MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 chromosome

Total Repeats: 94661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_018661	GCC	2	6	287746	287751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471476
5003	NC_018661	TGC	2	6	287810	287815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471476
5004	NC_018661	GCA	2	6	287825	287830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471476
5005	NC_018661	ATC	2	6	287831	287836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471476
5006	NC_018661	TAA	2	6	287853	287858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471476
5007	NC_018661	AG	3	6	287969	287974	50 %	0 %	50 %	0 %	407471476
5008	NC_018661	TGCC	2	8	288048	288055	0 %	25 %	25 %	50 %	407471476
5009	NC_018661	ACC	2	6	288074	288079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471476
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5011	NC_018661	GTT	2	6	288145	288150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471476
5012	NC_018661	AAG	2	6	288158	288163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471476
5013	NC_018661	ACC	2	6	288203	288208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471476
5014	NC_018661	AGA	2	6	288282	288287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471476
5015	NC_018661	GAC	2	6	288295	288300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471476
5016	NC_018661	GA	3	6	288305	288310	50 %	0 %	50 %	0 %	407471476
5017	NC_018661	ATC	2	6	288368	288373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471476
5018	NC_018661	ACA	2	6	288396	288401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471476
5019	NC_018661	CCCCG	2	10	288496	288505	0 %	0 %	20 %	80 %	407471476
5020	NC_018661	CGG	2	6	288634	288639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471476
5021	NC_018661	GCTG	2	8	288658	288665	0 %	25 %	50 %	25 %	407471476
5022	NC_018661	TCAGG	2	10	288720	288729	20 %	20 %	40 %	20 %	407471476
5023	NC_018661	CAG	2	6	288808	288813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471476
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5025	NC_018661	GCA	2	6	288860	288865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471476
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5027	NC_018661	GTA	2	6	288949	288954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471476
5028	NC_018661	A	6	6	288979	288984	100 %	0 %	0 %	0 %	407471476
5029	NC_018661	TGC	2	6	289007	289012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471476
5030	NC_018661	GTT	2	6	289028	289033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471476
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5032	NC_018661	TTC	3	9	289362	289370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471475
5033	NC_018661	TGG	2	6	289456	289461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471475
5034	NC_018661	ACC	2	6	289471	289476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471475
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5036	NC_018661	ATG	2	6	289590	289595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471475
5037	NC_018661	AGT	2	6	289664	289669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471475
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5039	NC_018661	ATT	2	6	290201	290206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471474
5040	NC_018661	GC	3	6	290241	290246	0 %	0 %	50 %	50 %	407471474
5041	NC_018661	TCA	2	6	290253	290258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471474
5042	NC_018661	CG	3	6	290262	290267	0 %	0 %	50 %	50 %	407471474
5043	NC_018661	T	6	6	290328	290333	0 %	100 %	0 %	0 %	407471474
5044	NC_018661	CCAAC	2	10	290345	290354	40 %	0 %	0 %	60 %	407471474
5045	NC_018661	ATC	2	6	290401	290406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471474
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5049	NC_018661	TGG	3	9	290479	290487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471474
5050	NC_018661	TGA	2	6	290503	290508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471474
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5053	NC_018661	ACC	2	6	290711	290716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471473
5054	NC_018661	AGA	2	6	290731	290736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471473
5055	NC_018661	AGT	2	6	290749	290754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471473
5056	NC_018661	GCC	2	6	290798	290803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471473
5057	NC_018661	GCCA	2	8	290883	290890	25 %	0 %	25 %	50 %	407471473
5058	NC_018661	ATC	2	6	290891	290896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471473
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5064	NC_018661	GTTGC	2	10	291189	291198	0 %	40 %	40 %	20 %	407471473
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5072	NC_018661	ACGCC	2	10	291423	291432	20 %	0 %	20 %	60 %	407471473
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5110	NC_018661	G	6	6	293445	293450	0 %	0 %	100 %	0 %	407471472
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5247	NC_018661	TTTC	2	8	300092	300099	0 %	75 %	0 %	25 %	407471466
5248	NC_018661	TCCGCC	2	12	300141	300152	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	407471466
5249	NC_018661	TCA	2	6	300159	300164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471466
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5251	NC_018661	T	6	6	300227	300232	0 %	100 %	0 %	0 %	407471466
5252	NC_018661	GT	3	6	300240	300245	0 %	50 %	50 %	0 %	407471466
5253	NC_018661	CTT	2	6	300382	300387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471466
5254	NC_018661	CCG	2	6	300388	300393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471466
5255	NC_018661	AT	3	6	300411	300416	50 %	50 %	0 %	0 %	407471466
5256	NC_018661	CGC	2	6	300469	300474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471466
5257	NC_018661	CTGC	2	8	300520	300527	0 %	25 %	25 %	50 %	407471466
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5259	NC_018661	AT	3	6	300654	300659	50 %	50 %	0 %	0 %	407471466
5260	NC_018661	CTT	2	6	300671	300676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471466
5261	NC_018661	GT	3	6	300703	300708	0 %	50 %	50 %	0 %	407471466
5262	NC_018661	TCA	2	6	300733	300738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471466
5263	NC_018661	CAT	2	6	300754	300759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471466
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5267	NC_018661	GCT	2	6	301022	301027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471466
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5270	NC_018661	GAC	2	6	301150	301155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471466
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5272	NC_018661	CAG	2	6	301241	301246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471466
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5275	NC_018661	TTC	2	6	301367	301372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471466
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5277	NC_018661	T	6	6	301540	301545	0 %	100 %	0 %	0 %	407471465
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5280	NC_018661	CATCAG	2	12	301708	301719	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407471465
5281	NC_018661	ATC	2	6	301787	301792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471465
5282	NC_018661	ATC	2	6	301890	301895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471465
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5311	NC_018661	GGCTGA	2	12	305319	305330	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407471461
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5318	NC_018661	TGC	2	6	305606	305611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471461
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5332	NC_018661	TCATTT	2	12	306630	306641	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	407471460
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5336	NC_018661	CAT	2	6	307018	307023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471459
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5354	NC_018661	CTG	2	6	308525	308530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471458
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5363	NC_018661	ATC	2	6	308807	308812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471458
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5489	NC_018661	ATT	2	6	316149	316154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471453
5490	NC_018661	GCC	2	6	316158	316163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471453
5491	NC_018661	A	7	7	316191	316197	100 %	0 %	0 %	0 %	407471453
5492	NC_018661	CCTGAA	2	12	316204	316215	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	407471453
5493	NC_018661	A	6	6	316298	316303	100 %	0 %	0 %	0 %	407471452
5494	NC_018661	TGAT	2	8	316362	316369	25 %	50 %	25 %	0 %	407471452
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5497	NC_018661	GAAA	2	8	316480	316487	75 %	0 %	25 %	0 %	407471452
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