MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 chromosome

Total Repeats: 16586

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_013008	TAAAT	2	10	5491247	5491256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16502	NC_013008	AAC	2	6	5491290	5491295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16503	NC_013008	GTT	2	6	5491376	5491381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16504	NC_013008	GCA	2	6	5491384	5491389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16505	NC_013008	GAAT	2	8	5491466	5491473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16506	NC_013008	CAT	2	6	5491487	5491492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16507	NC_013008	GGA	2	6	5491513	5491518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16508	NC_013008	AGT	2	6	5492262	5492267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16509	NC_013008	ATG	2	6	5492888	5492893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16510	NC_013008	AATGAT	2	12	5493727	5493738	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16511	NC_013008	GAA	2	6	5494095	5494100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16512	NC_013008	G	8	8	5494132	5494139	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16513	NC_013008	CGC	2	6	5494368	5494373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16514	NC_013008	CTC	2	6	5495438	5495443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16515	NC_013008	GGC	2	6	5495454	5495459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16516	NC_013008	CGA	2	6	5495487	5495492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16517	NC_013008	ACA	2	6	5495515	5495520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16518	NC_013008	C	7	7	5497061	5497067	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16519	NC_013008	CAA	2	6	5497102	5497107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16520	NC_013008	GCGCG	2	10	5497108	5497117	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16521	NC_013008	AAG	2	6	5497131	5497136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16522	NC_013008	TTA	2	6	5498785	5498790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16523	NC_013008	TGA	2	6	5498885	5498890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16524	NC_013008	TAA	2	6	5498968	5498973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16525	NC_013008	TCA	2	6	5499002	5499007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16526	NC_013008	TC	3	6	5499055	5499060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16527	NC_013008	TCG	2	6	5499734	5499739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16528	NC_013008	TCC	2	6	5499747	5499752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16529	NC_013008	CAC	2	6	5499779	5499784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16530	NC_013008	AAT	2	6	5500087	5500092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16531	NC_013008	CAA	2	6	5500120	5500125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16532	NC_013008	GCA	2	6	5502009	5502014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16533	NC_013008	CGC	2	6	5502109	5502114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16534	NC_013008	CG	3	6	5503081	5503086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16535	NC_013008	TGCG	2	8	5503111	5503118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16536	NC_013008	CTT	2	6	5503120	5503125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16537	NC_013008	GGT	2	6	5503136	5503141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16538	NC_013008	TCG	2	6	5503314	5503319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16539	NC_013008	AAG	2	6	5504631	5504636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16540	NC_013008	CCA	2	6	5504671	5504676	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16541	NC_013008	CATT	2	8	5504683	5504690	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16542	NC_013008	ATT	2	6	5504700	5504705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16543	NC_013008	GT	3	6	5504773	5504778	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16544	NC_013008	TGCGC	2	10	5505650	5505659	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16545	NC_013008	CTGAT	2	10	5507086	5507095	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16546	NC_013008	TCA	2	6	5509201	5509206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16547	NC_013008	TAT	2	6	5509231	5509236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16548	NC_013008	AAAAT	2	10	5509252	5509261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16549	NC_013008	TCCT	2	8	5509557	5509564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16550	NC_013008	CGCC	2	8	5512353	5512360	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16551	NC_013008	GCGG	2	8	5512366	5512373	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16552	NC_013008	GGAG	2	8	5513789	5513796	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
16553	NC_013008	TGA	2	6	5515035	5515040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16554	NC_013008	CGC	2	6	5515316	5515321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16555	NC_013008	TGA	3	9	5517033	5517041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16556	NC_013008	AGTAAA	2	12	5517104	5517115	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16557	NC_013008	A	6	6	5517113	5517118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16558	NC_013008	GCG	2	6	5519626	5519631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16559	NC_013008	CAG	2	6	5520259	5520264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16560	NC_013008	A	7	7	5520272	5520278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16561	NC_013008	CAA	2	6	5521813	5521818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16562	NC_013008	ATA	2	6	5521844	5521849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16563	NC_013008	T	6	6	5521853	5521858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16564	NC_013008	T	7	7	5521878	5521884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16565	NC_013008	TAG	2	6	5521887	5521892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16566	NC_013008	TTC	2	6	5524612	5524617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16567	NC_013008	CTG	2	6	5524636	5524641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16568	NC_013008	T	8	8	5526049	5526056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16569	NC_013008	GGT	2	6	5526060	5526065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16570	NC_013008	CCTG	2	8	5526845	5526852	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16571	NC_013008	ATGC	2	8	5526853	5526860	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16572	NC_013008	AT	3	6	5527073	5527078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16573	NC_013008	TGA	2	6	5527107	5527112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16574	NC_013008	ATC	2	6	5527114	5527119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16575	NC_013008	ATT	2	6	5527145	5527150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16576	NC_013008	TAA	2	6	5527152	5527157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16577	NC_013008	CAT	2	6	5527170	5527175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16578	NC_013008	TAA	2	6	5527181	5527186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16579	NC_013008	GTG	2	6	5527189	5527194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16580	NC_013008	ATTT	2	8	5527210	5527217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16581	NC_013008	T	6	6	5527215	5527220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16582	NC_013008	T	6	6	5527258	5527263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16583	NC_013008	T	6	6	5527304	5527309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16584	NC_013008	TAA	2	6	5527369	5527374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16585	NC_013008	AAG	2	6	5527411	5527416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16586	NC_013008	AGTA	2	8	5528123	5528130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.