MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 93411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_017656	CGGA	2	8	215728	215735	25 %	0 %	50 %	25 %	387505115
4003	NC_017656	GC	3	6	215754	215759	0 %	0 %	50 %	50 %	387505115
4004	NC_017656	TGG	2	6	215846	215851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387505115
4005	NC_017656	TTG	2	6	215935	215940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387505115
4006	NC_017656	CGA	2	6	215973	215978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505115
4007	NC_017656	CTG	2	6	215995	216000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505115
4008	NC_017656	TTGC	2	8	216085	216092	0 %	50 %	25 %	25 %	387505115
4009	NC_017656	G	6	6	216101	216106	0 %	0 %	100 %	0 %	387505115
4010	NC_017656	GAC	2	6	216166	216171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505115
4011	NC_017656	CTGCGC	2	12	216190	216201	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	387505115
4012	NC_017656	GCA	2	6	216216	216221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505115
4013	NC_017656	AAC	2	6	216243	216248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387505115
4014	NC_017656	AG	3	6	216279	216284	50 %	0 %	50 %	0 %	387505115
4015	NC_017656	CTG	2	6	216286	216291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505115
4016	NC_017656	CTG	2	6	216298	216303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505115
4017	NC_017656	GAT	2	6	216307	216312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387505115
4018	NC_017656	CGC	2	6	216329	216334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505115
4019	NC_017656	CGC	2	6	216379	216384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505115
4020	NC_017656	GCG	2	6	216385	216390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505115
4021	NC_017656	CCG	2	6	216396	216401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505115
4022	NC_017656	CTGG	2	8	216402	216409	0 %	25 %	50 %	25 %	387505115
4023	NC_017656	TGGCGC	2	12	216467	216478	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	387505115
4024	NC_017656	TGG	2	6	216544	216549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387505115
4025	NC_017656	CGG	2	6	216620	216625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505115
4026	NC_017656	GCGT	2	8	216692	216699	0 %	25 %	50 %	25 %	387505115
4027	NC_017656	TGC	2	6	216716	216721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505115
4028	NC_017656	CGG	2	6	216738	216743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505115
4029	NC_017656	GCC	2	6	216780	216785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505115
4030	NC_017656	CTG	2	6	216808	216813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505115
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4032	NC_017656	AAG	2	6	216860	216865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387505115
4033	NC_017656	TTAGT	2	10	216915	216924	20 %	60 %	20 %	0 %	387505115
4034	NC_017656	CAC	3	9	216983	216991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387505116
4035	NC_017656	CGA	2	6	217063	217068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505116
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4037	NC_017656	ATC	2	6	217190	217195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387505116
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4039	NC_017656	TCAT	2	8	217218	217225	25 %	50 %	0 %	25 %	387505116
4040	NC_017656	TGC	2	6	217263	217268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505117
4041	NC_017656	CGT	2	6	217295	217300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505117
4042	NC_017656	TTCA	2	8	217311	217318	25 %	50 %	0 %	25 %	387505117
4043	NC_017656	CT	3	6	217658	217663	0 %	50 %	0 %	50 %	387505118
4044	NC_017656	GC	3	6	217671	217676	0 %	0 %	50 %	50 %	387505118
4045	NC_017656	ATG	2	6	217701	217706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387505118
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4047	NC_017656	TGA	2	6	217736	217741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387505118
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4050	NC_017656	CGA	2	6	217851	217856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505118
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4052	NC_017656	TGG	2	6	217926	217931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387505118
4053	NC_017656	GAC	2	6	217986	217991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505118
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4094	NC_017656	CGA	2	6	220419	220424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505122
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4104	NC_017656	CGC	2	6	221003	221008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505122
4105	NC_017656	ACGGT	2	10	221010	221019	20 %	20 %	40 %	20 %	387505122
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4109	NC_017656	CAG	2	6	221222	221227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505122
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4120	NC_017656	ACC	2	6	221847	221852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387505122
4121	NC_017656	GTT	2	6	221879	221884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387505122
4122	NC_017656	CACG	2	8	221893	221900	25 %	0 %	25 %	50 %	387505122
4123	NC_017656	T	6	6	221912	221917	0 %	100 %	0 %	0 %	387505122
4124	NC_017656	TA	3	6	221947	221952	50 %	50 %	0 %	0 %	387505122
4125	NC_017656	ATC	2	6	221973	221978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387505122
4126	NC_017656	GC	3	6	221982	221987	0 %	0 %	50 %	50 %	387505122
4127	NC_017656	TGT	2	6	222067	222072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387505122
4128	NC_017656	GCT	2	6	222369	222374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505123
4129	NC_017656	CTGGCA	2	12	222434	222445	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387505123
4130	NC_017656	AAC	2	6	222553	222558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387505123
4131	NC_017656	GCC	2	6	222676	222681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505123
4132	NC_017656	TGA	2	6	222692	222697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387505123
4133	NC_017656	CTGG	2	8	222807	222814	0 %	25 %	50 %	25 %	387505123
4134	NC_017656	GCGA	2	8	222843	222850	25 %	0 %	50 %	25 %	387505123
4135	NC_017656	AGC	2	6	222932	222937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505124
4136	NC_017656	CG	3	6	223021	223026	0 %	0 %	50 %	50 %	387505124
4137	NC_017656	CGG	2	6	223038	223043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505124
4138	NC_017656	TTC	2	6	223116	223121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387505124
4139	NC_017656	GC	3	6	223150	223155	0 %	0 %	50 %	50 %	387505124
4140	NC_017656	CTA	2	6	223259	223264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387505124
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4142	NC_017656	TTTG	2	8	223437	223444	0 %	75 %	25 %	0 %	387505125
4143	NC_017656	TTC	2	6	223486	223491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387505125
4144	NC_017656	TACG	2	8	223536	223543	25 %	25 %	25 %	25 %	387505125
4145	NC_017656	CTGG	2	8	223596	223603	0 %	25 %	50 %	25 %	387505125
4146	NC_017656	GGT	2	6	223608	223613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387505125
4147	NC_017656	TAA	2	6	223616	223621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387505125
4148	NC_017656	CGT	2	6	223640	223645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505125
4149	NC_017656	CAA	2	6	223679	223684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387505125
4150	NC_017656	T	6	6	223693	223698	0 %	100 %	0 %	0 %	387505125
4151	NC_017656	CAA	2	6	223706	223711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387505125
4152	NC_017656	GCA	2	6	223727	223732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505125
4153	NC_017656	GCA	4	12	223772	223783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505125
4154	NC_017656	TGATT	2	10	223851	223860	20 %	60 %	20 %	0 %	387505125
4155	NC_017656	CTG	2	6	224088	224093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505125
4156	NC_017656	CAA	2	6	224102	224107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387505125
4157	NC_017656	CCAGTG	2	12	224159	224170	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387505125
4158	NC_017656	TTTGAA	2	12	224202	224213	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	387505125
4159	NC_017656	TAAA	2	8	224307	224314	75 %	25 %	0 %	0 %	387505126
4160	NC_017656	TCA	2	6	224345	224350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387505126
4161	NC_017656	ACC	2	6	224400	224405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387505126
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4165	NC_017656	TGC	2	6	224637	224642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505126
4166	NC_017656	ATC	2	6	224686	224691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387505126
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4169	NC_017656	A	6	6	224835	224840	100 %	0 %	0 %	0 %	387505126
4170	NC_017656	CAG	2	6	224886	224891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505126
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4174	NC_017656	TG	3	6	224978	224983	0 %	50 %	50 %	0 %	387505127
4175	NC_017656	TCAG	2	8	224993	225000	25 %	25 %	25 %	25 %	387505127
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4178	NC_017656	TAA	2	6	225045	225050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387505127
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4182	NC_017656	GCA	2	6	225129	225134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505127
4183	NC_017656	CAGT	2	8	225143	225150	25 %	25 %	25 %	25 %	387505127
4184	NC_017656	GCG	2	6	225231	225236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505127
4185	NC_017656	TGA	2	6	225294	225299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387505127
4186	NC_017656	CGCAA	2	10	225301	225310	40 %	0 %	20 %	40 %	387505127
4187	NC_017656	CGG	2	6	225371	225376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505127
4188	NC_017656	CAG	2	6	225388	225393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505127
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4193	NC_017656	GTT	2	6	225495	225500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387505127
4194	NC_017656	ACCA	2	8	225550	225557	50 %	0 %	0 %	50 %	387505127
4195	NC_017656	TCCAGC	2	12	225608	225619	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387505127
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4200	NC_017656	TGG	2	6	225899	225904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387505127
4201	NC_017656	A	8	8	226249	226256	100 %	0 %	0 %	0 %	387505128
4202	NC_017656	TGG	2	6	226269	226274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387505128
4203	NC_017656	ACCA	2	8	226280	226287	50 %	0 %	0 %	50 %	387505128
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4210	NC_017656	AGA	2	6	226537	226542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387505128
4211	NC_017656	GCAG	2	8	226546	226553	25 %	0 %	50 %	25 %	387505128
4212	NC_017656	GCG	2	6	226559	226564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505128
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4224	NC_017656	CTT	2	6	233104	233109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387505129
4225	NC_017656	CTA	2	6	233110	233115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387505129
4226	NC_017656	A	6	6	233175	233180	100 %	0 %	0 %	0 %	387505129
4227	NC_017656	CGC	2	6	233186	233191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505129
4228	NC_017656	CT	3	6	233252	233257	0 %	50 %	0 %	50 %	387505130
4229	NC_017656	CTC	2	6	233263	233268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387505130
4230	NC_017656	CCA	2	6	233398	233403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387505130
4231	NC_017656	TCG	2	6	233610	233615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387505130
4232	NC_017656	TTTC	2	8	233745	233752	0 %	75 %	0 %	25 %	387505130
4233	NC_017656	TAA	2	6	233761	233766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387505130
4234	NC_017656	GGA	2	6	233774	233779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387505130
4235	NC_017656	GCA	2	6	233845	233850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505130
4236	NC_017656	CGA	2	6	233955	233960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505130
4237	NC_017656	CTT	2	6	233974	233979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387505130
4238	NC_017656	TTGC	2	8	234070	234077	0 %	50 %	25 %	25 %	387505130
4239	NC_017656	CGA	2	6	234115	234120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505130
4240	NC_017656	TTC	2	6	234140	234145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387505130
4241	NC_017656	A	6	6	234406	234411	100 %	0 %	0 %	0 %	387505131
4242	NC_017656	CCG	2	6	234461	234466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505131
4243	NC_017656	ACC	2	6	234496	234501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387505131
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4353	NC_017656	CA	3	6	240936	240941	50 %	0 %	0 %	50 %	387505138
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4361	NC_017656	CCG	2	6	241504	241509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387505138
4362	NC_017656	A	6	6	241586	241591	100 %	0 %	0 %	0 %	387505138
4363	NC_017656	TAT	2	6	241818	241823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387505139
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4365	NC_017656	TTTC	2	8	241860	241867	0 %	75 %	0 %	25 %	387505139
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4488	NC_017656	CCA	2	6	247629	247634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387505144
4489	NC_017656	GGCG	2	8	247674	247681	0 %	0 %	75 %	25 %	387505144
4490	NC_017656	AT	3	6	247695	247700	50 %	50 %	0 %	0 %	387505144
4491	NC_017656	CATC	2	8	247701	247708	25 %	25 %	0 %	50 %	387505144
4492	NC_017656	GCA	2	6	247746	247751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387505144
4493	NC_017656	CG	3	6	247846	247851	0 %	0 %	50 %	50 %	387505144
4494	NC_017656	ATTC	2	8	247891	247898	25 %	50 %	0 %	25 %	387505144
4495	NC_017656	TCA	2	6	247943	247948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387505144
4496	NC_017656	CGG	2	6	247961	247966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505144
4497	NC_017656	ATCGC	2	10	247985	247994	20 %	20 %	20 %	40 %	387505144
4498	NC_017656	CTGT	2	8	247999	248006	0 %	50 %	25 %	25 %	387505144
4499	NC_017656	GGC	2	6	248023	248028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387505144
4500	NC_017656	TAA	2	6	248038	248043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387505144

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