MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 chromosome

Total Repeats: 93905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_018658	TGG	2	6	1008501	1008506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407480559
18003	NC_018658	GAT	2	6	1008520	1008525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480559
18004	NC_018658	CGA	2	6	1008550	1008555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480559
18005	NC_018658	CAT	2	6	1008557	1008562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407480559
18006	NC_018658	GTAC	2	8	1008566	1008573	25 %	25 %	25 %	25 %	407480559
18007	NC_018658	TCG	2	6	1008609	1008614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480559
18008	NC_018658	CTG	2	6	1008653	1008658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480559
18009	NC_018658	CTA	2	6	1008751	1008756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407480559
18010	NC_018658	TTC	2	6	1008770	1008775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407480559
18011	NC_018658	GTT	2	6	1008782	1008787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407480559
18012	NC_018658	TGA	2	6	1008865	1008870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480559
18013	NC_018658	ATG	2	6	1008930	1008935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480559
18014	NC_018658	GGCG	2	8	1008982	1008989	0 %	0 %	75 %	25 %	407480559
18015	NC_018658	CCA	2	6	1009002	1009007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407480559
18016	NC_018658	TGG	2	6	1009080	1009085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407480559
18017	NC_018658	GC	3	6	1009113	1009118	0 %	0 %	50 %	50 %	407480559
18018	NC_018658	GCC	2	6	1009190	1009195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480559
18019	NC_018658	TGGT	2	8	1009290	1009297	0 %	50 %	50 %	0 %	407480559
18020	NC_018658	TGA	2	6	1009302	1009307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480559
18021	NC_018658	TGC	2	6	1009320	1009325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480559
18022	NC_018658	CAG	2	6	1009580	1009585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480560
18023	NC_018658	AAG	2	6	1009622	1009627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407480560
18024	NC_018658	TTG	2	6	1009691	1009696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407480560
18025	NC_018658	GCG	2	6	1009762	1009767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480560
18026	NC_018658	ACG	2	6	1009811	1009816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480560
18027	NC_018658	CTG	2	6	1009912	1009917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480560
18028	NC_018658	AGA	2	6	1009944	1009949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407480560
18029	NC_018658	GCG	2	6	1010106	1010111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480561
18030	NC_018658	CGGAC	2	10	1010131	1010140	20 %	0 %	40 %	40 %	407480561
18031	NC_018658	CGC	2	6	1010238	1010243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480561
18032	NC_018658	CGC	2	6	1010269	1010274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480561
18033	NC_018658	CCG	2	6	1010343	1010348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480561
18034	NC_018658	CCG	2	6	1010357	1010362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480561
18035	NC_018658	GCC	2	6	1010439	1010444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480561
18036	NC_018658	CAG	2	6	1010465	1010470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480561
18037	NC_018658	GACTG	2	10	1010485	1010494	20 %	20 %	40 %	20 %	407480561
18038	NC_018658	CTTCT	2	10	1010508	1010517	0 %	60 %	0 %	40 %	407480561
18039	NC_018658	GCC	2	6	1010534	1010539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480561
18040	NC_018658	ATGGCG	2	12	1010546	1010557	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	407480561
18041	NC_018658	CTT	2	6	1010590	1010595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407480561
18042	NC_018658	CAG	2	6	1010726	1010731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480561
18043	NC_018658	TTA	2	6	1010769	1010774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407480561
18044	NC_018658	CGC	2	6	1010809	1010814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480561
18045	NC_018658	CTT	2	6	1010929	1010934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407480561
18046	NC_018658	GCG	2	6	1010936	1010941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480561
18047	NC_018658	TAT	2	6	1010974	1010979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407480561
18048	NC_018658	TGC	2	6	1011090	1011095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480561
18049	NC_018658	GGC	2	6	1011187	1011192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480561
18050	NC_018658	CAA	2	6	1011200	1011205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407480561
18051	NC_018658	TG	4	8	1011246	1011253	0 %	50 %	50 %	0 %	407480561
18052	NC_018658	TGA	2	6	1011346	1011351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480561
18053	NC_018658	AAC	2	6	1011352	1011357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407480561
18054	NC_018658	TGC	2	6	1011390	1011395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480561
18055	NC_018658	TGC	2	6	1011474	1011479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480561
18056	NC_018658	CGA	3	9	1011481	1011489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480561
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18058	NC_018658	GAT	2	6	1011589	1011594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480561
18059	NC_018658	CGC	3	9	1011625	1011633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480561
18060	NC_018658	GAT	2	6	1011637	1011642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480561
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18062	NC_018658	CAG	2	6	1011710	1011715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480561
18063	NC_018658	GCTG	2	8	1011727	1011734	0 %	25 %	50 %	25 %	407480561
18064	NC_018658	CTGG	2	8	1011736	1011743	0 %	25 %	50 %	25 %	407480561
18065	NC_018658	ACG	2	6	1011759	1011764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480561
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18068	NC_018658	CTGA	2	8	1011968	1011975	25 %	25 %	25 %	25 %	407480561
18069	NC_018658	GC	3	6	1011979	1011984	0 %	0 %	50 %	50 %	407480561
18070	NC_018658	GGCG	2	8	1011997	1012004	0 %	0 %	75 %	25 %	407480561
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18084	NC_018658	CGGG	2	8	1013247	1013254	0 %	0 %	75 %	25 %	407480562
18085	NC_018658	AAG	2	6	1013276	1013281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407480562
18086	NC_018658	TGA	2	6	1013333	1013338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480562
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18088	NC_018658	CGA	2	6	1013391	1013396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480562
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18097	NC_018658	TTTA	2	8	1013770	1013777	25 %	75 %	0 %	0 %	407480562
18098	NC_018658	GCG	3	9	1013795	1013803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480562
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18102	NC_018658	GGCG	2	8	1013937	1013944	0 %	0 %	75 %	25 %	407480562
18103	NC_018658	CTT	2	6	1014060	1014065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407480563
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18105	NC_018658	GT	3	6	1014179	1014184	0 %	50 %	50 %	0 %	407480563
18106	NC_018658	T	6	6	1014219	1014224	0 %	100 %	0 %	0 %	407480563
18107	NC_018658	GC	3	6	1014241	1014246	0 %	0 %	50 %	50 %	407480563
18108	NC_018658	GTC	2	6	1014264	1014269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480563
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18111	NC_018658	ATCGC	2	10	1014454	1014463	20 %	20 %	20 %	40 %	407480563
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18113	NC_018658	ACATC	2	10	1014674	1014683	40 %	20 %	0 %	40 %	407480563
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18115	NC_018658	GCA	2	6	1014803	1014808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480563
18116	NC_018658	AGC	2	6	1014860	1014865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480563
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18231	NC_018658	TGT	2	6	1020336	1020341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407480571
18232	NC_018658	GAT	2	6	1020350	1020355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480571
18233	NC_018658	GAT	2	6	1020460	1020465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480571
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18463	NC_018658	ATA	2	6	1033307	1033312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407480582
18464	NC_018658	TAA	2	6	1033315	1033320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407480582
18465	NC_018658	CCTAAA	2	12	1033421	1033432	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	407480582
18466	NC_018658	TGA	2	6	1033476	1033481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480582
18467	NC_018658	GAA	2	6	1033561	1033566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407480582
18468	NC_018658	GCC	2	6	1033567	1033572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480582
18469	NC_018658	ATC	2	6	1033574	1033579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407480582
18470	NC_018658	AAAC	2	8	1033582	1033589	75 %	0 %	0 %	25 %	407480582
18471	NC_018658	ATT	2	6	1033663	1033668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407480582
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18474	NC_018658	ACC	2	6	1033856	1033861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407480582
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18481	NC_018658	TCC	2	6	1034122	1034127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407480582
18482	NC_018658	ATC	2	6	1034168	1034173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407480582
18483	NC_018658	TAA	2	6	1034202	1034207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407480582
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18485	NC_018658	TGC	3	9	1034322	1034330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480582
18486	NC_018658	TGAC	2	8	1034364	1034371	25 %	25 %	25 %	25 %	407480582
18487	NC_018658	CGA	2	6	1034394	1034399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480582
18488	NC_018658	ATC	2	6	1034444	1034449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407480582
18489	NC_018658	GTT	2	6	1034471	1034476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407480582
18490	NC_018658	GCC	2	6	1034495	1034500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480582
18491	NC_018658	TGA	2	6	1034573	1034578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480582
18492	NC_018658	AGGG	2	8	1034580	1034587	25 %	0 %	75 %	0 %	407480582
18493	NC_018658	TCC	2	6	1034591	1034596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407480582
18494	NC_018658	T	6	6	1034810	1034815	0 %	100 %	0 %	0 %	407480583
18495	NC_018658	GCAT	2	8	1034871	1034878	25 %	25 %	25 %	25 %	407480583
18496	NC_018658	TCG	2	6	1034962	1034967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480583
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18499	NC_018658	ACG	2	6	1035361	1035366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480583
18500	NC_018658	GC	3	6	1035413	1035418	0 %	0 %	50 %	50 %	407480583

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