MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 15174

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017656	T	6	6	1702771	1702776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_017656	GTT	2	6	1702784	1702789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_017656	TA	3	6	1702832	1702837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_017656	TGAT	2	8	1702884	1702891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017656	TAA	2	6	1702902	1702907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017656	TAA	2	6	1702911	1702916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_017656	AGTAC	2	10	1702931	1702940	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5008	NC_017656	TGG	2	6	1702943	1702948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_017656	TA	3	6	1702950	1702955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_017656	GTT	2	6	1705488	1705493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_017656	ACT	2	6	1706511	1706516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_017656	TTAAT	2	10	1706527	1706536	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_017656	TCT	2	6	1706537	1706542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_017656	T	6	6	1706580	1706585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017656	TTC	2	6	1706587	1706592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_017656	GTT	2	6	1706775	1706780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017656	AAT	2	6	1706803	1706808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_017656	CTC	2	6	1709553	1709558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_017656	GTC	2	6	1709568	1709573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_017656	ATTC	2	8	1709612	1709619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5021	NC_017656	ATC	2	6	1709622	1709627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_017656	GAAG	2	8	1709638	1709645	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017656	CTAA	2	8	1709658	1709665	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5024	NC_017656	A	6	6	1710044	1710049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017656	GAG	2	6	1710082	1710087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_017656	ACA	2	6	1711055	1711060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_017656	TGAA	2	8	1711104	1711111	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017656	TGA	2	6	1711116	1711121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_017656	AAGT	2	8	1712001	1712008	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017656	CAG	2	6	1712024	1712029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_017656	AT	3	6	1712052	1712057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_017656	TCTA	2	8	1712059	1712066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5033	NC_017656	GTT	2	6	1712082	1712087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017656	TC	3	6	1712660	1712665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_017656	GTT	2	6	1714205	1714210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_017656	TCA	2	6	1716996	1717001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017656	ATC	2	6	1717096	1717101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_017656	ATAA	2	8	1717135	1717142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017656	A	7	7	1718077	1718083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017656	AC	3	6	1718117	1718122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_017656	TTC	2	6	1718209	1718214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_017656	ATT	2	6	1718245	1718250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_017656	TGAA	2	8	1718258	1718265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017656	TTA	2	6	1718313	1718318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_017656	GTT	2	6	1718338	1718343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_017656	GACC	2	8	1718345	1718352	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_017656	GGA	2	6	1718386	1718391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017656	ATT	2	6	1720224	1720229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_017656	TTG	2	6	1720241	1720246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017656	A	6	6	1720259	1720264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_017656	TTA	2	6	1720375	1720380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_017656	TGA	2	6	1720401	1720406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_017656	AAT	2	6	1720443	1720448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017656	TGA	2	6	1720453	1720458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_017656	CTGT	2	8	1721471	1721478	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_017656	CGC	2	6	1721488	1721493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_017656	CT	3	6	1721517	1721522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_017656	TC	3	6	1721540	1721545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_017656	T	6	6	1721603	1721608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_017656	ACG	2	6	1721637	1721642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_017656	TGA	2	6	1721650	1721655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_017656	T	8	8	1721662	1721669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017656	TTAT	2	8	1721675	1721682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_017656	GAC	2	6	1721729	1721734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_017656	TTAT	2	8	1721737	1721744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_017656	CGATC	2	10	1721795	1721804	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5067	NC_017656	CAC	2	6	1721830	1721835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_017656	GAA	2	6	1721841	1721846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_017656	TGA	2	6	1721895	1721900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017656	TCG	2	6	1723341	1723346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_017656	ATT	2	6	1725925	1725930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017656	AAT	2	6	1725931	1725936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_017656	ATT	3	9	1726170	1726178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017656	CAA	2	6	1730354	1730359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_017656	AGC	2	6	1730526	1730531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_017656	CCG	2	6	1730672	1730677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_017656	GAA	2	6	1730717	1730722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_017656	CTG	2	6	1731029	1731034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_017656	TTA	2	6	1731040	1731045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_017656	GGCT	2	8	1731080	1731087	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_017656	GGGT	2	8	1731146	1731153	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017656	AAG	2	6	1731163	1731168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017656	GTT	2	6	1731237	1731242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017656	ATA	2	6	1731676	1731681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017656	AAC	2	6	1731702	1731707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_017656	GGA	2	6	1734215	1734220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017656	TAAA	2	8	1736320	1736327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_017656	AGG	2	6	1736371	1736376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017656	TGC	2	6	1736994	1736999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_017656	CGG	2	6	1737403	1737408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5091	NC_017656	A	7	7	1737426	1737432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017656	T	7	7	1737448	1737454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_017656	CAA	2	6	1737549	1737554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_017656	CAA	2	6	1738525	1738530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_017656	TG	3	6	1738540	1738545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017656	TG	4	8	1738635	1738642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_017656	A	6	6	1738666	1738671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017656	CGG	2	6	1738751	1738756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_017656	GTTTT	2	10	1738757	1738766	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017656	T	6	6	1738763	1738768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_017656	AAC	2	6	1738805	1738810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_017656	CTG	2	6	1738817	1738822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_017656	CAG	2	6	1738826	1738831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_017656	CA	3	6	1738860	1738865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5105	NC_017656	CAG	2	6	1738891	1738896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5106	NC_017656	GCG	2	6	1738903	1738908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_017656	GAA	2	6	1738955	1738960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_017656	CGTC	2	8	1739081	1739088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_017656	AT	3	6	1741234	1741239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_017656	CGC	2	6	1741296	1741301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5111	NC_017656	AAT	2	6	1741369	1741374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017656	AAC	2	6	1741472	1741477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_017656	TGGC	2	8	1741513	1741520	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5114	NC_017656	T	6	6	1741521	1741526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017656	AGC	2	6	1741543	1741548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5117	NC_017656	GTG	2	6	1741703	1741708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_017656	AGCG	2	8	1741711	1741718	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5119	NC_017656	CCA	2	6	1741759	1741764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_017656	GCTG	2	8	1741811	1741818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5121	NC_017656	CAT	2	6	1741856	1741861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_017656	GTT	2	6	1741864	1741869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_017656	CCACA	2	10	1741936	1741945	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5124	NC_017656	CT	3	6	1741960	1741965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5125	NC_017656	TTA	2	6	1741978	1741983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_017656	A	7	7	1742066	1742072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_017656	ATG	2	6	1742079	1742084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017656	GCG	2	6	1742096	1742101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_017656	TCTG	2	8	1742152	1742159	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5130	NC_017656	CAT	2	6	1742191	1742196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5132	NC_017656	CTC	2	6	1742228	1742233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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