MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 chromosome

Total Repeats: 94661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_018661	TTA	2	6	618360	618365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471148
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11004	NC_018661	GC	3	6	618457	618462	0 %	0 %	50 %	50 %	407471148
11005	NC_018661	TGA	2	6	618490	618495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471148
11006	NC_018661	TTG	3	9	618497	618505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471148
11007	NC_018661	GCA	2	6	618538	618543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471148
11008	NC_018661	TTC	2	6	618558	618563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471148
11009	NC_018661	CATT	2	8	618661	618668	25 %	50 %	0 %	25 %	407471148
11010	NC_018661	ACAG	2	8	618671	618678	50 %	0 %	25 %	25 %	407471148
11011	NC_018661	ATT	2	6	618700	618705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471148
11012	NC_018661	CGC	2	6	618713	618718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471148
11013	NC_018661	GAA	3	9	618766	618774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471148
11014	NC_018661	GCCA	2	8	618800	618807	25 %	0 %	25 %	50 %	407471148
11015	NC_018661	ACA	2	6	618882	618887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471148
11016	NC_018661	AAT	2	6	618905	618910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471148
11017	NC_018661	TTA	2	6	618915	618920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471148
11018	NC_018661	ATG	2	6	619017	619022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471148
11019	NC_018661	ACCCC	2	10	619074	619083	20 %	0 %	0 %	80 %	407471148
11020	NC_018661	AGG	2	6	619160	619165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407471147
11021	NC_018661	TC	3	6	619199	619204	0 %	50 %	0 %	50 %	407471147
11022	NC_018661	ATC	2	6	619251	619256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471147
11023	NC_018661	AAT	2	6	619340	619345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471147
11024	NC_018661	CTGG	2	8	619386	619393	0 %	25 %	50 %	25 %	407471147
11025	NC_018661	AG	3	6	619408	619413	50 %	0 %	50 %	0 %	407471147
11026	NC_018661	GCA	2	6	619418	619423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471147
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11033	NC_018661	CTT	2	6	619742	619747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471147
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11039	NC_018661	TCT	2	6	620089	620094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471147
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11042	NC_018661	GCC	2	6	620163	620168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471147
11043	NC_018661	GGT	2	6	620169	620174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471147
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11052	NC_018661	GAT	2	6	621110	621115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471146
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11054	NC_018661	CCA	2	6	621245	621250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471146
11055	NC_018661	GTGCT	2	10	621256	621265	0 %	40 %	40 %	20 %	407471146
11056	NC_018661	CGT	2	6	621408	621413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471146
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11118	NC_018661	CGT	2	6	624174	624179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471144
11119	NC_018661	TGC	2	6	624224	624229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471144
11120	NC_018661	CG	4	8	624238	624245	0 %	0 %	50 %	50 %	407471144
11121	NC_018661	CAT	2	6	624257	624262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471144
11122	NC_018661	CT	3	6	624287	624292	0 %	50 %	0 %	50 %	407471144
11123	NC_018661	GCGG	2	8	624333	624340	0 %	0 %	75 %	25 %	407471144
11124	NC_018661	CGC	2	6	624416	624421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471144
11125	NC_018661	GTG	2	6	624442	624447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471144
11126	NC_018661	GTT	2	6	624474	624479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471144
11127	NC_018661	CGA	2	6	624485	624490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471144
11128	NC_018661	GCG	2	6	624534	624539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471144
11129	NC_018661	GGT	3	9	624548	624556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471144
11130	NC_018661	GAAC	2	8	624605	624612	50 %	0 %	25 %	25 %	407471144
11131	NC_018661	CTG	2	6	624702	624707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471144
11132	NC_018661	CTG	2	6	624717	624722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471144
11133	NC_018661	GCGGT	2	10	624769	624778	0 %	20 %	60 %	20 %	407471144
11134	NC_018661	TCCT	2	8	624786	624793	0 %	50 %	0 %	50 %	407471144
11135	NC_018661	TG	3	6	624865	624870	0 %	50 %	50 %	0 %	407471144
11136	NC_018661	GTCC	2	8	624934	624941	0 %	25 %	25 %	50 %	407471144
11137	NC_018661	TGA	2	6	624986	624991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471144
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11142	NC_018661	GCG	2	6	625281	625286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471144
11143	NC_018661	ACGT	2	8	625312	625319	25 %	25 %	25 %	25 %	407471144
11144	NC_018661	TAC	2	6	625371	625376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471144
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11149	NC_018661	TAT	2	6	625905	625910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471143
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11153	NC_018661	CTG	2	6	626152	626157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471143
11154	NC_018661	CTT	2	6	626196	626201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471143
11155	NC_018661	CT	3	6	626211	626216	0 %	50 %	0 %	50 %	407471143
11156	NC_018661	GAA	2	6	626269	626274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471143
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11169	NC_018661	GC	3	6	626757	626762	0 %	0 %	50 %	50 %	407471142
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11222	NC_018661	GTC	2	6	629129	629134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471140
11223	NC_018661	GCG	2	6	629144	629149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471140
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11227	NC_018661	CGA	2	6	629367	629372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471140
11228	NC_018661	CTGCA	2	10	629426	629435	20 %	20 %	20 %	40 %	407471140
11229	NC_018661	CGC	2	6	629546	629551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471140
11230	NC_018661	GGC	2	6	629632	629637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471140
11231	NC_018661	GAA	2	6	629659	629664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471140
11232	NC_018661	ATCGAA	2	12	629677	629688	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	407471140
11233	NC_018661	CGAC	2	8	629714	629721	25 %	0 %	25 %	50 %	407471140
11234	NC_018661	TCG	2	6	629745	629750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471140
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11236	NC_018661	CGG	3	9	629841	629849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471140
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11353	NC_018661	CAAT	2	8	635447	635454	50 %	25 %	0 %	25 %	407471136
11354	NC_018661	GCA	2	6	635464	635469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471136
11355	NC_018661	GCCA	2	8	635500	635507	25 %	0 %	25 %	50 %	407471136
11356	NC_018661	GAT	2	6	635513	635518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471136
11357	NC_018661	GA	3	6	635550	635555	50 %	0 %	50 %	0 %	407471136
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11362	NC_018661	GCA	2	6	636133	636138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471135
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11364	NC_018661	AGC	2	6	636183	636188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471135
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11366	NC_018661	CAT	2	6	636325	636330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471135
11367	NC_018661	CGA	2	6	636390	636395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471135
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11372	NC_018661	TGC	2	6	636603	636608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471135
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11473	NC_018661	TGC	2	6	642017	642022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471127
11474	NC_018661	TGG	2	6	642065	642070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471127
11475	NC_018661	CGG	2	6	642090	642095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471127
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11477	NC_018661	GCT	2	6	642224	642229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471126
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11499	NC_018661	GCCGC	2	10	643589	643598	0 %	0 %	40 %	60 %	407471124
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