MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 99348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013361	CTG	2	6	215243	215248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853398
4002	NC_013361	GAC	2	6	215414	215419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853398
4003	NC_013361	CTGCGC	2	12	215438	215449	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	260853398
4004	NC_013361	GCA	2	6	215464	215469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853398
4005	NC_013361	AG	3	6	215527	215532	50 %	0 %	50 %	0 %	260853398
4006	NC_013361	CTG	2	6	215546	215551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853398
4007	NC_013361	GAT	2	6	215555	215560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853398
4008	NC_013361	CGC	2	6	215627	215632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853398
4009	NC_013361	GCG	2	6	215633	215638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853398
4010	NC_013361	GCTG	2	8	215649	215656	0 %	25 %	50 %	25 %	260853398
4011	NC_013361	TGGCGC	2	12	215715	215726	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	260853398
4012	NC_013361	CCG	2	6	215770	215775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853398
4013	NC_013361	TGG	2	6	215792	215797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853398
4014	NC_013361	CGG	2	6	215868	215873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853398
4015	NC_013361	GCGT	2	8	215940	215947	0 %	25 %	50 %	25 %	260853398
4016	NC_013361	TGC	2	6	215964	215969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853398
4017	NC_013361	CGG	2	6	215986	215991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853398
4018	NC_013361	GAA	2	6	216001	216006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853398
4019	NC_013361	GCC	2	6	216028	216033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853398
4020	NC_013361	CTG	2	6	216056	216061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853398
4021	NC_013361	GCG	2	6	216083	216088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853398
4022	NC_013361	AAG	2	6	216108	216113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853398
4023	NC_013361	CAC	3	9	216230	216238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853399
4024	NC_013361	CGA	2	6	216310	216315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853399
4025	NC_013361	ATG	2	6	216404	216409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853399
4026	NC_013361	ATC	2	6	216437	216442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853399
4027	NC_013361	ATTG	2	8	216446	216453	25 %	50 %	25 %	0 %	260853399
4028	NC_013361	TCAT	2	8	216465	216472	25 %	50 %	0 %	25 %	260853399
4029	NC_013361	TGC	2	6	216510	216515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853400
4030	NC_013361	CGT	2	6	216542	216547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853400
4031	NC_013361	TTCA	2	8	216558	216565	25 %	50 %	0 %	25 %	260853400
4032	NC_013361	CT	3	6	216905	216910	0 %	50 %	0 %	50 %	260853401
4033	NC_013361	GC	3	6	216918	216923	0 %	0 %	50 %	50 %	260853401
4034	NC_013361	ATG	2	6	216948	216953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853401
4035	NC_013361	TGA	2	6	216983	216988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853401
4036	NC_013361	TG	3	6	217012	217017	0 %	50 %	50 %	0 %	260853401
4037	NC_013361	GAT	2	6	217020	217025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853401
4038	NC_013361	GCG	2	6	217097	217102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853401
4039	NC_013361	GCG	2	6	217161	217166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853401
4040	NC_013361	TGG	2	6	217173	217178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853401
4041	NC_013361	TG	3	6	217197	217202	0 %	50 %	50 %	0 %	260853401
4042	NC_013361	AAC	2	6	217240	217245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853401
4043	NC_013361	AAT	2	6	217332	217337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853401
4044	NC_013361	TTAAC	2	10	217345	217354	40 %	40 %	0 %	20 %	260853401
4045	NC_013361	CAA	2	6	217362	217367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853401
4046	NC_013361	GCGG	2	8	217445	217452	0 %	0 %	75 %	25 %	260853402
4047	NC_013361	GCA	2	6	217453	217458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853402
4048	NC_013361	TAA	2	6	217462	217467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853402
4049	NC_013361	CGC	2	6	217543	217548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853402
4050	NC_013361	CAT	2	6	217553	217558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853402
4051	NC_013361	CAG	2	6	217564	217569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853402
4052	NC_013361	TGG	2	6	217644	217649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853402
4053	NC_013361	AAC	2	6	217666	217671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853402
4054	NC_013361	CGA	2	6	217685	217690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853402
4055	NC_013361	A	6	6	217815	217820	100 %	0 %	0 %	0 %	260853403
4056	NC_013361	TAA	2	6	217871	217876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853403
4057	NC_013361	GCG	2	6	217945	217950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853403
4058	NC_013361	TGC	2	6	217951	217956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853403
4059	NC_013361	CT	3	6	217985	217990	0 %	50 %	0 %	50 %	260853403
4060	NC_013361	TGA	2	6	218017	218022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853403
4061	NC_013361	GAA	2	6	218046	218051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853403
4062	NC_013361	TCC	2	6	218055	218060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260853403
4063	NC_013361	GCG	2	6	218283	218288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853403
4064	NC_013361	GC	3	6	218364	218369	0 %	0 %	50 %	50 %	260853403
4065	NC_013361	CCAA	2	8	218445	218452	50 %	0 %	0 %	50 %	260853403
4066	NC_013361	CGG	2	6	218470	218475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853403
4067	NC_013361	AGT	2	6	218502	218507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853403
4068	NC_013361	GTC	2	6	218845	218850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853404
4069	NC_013361	A	6	6	218859	218864	100 %	0 %	0 %	0 %	260853404
4070	NC_013361	GCTG	2	8	218902	218909	0 %	25 %	50 %	25 %	260853404
4071	NC_013361	GTCA	2	8	219008	219015	25 %	25 %	25 %	25 %	260853404
4072	NC_013361	GC	3	6	219084	219089	0 %	0 %	50 %	50 %	260853404
4073	NC_013361	GTC	2	6	219106	219111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853404
4074	NC_013361	CG	3	6	219153	219158	0 %	0 %	50 %	50 %	260853404
4075	NC_013361	CCA	2	6	219179	219184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853404
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4077	NC_013361	CTG	2	6	219357	219362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853404
4078	NC_013361	GA	3	6	219382	219387	50 %	0 %	50 %	0 %	260853404
4079	NC_013361	CGC	2	6	219452	219457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853404
4080	NC_013361	CCA	2	6	219577	219582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853404
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4083	NC_013361	GAT	2	6	219659	219664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853404
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4087	NC_013361	CGA	2	6	220899	220904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853405
4088	NC_013361	TCG	2	6	220920	220925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853405
4089	NC_013361	CAG	2	6	221021	221026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853405
4090	NC_013361	TCGT	2	8	221159	221166	0 %	50 %	25 %	25 %	260853405
4091	NC_013361	CGC	2	6	221183	221188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853405
4092	NC_013361	CAG	2	6	221336	221341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853405
4093	NC_013361	GCCA	2	8	221369	221376	25 %	0 %	25 %	50 %	260853405
4094	NC_013361	AGT	2	6	221437	221442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853405
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4097	NC_013361	ACGGT	2	10	221490	221499	20 %	20 %	40 %	20 %	260853405
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4100	NC_013361	CAG	2	6	221657	221662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853405
4101	NC_013361	CAG	2	6	221702	221707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853405
4102	NC_013361	AGC	3	9	221804	221812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853405
4103	NC_013361	GC	3	6	221811	221816	0 %	0 %	50 %	50 %	260853405
4104	NC_013361	GCC	2	6	221936	221941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853405
4105	NC_013361	TCA	2	6	222076	222081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853405
4106	NC_013361	TCG	2	6	222123	222128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853405
4107	NC_013361	CTT	2	6	222211	222216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853405
4108	NC_013361	CAA	2	6	222256	222261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853405
4109	NC_013361	GCA	2	6	222265	222270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853405
4110	NC_013361	CT	3	6	222300	222305	0 %	50 %	0 %	50 %	260853405
4111	NC_013361	GCTG	2	8	222318	222325	0 %	25 %	50 %	25 %	260853405
4112	NC_013361	ACC	2	6	222327	222332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853405
4113	NC_013361	GTT	2	6	222359	222364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853405
4114	NC_013361	CACG	2	8	222373	222380	25 %	0 %	25 %	50 %	260853405
4115	NC_013361	T	6	6	222392	222397	0 %	100 %	0 %	0 %	260853405
4116	NC_013361	TA	3	6	222427	222432	50 %	50 %	0 %	0 %	260853405
4117	NC_013361	ATC	2	6	222453	222458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853405
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4119	NC_013361	TGT	2	6	222547	222552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853405
4120	NC_013361	GCT	2	6	222850	222855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853406
4121	NC_013361	CTGGCA	2	12	222915	222926	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260853406
4122	NC_013361	AAC	2	6	223034	223039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853406
4123	NC_013361	CCG	2	6	223122	223127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853406
4124	NC_013361	GCC	2	6	223157	223162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853406
4125	NC_013361	TGA	2	6	223173	223178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853406
4126	NC_013361	CTGG	2	8	223288	223295	0 %	25 %	50 %	25 %	260853406
4127	NC_013361	GCGA	2	8	223324	223331	25 %	0 %	50 %	25 %	260853406
4128	NC_013361	ATAC	2	8	223394	223401	50 %	25 %	0 %	25 %	260853407
4129	NC_013361	AGC	2	6	223413	223418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853407
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4131	NC_013361	CGG	2	6	223519	223524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853407
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4134	NC_013361	CTA	2	6	223740	223745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853407
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4137	NC_013361	TCA	2	6	223940	223945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853408
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4140	NC_013361	CTGG	2	8	224077	224084	0 %	25 %	50 %	25 %	260853408
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4142	NC_013361	CGT	2	6	224121	224126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853408
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4145	NC_013361	CAA	2	6	224187	224192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853408
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4149	NC_013361	CTG	2	6	224569	224574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853408
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4151	NC_013361	CCAGTG	2	12	224640	224651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260853408
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4153	NC_013361	TAAA	2	8	224788	224795	75 %	25 %	0 %	0 %	260853409
4154	NC_013361	TCA	2	6	224826	224831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853409
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4227	NC_013361	GCA	2	6	234475	234480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853413
4228	NC_013361	CGA	2	6	234585	234590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853413
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4230	NC_013361	TTGC	2	8	234700	234707	0 %	50 %	25 %	25 %	260853413
4231	NC_013361	TTC	2	6	234770	234775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853413
4232	NC_013361	A	6	6	235036	235041	100 %	0 %	0 %	0 %	260853414
4233	NC_013361	CCG	2	6	235091	235096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853414
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4238	NC_013361	TGC	2	6	235391	235396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853414
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4242	NC_013361	CG	3	6	235770	235775	0 %	0 %	50 %	50 %	260853414
4243	NC_013361	ATAA	2	8	235824	235831	75 %	25 %	0 %	0 %	260853414
4244	NC_013361	ACAAT	2	10	235912	235921	60 %	20 %	0 %	20 %	260853415
4245	NC_013361	ACCATG	2	12	235925	235936	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260853415
4246	NC_013361	GGT	2	6	236112	236117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853415
4247	NC_013361	CAC	2	6	236190	236195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853415
4248	NC_013361	ATG	2	6	236279	236284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853415
4249	NC_013361	GCA	2	6	236290	236295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853415
4250	NC_013361	GTGAA	2	10	236300	236309	40 %	20 %	40 %	0 %	260853415
4251	NC_013361	TAATT	2	10	236484	236493	40 %	60 %	0 %	0 %	260853415
4252	NC_013361	TTC	2	6	236517	236522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853415
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4255	NC_013361	TGT	3	9	236741	236749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853416
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4258	NC_013361	CTGC	2	8	236923	236930	0 %	25 %	25 %	50 %	260853416
4259	NC_013361	CTG	2	6	236985	236990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853416
4260	NC_013361	GCG	2	6	237074	237079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853416
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4262	NC_013361	CTT	2	6	237156	237161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853416
4263	NC_013361	GCT	2	6	237285	237290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853416
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4281	NC_013361	ATTA	2	8	238235	238242	50 %	50 %	0 %	0 %	260853417
4282	NC_013361	A	7	7	238263	238269	100 %	0 %	0 %	0 %	260853417
4283	NC_013361	T	6	6	238317	238322	0 %	100 %	0 %	0 %	260853417
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4300	NC_013361	TCA	2	6	239134	239139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853418
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4303	NC_013361	ATG	2	6	239301	239306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853418
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4361	NC_013361	T	7	7	242623	242629	0 %	100 %	0 %	0 %	260853422
4362	NC_013361	TAT	2	6	242645	242650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853422
4363	NC_013361	GTAA	2	8	242652	242659	50 %	25 %	25 %	0 %	260853422
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4365	NC_013361	A	6	6	242780	242785	100 %	0 %	0 %	0 %	260853422
4366	NC_013361	AAG	2	6	242788	242793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853422
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4368	NC_013361	A	6	6	242825	242830	100 %	0 %	0 %	0 %	260853422
4369	NC_013361	GAAA	2	8	242835	242842	75 %	0 %	25 %	0 %	260853422
4370	NC_013361	TTTAA	2	10	242847	242856	40 %	60 %	0 %	0 %	260853422
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4374	NC_013361	CTC	2	6	243064	243069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260853423
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4397	NC_013361	TC	3	6	243924	243929	0 %	50 %	0 %	50 %	260853424
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4484	NC_013361	CATC	2	8	248060	248067	25 %	25 %	0 %	50 %	260853426
4485	NC_013361	GCA	2	6	248105	248110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853426
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4488	NC_013361	TCA	2	6	248302	248307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853426
4489	NC_013361	GCG	2	6	248319	248324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853426
4490	NC_013361	ATCGC	2	10	248344	248353	20 %	20 %	20 %	40 %	260853426
4491	NC_013361	CTGT	2	8	248358	248365	0 %	50 %	25 %	25 %	260853426
4492	NC_013361	GGC	2	6	248382	248387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853426
4493	NC_013361	TAA	2	6	248397	248402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853426
4494	NC_013361	CGG	2	6	248500	248505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853426
4495	NC_013361	CAG	2	6	248520	248525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853426
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4497	NC_013361	GC	3	6	248572	248577	0 %	0 %	50 %	50 %	260853426
4498	NC_013361	CAGC	2	8	248586	248593	25 %	0 %	25 %	50 %	260853426
4499	NC_013361	GTT	2	6	248711	248716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853426
4500	NC_013361	ATAA	2	8	248742	248749	75 %	25 %	0 %	0 %	260853426

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