MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 17981

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_013361	GGCGCG	2	12	4152778	4152789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_013361	TGA	2	6	4152845	4152850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_013361	TTC	2	6	4152873	4152878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_013361	CCG	2	6	4152898	4152903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13005	NC_013361	TGT	2	6	4152991	4152996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_013361	T	6	6	4153004	4153009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_013361	AAT	2	6	4153018	4153023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_013361	CTG	2	6	4153030	4153035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13009	NC_013361	GCG	2	6	4153042	4153047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_013361	TCC	2	6	4153077	4153082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13011	NC_013361	GCG	2	6	4153142	4153147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_013361	ACC	2	6	4153221	4153226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13013	NC_013361	ATT	2	6	4153323	4153328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_013361	AAC	2	6	4155911	4155916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_013361	T	6	6	4155952	4155957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_013361	CGC	2	6	4156070	4156075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13017	NC_013361	CCT	2	6	4157239	4157244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13018	NC_013361	ATG	2	6	4157825	4157830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_013361	TCTTT	2	10	4157841	4157850	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13020	NC_013361	C	6	6	4157873	4157878	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13021	NC_013361	CTT	2	6	4157911	4157916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_013361	TGTT	2	8	4157956	4157963	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_013361	AGCA	2	8	4158019	4158026	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13024	NC_013361	GCA	2	6	4158127	4158132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13025	NC_013361	TCT	2	6	4158253	4158258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13026	NC_013361	CTGG	2	8	4158368	4158375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13027	NC_013361	CTCG	2	8	4158462	4158469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13028	NC_013361	TCC	2	6	4158496	4158501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13029	NC_013361	AAT	2	6	4158574	4158579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_013361	GAC	2	6	4158622	4158627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_013361	TG	3	6	4159762	4159767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_013361	T	6	6	4159821	4159826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_013361	AGC	2	6	4159871	4159876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_013361	T	7	7	4159902	4159908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_013361	TCTCCC	2	12	4160942	4160953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13036	NC_013361	T	6	6	4161059	4161064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_013361	TGT	2	6	4161067	4161072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_013361	AAAT	2	8	4161113	4161120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_013361	CT	3	6	4161147	4161152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13040	NC_013361	ACA	2	6	4161266	4161271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_013361	T	6	6	4163147	4163152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_013361	AAC	2	6	4163156	4163161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_013361	AGCT	2	8	4166111	4166118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13044	NC_013361	A	7	7	4166205	4166211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_013361	TC	3	6	4166231	4166236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13046	NC_013361	GTC	2	6	4166265	4166270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_013361	ATTC	2	8	4166386	4166393	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13048	NC_013361	TCG	2	6	4167914	4167919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13049	NC_013361	TA	3	6	4167922	4167927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_013361	A	6	6	4167929	4167934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_013361	AGGG	2	8	4171755	4171762	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_013361	CCCT	2	8	4171767	4171774	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13053	NC_013361	TTA	2	6	4172318	4172323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_013361	A	6	6	4173123	4173128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_013361	TAG	2	6	4173181	4173186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_013361	T	6	6	4173208	4173213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_013361	TA	3	6	4173270	4173275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_013361	TCG	2	6	4174161	4174166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_013361	AAC	2	6	4174267	4174272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_013361	AAT	2	6	4174458	4174463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_013361	TCAC	2	8	4175537	4175544	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13062	NC_013361	GGT	2	6	4175584	4175589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13063	NC_013361	ACT	2	6	4176043	4176048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13065	NC_013361	CAC	2	6	4177155	4177160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13066	NC_013361	TC	3	6	4177170	4177175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13067	NC_013361	ACG	2	6	4177187	4177192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_013361	A	7	7	4177213	4177219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_013361	CAG	2	6	4177224	4177229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_013361	A	6	6	4177669	4177674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_013361	GAG	2	6	4177676	4177681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13074	NC_013361	GA	3	6	4177708	4177713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_013361	TGT	2	6	4178748	4178753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13079	NC_013361	TTA	2	6	4178898	4178903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13081	NC_013361	TGC	2	6	4178954	4178959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13084	NC_013361	AAT	2	6	4179421	4179426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_013361	TTTA	2	8	4179436	4179443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_013361	TA	3	6	4179461	4179466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_013361	A	6	6	4179477	4179482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_013361	AAAG	2	8	4179529	4179536	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_013361	TTAA	2	8	4179583	4179590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_013361	TAA	3	9	4179995	4180003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13091	NC_013361	AG	3	6	4180995	4181000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_013361	GCG	2	6	4181916	4181921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_013361	CAA	2	6	4181949	4181954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13095	NC_013361	GCATC	2	10	4181998	4182007	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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13097	NC_013361	CAA	2	6	4182036	4182041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_013361	GCATC	2	10	4182076	4182085	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13099	NC_013361	TTA	2	6	4184808	4184813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_013361	T	7	7	4184814	4184820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_013361	TTA	2	6	4184867	4184872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_013361	CG	3	6	4184889	4184894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13103	NC_013361	CTA	2	6	4184954	4184959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13107	NC_013361	TC	3	6	4189198	4189203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13108	NC_013361	ATCCT	2	10	4191788	4191797	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13109	NC_013361	GTAACC	2	12	4192832	4192843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_013361	ACAG	2	8	4192856	4192863	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13111	NC_013361	ATT	2	6	4192868	4192873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_013361	TAAA	2	8	4192880	4192887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_013361	ATGAA	2	10	4193882	4193891	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_013361	CAA	2	6	4193972	4193977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_013361	A	8	8	4194017	4194024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13116	NC_013361	CAT	2	6	4194056	4194061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_013361	A	6	6	4194080	4194085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13118	NC_013361	TTC	2	6	4194370	4194375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13121	NC_013361	CGC	2	6	4194437	4194442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13122	NC_013361	AGACAA	2	12	4194452	4194463	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13123	NC_013361	TCG	2	6	4194491	4194496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_013361	T	6	6	4194546	4194551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13125	NC_013361	TAT	2	6	4194589	4194594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_013361	GAC	2	6	4194605	4194610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13127	NC_013361	AGGC	2	8	4194612	4194619	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13128	NC_013361	TAA	2	6	4196376	4196381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13129	NC_013361	CTT	2	6	4196382	4196387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13130	NC_013361	TAT	2	6	4196396	4196401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13131	NC_013361	AT	3	6	4196533	4196538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13132	NC_013361	CGC	2	6	4196577	4196582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13140	NC_013361	TCAT	2	8	4196807	4196814	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13145	NC_013361	C	7	7	4197033	4197039	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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13177	NC_013361	TTTCT	2	10	4210720	4210729	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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13242	NC_013361	A	6	6	4248325	4248330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13257	NC_013361	TTAA	2	8	4248873	4248880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13258	NC_013361	CAA	2	6	4251910	4251915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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