MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli UMNK88 plasmid pUMNK88

Total Repeats: 2609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017645	TAT	2	6	152993	152998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386617508
2502	NC_017645	TGTT	2	8	153094	153101	0 %	75 %	25 %	0 %	386617508
2503	NC_017645	CCG	2	6	153106	153111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386617508
2504	NC_017645	TGG	2	6	153140	153145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617508
2505	NC_017645	CGG	2	6	153206	153211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386617508
2506	NC_017645	CAAG	2	8	153344	153351	50 %	0 %	25 %	25 %	386617508
2507	NC_017645	CAGC	2	8	153369	153376	25 %	0 %	25 %	50 %	386617508
2508	NC_017645	GTG	2	6	153397	153402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617508
2509	NC_017645	TCG	2	6	153597	153602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617508
2510	NC_017645	GAT	2	6	153669	153674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617508
2511	NC_017645	GCA	2	6	153780	153785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617508
2512	NC_017645	GCT	2	6	153795	153800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617508
2513	NC_017645	CTG	2	6	153832	153837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617508
2514	NC_017645	GGC	3	9	153855	153863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386617508
2515	NC_017645	TCA	2	6	153909	153914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617508
2516	NC_017645	CAA	2	6	154129	154134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386617508
2517	NC_017645	GGT	2	6	154191	154196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617508
2518	NC_017645	GCCGC	2	10	154251	154260	0 %	0 %	40 %	60 %	386617508
2519	NC_017645	GGC	2	6	154277	154282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386617508
2520	NC_017645	GCA	2	6	154335	154340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617508
2521	NC_017645	GTG	2	6	154456	154461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617508
2522	NC_017645	CAGGT	2	10	154510	154519	20 %	20 %	40 %	20 %	386617508
2523	NC_017645	CTGAA	2	10	154714	154723	40 %	20 %	20 %	20 %	386617508
2524	NC_017645	A	6	6	154722	154727	100 %	0 %	0 %	0 %	386617508
2525	NC_017645	TGG	2	6	154853	154858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617508
2526	NC_017645	AAC	2	6	154918	154923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386617508
2527	NC_017645	GCT	2	6	155037	155042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617508
2528	NC_017645	ATG	2	6	155053	155058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617508
2529	NC_017645	GCA	2	6	155142	155147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617508
2530	NC_017645	TGG	3	9	155171	155179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617508
2531	NC_017645	GCA	2	6	155186	155191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617508
2532	NC_017645	TGA	2	6	155210	155215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617508
2533	NC_017645	CTGA	2	8	155259	155266	25 %	25 %	25 %	25 %	386617508
2534	NC_017645	GAT	2	6	155378	155383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617508
2535	NC_017645	AGG	2	6	155387	155392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386617508
2536	NC_017645	TTCT	2	8	155401	155408	0 %	75 %	0 %	25 %	386617508
2537	NC_017645	ACA	2	6	155509	155514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386617508
2538	NC_017645	GTTT	2	8	155636	155643	0 %	75 %	25 %	0 %	386617509
2539	NC_017645	T	7	7	155641	155647	0 %	100 %	0 %	0 %	386617509
2540	NC_017645	GGT	2	6	155660	155665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617509
2541	NC_017645	TCCC	2	8	155760	155767	0 %	25 %	0 %	75 %	386617509
2542	NC_017645	CAG	2	6	155778	155783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617509
2543	NC_017645	GT	3	6	155865	155870	0 %	50 %	50 %	0 %	386617509
2544	NC_017645	CAT	2	6	155875	155880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617509
2545	NC_017645	CAG	2	6	155905	155910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617509
2546	NC_017645	AGA	2	6	156691	156696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386617510
2547	NC_017645	GGT	2	6	156779	156784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617510
2548	NC_017645	ACG	2	6	156877	156882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617510
2549	NC_017645	AGG	2	6	156910	156915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386617510
2550	NC_017645	TGA	2	6	156921	156926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617510
2551	NC_017645	TCTG	2	8	156949	156956	0 %	50 %	25 %	25 %	386617511
2552	NC_017645	TCA	2	6	156968	156973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617511
2553	NC_017645	AGC	2	6	157015	157020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617511
2554	NC_017645	CCTTGG	2	12	157106	157117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617511
2555	NC_017645	CAG	3	9	157190	157198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617511
2556	NC_017645	TCT	2	6	157262	157267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386617511
2557	NC_017645	CAG	2	6	157269	157274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617511
2558	NC_017645	TCT	2	6	157276	157281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386617511
2559	NC_017645	CTAT	2	8	157428	157435	25 %	50 %	0 %	25 %	386617511
2560	NC_017645	G	6	6	157457	157462	0 %	0 %	100 %	0 %	386617512
2561	NC_017645	ATT	2	6	157482	157487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386617512
2562	NC_017645	AAG	3	9	157522	157530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386617512
2563	NC_017645	GAT	2	6	157602	157607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617512
2564	NC_017645	CAG	2	6	157720	157725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617512
2565	NC_017645	CAT	2	6	157733	157738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617512
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2567	NC_017645	TGA	2	6	157790	157795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617512
2568	NC_017645	TGC	2	6	157802	157807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386617512
2569	NC_017645	GA	3	6	157838	157843	50 %	0 %	50 %	0 %	386617512
2570	NC_017645	GA	3	6	157877	157882	50 %	0 %	50 %	0 %	386617512
2571	NC_017645	TGG	2	6	157894	157899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617512
2572	NC_017645	ACAG	2	8	157908	157915	50 %	0 %	25 %	25 %	386617512
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2577	NC_017645	A	6	6	158031	158036	100 %	0 %	0 %	0 %	386617512
2578	NC_017645	ATC	2	6	158150	158155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386617513
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2580	NC_017645	CA	3	6	158279	158284	50 %	0 %	0 %	50 %	386617513
2581	NC_017645	CT	3	6	158299	158304	0 %	50 %	0 %	50 %	386617513
2582	NC_017645	TGG	2	6	158329	158334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617513
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2585	NC_017645	AAGG	2	8	158586	158593	50 %	0 %	50 %	0 %	386617513
2586	NC_017645	TGG	3	9	158596	158604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386617513
2587	NC_017645	T	7	7	158678	158684	0 %	100 %	0 %	0 %	386617514
2588	NC_017645	CTT	2	6	158686	158691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386617514
2589	NC_017645	ATT	2	6	158873	158878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386617514
2590	NC_017645	CTTTT	2	10	158896	158905	0 %	80 %	0 %	20 %	386617514
2591	NC_017645	TCT	4	12	158906	158917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386617514
2592	NC_017645	TCC	2	6	158933	158938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386617514
2593	NC_017645	ATT	2	6	159044	159049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386617514
2594	NC_017645	CT	3	6	159052	159057	0 %	50 %	0 %	50 %	386617514
2595	NC_017645	CTC	2	6	159085	159090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386617514
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2597	NC_017645	CCAG	2	8	159529	159536	25 %	0 %	25 %	50 %	386617515
2598	NC_017645	CATC	2	8	159551	159558	25 %	25 %	0 %	50 %	386617515
2599	NC_017645	AGT	2	6	159629	159634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386617515
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2601	NC_017645	TCC	2	6	159873	159878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386617515
2602	NC_017645	AGG	2	6	159892	159897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386617515
2603	NC_017645	ACA	2	6	159919	159924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386617515
2604	NC_017645	CT	3	6	160029	160034	0 %	50 %	0 %	50 %	386617515
2605	NC_017645	CAGG	2	8	160061	160068	25 %	0 %	50 %	25 %	386617515
2606	NC_017645	TC	3	6	160217	160222	0 %	50 %	0 %	50 %	386617515
2607	NC_017645	ATCA	2	8	160224	160231	50 %	25 %	0 %	25 %	386617515
2608	NC_017645	TGT	2	6	160267	160272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386617515
2609	NC_017645	GAC	2	6	160308	160313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386617515

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.