MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Erwinia pyrifoliae Ep1/96 chromosome

Total Repeats: 12111

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_012214	GAA	2	6	3987133	3987138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_012214	TGA	2	6	3987181	3987186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12003	NC_012214	GAT	2	6	3987194	3987199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12004	NC_012214	ATG	2	6	3988863	3988868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12005	NC_012214	ACC	2	6	3989701	3989706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12006	NC_012214	TTC	2	6	3989725	3989730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12007	NC_012214	ATG	2	6	3989751	3989756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12008	NC_012214	CAAT	2	8	3989796	3989803	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12009	NC_012214	AAT	2	6	3989887	3989892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12010	NC_012214	ACTTAT	2	12	3990034	3990045	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12011	NC_012214	GTT	2	6	3990105	3990110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12012	NC_012214	CTT	2	6	3990113	3990118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12013	NC_012214	CGA	2	6	3990469	3990474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12014	NC_012214	CTGCT	2	10	3990541	3990550	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12015	NC_012214	AGGTG	2	10	3990723	3990732	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_012214	T	6	6	3994363	3994368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12017	NC_012214	GCAG	2	8	3994397	3994404	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12018	NC_012214	GC	3	6	3994419	3994424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12019	NC_012214	GCAA	2	8	3994484	3994491	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12020	NC_012214	TCA	2	6	3997056	3997061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12021	NC_012214	TTG	2	6	3997062	3997067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12022	NC_012214	CCGC	2	8	3997112	3997119	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12023	NC_012214	GGA	2	6	3997158	3997163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12024	NC_012214	AAT	2	6	3997318	3997323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12025	NC_012214	ATT	2	6	3997454	3997459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12026	NC_012214	ATT	2	6	3997523	3997528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12027	NC_012214	TTA	2	6	3997543	3997548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12028	NC_012214	AC	3	6	3997552	3997557	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12029	NC_012214	GTCG	2	8	3997564	3997571	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12030	NC_012214	T	6	6	3997572	3997577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12031	NC_012214	TCA	2	6	3998176	3998181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12032	NC_012214	GCG	2	6	3998246	3998251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12033	NC_012214	GAT	2	6	3998258	3998263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12034	NC_012214	GTTG	2	8	3998272	3998279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12035	NC_012214	CGA	2	6	3998324	3998329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12036	NC_012214	GCC	2	6	3998336	3998341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12037	NC_012214	T	7	7	4000096	4000102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12038	NC_012214	TGC	2	6	4001488	4001493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12039	NC_012214	CAGT	2	8	4001502	4001509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12040	NC_012214	ACC	2	6	4001511	4001516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12041	NC_012214	AATA	2	8	4001559	4001566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12042	NC_012214	T	6	6	4003815	4003820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12043	NC_012214	TCCT	2	8	4003841	4003848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12044	NC_012214	TCA	2	6	4003857	4003862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12045	NC_012214	AAT	2	6	4004351	4004356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12046	NC_012214	CT	3	6	4004530	4004535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12047	NC_012214	AGG	2	6	4004553	4004558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12048	NC_012214	TAA	2	6	4004625	4004630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12049	NC_012214	A	6	6	4004676	4004681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12050	NC_012214	TAA	2	6	4004729	4004734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12051	NC_012214	A	7	7	4004746	4004752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12052	NC_012214	A	7	7	4004792	4004798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_012214	A	7	7	4004834	4004840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12054	NC_012214	AAT	2	6	4004884	4004889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12055	NC_012214	CCA	2	6	4005392	4005397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12056	NC_012214	CGC	2	6	4006984	4006989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12057	NC_012214	ATA	2	6	4010005	4010010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12058	NC_012214	ATTA	2	8	4010039	4010046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12059	NC_012214	TGC	2	6	4010048	4010053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12060	NC_012214	ACC	2	6	4010126	4010131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12061	NC_012214	ACA	2	6	4010174	4010179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12062	NC_012214	CCG	2	6	4010187	4010192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12063	NC_012214	CAG	2	6	4010267	4010272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12064	NC_012214	A	6	6	4010276	4010281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12065	NC_012214	TGG	2	6	4010367	4010372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12066	NC_012214	GGC	2	6	4010375	4010380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12067	NC_012214	GAT	2	6	4010650	4010655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12068	NC_012214	A	6	6	4010728	4010733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12069	NC_012214	ACA	2	6	4010774	4010779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12070	NC_012214	ATA	2	6	4010807	4010812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12072	NC_012214	AAT	2	6	4010881	4010886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12073	NC_012214	A	6	6	4010891	4010896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12074	NC_012214	CA	3	6	4010898	4010903	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12075	NC_012214	TAAA	2	8	4010925	4010932	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12076	NC_012214	AAT	2	6	4010973	4010978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12077	NC_012214	AT	3	6	4010989	4010994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12078	NC_012214	CAC	2	6	4011479	4011484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12079	NC_012214	AGA	2	6	4011510	4011515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12080	NC_012214	ATA	2	6	4011585	4011590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12083	NC_012214	AG	3	6	4013743	4013748	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12084	NC_012214	ATT	2	6	4013754	4013759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12085	NC_012214	GCG	2	6	4013786	4013791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12086	NC_012214	ATGAA	2	10	4015203	4015212	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12087	NC_012214	TAC	2	6	4015237	4015242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12088	NC_012214	A	7	7	4015254	4015260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12089	NC_012214	CAG	2	6	4015348	4015353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12090	NC_012214	A	7	7	4015365	4015371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12091	NC_012214	CAGT	2	8	4015374	4015381	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12092	NC_012214	TGC	2	6	4015940	4015945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12093	NC_012214	CAT	2	6	4017460	4017465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12094	NC_012214	GCC	2	6	4018424	4018429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12095	NC_012214	CTCC	2	8	4020531	4020538	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
12096	NC_012214	ACG	2	6	4021056	4021061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12097	NC_012214	GTTT	2	8	4021367	4021374	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12098	NC_012214	AGT	2	6	4021387	4021392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12099	NC_012214	ATG	2	6	4022888	4022893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12100	NC_012214	ATA	2	6	4022896	4022901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12101	NC_012214	A	6	6	4022939	4022944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12102	NC_012214	A	8	8	4022999	4023006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12103	NC_012214	A	7	7	4023118	4023124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12104	NC_012214	T	6	6	4023231	4023236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12105	NC_012214	CAG	2	6	4023284	4023289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12106	NC_012214	GGT	2	6	4023339	4023344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12107	NC_012214	AGA	2	6	4025964	4025969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12108	NC_012214	T	6	6	4025972	4025977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12109	NC_012214	TCT	2	6	4026000	4026005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12110	NC_012214	CGA	2	6	4026014	4026019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12111	NC_012214	TTA	2	6	4026058	4026063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.