MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Erysipelothrix rhusiopathiae str. Fujisawa chromosome

Total Repeats: 33485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_015601	ATA	2	6	960115	960120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336066143
18003	NC_015601	CAT	2	6	960148	960153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066143
18004	NC_015601	ATT	2	6	960229	960234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336066143
18005	NC_015601	ATG	2	6	960293	960298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336066143
18006	NC_015601	CTTC	2	8	960306	960313	0 %	50 %	0 %	50 %	336066143
18007	NC_015601	ATC	2	6	960349	960354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066143
18008	NC_015601	TTC	2	6	960400	960405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336066143
18009	NC_015601	ATT	2	6	960409	960414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336066143
18010	NC_015601	CAATCC	2	12	960526	960537	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	336066143
18011	NC_015601	TCAT	2	8	960614	960621	25 %	50 %	0 %	25 %	336066143
18012	NC_015601	CAT	2	6	960627	960632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066143
18013	NC_015601	ATC	2	6	960715	960720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066143
18014	NC_015601	TGT	2	6	960742	960747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336066143
18015	NC_015601	AAT	2	6	960826	960831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336066143
18016	NC_015601	CCA	2	6	960833	960838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336066143
18017	NC_015601	TGT	2	6	960842	960847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336066143
18018	NC_015601	TGT	2	6	960850	960855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336066143
18019	NC_015601	ATT	2	6	960901	960906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336066143
18020	NC_015601	T	6	6	960960	960965	0 %	100 %	0 %	0 %	336066143
18021	NC_015601	AGAA	2	8	961208	961215	75 %	0 %	25 %	0 %	336066143
18022	NC_015601	CAA	2	6	961290	961295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336066143
18023	NC_015601	GAA	2	6	961298	961303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336066143
18024	NC_015601	CTA	2	6	961323	961328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066143
18025	NC_015601	AAG	2	6	961357	961362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336066143
18026	NC_015601	GAG	2	6	961495	961500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336066143
18027	NC_015601	TCA	2	6	961502	961507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066143
18028	NC_015601	T	6	6	961537	961542	0 %	100 %	0 %	0 %	336066143
18029	NC_015601	TAA	2	6	961570	961575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336066143
18030	NC_015601	GTT	2	6	961695	961700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336066143
18031	NC_015601	AT	3	6	961709	961714	50 %	50 %	0 %	0 %	336066143
18032	NC_015601	CCA	2	6	961730	961735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336066143
18033	NC_015601	TAA	2	6	961854	961859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336066143
18034	NC_015601	CAA	2	6	961900	961905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336066143
18035	NC_015601	ACGCA	2	10	961950	961959	40 %	0 %	20 %	40 %	336066143
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18037	NC_015601	A	6	6	962116	962121	100 %	0 %	0 %	0 %	336066143
18038	NC_015601	TTA	2	6	962148	962153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336066143
18039	NC_015601	T	6	6	962218	962223	0 %	100 %	0 %	0 %	336066143
18040	NC_015601	ATT	2	6	962236	962241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336066143
18041	NC_015601	ATC	2	6	962254	962259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066143
18042	NC_015601	ATA	2	6	962316	962321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336066143
18043	NC_015601	CAT	2	6	962328	962333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066143
18044	NC_015601	ATCA	2	8	962446	962453	50 %	25 %	0 %	25 %	336066143
18045	NC_015601	CATC	2	8	962568	962575	25 %	25 %	0 %	50 %	336066143
18046	NC_015601	CTT	2	6	962577	962582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336066143
18047	NC_015601	AACCGG	2	12	962647	962658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336066143
18048	NC_015601	TCT	2	6	962679	962684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336066143
18049	NC_015601	AAC	2	6	962686	962691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336066143
18050	NC_015601	ATG	2	6	962726	962731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336066143
18051	NC_015601	ATA	2	6	962737	962742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336066143
18052	NC_015601	TGT	2	6	962755	962760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336066143
18053	NC_015601	T	6	6	962902	962907	0 %	100 %	0 %	0 %	336066143
18054	NC_015601	AT	3	6	962996	963001	50 %	50 %	0 %	0 %	336066143
18055	NC_015601	CAT	2	6	963009	963014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066143
18056	NC_015601	TCA	2	6	963068	963073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066143
18057	NC_015601	ACG	2	6	963085	963090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336066143
18058	NC_015601	TTC	2	6	963205	963210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336066143
18059	NC_015601	CAA	2	6	963228	963233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336066143
18060	NC_015601	ATA	2	6	963262	963267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336066143
18061	NC_015601	GTAA	2	8	963353	963360	50 %	25 %	25 %	0 %	336066143
18062	NC_015601	TCG	2	6	963397	963402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336066143
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18064	NC_015601	ACT	2	6	963434	963439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066143
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18072	NC_015601	AATTTT	2	12	963758	963769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336066143
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18074	NC_015601	CT	3	6	963778	963783	0 %	50 %	0 %	50 %	336066143
18075	NC_015601	CATT	2	8	963804	963811	25 %	50 %	0 %	25 %	336066143
18076	NC_015601	T	7	7	963836	963842	0 %	100 %	0 %	0 %	336066143
18077	NC_015601	ATGAA	2	10	963883	963892	60 %	20 %	20 %	0 %	336066143
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18080	NC_015601	CTTT	2	8	963997	964004	0 %	75 %	0 %	25 %	336066144
18081	NC_015601	TGGA	2	8	964075	964082	25 %	25 %	50 %	0 %	336066144
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18094	NC_015601	ATCT	2	8	964748	964755	25 %	50 %	0 %	25 %	336066145
18095	NC_015601	ATCA	2	8	964862	964869	50 %	25 %	0 %	25 %	336066145
18096	NC_015601	CAT	2	6	964885	964890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066145
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18103	NC_015601	AATATC	2	12	965099	965110	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	336066145
18104	NC_015601	AAAC	2	8	965116	965123	75 %	0 %	0 %	25 %	336066145
18105	NC_015601	ACT	2	6	965186	965191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066145
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18110	NC_015601	TCA	2	6	965529	965534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066145
18111	NC_015601	GCT	2	6	965604	965609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336066145
18112	NC_015601	CGT	2	6	965635	965640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336066145
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18115	NC_015601	TAA	3	9	965720	965728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336066145
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18120	NC_015601	ATC	2	6	965873	965878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066145
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18225	NC_015601	ATAC	2	8	970532	970539	50 %	25 %	0 %	25 %	336066149
18226	NC_015601	TGT	2	6	970606	970611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336066150
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18479	NC_015601	TTC	2	6	984303	984308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336066162
18480	NC_015601	TCA	2	6	984328	984333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066162
18481	NC_015601	CAC	2	6	984359	984364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336066162
18482	NC_015601	AAC	2	6	984369	984374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336066162
18483	NC_015601	T	7	7	984418	984424	0 %	100 %	0 %	0 %	336066162
18484	NC_015601	TGA	2	6	984460	984465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336066162
18485	NC_015601	CAT	2	6	984524	984529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066162
18486	NC_015601	CTTCTG	2	12	984566	984577	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	336066162
18487	NC_015601	ACT	2	6	984606	984611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066162
18488	NC_015601	TCC	2	6	984646	984651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336066163
18489	NC_015601	ATC	2	6	984661	984666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066163
18490	NC_015601	TCCCCA	2	12	984683	984694	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	336066163
18491	NC_015601	AAT	2	6	984713	984718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336066163
18492	NC_015601	GTT	2	6	984773	984778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336066163
18493	NC_015601	TAA	2	6	984857	984862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336066163
18494	NC_015601	GAT	2	6	984967	984972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336066164
18495	NC_015601	T	6	6	985240	985245	0 %	100 %	0 %	0 %	336066164
18496	NC_015601	CAA	2	6	985381	985386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336066164
18497	NC_015601	CAG	2	6	985432	985437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336066164
18498	NC_015601	CAC	2	6	985450	985455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336066164
18499	NC_015601	CTA	2	6	985456	985461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336066164
18500	NC_015601	CTT	2	6	985477	985482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336066164

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