MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 17981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_013361	CA	3	6	5195030	5195035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16002	NC_013361	CCAG	2	8	5195061	5195068	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16003	NC_013361	ACC	2	6	5196326	5196331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16004	NC_013361	GAA	2	6	5196369	5196374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_013361	CAGGA	2	10	5196376	5196385	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16006	NC_013361	T	7	7	5196449	5196455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_013361	AGC	2	6	5196475	5196480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16008	NC_013361	CGG	2	6	5196557	5196562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16009	NC_013361	ACC	2	6	5196577	5196582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16010	NC_013361	TTGA	2	8	5196592	5196599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_013361	GCA	2	6	5196668	5196673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_013361	A	9	9	5196772	5196780	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16013	NC_013361	TCA	2	6	5196921	5196926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16014	NC_013361	GGC	2	6	5196959	5196964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16015	NC_013361	GAA	2	6	5197007	5197012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_013361	AGCCC	2	10	5197096	5197105	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16017	NC_013361	ATG	2	6	5197197	5197202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_013361	GTC	2	6	5198026	5198031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16019	NC_013361	CCTG	2	8	5198035	5198042	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16020	NC_013361	TAT	2	6	5198066	5198071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_013361	ATA	2	6	5199809	5199814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_013361	CCG	2	6	5199820	5199825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16023	NC_013361	TTA	2	6	5199832	5199837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_013361	GCC	2	6	5200808	5200813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16025	NC_013361	CAT	2	6	5200872	5200877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16026	NC_013361	GTA	2	6	5200954	5200959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_013361	TCA	2	6	5200961	5200966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16028	NC_013361	AG	3	6	5202320	5202325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_013361	ATA	2	6	5202361	5202366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16030	NC_013361	TCT	2	6	5202378	5202383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_013361	TCTT	2	8	5202394	5202401	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16032	NC_013361	ACAA	2	8	5202452	5202459	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16033	NC_013361	AAT	2	6	5202461	5202466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_013361	TTA	2	6	5202467	5202472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_013361	TAA	2	6	5202494	5202499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_013361	T	6	6	5202500	5202505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_013361	CATT	2	8	5202656	5202663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16038	NC_013361	TTA	2	6	5202688	5202693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_013361	ATT	2	6	5205788	5205793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_013361	CTA	2	6	5207292	5207297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_013361	CCA	2	6	5207316	5207321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16042	NC_013361	GAT	2	6	5207385	5207390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_013361	CTC	2	6	5207454	5207459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16044	NC_013361	GTA	2	6	5207509	5207514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_013361	TAAA	2	8	5207521	5207528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_013361	ACG	2	6	5207550	5207555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16047	NC_013361	AGT	2	6	5207591	5207596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_013361	TAA	2	6	5207602	5207607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_013361	AGA	2	6	5207719	5207724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_013361	CGC	2	6	5209418	5209423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16051	NC_013361	GATT	2	8	5209522	5209529	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_013361	TAA	2	6	5209539	5209544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_013361	T	7	7	5209567	5209573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_013361	GTT	2	6	5209648	5209653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_013361	TTTTA	2	10	5209688	5209697	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_013361	ATTC	2	8	5209749	5209756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16057	NC_013361	CCCG	2	8	5209827	5209834	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16058	NC_013361	CATT	2	8	5209856	5209863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16059	NC_013361	GTAT	2	8	5210129	5210136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_013361	AAT	2	6	5210143	5210148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_013361	GT	3	6	5213806	5213811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_013361	CAT	2	6	5213882	5213887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16063	NC_013361	CAG	2	6	5213926	5213931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16064	NC_013361	GAA	2	6	5213956	5213961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_013361	AGC	2	6	5213981	5213986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16066	NC_013361	ACC	2	6	5214006	5214011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16067	NC_013361	TGG	2	6	5214070	5214075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_013361	GCC	2	6	5214142	5214147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16069	NC_013361	GGTA	2	8	5214171	5214178	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16070	NC_013361	TGG	2	6	5214189	5214194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_013361	GC	3	6	5214197	5214202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16072	NC_013361	A	6	6	5214232	5214237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_013361	AGG	2	6	5214288	5214293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_013361	GCG	2	6	5214734	5214739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16075	NC_013361	T	6	6	5216309	5216314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16076	NC_013361	TGA	2	6	5216372	5216377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16077	NC_013361	ATA	2	6	5216449	5216454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_013361	ATG	2	6	5216461	5216466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_013361	GAAA	2	8	5216502	5216509	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_013361	A	7	7	5216507	5216513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_013361	AAC	2	6	5216592	5216597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16082	NC_013361	CAC	2	6	5216613	5216618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16083	NC_013361	CCAG	2	8	5216637	5216644	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16084	NC_013361	AAG	2	6	5216657	5216662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16085	NC_013361	GCG	2	6	5216696	5216701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16086	NC_013361	TGC	2	6	5216741	5216746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16087	NC_013361	GCGAC	2	10	5216790	5216799	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16088	NC_013361	ACC	2	6	5216840	5216845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16089	NC_013361	CTT	2	6	5216922	5216927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16090	NC_013361	CCCA	2	8	5216986	5216993	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16091	NC_013361	CGC	2	6	5217009	5217014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16092	NC_013361	AATG	2	8	5217031	5217038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_013361	AAC	2	6	5217062	5217067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16094	NC_013361	CAG	2	6	5217127	5217132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16095	NC_013361	GGT	2	6	5217178	5217183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_013361	AG	3	6	5217184	5217189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_013361	CCACAG	2	12	5217235	5217246	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16098	NC_013361	CGA	2	6	5217387	5217392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16099	NC_013361	CAG	2	6	5217397	5217402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16100	NC_013361	CGC	2	6	5217415	5217420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16101	NC_013361	AGTAGC	2	12	5217428	5217439	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16102	NC_013361	TAA	2	6	5217447	5217452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16103	NC_013361	CACC	2	8	5217554	5217561	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16104	NC_013361	TGC	3	9	5217585	5217593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16105	NC_013361	CGC	2	6	5217614	5217619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16106	NC_013361	GCC	2	6	5217699	5217704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16107	NC_013361	GTT	2	6	5217732	5217737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_013361	ATC	2	6	5217760	5217765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16109	NC_013361	GCG	2	6	5217767	5217772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16110	NC_013361	CAG	2	6	5217786	5217791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16111	NC_013361	AAG	2	6	5217808	5217813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_013361	CCAT	2	8	5217832	5217839	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16113	NC_013361	ATC	2	6	5217895	5217900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16114	NC_013361	CCAG	2	8	5217914	5217921	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16115	NC_013361	GCGG	2	8	5217945	5217952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16116	NC_013361	GC	3	6	5217992	5217997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16117	NC_013361	CAT	2	6	5218002	5218007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_013361	AAC	2	6	5218033	5218038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16119	NC_013361	CAG	2	6	5218089	5218094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_013361	TCG	2	6	5218240	5218245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_013361	CCAG	2	8	5218269	5218276	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16122	NC_013361	CGG	2	6	5218325	5218330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16123	NC_013361	CGC	2	6	5218376	5218381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16124	NC_013361	ATT	2	6	5218386	5218391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_013361	GT	3	6	5218415	5218420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_013361	TCA	3	9	5218457	5218465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16127	NC_013361	TTG	2	6	5218468	5218473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16128	NC_013361	CG	3	6	5218539	5218544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16129	NC_013361	TTTC	2	8	5218568	5218575	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16130	NC_013361	CGC	2	6	5218592	5218597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16131	NC_013361	CGCC	2	8	5218667	5218674	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16132	NC_013361	TGC	2	6	5218763	5218768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16242	NC_013361	AAT	2	6	5235625	5235630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16248	NC_013361	AAAG	2	8	5237188	5237195	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16249	NC_013361	TCC	2	6	5238211	5238216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16250	NC_013361	GCT	2	6	5238234	5238239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16251	NC_013361	GCG	2	6	5240871	5240876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16252	NC_013361	CTT	2	6	5241034	5241039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16253	NC_013361	ACC	2	6	5241058	5241063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16254	NC_013361	GTC	2	6	5242331	5242336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16255	NC_013361	CTTT	2	8	5242346	5242353	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16256	NC_013361	GAT	2	6	5242357	5242362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16262	NC_013361	TAA	2	6	5242472	5242477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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