MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 chromosome

Total Repeats: 93905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_018658	GCC	2	6	560969	560974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480129
10002	NC_018658	GCG	2	6	561286	561291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480130
10003	NC_018658	AGA	2	6	561402	561407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407480130
10004	NC_018658	ATT	2	6	561412	561417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407480130
10005	NC_018658	ACA	2	6	561431	561436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407480130
10006	NC_018658	GTGC	2	8	561454	561461	0 %	25 %	50 %	25 %	407480130
10007	NC_018658	GTG	2	6	561467	561472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407480130
10008	NC_018658	A	6	6	561473	561478	100 %	0 %	0 %	0 %	407480130
10009	NC_018658	CTG	2	6	561508	561513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480130
10010	NC_018658	GCG	2	6	561535	561540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480130
10011	NC_018658	GTG	2	6	561560	561565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407480130
10012	NC_018658	GCGTC	2	10	561666	561675	0 %	20 %	40 %	40 %	407480130
10013	NC_018658	AAG	2	6	561710	561715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407480130
10014	NC_018658	GCG	2	6	561731	561736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480130
10015	NC_018658	AATT	2	8	561743	561750	50 %	50 %	0 %	0 %	407480130
10016	NC_018658	GGC	2	6	561777	561782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480130
10017	NC_018658	GAA	2	6	561826	561831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407480130
10018	NC_018658	AACGCG	2	12	561839	561850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480130
10019	NC_018658	GGC	3	9	561859	561867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480130
10020	NC_018658	TTC	2	6	561886	561891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407480130
10021	NC_018658	AAG	2	6	561935	561940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407480130
10022	NC_018658	TGC	2	6	561975	561980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480130
10023	NC_018658	GTA	2	6	562000	562005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480130
10024	NC_018658	CCG	2	6	562074	562079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480130
10025	NC_018658	TGG	2	6	562115	562120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407480130
10026	NC_018658	TGA	2	6	562143	562148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480130
10027	NC_018658	TGA	2	6	562185	562190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480130
10028	NC_018658	GCCAG	2	10	562200	562209	20 %	0 %	40 %	40 %	407480130
10029	NC_018658	CG	3	6	562266	562271	0 %	0 %	50 %	50 %	407480130
10030	NC_018658	TGC	2	6	562355	562360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480130
10031	NC_018658	ATT	2	6	562384	562389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407480130
10032	NC_018658	TGG	2	6	562425	562430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407480130
10033	NC_018658	GCA	2	6	562557	562562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480130
10034	NC_018658	AAG	2	6	562619	562624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407480130
10035	NC_018658	GCCA	2	8	562649	562656	25 %	0 %	25 %	50 %	407480130
10036	NC_018658	TAA	2	6	562696	562701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407480130
10037	NC_018658	CAA	2	6	562876	562881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407480131
10038	NC_018658	AAT	2	6	562882	562887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407480131
10039	NC_018658	TA	3	6	562942	562947	50 %	50 %	0 %	0 %	407480131
10040	NC_018658	CTGA	2	8	562969	562976	25 %	25 %	25 %	25 %	407480131
10041	NC_018658	GCA	2	6	562984	562989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480131
10042	NC_018658	CCG	2	6	563059	563064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480131
10043	NC_018658	CGG	2	6	563209	563214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480131
10044	NC_018658	TG	3	6	563235	563240	0 %	50 %	50 %	0 %	407480131
10045	NC_018658	CAC	2	6	563261	563266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407480131
10046	NC_018658	CGG	2	6	563286	563291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480131
10047	NC_018658	CAC	2	6	563330	563335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407480131
10048	NC_018658	GAA	2	6	563457	563462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407480131
10049	NC_018658	ACG	2	6	563543	563548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480131
10050	NC_018658	GTA	2	6	563558	563563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480131
10051	NC_018658	TGC	2	6	563590	563595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480131
10052	NC_018658	CTGA	2	8	563651	563658	25 %	25 %	25 %	25 %	407480131
10053	NC_018658	GGC	3	9	563687	563695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480131
10054	NC_018658	ACT	2	6	563715	563720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407480131
10055	NC_018658	ATT	2	6	563754	563759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407480131
10056	NC_018658	GTTT	2	8	563942	563949	0 %	75 %	25 %	0 %	407480132
10057	NC_018658	GTG	2	6	563959	563964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407480132
10058	NC_018658	T	6	6	563989	563994	0 %	100 %	0 %	0 %	407480132
10059	NC_018658	CTGG	2	8	564021	564028	0 %	25 %	50 %	25 %	407480132
10060	NC_018658	GTT	2	6	564081	564086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407480132
10061	NC_018658	TGC	2	6	564103	564108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480132
10062	NC_018658	TAA	2	6	564159	564164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407480133
10063	NC_018658	CG	3	6	564268	564273	0 %	0 %	50 %	50 %	407480133
10064	NC_018658	CGT	2	6	564286	564291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480133
10065	NC_018658	A	6	6	564356	564361	100 %	0 %	0 %	0 %	407480133
10066	NC_018658	TTA	2	6	564433	564438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407480133
10067	NC_018658	AGG	2	6	564465	564470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407480133
10068	NC_018658	CGT	2	6	564476	564481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480133
10069	NC_018658	AAC	2	6	564530	564535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407480133
10070	NC_018658	TAC	2	6	564537	564542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407480133
10071	NC_018658	CG	3	6	564620	564625	0 %	0 %	50 %	50 %	407480133
10072	NC_018658	CAG	2	6	564627	564632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480133
10073	NC_018658	TTA	2	6	564672	564677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407480133
10074	NC_018658	CGG	2	6	564690	564695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480133
10075	NC_018658	GAA	2	6	564740	564745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407480133
10076	NC_018658	CGC	2	6	564789	564794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480133
10077	NC_018658	CAG	2	6	564856	564861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480133
10078	NC_018658	GAC	2	6	564869	564874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480133
10079	NC_018658	CAC	2	6	564982	564987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407480133
10080	NC_018658	GTG	2	6	564995	565000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407480133
10081	NC_018658	CGA	2	6	565021	565026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480133
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10083	NC_018658	TGTT	2	8	565160	565167	0 %	75 %	25 %	0 %	407480134
10084	NC_018658	GCG	2	6	565213	565218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480134
10085	NC_018658	TTG	2	6	565220	565225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407480134
10086	NC_018658	CCG	2	6	565226	565231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480134
10087	NC_018658	TGC	2	6	565242	565247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480134
10088	NC_018658	CAT	2	6	565296	565301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407480134
10089	NC_018658	ATC	2	6	565336	565341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407480134
10090	NC_018658	GAT	2	6	565347	565352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480134
10091	NC_018658	ATT	2	6	565362	565367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407480134
10092	NC_018658	GAT	2	6	565368	565373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480134
10093	NC_018658	CGC	2	6	565511	565516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407480134
10094	NC_018658	TG	4	8	565557	565564	0 %	50 %	50 %	0 %	407480134
10095	NC_018658	CGAT	2	8	565594	565601	25 %	25 %	25 %	25 %	407480134
10096	NC_018658	AAG	2	6	565607	565612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407480134
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10098	NC_018658	GCA	2	6	565748	565753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480134
10099	NC_018658	CGCTGA	2	12	565820	565831	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407480134
10100	NC_018658	CTTAT	2	10	565850	565859	20 %	60 %	0 %	20 %	407480134
10101	NC_018658	T	6	6	565903	565908	0 %	100 %	0 %	0 %	407480134
10102	NC_018658	AGC	2	6	565943	565948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480134
10103	NC_018658	CGG	2	6	566021	566026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480134
10104	NC_018658	GCG	2	6	566051	566056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480134
10105	NC_018658	GAA	2	6	566086	566091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407480134
10106	NC_018658	TCA	2	6	566139	566144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407480134
10107	NC_018658	GTG	2	6	566228	566233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407480134
10108	NC_018658	TGA	2	6	566240	566245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407480134
10109	NC_018658	TGG	2	6	566291	566296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407480134
10110	NC_018658	GCT	2	6	566340	566345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480134
10111	NC_018658	TGC	2	6	566387	566392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480134
10112	NC_018658	TCAG	2	8	566522	566529	25 %	25 %	25 %	25 %	407480134
10113	NC_018658	TCG	2	6	566555	566560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480134
10114	NC_018658	TG	3	6	566563	566568	0 %	50 %	50 %	0 %	407480134
10115	NC_018658	CG	3	6	566606	566611	0 %	0 %	50 %	50 %	407480134
10116	NC_018658	GTTT	2	8	566640	566647	0 %	75 %	25 %	0 %	407480134
10117	NC_018658	CGT	2	6	566683	566688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480134
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10119	NC_018658	CAG	2	6	566716	566721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480134
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10358	NC_018658	GAC	2	6	580856	580861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407480150
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10362	NC_018658	CGT	2	6	580950	580955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407480150
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10452	NC_018658	CCAG	2	8	585330	585337	25 %	0 %	25 %	50 %	407480156
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10461	NC_018658	GTAC	2	8	585641	585648	25 %	25 %	25 %	25 %	407480156
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10466	NC_018658	CGG	2	6	585752	585757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407480156
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