MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 14216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009801	CATC	2	8	3413102	3413109	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10002	NC_009801	CTG	2	6	3413431	3413436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_009801	GAA	2	6	3414113	3414118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_009801	GAAT	2	8	3414179	3414186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_009801	CAT	2	6	3415146	3415151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_009801	CAA	2	6	3415281	3415286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_009801	ATC	2	6	3415503	3415508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_009801	CCATCA	2	12	3415510	3415521	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
10009	NC_009801	TCA	2	6	3415626	3415631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_009801	AAG	2	6	3415646	3415651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_009801	TCG	2	6	3415760	3415765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_009801	TAG	2	6	3416089	3416094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_009801	TA	3	6	3416153	3416158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_009801	A	6	6	3416251	3416256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_009801	ATT	2	6	3416276	3416281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_009801	A	6	6	3416293	3416298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_009801	TGT	2	6	3416335	3416340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_009801	CAC	2	6	3416466	3416471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10019	NC_009801	CAA	2	6	3416473	3416478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_009801	ACC	2	6	3416504	3416509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10021	NC_009801	ATC	2	6	3416529	3416534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_009801	AAACAA	2	12	3416562	3416573	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10023	NC_009801	A	7	7	3416617	3416623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_009801	TGG	2	6	3416673	3416678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_009801	CAG	2	6	3417844	3417849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_009801	AAT	2	6	3417905	3417910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_009801	CAT	2	6	3417930	3417935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_009801	TTCAT	2	10	3420848	3420857	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10029	NC_009801	TCT	2	6	3420871	3420876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_009801	TTC	2	6	3421805	3421810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_009801	CATT	2	8	3421811	3421818	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10032	NC_009801	AAT	2	6	3421833	3421838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_009801	GA	3	6	3422331	3422336	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_009801	CGTCAC	2	12	3422822	3422833	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10035	NC_009801	TTTCTC	2	12	3422856	3422867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10036	NC_009801	AGG	2	6	3422891	3422896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_009801	AGA	2	6	3423144	3423149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_009801	CCA	2	6	3423162	3423167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10039	NC_009801	AAT	2	6	3423584	3423589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_009801	CAC	2	6	3423613	3423618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_009801	TCAC	2	8	3424740	3424747	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10042	NC_009801	TTG	2	6	3425699	3425704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_009801	GGA	2	6	3425726	3425731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_009801	TGA	2	6	3425871	3425876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_009801	TTA	2	6	3425916	3425921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_009801	AAT	2	6	3425929	3425934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_009801	GCA	2	6	3425939	3425944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_009801	TGG	2	6	3425947	3425952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_009801	CTG	3	9	3425955	3425963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_009801	CA	3	6	3426043	3426048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10051	NC_009801	CCT	2	6	3426077	3426082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_009801	A	6	6	3427138	3427143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_009801	TGG	2	6	3427192	3427197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_009801	TA	3	6	3427243	3427248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_009801	CAC	2	6	3427272	3427277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_009801	A	6	6	3427341	3427346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_009801	ATGA	2	8	3436899	3436906	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_009801	AAT	2	6	3438319	3438324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_009801	TTA	2	6	3438333	3438338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_009801	GTT	2	6	3438370	3438375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_009801	GTT	2	6	3439198	3439203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_009801	TGT	2	6	3439204	3439209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_009801	TAA	2	6	3443903	3443908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_009801	A	6	6	3443930	3443935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_009801	TCT	2	6	3443968	3443973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10070	NC_009801	ATT	2	6	3444380	3444385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_009801	TTA	2	6	3446085	3446090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_009801	TAA	2	6	3446120	3446125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_009801	CGC	2	6	3446179	3446184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10074	NC_009801	TTG	2	6	3446277	3446282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_009801	TAC	2	6	3446365	3446370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_009801	T	7	7	3446413	3446419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_009801	TGT	2	6	3452830	3452835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_009801	TG	3	6	3452838	3452843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_009801	GC	3	6	3452857	3452862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10080	NC_009801	TTA	2	6	3452878	3452883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_009801	TTTTCG	2	12	3452891	3452902	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10082	NC_009801	T	8	8	3452931	3452938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_009801	CCTTG	2	10	3452951	3452960	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10084	NC_009801	AAT	2	6	3454995	3455000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10086	NC_009801	TAA	2	6	3455042	3455047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10088	NC_009801	AATA	2	8	3455072	3455079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_009801	TATT	2	8	3455081	3455088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_009801	CTT	3	9	3455164	3455172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_009801	AT	3	6	3455174	3455179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_009801	TAAAT	2	10	3455183	3455192	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_009801	A	6	6	3455211	3455216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_009801	ATT	2	6	3455226	3455231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_009801	TA	3	6	3455289	3455294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_009801	ATT	2	6	3455304	3455309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_009801	ATTTT	2	10	3455313	3455322	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_009801	T	6	6	3455333	3455338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_009801	GT	3	6	3457997	3458002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_009801	GTG	2	6	3459446	3459451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10102	NC_009801	ATC	2	6	3465203	3465208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10105	NC_009801	TGGA	2	8	3466083	3466090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_009801	ATTTAA	2	12	3466092	3466103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_009801	AT	3	6	3466106	3466111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_009801	T	6	6	3468434	3468439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_009801	CATT	2	8	3468482	3468489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10110	NC_009801	AAT	2	6	3468503	3468508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_009801	AT	3	6	3468534	3468539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_009801	ATGAA	2	10	3468546	3468555	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_009801	AT	3	6	3468567	3468572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_009801	ATT	2	6	3468606	3468611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_009801	ACA	2	6	3468636	3468641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_009801	TTG	2	6	3470546	3470551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10119	NC_009801	CGC	2	6	3471625	3471630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10120	NC_009801	TAT	2	6	3471687	3471692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_009801	CTGC	2	8	3471726	3471733	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10122	NC_009801	GGTT	2	8	3471863	3471870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_009801	AT	3	6	3479553	3479558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_009801	AAT	2	6	3479579	3479584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_009801	CGAT	2	8	3479586	3479593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10126	NC_009801	CA	3	6	3479605	3479610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10127	NC_009801	TAT	2	6	3479613	3479618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_009801	GCG	2	6	3479640	3479645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10130	NC_009801	TAAT	2	8	3479678	3479685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10253	NC_009801	TAT	2	6	3534309	3534314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10256	NC_009801	CTC	2	6	3540304	3540309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10257	NC_009801	A	6	6	3540331	3540336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10258	NC_009801	AGC	3	9	3540355	3540363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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