MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O55:H7 str. RM12579 chromosome

Total Repeats: 93411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_017656	ATC	2	6	1163726	1163731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387506007
21003	NC_017656	GCG	2	6	1163880	1163885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387506007
21004	NC_017656	CG	3	6	1163884	1163889	0 %	0 %	50 %	50 %	387506007
21005	NC_017656	GAT	2	6	1164131	1164136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387506007
21006	NC_017656	AAG	2	6	1164137	1164142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387506007
21007	NC_017656	CTG	2	6	1164203	1164208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387506007
21008	NC_017656	GCTG	2	8	1164595	1164602	0 %	25 %	50 %	25 %	387506007
21009	NC_017656	GATC	2	8	1164640	1164647	25 %	25 %	25 %	25 %	387506007
21010	NC_017656	AACA	2	8	1164695	1164702	75 %	0 %	0 %	25 %	387506007
21011	NC_017656	GTG	2	6	1164870	1164875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387506007
21012	NC_017656	ATG	2	6	1164908	1164913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387506007
21013	NC_017656	GGT	2	6	1164977	1164982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387506007
21014	NC_017656	CGTC	2	8	1165007	1165014	0 %	25 %	25 %	50 %	387506007
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21016	NC_017656	CCG	2	6	1165190	1165195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387506008
21017	NC_017656	TGG	2	6	1165211	1165216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387506008
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21019	NC_017656	TGT	2	6	1165355	1165360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387506008
21020	NC_017656	TG	3	6	1165373	1165378	0 %	50 %	50 %	0 %	387506008
21021	NC_017656	AACGA	2	10	1165431	1165440	60 %	0 %	20 %	20 %	387506008
21022	NC_017656	GTT	2	6	1165465	1165470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387506008
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21025	NC_017656	GGC	2	6	1165577	1165582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387506008
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21067	NC_017656	TGCT	2	8	1167933	1167940	0 %	50 %	25 %	25 %	387506011
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21116	NC_017656	CAC	2	6	1171098	1171103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387506013
21117	NC_017656	TCA	2	6	1171109	1171114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387506013
21118	NC_017656	CTT	2	6	1171130	1171135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387506013
21119	NC_017656	TAA	2	6	1171498	1171503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387506014
21120	NC_017656	CTG	3	9	1171508	1171516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387506014
21121	NC_017656	AGC	2	6	1171605	1171610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387506014
21122	NC_017656	TCA	2	6	1171621	1171626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387506014
21123	NC_017656	ACC	2	6	1171646	1171651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387506014
21124	NC_017656	GATG	2	8	1171655	1171662	25 %	25 %	50 %	0 %	387506014
21125	NC_017656	GTG	2	6	1171667	1171672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387506014
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21127	NC_017656	CCAG	2	8	1171692	1171699	25 %	0 %	25 %	50 %	387506014
21128	NC_017656	TCG	2	6	1171716	1171721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387506014
21129	NC_017656	GC	3	6	1171870	1171875	0 %	0 %	50 %	50 %	387506014
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21143	NC_017656	GTT	2	6	1172519	1172524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387506014
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21147	NC_017656	GGT	2	6	1172830	1172835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387506014
21148	NC_017656	CTT	2	6	1172851	1172856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387506014
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21150	NC_017656	CAG	2	6	1172956	1172961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387506014
21151	NC_017656	AAGT	2	8	1172973	1172980	50 %	25 %	25 %	0 %	387506014
21152	NC_017656	TTTC	2	8	1173046	1173053	0 %	75 %	0 %	25 %	387506014
21153	NC_017656	TTC	2	6	1173086	1173091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387506014
21154	NC_017656	AG	3	6	1173144	1173149	50 %	0 %	50 %	0 %	387506014
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21159	NC_017656	ATC	2	6	1173354	1173359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387506014
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21216	NC_017656	CAG	2	6	1176277	1176282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387506016
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21222	NC_017656	GTTG	2	8	1176584	1176591	0 %	50 %	50 %	0 %	387506016
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21228	NC_017656	TTA	2	6	1177203	1177208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387506017
21229	NC_017656	GTT	2	6	1177216	1177221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387506017
21230	NC_017656	TCT	2	6	1177270	1177275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387506017
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21232	NC_017656	GCGTG	2	10	1177378	1177387	0 %	20 %	60 %	20 %	387506017
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21341	NC_017656	GCA	2	6	1183256	1183261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387506022
21342	NC_017656	CAA	2	6	1183277	1183282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387506022
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21344	NC_017656	GAA	2	6	1183401	1183406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387506022
21345	NC_017656	A	6	6	1183422	1183427	100 %	0 %	0 %	0 %	387506022
21346	NC_017656	CGA	2	6	1183430	1183435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387506022
21347	NC_017656	GTT	2	6	1183446	1183451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387506022
21348	NC_017656	GAACGT	2	12	1183467	1183478	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387506022
21349	NC_017656	AGA	2	6	1183505	1183510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387506022
21350	NC_017656	CAA	2	6	1183517	1183522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387506022
21351	NC_017656	CGA	2	6	1183688	1183693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387506022
21352	NC_017656	CTGT	2	8	1183743	1183750	0 %	50 %	25 %	25 %	387506022
21353	NC_017656	AACA	2	8	1183797	1183804	75 %	0 %	0 %	25 %	387506022
21354	NC_017656	CAA	2	6	1183823	1183828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387506022
21355	NC_017656	AGC	2	6	1183850	1183855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387506022
21356	NC_017656	CAC	2	6	1184197	1184202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387506023
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21358	NC_017656	CT	3	6	1184616	1184621	0 %	50 %	0 %	50 %	387506024
21359	NC_017656	CCGT	2	8	1184655	1184662	0 %	25 %	25 %	50 %	387506024
21360	NC_017656	AGCAA	2	10	1184707	1184716	60 %	0 %	20 %	20 %	387506024
21361	NC_017656	TTG	2	6	1184720	1184725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387506024
21362	NC_017656	TTG	2	6	1184763	1184768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387506024
21363	NC_017656	ATG	2	6	1184946	1184951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387506024
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21365	NC_017656	GCG	2	6	1185221	1185226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387506024
21366	NC_017656	GCTG	2	8	1185229	1185236	0 %	25 %	50 %	25 %	387506024
21367	NC_017656	CTG	2	6	1185313	1185318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387506024
21368	NC_017656	TGC	2	6	1185319	1185324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387506024
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21376	NC_017656	CT	3	6	1185503	1185508	0 %	50 %	0 %	50 %	387506024
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21382	NC_017656	TG	4	8	1185951	1185958	0 %	50 %	50 %	0 %	387506024
21383	NC_017656	CTGGC	2	10	1186097	1186106	0 %	20 %	40 %	40 %	387506024
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21386	NC_017656	TG	3	6	1186286	1186291	0 %	50 %	50 %	0 %	387506024
21387	NC_017656	TGGCAA	2	12	1186304	1186315	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	387506024
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21455	NC_017656	CGG	2	6	1189155	1189160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387506026
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21464	NC_017656	TGA	2	6	1189497	1189502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387506026
21465	NC_017656	AAAC	2	8	1189653	1189660	75 %	0 %	0 %	25 %	387506027
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21491	NC_017656	CG	5	10	1191156	1191165	0 %	0 %	50 %	50 %	387506029
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21494	NC_017656	CG	3	6	1191253	1191258	0 %	0 %	50 %	50 %	387506029
21495	NC_017656	CGA	2	6	1191317	1191322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387506029
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21498	NC_017656	GAA	2	6	1191450	1191455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387506029
21499	NC_017656	GATCGT	2	12	1191537	1191548	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	387506029
21500	NC_017656	CGT	2	6	1191627	1191632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387506029

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