MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 17981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_013361	GAC	2	6	5329162	5329167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16502	NC_013361	GCG	2	6	5329169	5329174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16503	NC_013361	CCAT	2	8	5329176	5329183	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16504	NC_013361	CCT	2	6	5330292	5330297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16505	NC_013361	GAGT	2	8	5330338	5330345	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16506	NC_013361	ATA	2	6	5330359	5330364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16507	NC_013361	TTA	2	6	5330413	5330418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16508	NC_013361	AAAT	2	8	5331342	5331349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16509	NC_013361	TTTGT	2	10	5331353	5331362	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16510	NC_013361	ATT	2	6	5331382	5331387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16511	NC_013361	AAT	2	6	5331388	5331393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16512	NC_013361	TTGT	2	8	5331412	5331419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16513	NC_013361	ATAA	2	8	5331424	5331431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16514	NC_013361	GT	3	6	5331433	5331438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16515	NC_013361	T	7	7	5331447	5331453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16516	NC_013361	AAT	2	6	5332673	5332678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16517	NC_013361	AT	3	6	5332677	5332682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16518	NC_013361	AG	3	6	5332714	5332719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16519	NC_013361	T	7	7	5332723	5332729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16520	NC_013361	CTC	2	6	5332745	5332750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16521	NC_013361	TCA	2	6	5332779	5332784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16522	NC_013361	ATT	2	6	5332817	5332822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16523	NC_013361	TAA	2	6	5332828	5332833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16524	NC_013361	A	6	6	5332844	5332849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16525	NC_013361	CTT	2	6	5332912	5332917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16526	NC_013361	TA	3	6	5332926	5332931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16527	NC_013361	GAT	2	6	5332935	5332940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16528	NC_013361	GGT	2	6	5332947	5332952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16529	NC_013361	AGA	2	6	5333011	5333016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16531	NC_013361	GCA	2	6	5333081	5333086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16532	NC_013361	GATA	2	8	5333238	5333245	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16533	NC_013361	G	7	7	5333282	5333288	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16534	NC_013361	CCG	3	9	5333337	5333345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16535	NC_013361	TA	3	6	5333417	5333422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16536	NC_013361	AAAAC	2	10	5333487	5333496	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
16537	NC_013361	TTC	2	6	5333549	5333554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16538	NC_013361	T	7	7	5333592	5333598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16539	NC_013361	TAA	2	6	5333645	5333650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16540	NC_013361	TGA	2	6	5333670	5333675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16541	NC_013361	GATA	2	8	5333695	5333702	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16542	NC_013361	TTG	2	6	5333739	5333744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16543	NC_013361	TCCT	2	8	5333746	5333753	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16544	NC_013361	GATAAG	2	12	5333754	5333765	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16545	NC_013361	AT	3	6	5333781	5333786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16546	NC_013361	TCA	2	6	5339191	5339196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16547	NC_013361	ACA	2	6	5339223	5339228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16548	NC_013361	AT	3	6	5339254	5339259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16549	NC_013361	AAAG	2	8	5339279	5339286	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16550	NC_013361	TGAG	2	8	5339353	5339360	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16551	NC_013361	TTTA	2	8	5339722	5339729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16552	NC_013361	AAT	2	6	5339731	5339736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16553	NC_013361	ATTT	2	8	5339763	5339770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16554	NC_013361	T	7	7	5340213	5340219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16555	NC_013361	AGA	2	6	5340233	5340238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16556	NC_013361	GAT	2	6	5340340	5340345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16557	NC_013361	AT	3	6	5340378	5340383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16558	NC_013361	CAG	2	6	5340419	5340424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16559	NC_013361	CGGT	2	8	5340491	5340498	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16560	NC_013361	AGC	2	6	5340525	5340530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16561	NC_013361	TAT	2	6	5340533	5340538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16562	NC_013361	CT	3	6	5344067	5344072	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16563	NC_013361	ATGCG	2	10	5344082	5344091	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16564	NC_013361	TAT	2	6	5344468	5344473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16565	NC_013361	ATT	2	6	5344474	5344479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16566	NC_013361	TA	4	8	5344513	5344520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16567	NC_013361	AAT	2	6	5344544	5344549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16568	NC_013361	CA	3	6	5344553	5344558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16569	NC_013361	TACT	2	8	5344561	5344568	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16570	NC_013361	TA	3	6	5349965	5349970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16571	NC_013361	TCC	2	6	5350514	5350519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16572	NC_013361	AAT	2	6	5350534	5350539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16574	NC_013361	ATA	2	6	5350575	5350580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16575	NC_013361	TGGC	2	8	5350624	5350631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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16578	NC_013361	ATA	2	6	5351145	5351150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16584	NC_013361	AT	3	6	5351308	5351313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16585	NC_013361	TA	3	6	5351950	5351955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16593	NC_013361	ATT	2	6	5352192	5352197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16594	NC_013361	ATT	2	6	5352231	5352236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16596	NC_013361	ATGTT	2	10	5352275	5352284	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16597	NC_013361	CATTA	2	10	5352314	5352323	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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16599	NC_013361	ATAAA	2	10	5352362	5352371	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16600	NC_013361	AT	3	6	5354002	5354007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16601	NC_013361	G	7	7	5354034	5354040	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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16611	NC_013361	ATA	3	9	5357688	5357696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16612	NC_013361	TGG	2	6	5358939	5358944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16613	NC_013361	A	6	6	5358957	5358962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16614	NC_013361	TGT	2	6	5359006	5359011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16617	NC_013361	AAGA	2	8	5360149	5360156	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16618	NC_013361	TTA	2	6	5360157	5360162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16619	NC_013361	TA	3	6	5360168	5360173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16620	NC_013361	TG	3	6	5363947	5363952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16621	NC_013361	TTTTAA	2	12	5363984	5363995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16622	NC_013361	TAA	2	6	5364003	5364008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16623	NC_013361	ATT	2	6	5364683	5364688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16625	NC_013361	AAAT	2	8	5364780	5364787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16626	NC_013361	TAA	2	6	5364792	5364797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16627	NC_013361	ATG	2	6	5364798	5364803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16629	NC_013361	T	6	6	5364855	5364860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16630	NC_013361	T	7	7	5364948	5364954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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