MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 14216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_009801	TAAA	2	8	4901902	4901909	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_009801	AG	3	6	4901911	4901916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_009801	TCT	2	6	4901944	4901949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_009801	TCA	2	6	4902072	4902077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_009801	ACA	2	6	4902194	4902199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_009801	GGT	2	6	4902284	4902289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_009801	A	6	6	4902330	4902335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_009801	TTTA	2	8	4902336	4902343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_009801	GTTT	2	8	4902536	4902543	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14010	NC_009801	A	6	6	4902627	4902632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_009801	AGCC	2	8	4902702	4902709	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14012	NC_009801	AAT	2	6	4902713	4902718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14013	NC_009801	ATA	2	6	4902744	4902749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_009801	TAA	2	6	4902808	4902813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14015	NC_009801	GGC	2	6	4902826	4902831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_009801	T	6	6	4902861	4902866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_009801	AT	3	6	4902902	4902907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_009801	ATG	2	6	4902928	4902933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_009801	TTA	3	9	4902938	4902946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14020	NC_009801	AT	3	6	4902967	4902972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_009801	TTA	2	6	4903016	4903021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_009801	AGA	2	6	4903056	4903061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_009801	TTA	2	6	4903081	4903086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_009801	TGC	2	6	4903105	4903110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14025	NC_009801	ATG	2	6	4903130	4903135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_009801	GAT	2	6	4905817	4905822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_009801	TACCT	2	10	4908253	4908262	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14028	NC_009801	GTT	2	6	4908272	4908277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_009801	TTG	2	6	4908313	4908318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_009801	TGC	2	6	4908363	4908368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_009801	GCA	2	6	4908374	4908379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_009801	GTT	2	6	4908504	4908509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14033	NC_009801	AAC	2	6	4908524	4908529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_009801	GC	3	6	4909787	4909792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14035	NC_009801	CTT	2	6	4909804	4909809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_009801	CT	3	6	4909821	4909826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14037	NC_009801	TTA	2	6	4912300	4912305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_009801	TAA	2	6	4912306	4912311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_009801	AAG	2	6	4912348	4912353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_009801	TTC	2	6	4912426	4912431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14042	NC_009801	GTG	2	6	4912522	4912527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_009801	TCA	2	6	4912533	4912538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14044	NC_009801	ATT	2	6	4912561	4912566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_009801	GAA	2	6	4912621	4912626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14047	NC_009801	AT	3	6	4912726	4912731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_009801	ATAA	2	8	4912828	4912835	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_009801	GCA	2	6	4912867	4912872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_009801	ACC	2	6	4912890	4912895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14051	NC_009801	AT	3	6	4912896	4912901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_009801	TGT	3	9	4912950	4912958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_009801	AGAT	2	8	4913092	4913099	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14055	NC_009801	GAAG	2	8	4913165	4913172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_009801	TAA	2	6	4913183	4913188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_009801	ATA	2	6	4913224	4913229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_009801	GTA	2	6	4913282	4913287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_009801	CATG	2	8	4913309	4913316	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14060	NC_009801	TGT	2	6	4913321	4913326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_009801	TGG	2	6	4913358	4913363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_009801	A	6	6	4913382	4913387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14064	NC_009801	TGCA	2	8	4913406	4913413	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14065	NC_009801	TTA	2	6	4913429	4913434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14067	NC_009801	TAT	2	6	4913525	4913530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_009801	ATA	2	6	4913551	4913556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_009801	AAAT	2	8	4913574	4913581	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14073	NC_009801	T	6	6	4913703	4913708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14077	NC_009801	TG	3	6	4917731	4917736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_009801	TAAA	2	8	4917798	4917805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_009801	A	6	6	4917803	4917808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_009801	TTGT	2	8	4919588	4919595	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_009801	TGT	2	6	4919602	4919607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_009801	TAA	2	6	4919616	4919621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14084	NC_009801	ATT	2	6	4922799	4922804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_009801	TC	4	8	4922832	4922839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14086	NC_009801	AACA	2	8	4925424	4925431	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14087	NC_009801	AGGC	2	8	4925492	4925499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14088	NC_009801	CTGC	2	8	4925540	4925547	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14089	NC_009801	ACAG	2	8	4925554	4925561	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14090	NC_009801	TCA	2	6	4925610	4925615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14093	NC_009801	GTGAT	2	10	4926034	4926043	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_009801	GCTG	2	8	4926100	4926107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14095	NC_009801	TCT	2	6	4926184	4926189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14096	NC_009801	CTG	2	6	4926194	4926199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14097	NC_009801	GTA	2	6	4926215	4926220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_009801	TGGC	2	8	4926232	4926239	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14099	NC_009801	AATCTG	2	12	4926314	4926325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14100	NC_009801	ACA	2	6	4926328	4926333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_009801	ATT	2	6	4926538	4926543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14102	NC_009801	AAT	2	6	4926586	4926591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14103	NC_009801	TA	3	6	4926608	4926613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_009801	GCC	2	6	4927214	4927219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14105	NC_009801	GGC	2	6	4927224	4927229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14106	NC_009801	CAT	2	6	4927230	4927235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14107	NC_009801	CT	3	6	4928200	4928205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14108	NC_009801	CCG	2	6	4928438	4928443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14109	NC_009801	TGCGT	2	10	4930664	4930673	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14110	NC_009801	GAG	2	6	4930676	4930681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_009801	CG	4	8	4930722	4930729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14112	NC_009801	CGT	2	6	4930802	4930807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14113	NC_009801	AAT	2	6	4930854	4930859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_009801	AAT	2	6	4930867	4930872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_009801	TTTCC	2	10	4930939	4930948	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14116	NC_009801	TAC	2	6	4934154	4934159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14117	NC_009801	TCC	2	6	4935197	4935202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14118	NC_009801	CAA	2	6	4935307	4935312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14119	NC_009801	A	6	6	4935311	4935316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14120	NC_009801	ATT	2	6	4936363	4936368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_009801	T	8	8	4936408	4936415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_009801	ATG	2	6	4936426	4936431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_009801	TCAG	2	8	4936482	4936489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14124	NC_009801	TGC	2	6	4938864	4938869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14125	NC_009801	A	7	7	4938882	4938888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_009801	TGT	2	6	4938894	4938899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14127	NC_009801	T	6	6	4938923	4938928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_009801	GA	3	6	4938989	4938994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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14130	NC_009801	GGA	2	6	4940920	4940925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.