MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 15174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_017656	ATC	2	6	2797292	2797297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_017656	GCG	2	6	2800784	2800789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_017656	ATT	2	6	2800818	2800823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_017656	GCG	2	6	2800898	2800903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_017656	AAT	2	6	2803858	2803863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_017656	CAG	2	6	2803995	2804000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_017656	A	6	6	2804010	2804015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_017656	TG	3	6	2804029	2804034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_017656	CGT	2	6	2805645	2805650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_017656	TTC	2	6	2805670	2805675	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_017656	AGCC	2	8	2807910	2807917	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8012	NC_017656	GTC	2	6	2807943	2807948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_017656	G	6	6	2807957	2807962	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_017656	TGG	2	6	2807978	2807983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_017656	GTCAG	2	10	2808007	2808016	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8016	NC_017656	CGG	2	6	2812373	2812378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_017656	GCG	2	6	2812379	2812384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_017656	GGAA	2	8	2812395	2812402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_017656	ATC	2	6	2812407	2812412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_017656	AGCC	2	8	2814788	2814795	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8021	NC_017656	T	6	6	2814797	2814802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_017656	A	6	6	2814876	2814881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_017656	GAA	2	6	2814905	2814910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_017656	GTT	3	9	2818415	2818423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_017656	CGC	2	6	2818519	2818524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8026	NC_017656	CAT	2	6	2822318	2822323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_017656	TA	3	6	2822326	2822331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_017656	TCTT	2	8	2822369	2822376	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8029	NC_017656	TTA	2	6	2822413	2822418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_017656	TGA	2	6	2822421	2822426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_017656	TAA	2	6	2822454	2822459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_017656	AAT	2	6	2822503	2822508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_017656	TATAA	2	10	2822514	2822523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_017656	AAC	2	6	2822570	2822575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_017656	CAA	2	6	2822587	2822592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_017656	TA	3	6	2822608	2822613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_017656	TGA	2	6	2822642	2822647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_017656	TAA	2	6	2822689	2822694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_017656	TCCT	2	8	2822829	2822836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8040	NC_017656	TA	4	8	2822913	2822920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_017656	AGC	2	6	2822929	2822934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_017656	TAC	2	6	2822941	2822946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_017656	GCG	2	6	2825304	2825309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_017656	GCG	2	6	2825384	2825389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_017656	GCG	2	6	2825465	2825470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_017656	AC	3	6	2825506	2825511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8047	NC_017656	ACG	2	6	2826918	2826923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_017656	TAT	2	6	2826932	2826937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_017656	T	6	6	2827619	2827624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_017656	GGT	2	6	2827644	2827649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_017656	ACT	2	6	2827702	2827707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_017656	CCA	2	6	2827750	2827755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8053	NC_017656	CCACTA	2	12	2827757	2827768	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
8054	NC_017656	CAG	2	6	2827779	2827784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_017656	CAT	2	6	2827815	2827820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_017656	CA	3	6	2827827	2827832	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8057	NC_017656	CATC	2	8	2827853	2827860	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8058	NC_017656	GAA	2	6	2827866	2827871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_017656	ACTGA	2	10	2827906	2827915	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8060	NC_017656	CAT	2	6	2827983	2827988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_017656	ACC	2	6	2828014	2828019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8062	NC_017656	CAG	2	6	2828037	2828042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_017656	T	6	6	2828070	2828075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_017656	ATC	2	6	2828107	2828112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_017656	AGCAG	2	10	2828126	2828135	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8066	NC_017656	GCC	2	6	2828146	2828151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8067	NC_017656	CG	3	6	2828250	2828255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8068	NC_017656	GGC	2	6	2828265	2828270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8069	NC_017656	CGG	2	6	2828313	2828318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_017656	CCG	2	6	2828351	2828356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8071	NC_017656	GC	3	6	2828400	2828405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8072	NC_017656	ACC	2	6	2828431	2828436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8074	NC_017656	A	6	6	2828461	2828466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_017656	CG	3	6	2828503	2828508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8076	NC_017656	TAA	2	6	2828564	2828569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_017656	ACC	2	6	2828614	2828619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8078	NC_017656	AGAGA	2	10	2828629	2828638	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_017656	ACCC	2	8	2828667	2828674	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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8085	NC_017656	TGA	2	6	2828825	2828830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8087	NC_017656	ACA	2	6	2828905	2828910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_017656	CAGAA	2	10	2828951	2828960	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8089	NC_017656	GGC	2	6	2828969	2828974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8093	NC_017656	AT	3	6	2830028	2830033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8096	NC_017656	TGTT	2	8	2830216	2830223	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_017656	TTA	2	6	2830226	2830231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_017656	TATT	2	8	2830235	2830242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_017656	AAT	2	6	2830246	2830251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8101	NC_017656	AT	3	6	2830310	2830315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_017656	TAT	2	6	2831467	2831472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_017656	T	6	6	2831520	2831525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_017656	T	6	6	2831560	2831565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_017656	GTA	2	6	2831599	2831604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8107	NC_017656	AGC	2	6	2831654	2831659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_017656	TTAT	2	8	2834125	2834132	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_017656	GA	3	6	2834153	2834158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_017656	TAAAT	2	10	2834202	2834211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_017656	CA	3	6	2834223	2834228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8112	NC_017656	TTA	2	6	2834229	2834234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_017656	A	6	6	2834347	2834352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_017656	TCA	2	6	2838601	2838606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8117	NC_017656	ACA	2	6	2843916	2843921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_017656	GTA	2	6	2845242	2845247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_017656	A	6	6	2845912	2845917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_017656	CTT	2	6	2845947	2845952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_017656	AAT	2	6	2845954	2845959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_017656	A	6	6	2845969	2845974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_017656	AC	3	6	2845993	2845998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8124	NC_017656	ATA	3	9	2846003	2846011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_017656	ATC	2	6	2846021	2846026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_017656	TTTA	2	8	2846087	2846094	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_017656	ATG	2	6	2846537	2846542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_017656	A	6	6	2847326	2847331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_017656	GTTAA	2	10	2847374	2847383	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_017656	ACA	2	6	2847425	2847430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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