MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli JJ1886 plasmid pJJ1886_5

Total Repeats: 1886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022651	ATG	2	6	34145	34150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555228
502	NC_022651	TTA	2	6	34175	34180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555228
503	NC_022651	ATA	2	6	34296	34301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555229
504	NC_022651	GGCCT	2	10	34311	34320	0 %	20 %	40 %	40 %	556555229
505	NC_022651	TGG	2	6	34355	34360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555229
506	NC_022651	GTT	2	6	34440	34445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555229
507	NC_022651	GAGCA	2	10	34500	34509	40 %	0 %	40 %	20 %	556555229
508	NC_022651	GC	3	6	34511	34516	0 %	0 %	50 %	50 %	556555229
509	NC_022651	GGCG	2	8	34524	34531	0 %	0 %	75 %	25 %	556555229
510	NC_022651	TGA	2	6	34544	34549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555229
511	NC_022651	CTT	2	6	34566	34571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555229
512	NC_022651	GTT	2	6	34575	34580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555229
513	NC_022651	ACG	2	6	34620	34625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555229
514	NC_022651	GGA	2	6	34626	34631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555229
515	NC_022651	GA	3	6	34630	34635	50 %	0 %	50 %	0 %	556555229
516	NC_022651	CAGC	2	8	34841	34848	25 %	0 %	25 %	50 %	556555229
517	NC_022651	ATG	2	6	34909	34914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555229
518	NC_022651	CAG	2	6	35255	35260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555188
519	NC_022651	GGA	2	6	35383	35388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555188
520	NC_022651	AAG	2	6	35408	35413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555188
521	NC_022651	TGA	2	6	35497	35502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555188
522	NC_022651	TGG	2	6	35535	35540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555188
523	NC_022651	GGA	2	6	35577	35582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555188
524	NC_022651	CGT	2	6	35665	35670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555188
525	NC_022651	TCA	2	6	35680	35685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555188
526	NC_022651	TCA	2	6	35713	35718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555188
527	NC_022651	T	6	6	35995	36000	0 %	100 %	0 %	0 %	556555230
528	NC_022651	GAA	2	6	36139	36144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555230
529	NC_022651	ATG	2	6	36154	36159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555230
530	NC_022651	TAT	2	6	36191	36196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555230
531	NC_022651	CGC	2	6	36229	36234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555230
532	NC_022651	TGC	2	6	36324	36329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555230
533	NC_022651	CTG	2	6	36350	36355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555230
534	NC_022651	ACTT	2	8	36359	36366	25 %	50 %	0 %	25 %	556555230
535	NC_022651	GGA	2	6	36379	36384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555230
536	NC_022651	T	6	6	36402	36407	0 %	100 %	0 %	0 %	556555230
537	NC_022651	TGAA	2	8	36458	36465	50 %	25 %	25 %	0 %	556555230
538	NC_022651	ACG	2	6	36476	36481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555230
539	NC_022651	GCA	2	6	36502	36507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555230
540	NC_022651	CAA	2	6	36512	36517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555230
541	NC_022651	ACT	2	6	36543	36548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555230
542	NC_022651	CAA	2	6	36565	36570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555230
543	NC_022651	TGGA	2	8	36580	36587	25 %	25 %	50 %	0 %	556555230
544	NC_022651	GGCT	2	8	36630	36637	0 %	25 %	50 %	25 %	556555230
545	NC_022651	GCA	2	6	36691	36696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555230
546	NC_022651	ACG	2	6	36739	36744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555230
547	NC_022651	ACG	2	6	37911	37916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555231
548	NC_022651	ACG	2	6	38031	38036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555231
549	NC_022651	TGTT	2	8	38167	38174	0 %	75 %	25 %	0 %	556555231
550	NC_022651	GCG	2	6	38193	38198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555231
551	NC_022651	CG	3	6	38197	38202	0 %	0 %	50 %	50 %	556555231
552	NC_022651	GCA	2	6	38233	38238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555231
553	NC_022651	GTCG	2	8	38262	38269	0 %	25 %	50 %	25 %	556555231
554	NC_022651	GGTA	2	8	38306	38313	25 %	25 %	50 %	0 %	556555231
555	NC_022651	GTG	2	6	38416	38421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555231
556	NC_022651	GCA	2	6	38474	38479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555231
557	NC_022651	GCA	2	6	38501	38506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555231
558	NC_022651	CTTTA	2	10	38992	39001	20 %	60 %	0 %	20 %	556555232
559	NC_022651	TGA	2	6	39029	39034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555232
560	NC_022651	CT	4	8	39066	39073	0 %	50 %	0 %	50 %	556555232
561	NC_022651	TG	3	6	39131	39136	0 %	50 %	50 %	0 %	556555232
562	NC_022651	AGTC	2	8	39176	39183	25 %	25 %	25 %	25 %	556555232
563	NC_022651	TCTG	2	8	39241	39248	0 %	50 %	25 %	25 %	556555232
564	NC_022651	CTG	2	6	39515	39520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555233
565	NC_022651	TGT	2	6	39530	39535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555233
566	NC_022651	GCA	2	6	39559	39564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555233
567	NC_022651	GCCT	2	8	39603	39610	0 %	25 %	25 %	50 %	556555233
568	NC_022651	AGA	2	6	39624	39629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555233
569	NC_022651	TGGC	2	8	39660	39667	0 %	25 %	50 %	25 %	556555233
570	NC_022651	ATC	2	6	39668	39673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555233
571	NC_022651	CTG	2	6	39682	39687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555233
572	NC_022651	CAA	2	6	39688	39693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555233
573	NC_022651	GAAC	2	8	39698	39705	50 %	0 %	25 %	25 %	556555233
574	NC_022651	CCA	2	6	39761	39766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555233
575	NC_022651	ACC	2	6	39838	39843	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555233
576	NC_022651	CAG	2	6	39899	39904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555233
577	NC_022651	TCT	2	6	39907	39912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555233
578	NC_022651	CCG	2	6	39930	39935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555233
579	NC_022651	AAT	2	6	40046	40051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555233
580	NC_022651	AAT	2	6	40070	40075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555233
581	NC_022651	ATT	2	6	40118	40123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555189
582	NC_022651	GGT	2	6	40193	40198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555189
583	NC_022651	CTG	3	9	40199	40207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555189
584	NC_022651	TAA	2	6	40233	40238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555189
585	NC_022651	AAT	2	6	40257	40262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555189
586	NC_022651	T	6	6	40262	40267	0 %	100 %	0 %	0 %	556555189
587	NC_022651	TGA	2	6	40281	40286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555189
588	NC_022651	TGTTT	2	10	40315	40324	0 %	80 %	20 %	0 %	556555189
589	NC_022651	TTTA	2	8	40376	40383	25 %	75 %	0 %	0 %	556555234
590	NC_022651	G	6	6	40401	40406	0 %	0 %	100 %	0 %	556555234
591	NC_022651	TGT	2	6	40441	40446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555234
592	NC_022651	GCA	2	6	40469	40474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555234
593	NC_022651	TGT	2	6	40484	40489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555234
594	NC_022651	CCCGG	2	10	40512	40521	0 %	0 %	40 %	60 %	556555234
595	NC_022651	CATT	2	8	40538	40545	25 %	50 %	0 %	25 %	556555234
596	NC_022651	TCA	2	6	40637	40642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555234
597	NC_022651	ACC	2	6	40652	40657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555234
598	NC_022651	AAC	2	6	40761	40766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	556555234
599	NC_022651	CA	3	6	40784	40789	50 %	0 %	0 %	50 %	556555234
600	NC_022651	ATAA	2	8	40807	40814	75 %	25 %	0 %	0 %	556555234
601	NC_022651	AT	3	6	40825	40830	50 %	50 %	0 %	0 %	556555234
602	NC_022651	ATT	2	6	41036	41041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555235
603	NC_022651	GCT	2	6	41071	41076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555235
604	NC_022651	CTG	2	6	41137	41142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555235
605	NC_022651	C	6	6	41205	41210	0 %	0 %	0 %	100 %	556555235
606	NC_022651	T	6	6	41420	41425	0 %	100 %	0 %	0 %	556555236
607	NC_022651	TCA	2	6	41431	41436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555236
608	NC_022651	GGC	2	6	41471	41476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	556555236
609	NC_022651	CTT	2	6	41507	41512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555236
610	NC_022651	CCT	2	6	41513	41518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	556555236
611	NC_022651	GGCA	2	8	41558	41565	25 %	0 %	50 %	25 %	556555236
612	NC_022651	CA	3	6	41579	41584	50 %	0 %	0 %	50 %	556555236
613	NC_022651	T	6	6	41628	41633	0 %	100 %	0 %	0 %	556555236
614	NC_022651	GT	3	6	41708	41713	0 %	50 %	50 %	0 %	556555236
615	NC_022651	AAT	2	6	41722	41727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555236
616	NC_022651	CCA	2	6	41733	41738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	556555236
617	NC_022651	T	7	7	41814	41820	0 %	100 %	0 %	0 %	556555236
618	NC_022651	TGG	2	6	41883	41888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555236
619	NC_022651	GTG	2	6	41890	41895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555236
620	NC_022651	TGA	2	6	41900	41905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555236
621	NC_022651	T	6	6	42096	42101	0 %	100 %	0 %	0 %	556555237
622	NC_022651	GCC	2	6	42121	42126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	556555237
623	NC_022651	A	6	6	42135	42140	100 %	0 %	0 %	0 %	556555237
624	NC_022651	CAT	2	6	42212	42217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	556555237
625	NC_022651	TGG	2	6	42237	42242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	556555237
626	NC_022651	CT	3	6	42301	42306	0 %	50 %	0 %	50 %	556555237
627	NC_022651	GAA	2	6	42390	42395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555237
628	NC_022651	TCT	3	9	42461	42469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	556555237
629	NC_022651	CT	3	6	42503	42508	0 %	50 %	0 %	50 %	556555237
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749	NC_022651	A	6	6	49118	49123	100 %	0 %	0 %	0 %	556555241
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755	NC_022651	CCTGCC	2	12	49318	49329	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	556555241
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757	NC_022651	TTA	2	6	49368	49373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555241
758	NC_022651	AGA	2	6	49449	49454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	556555241
759	NC_022651	CCCT	2	8	49480	49487	0 %	25 %	0 %	75 %	556555242
760	NC_022651	C	6	6	49536	49541	0 %	0 %	0 %	100 %	556555242
761	NC_022651	TTA	2	6	49544	49549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555242
762	NC_022651	ACAT	2	8	49621	49628	50 %	25 %	0 %	25 %	556555242
763	NC_022651	ATT	2	6	49653	49658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	556555242
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767	NC_022651	AT	4	8	49764	49771	50 %	50 %	0 %	0 %	556555242
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772	NC_022651	TGA	2	6	49873	49878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	556555243
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789	NC_022651	TTCTG	2	10	50495	50504	0 %	60 %	20 %	20 %	556555244
790	NC_022651	CTG	2	6	50515	50520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	556555244
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873	NC_022651	AT	3	6	54990	54995	50 %	50 %	0 %	0 %	556555251
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877	NC_022651	AAT	2	6	55088	55093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	556555251
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879	NC_022651	AT	3	6	55151	55156	50 %	50 %	0 %	0 %	556555251
880	NC_022651	TTG	2	6	55167	55172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	556555251
881	NC_022651	T	6	6	55273	55278	0 %	100 %	0 %	0 %	556555252
882	NC_022651	CAG	2	6	55476	55481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	556555252
883	NC_022651	GGA	2	6	55482	55487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	556555252
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1000	NC_022651	T	7	7	61077	61083	0 %	100 %	0 %	0 %	556555258

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