT	5	10	3240160	3240169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_017656	TTTA	2	8	3240170	3240177	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_017656	TTA	2	6	3240194	3240199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_017656	GCT	2	6	3240227	3240232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9103	NC_017656	T	6	6	3240250	3240255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_017656	A	7	7	3240270	3240276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_017656	ATT	2	6	3240307	3240312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_017656	ATAA	2	8	3240325	3240332	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9107	NC_017656	TTTA	2	8	3240354	3240361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_017656	AT	3	6	3242045	3242050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_017656	CGAT	2	8	3242074	3242081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9110	NC_017656	AT	3	6	3242080	3242085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_017656	TAT	2	6	3242106	3242111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_017656	ATCG	2	8	3242121	3242128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9113	NC_017656	ATC	2	6	3242183	3242188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9114	NC_017656	A	6	6	3244827	3244832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_017656	TTA	2	6	3244872	3244877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_017656	ATG	2	6	3244928	3244933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_017656	GTT	2	6	3244969	3244974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_017656	TAT	2	6	3244991	3244996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_017656	GTAT	2	8	3245016	3245023	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_017656	ATTA	2	8	3245065	3245072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_017656	TAAG	2	8	3245126	3245133	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_017656	GTC	2	6	3245599	3245604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9123	NC_017656	ATAA	2	8	3245616	3245623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_017656	ATA	2	6	3245625	3245630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9125	NC_017656	TTA	2	6	3250250	3250255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9127	NC_017656	AAT	2	6	3250273	3250278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_017656	T	6	6	3250284	3250289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_017656	TA	4	8	3250312	3250319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_017656	A	6	6	3250435	3250440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9131	NC_017656	T	7	7	3250466	3250472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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