MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Erysipelothrix rhusiopathiae str. Fujisawa chromosome

Total Repeats: 33485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015601	AGA	2	6	15	20	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065243
2	NC_015601	TG	3	6	21	26	0 %	50 %	50 %	0 %	336065243
3	NC_015601	TGC	2	6	108	113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065243
4	NC_015601	T	6	6	186	191	0 %	100 %	0 %	0 %	336065243
5	NC_015601	ACG	2	6	194	199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065243
6	NC_015601	TTA	2	6	200	205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065243
7	NC_015601	A	8	8	262	269	100 %	0 %	0 %	0 %	336065243
8	NC_015601	GTC	2	6	307	312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065243
9	NC_015601	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065243
10	NC_015601	TGT	2	6	357	362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065243
11	NC_015601	AAAG	2	8	376	383	75 %	0 %	25 %	0 %	336065243
12	NC_015601	GCA	2	6	391	396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065243
13	NC_015601	AC	3	6	428	433	50 %	0 %	0 %	50 %	336065243
14	NC_015601	TA	3	6	441	446	50 %	50 %	0 %	0 %	336065243
15	NC_015601	A	6	6	502	507	100 %	0 %	0 %	0 %	336065243
16	NC_015601	GAT	2	6	637	642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065243
17	NC_015601	TTC	2	6	682	687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065243
18	NC_015601	A	6	6	715	720	100 %	0 %	0 %	0 %	336065243
19	NC_015601	TAA	2	6	779	784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065243
20	NC_015601	TGA	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065243
21	NC_015601	CTT	2	6	975	980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065243
22	NC_015601	ACT	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065243
23	NC_015601	TAA	2	6	1218	1223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065243
24	NC_015601	AGAAA	2	10	1284	1293	80 %	0 %	20 %	0 %	336065243
25	NC_015601	GCA	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065244
26	NC_015601	TCTG	2	8	1703	1710	0 %	50 %	25 %	25 %	336065244
27	NC_015601	AAG	2	6	1777	1782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065244
28	NC_015601	AAAT	2	8	1802	1809	75 %	25 %	0 %	0 %	336065244
29	NC_015601	GAA	2	6	1821	1826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065244
30	NC_015601	AGT	2	6	1832	1837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065244
31	NC_015601	ATT	2	6	1902	1907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065244
32	NC_015601	GTA	2	6	1960	1965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065244
33	NC_015601	CAA	2	6	1981	1986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065244
34	NC_015601	CAA	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065244
35	NC_015601	A	6	6	2166	2171	100 %	0 %	0 %	0 %	336065244
36	NC_015601	ATT	2	6	2342	2347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065244
37	NC_015601	GT	3	6	2491	2496	0 %	50 %	50 %	0 %	336065244
38	NC_015601	GAA	2	6	2532	2537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065244
39	NC_015601	TGG	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065244
40	NC_015601	AGA	2	6	2684	2689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065244
41	NC_015601	TCG	2	6	2848	2853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065245
42	NC_015601	TGG	2	6	2899	2904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065245
43	NC_015601	CATC	2	8	2910	2917	25 %	25 %	0 %	50 %	336065245
44	NC_015601	TACA	2	8	2949	2956	50 %	25 %	0 %	25 %	336065245
45	NC_015601	ACG	2	6	2961	2966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065245
46	NC_015601	CAT	2	6	3006	3011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065245
47	NC_015601	TGT	2	6	3028	3033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065245
48	NC_015601	GAT	2	6	3064	3069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065245
49	NC_015601	CAT	2	6	3116	3121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065245
50	NC_015601	GTTAT	2	10	3153	3162	20 %	60 %	20 %	0 %	336065245
51	NC_015601	GGT	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065245
52	NC_015601	TGC	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065245
53	NC_015601	GTGG	2	8	3197	3204	0 %	25 %	75 %	0 %	336065245
54	NC_015601	CATT	2	8	3246	3253	25 %	50 %	0 %	25 %	336065245
55	NC_015601	CAA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065245
56	NC_015601	ATC	2	6	3337	3342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065245
57	NC_015601	TAA	2	6	3376	3381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065245
58	NC_015601	CAT	2	6	3402	3407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065245
59	NC_015601	ATG	2	6	3411	3416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065245
60	NC_015601	TTA	2	6	3423	3428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065245
61	NC_015601	ATA	2	6	3453	3458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065245
62	NC_015601	GAA	3	9	3677	3685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065246
63	NC_015601	TGG	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065246
64	NC_015601	CAA	2	6	3730	3735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065246
65	NC_015601	CGG	2	6	3769	3774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336065246
66	NC_015601	GAA	2	6	3797	3802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065246
67	NC_015601	A	7	7	3805	3811	100 %	0 %	0 %	0 %	336065246
68	NC_015601	TTG	2	6	3822	3827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065246
69	NC_015601	GA	3	6	3885	3890	50 %	0 %	50 %	0 %	336065246
70	NC_015601	ATC	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065246
71	NC_015601	TAA	2	6	4125	4130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065246
72	NC_015601	ATT	2	6	4195	4200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065246
73	NC_015601	A	7	7	4210	4216	100 %	0 %	0 %	0 %	336065246
74	NC_015601	G	6	6	4227	4232	0 %	0 %	100 %	0 %	336065246
75	NC_015601	ATT	2	6	4241	4246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065246
76	NC_015601	TGA	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065246
77	NC_015601	GCA	2	6	4358	4363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065246
78	NC_015601	TA	3	6	4366	4371	50 %	50 %	0 %	0 %	336065246
79	NC_015601	ATT	2	6	4386	4391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065246
80	NC_015601	TGC	2	6	4420	4425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065246
81	NC_015601	ATC	2	6	4449	4454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065246
82	NC_015601	AAT	2	6	4492	4497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065246
83	NC_015601	CAT	2	6	4576	4581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065247
84	NC_015601	GTT	2	6	4752	4757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
85	NC_015601	ATGG	2	8	4797	4804	25 %	25 %	50 %	0 %	336065247
86	NC_015601	GAT	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065247
87	NC_015601	TGA	2	6	4894	4899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065247
88	NC_015601	AAG	2	6	4912	4917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065247
89	NC_015601	ATG	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065247
90	NC_015601	CATA	2	8	5046	5053	50 %	25 %	0 %	25 %	336065247
91	NC_015601	ATC	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336065247
92	NC_015601	TTG	2	6	5182	5187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
93	NC_015601	A	6	6	5226	5231	100 %	0 %	0 %	0 %	336065247
94	NC_015601	TTAA	2	8	5232	5239	50 %	50 %	0 %	0 %	336065247
95	NC_015601	ATTG	2	8	5276	5283	25 %	50 %	25 %	0 %	336065247
96	NC_015601	TCT	2	6	5319	5324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065247
97	NC_015601	TTC	2	6	5330	5335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065247
98	NC_015601	GAAG	2	8	5349	5356	50 %	0 %	50 %	0 %	336065247
99	NC_015601	GT	3	6	5383	5388	0 %	50 %	50 %	0 %	336065247
100	NC_015601	TGT	2	6	5405	5410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
101	NC_015601	TGG	3	9	5411	5419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065247
102	NC_015601	TTG	2	6	5605	5610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
103	NC_015601	GGT	2	6	5625	5630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065247
104	NC_015601	AGG	2	6	5642	5647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336065247
105	NC_015601	TGG	2	6	5672	5677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065247
106	NC_015601	TAA	2	6	5809	5814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065247
107	NC_015601	AATG	2	8	5843	5850	50 %	25 %	25 %	0 %	336065247
108	NC_015601	CTT	2	6	5852	5857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065247
109	NC_015601	TTG	2	6	5886	5891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
110	NC_015601	ATG	2	6	5910	5915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065247
111	NC_015601	GGT	2	6	5928	5933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065247
112	NC_015601	TAA	2	6	5939	5944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065247
113	NC_015601	GCT	2	6	5946	5951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065247
114	NC_015601	GCT	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336065247
115	NC_015601	CAG	3	9	5983	5991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065247
116	NC_015601	GCA	2	6	6024	6029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336065247
117	NC_015601	TCC	2	6	6038	6043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336065247
118	NC_015601	TTG	2	6	6055	6060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
119	NC_015601	ATT	3	9	6065	6073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065247
120	NC_015601	CTT	2	6	6133	6138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065247
121	NC_015601	TGT	2	6	6200	6205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
122	NC_015601	CAC	2	6	6259	6264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	336065247
123	NC_015601	TTC	2	6	6283	6288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336065247
124	NC_015601	ATT	2	6	6324	6329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065247
125	NC_015601	TGT	2	6	6335	6340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
126	NC_015601	GTT	2	6	6377	6382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065247
127	NC_015601	A	6	6	6518	6523	100 %	0 %	0 %	0 %	336065248
128	NC_015601	AT	3	6	6532	6537	50 %	50 %	0 %	0 %	336065248
129	NC_015601	GTG	2	6	6582	6587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336065248
130	NC_015601	ATTC	2	8	6602	6609	25 %	50 %	0 %	25 %	336065248
131	NC_015601	TTCAA	2	10	6613	6622	40 %	40 %	0 %	20 %	336065248
132	NC_015601	GAA	2	6	6632	6637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065248
133	NC_015601	TGT	3	9	6673	6681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336065248
134	NC_015601	TAA	2	6	6691	6696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065248
135	NC_015601	TAA	2	6	6779	6784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336065249
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256	NC_015601	TGA	2	6	11815	11820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065251
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259	NC_015601	AT	3	6	11860	11865	50 %	50 %	0 %	0 %	336065251
260	NC_015601	GAA	2	6	11968	11973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065251
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264	NC_015601	GAA	2	6	12176	12181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065251
265	NC_015601	ACA	2	6	12185	12190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336065251
266	NC_015601	AGAAAT	2	12	12217	12228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	336065251
267	NC_015601	TTA	2	6	12574	12579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336065252
268	NC_015601	AAG	3	9	12591	12599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065252
269	NC_015601	TGA	2	6	12746	12751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065252
270	NC_015601	GAA	2	6	12807	12812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065252
271	NC_015601	GAA	2	6	12816	12821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336065252
272	NC_015601	TTTG	2	8	12824	12831	0 %	75 %	25 %	0 %	336065252
273	NC_015601	ATAAA	2	10	12832	12841	80 %	20 %	0 %	0 %	336065252
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281	NC_015601	GTA	2	6	13407	13412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336065252
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