MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli ABU 83972 chromosome

Total Repeats: 12827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017631	CAT	2	6	5009142	5009147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_017631	TGT	2	6	5009297	5009302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_017631	CAT	2	6	5010079	5010084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_017631	CT	3	6	5010136	5010141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12505	NC_017631	CA	3	6	5010195	5010200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12506	NC_017631	GCA	2	6	5010201	5010206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_017631	CAA	2	6	5010214	5010219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_017631	GAC	2	6	5010248	5010253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_017631	CAA	3	9	5010340	5010348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_017631	CA	3	6	5010370	5010375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12511	NC_017631	GC	3	6	5010397	5010402	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12512	NC_017631	C	8	8	5010420	5010427	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12513	NC_017631	ACC	2	6	5010443	5010448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12514	NC_017631	ATC	2	6	5010559	5010564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_017631	A	6	6	5010596	5010601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_017631	ATC	2	6	5010617	5010622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_017631	TCA	2	6	5010623	5010628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_017631	ATC	2	6	5010645	5010650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_017631	TCG	2	6	5010671	5010676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12520	NC_017631	GATT	2	8	5010822	5010829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_017631	CAG	2	6	5010850	5010855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_017631	ATT	2	6	5010952	5010957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_017631	TAG	2	6	5010990	5010995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_017631	TA	3	6	5011006	5011011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_017631	TA	3	6	5011043	5011048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_017631	CATA	2	8	5011084	5011091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12527	NC_017631	CAGC	2	8	5011116	5011123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12528	NC_017631	ATT	2	6	5011166	5011171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_017631	AAC	2	6	5011214	5011219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12530	NC_017631	ATC	2	6	5011225	5011230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_017631	AAC	2	6	5011295	5011300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12532	NC_017631	TA	3	6	5011368	5011373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_017631	CCT	2	6	5011487	5011492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12534	NC_017631	CATTA	2	10	5011497	5011506	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12535	NC_017631	GAT	2	6	5011554	5011559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_017631	CTC	2	6	5011566	5011571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12537	NC_017631	T	7	7	5011586	5011592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_017631	A	6	6	5011758	5011763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_017631	T	6	6	5011820	5011825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_017631	A	6	6	5011889	5011894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_017631	A	6	6	5011897	5011902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_017631	TTC	2	6	5014058	5014063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12543	NC_017631	AT	3	6	5014961	5014966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_017631	CAT	2	6	5015007	5015012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12545	NC_017631	TTCAT	2	10	5015972	5015981	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12546	NC_017631	TCT	2	6	5015995	5016000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12547	NC_017631	ATTC	2	8	5016034	5016041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12548	NC_017631	TTC	2	6	5016929	5016934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12549	NC_017631	CATT	2	8	5016935	5016942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12550	NC_017631	ATC	2	6	5016958	5016963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12551	NC_017631	CGTCAC	2	12	5017946	5017957	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12552	NC_017631	TTTCTC	2	12	5017980	5017991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12553	NC_017631	AGG	2	6	5018015	5018020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_017631	AGA	2	6	5018268	5018273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_017631	CCA	2	6	5018286	5018291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12556	NC_017631	CAC	2	6	5018737	5018742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12557	NC_017631	AAC	2	6	5019657	5019662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12558	NC_017631	TCAC	2	8	5019864	5019871	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12559	NC_017631	GTT	2	6	5020294	5020299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_017631	TAT	2	6	5020300	5020305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_017631	T	7	7	5020391	5020397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_017631	GGAA	2	8	5020546	5020553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_017631	CAA	2	6	5021807	5021812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12564	NC_017631	TGC	2	6	5026996	5027001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12565	NC_017631	CTGA	2	8	5027367	5027374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12566	NC_017631	AAT	2	6	5032444	5032449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_017631	TA	3	6	5032453	5032458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_017631	GAAAAT	2	12	5032460	5032471	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_017631	TGA	2	6	5032513	5032518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_017631	ATG	2	6	5032553	5032558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_017631	AAT	2	6	5032573	5032578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_017631	A	6	6	5032897	5032902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_017631	GAT	2	6	5032965	5032970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_017631	ACA	2	6	5032981	5032986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12575	NC_017631	A	6	6	5033139	5033144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_017631	TCT	2	6	5034892	5034897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12577	NC_017631	TA	3	6	5034934	5034939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12578	NC_017631	ATT	2	6	5034979	5034984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_017631	A	6	6	5035012	5035017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_017631	CAG	2	6	5035043	5035048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12581	NC_017631	CCA	2	6	5035064	5035069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12582	NC_017631	GCTTAT	2	12	5035081	5035092	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12583	NC_017631	CA	3	6	5035133	5035138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12584	NC_017631	TAT	2	6	5035612	5035617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12585	NC_017631	T	6	6	5035678	5035683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12586	NC_017631	AAT	2	6	5035701	5035706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_017631	TC	3	6	5035742	5035747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12588	NC_017631	ATG	2	6	5035821	5035826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_017631	CCA	2	6	5035867	5035872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12590	NC_017631	AAT	2	6	5035987	5035992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_017631	GCT	2	6	5036000	5036005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12592	NC_017631	A	7	7	5036025	5036031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_017631	AAT	2	6	5036078	5036083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_017631	CTG	2	6	5036106	5036111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12595	NC_017631	AT	3	6	5036131	5036136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_017631	T	7	7	5036154	5036160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_017631	TG	3	6	5036167	5036172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_017631	ACC	2	6	5036206	5036211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12599	NC_017631	GGA	2	6	5036221	5036226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_017631	GATG	2	8	5036239	5036246	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_017631	TGT	2	6	5039222	5039227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_017631	T	6	6	5039234	5039239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_017631	T	6	6	5039284	5039289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_017631	ATT	2	6	5039323	5039328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_017631	TAAA	2	8	5039329	5039336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_017631	TCT	2	6	5039371	5039376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12607	NC_017631	TCA	2	6	5039499	5039504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12609	NC_017631	GGT	2	6	5039711	5039716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_017631	ATTT	2	8	5039762	5039769	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_017631	GTG	2	6	5039812	5039817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_017631	TCA	2	6	5039857	5039862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12613	NC_017631	GAT	2	6	5039947	5039952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_017631	GTTT	2	8	5039963	5039970	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_017631	CAGG	2	8	5040143	5040150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12616	NC_017631	AAT	2	6	5040151	5040156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_017631	ATA	2	6	5040182	5040187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_017631	TAA	2	6	5040246	5040251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_017631	T	6	6	5040299	5040304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_017631	AT	3	6	5040340	5040345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_017631	ATG	2	6	5040366	5040371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_017631	TTA	2	6	5040376	5040381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_017631	AT	3	6	5040405	5040410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_017631	TTA	2	6	5040454	5040459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12625	NC_017631	AGA	2	6	5040494	5040499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12626	NC_017631	GTTA	2	8	5040514	5040521	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_017631	ATT	2	6	5040570	5040575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12628	NC_017631	TCA	2	6	5045324	5045329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12783	NC_017631	ATT	2	6	5106572	5106577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12792	NC_017631	GCGG	2	8	5115232	5115239	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12793	NC_017631	GA	3	6	5116646	5116651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12794	NC_017631	GGAG	2	8	5116655	5116662	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12795	NC_017631	AGGG	2	8	5117978	5117985	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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12805	NC_017631	CAA	2	6	5125074	5125079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.