MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Eggerthella lenta DSM 2243 chromosome

Total Repeats: 10840

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_013204	GGA	2	6	3506942	3506947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_013204	ACGC	2	8	3506960	3506967	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10503	NC_013204	GGAG	2	8	3507013	3507020	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_013204	GA	3	6	3507023	3507028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_013204	GAT	2	6	3507051	3507056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_013204	CGGC	2	8	3507065	3507072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10507	NC_013204	CCT	2	6	3508780	3508785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10508	NC_013204	GCG	2	6	3508821	3508826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_013204	CG	3	6	3508888	3508893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10510	NC_013204	ACG	2	6	3508944	3508949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_013204	AGG	2	6	3508953	3508958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_013204	ATG	2	6	3510538	3510543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_013204	CCG	3	9	3511542	3511550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10514	NC_013204	GGC	2	6	3511618	3511623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_013204	AGC	2	6	3511644	3511649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10516	NC_013204	TTG	2	6	3511799	3511804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_013204	CCG	2	6	3512040	3512045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10518	NC_013204	TGA	2	6	3512136	3512141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_013204	GAC	2	6	3512203	3512208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10520	NC_013204	TCA	2	6	3512220	3512225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10521	NC_013204	TCA	2	6	3513805	3513810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10522	NC_013204	GC	3	6	3513819	3513824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10523	NC_013204	GCAAAA	2	12	3513844	3513855	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10524	NC_013204	CGC	2	6	3513968	3513973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10525	NC_013204	CCG	2	6	3513974	3513979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10526	NC_013204	CG	3	6	3513985	3513990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10527	NC_013204	CGC	2	6	3514015	3514020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10528	NC_013204	G	7	7	3514091	3514097	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_013204	AGAGGG	2	12	3514137	3514148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_013204	GCC	2	6	3516353	3516358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10531	NC_013204	TCC	2	6	3517030	3517035	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10532	NC_013204	TCAG	2	8	3517054	3517061	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10535	NC_013204	ACG	2	6	3517196	3517201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10536	NC_013204	GCG	2	6	3517302	3517307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10537	NC_013204	GC	3	6	3517356	3517361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10538	NC_013204	CCT	2	6	3518944	3518949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10539	NC_013204	CTC	2	6	3522542	3522547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10540	NC_013204	TGGA	2	8	3522654	3522661	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_013204	ATC	2	6	3522676	3522681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10542	NC_013204	ATT	2	6	3522690	3522695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_013204	GAA	2	6	3522776	3522781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_013204	CCT	2	6	3523658	3523663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10545	NC_013204	GCCT	2	8	3523735	3523742	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10546	NC_013204	GCG	3	9	3523748	3523756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10547	NC_013204	CCG	2	6	3523812	3523817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10548	NC_013204	CGC	2	6	3523825	3523830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10549	NC_013204	CGC	2	6	3523854	3523859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10550	NC_013204	CGA	2	6	3523860	3523865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10552	NC_013204	GC	4	8	3523921	3523928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10553	NC_013204	CGC	3	9	3525587	3525595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10554	NC_013204	GCG	3	9	3525599	3525607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10555	NC_013204	AAG	2	6	3525639	3525644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_013204	CG	3	6	3525655	3525660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10557	NC_013204	GCA	2	6	3526608	3526613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_013204	TGA	2	6	3526794	3526799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_013204	CGG	2	6	3526894	3526899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10560	NC_013204	GAGG	2	8	3526900	3526907	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_013204	TCC	2	6	3528438	3528443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10562	NC_013204	TTC	2	6	3528444	3528449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10563	NC_013204	TC	3	6	3528448	3528453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10564	NC_013204	GC	3	6	3528479	3528484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10565	NC_013204	TCA	2	6	3528491	3528496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10568	NC_013204	CG	3	6	3528563	3528568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10569	NC_013204	CTT	2	6	3528613	3528618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10572	NC_013204	CG	3	6	3529102	3529107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10573	NC_013204	GAC	2	6	3529116	3529121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10577	NC_013204	ATT	2	6	3529262	3529267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10582	NC_013204	GTC	2	6	3531179	3531184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10584	NC_013204	CGT	2	6	3531248	3531253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10586	NC_013204	CG	3	6	3531520	3531525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10587	NC_013204	ACCG	2	8	3531582	3531589	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10588	NC_013204	CG	3	6	3531594	3531599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10591	NC_013204	AAT	2	6	3531816	3531821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_013204	AC	3	6	3531896	3531901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10593	NC_013204	CG	3	6	3531933	3531938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10594	NC_013204	GCG	2	6	3531951	3531956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10598	NC_013204	CG	3	6	3539892	3539897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10599	NC_013204	TCT	2	6	3539955	3539960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10602	NC_013204	GC	3	6	3541343	3541348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10603	NC_013204	TC	3	6	3542307	3542312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10605	NC_013204	AAAG	2	8	3543834	3543841	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10607	NC_013204	TGCT	2	8	3544678	3544685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10608	NC_013204	AAG	2	6	3544736	3544741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10609	NC_013204	GC	3	6	3544750	3544755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10610	NC_013204	CA	3	6	3544857	3544862	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10611	NC_013204	GC	3	6	3544885	3544890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10612	NC_013204	CTC	2	6	3549562	3549567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10613	NC_013204	CTC	2	6	3549577	3549582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10614	NC_013204	GGGGA	2	10	3549622	3549631	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_013204	A	6	6	3549743	3549748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10622	NC_013204	GC	3	6	3555026	3555031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10623	NC_013204	ATG	3	9	3557414	3557422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10630	NC_013204	CTT	2	6	3559087	3559092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.