MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 99348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_013361	GC	3	6	1017488	1017493	0 %	0 %	50 %	50 %	260854129
18003	NC_013361	AAAGAT	2	12	1017496	1017507	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	260854129
18004	NC_013361	TGA	2	6	1017515	1017520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260854129
18005	NC_013361	AGA	2	6	1017543	1017548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260854129
18006	NC_013361	TTAT	2	8	1017609	1017616	25 %	75 %	0 %	0 %	260854129
18007	NC_013361	CGA	2	6	1017627	1017632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854129
18008	NC_013361	ATC	2	6	1017682	1017687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260854130
18009	NC_013361	GCGATA	2	12	1017796	1017807	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	260854130
18010	NC_013361	TCG	2	6	1017823	1017828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854130
18011	NC_013361	GGC	2	6	1017909	1017914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260854130
18012	NC_013361	GGT	2	6	1017931	1017936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260854130
18013	NC_013361	TCCA	2	8	1017997	1018004	25 %	25 %	0 %	50 %	260854130
18014	NC_013361	ACG	2	6	1018020	1018025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854130
18015	NC_013361	GCC	2	6	1018066	1018071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260854130
18016	NC_013361	TCG	2	6	1018117	1018122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854130
18017	NC_013361	CAA	2	6	1018128	1018133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260854130
18018	NC_013361	TTC	2	6	1018230	1018235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260854130
18019	NC_013361	T	7	7	1018251	1018257	0 %	100 %	0 %	0 %	260854130
18020	NC_013361	GTTG	2	8	1018260	1018267	0 %	50 %	50 %	0 %	260854130
18021	NC_013361	ATT	2	6	1018269	1018274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260854130
18022	NC_013361	CTC	2	6	1018553	1018558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260854131
18023	NC_013361	TC	3	6	1018557	1018562	0 %	50 %	0 %	50 %	260854131
18024	NC_013361	CGG	2	6	1018621	1018626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260854131
18025	NC_013361	CGGT	2	8	1018816	1018823	0 %	25 %	50 %	25 %	260854131
18026	NC_013361	TCAT	2	8	1018989	1018996	25 %	50 %	0 %	25 %	260854131
18027	NC_013361	TGA	2	6	1019002	1019007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260854131
18028	NC_013361	A	6	6	1019019	1019024	100 %	0 %	0 %	0 %	260854131
18029	NC_013361	CG	4	8	1019090	1019097	0 %	0 %	50 %	50 %	260854131
18030	NC_013361	AAAGAG	2	12	1019157	1019168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260854131
18031	NC_013361	CAA	2	6	1019177	1019182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260854131
18032	NC_013361	TAACCG	2	12	1019195	1019206	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	260854131
18033	NC_013361	CTG	2	6	1019208	1019213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854131
18034	NC_013361	AGC	2	6	1019217	1019222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854131
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18036	NC_013361	CTT	2	6	1019390	1019395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260854131
18037	NC_013361	ACCGC	2	10	1019565	1019574	20 %	0 %	20 %	60 %	260854131
18038	NC_013361	A	6	6	1019577	1019582	100 %	0 %	0 %	0 %	260854131
18039	NC_013361	AGC	2	6	1019632	1019637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854131
18040	NC_013361	TGA	3	9	1019701	1019709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260854131
18041	NC_013361	CAA	2	6	1019849	1019854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260854132
18042	NC_013361	TCAC	2	8	1019855	1019862	25 %	25 %	0 %	50 %	260854132
18043	NC_013361	GC	3	6	1019893	1019898	0 %	0 %	50 %	50 %	260854132
18044	NC_013361	CGCC	2	8	1020024	1020031	0 %	0 %	25 %	75 %	260854132
18045	NC_013361	ATT	2	6	1020061	1020066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260854132
18046	NC_013361	CAC	2	6	1020120	1020125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260854132
18047	NC_013361	CGG	2	6	1020192	1020197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260854132
18048	NC_013361	AAT	2	6	1020226	1020231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260854132
18049	NC_013361	GTG	3	9	1020239	1020247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260854132
18050	NC_013361	A	6	6	1020256	1020261	100 %	0 %	0 %	0 %	260854132
18051	NC_013361	GCC	2	6	1020302	1020307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260854132
18052	NC_013361	CCA	2	6	1020321	1020326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260854132
18053	NC_013361	TGGC	2	8	1020356	1020363	0 %	25 %	50 %	25 %	260854132
18054	NC_013361	GCC	2	6	1020388	1020393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260854132
18055	NC_013361	ACG	2	6	1020401	1020406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854132
18056	NC_013361	GTT	2	6	1020418	1020423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260854132
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18060	NC_013361	CCAG	2	8	1020734	1020741	25 %	0 %	25 %	50 %	260854133
18061	NC_013361	CG	3	6	1020786	1020791	0 %	0 %	50 %	50 %	260854133
18062	NC_013361	GAC	2	6	1020802	1020807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854133
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18067	NC_013361	CAG	2	6	1021081	1021086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854133
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18070	NC_013361	GA	3	6	1021170	1021175	50 %	0 %	50 %	0 %	260854133
18071	NC_013361	AG	4	8	1021178	1021185	50 %	0 %	50 %	0 %	260854133
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18098	NC_013361	A	7	7	1022719	1022725	100 %	0 %	0 %	0 %	260854134
18099	NC_013361	GTC	2	6	1022773	1022778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854135
18100	NC_013361	GCGG	2	8	1022838	1022845	0 %	0 %	75 %	25 %	260854135
18101	NC_013361	CTGA	2	8	1022918	1022925	25 %	25 %	25 %	25 %	260854135
18102	NC_013361	AACCAC	2	12	1022932	1022943	50 %	0 %	0 %	50 %	260854135
18103	NC_013361	GC	3	6	1023012	1023017	0 %	0 %	50 %	50 %	260854135
18104	NC_013361	CGA	2	6	1023226	1023231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854136
18105	NC_013361	GCCT	2	8	1023266	1023273	0 %	25 %	25 %	50 %	260854136
18106	NC_013361	GCA	2	6	1023277	1023282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854136
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18109	NC_013361	TGC	2	6	1023400	1023405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854136
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18112	NC_013361	ATA	2	6	1023557	1023562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260854136
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18114	NC_013361	T	6	6	1023618	1023623	0 %	100 %	0 %	0 %	260854136
18115	NC_013361	AAT	2	6	1023632	1023637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260854136
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18117	NC_013361	GCC	2	6	1023737	1023742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260854136
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18121	NC_013361	CCAT	2	8	1023912	1023919	25 %	25 %	0 %	50 %	260854136
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18232	NC_013361	CTG	2	6	1030097	1030102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854144
18233	NC_013361	CCTG	2	8	1030120	1030127	0 %	25 %	25 %	50 %	260854144
18234	NC_013361	GAT	2	6	1030151	1030156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260854144
18235	NC_013361	GGT	2	6	1030181	1030186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260854144
18236	NC_013361	TGG	2	6	1030194	1030199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260854144
18237	NC_013361	GTTG	2	8	1030204	1030211	0 %	50 %	50 %	0 %	260854144
18238	NC_013361	CGT	2	6	1030231	1030236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854144
18239	NC_013361	GGC	2	6	1030255	1030260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260854144
18240	NC_013361	AT	3	6	1030315	1030320	50 %	50 %	0 %	0 %	260854144
18241	NC_013361	GTT	2	6	1030355	1030360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260854144
18242	NC_013361	CGG	2	6	1030388	1030393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260854144
18243	NC_013361	GGC	2	6	1030430	1030435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260854144
18244	NC_013361	CAC	2	6	1030458	1030463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260854144
18245	NC_013361	CG	3	6	1030489	1030494	0 %	0 %	50 %	50 %	260854144
18246	NC_013361	GGAA	2	8	1030582	1030589	50 %	0 %	50 %	0 %	260854144
18247	NC_013361	A	6	6	1030593	1030598	100 %	0 %	0 %	0 %	260854144
18248	NC_013361	GGT	2	6	1030676	1030681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260854144
18249	NC_013361	T	7	7	1030837	1030843	0 %	100 %	0 %	0 %	260854145
18250	NC_013361	GGC	2	6	1030984	1030989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260854145
18251	NC_013361	GAT	2	6	1031048	1031053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260854145
18252	NC_013361	TGG	2	6	1031067	1031072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260854145
18253	NC_013361	CTG	2	6	1031186	1031191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854145
18254	NC_013361	AAC	2	6	1031216	1031221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260854145
18255	NC_013361	TCC	2	6	1031238	1031243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260854145
18256	NC_013361	TAAA	2	8	1031609	1031616	75 %	25 %	0 %	0 %	260854146
18257	NC_013361	A	6	6	1031614	1031619	100 %	0 %	0 %	0 %	260854146
18258	NC_013361	A	6	6	1031684	1031689	100 %	0 %	0 %	0 %	260854146
18259	NC_013361	GTC	2	6	1031767	1031772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854146
18260	NC_013361	TGG	2	6	1031840	1031845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260854146
18261	NC_013361	GAA	2	6	1031925	1031930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260854146
18262	NC_013361	GCT	2	6	1031943	1031948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854146
18263	NC_013361	CGA	2	6	1032005	1032010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854146
18264	NC_013361	AGA	2	6	1032147	1032152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260854146
18265	NC_013361	GAT	2	6	1032208	1032213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260854146
18266	NC_013361	ACCGG	2	10	1032217	1032226	20 %	0 %	40 %	40 %	260854146
18267	NC_013361	CTG	2	6	1032235	1032240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854146
18268	NC_013361	CG	3	6	1032358	1032363	0 %	0 %	50 %	50 %	260854146
18269	NC_013361	GAA	2	6	1032372	1032377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260854146
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18272	NC_013361	GTA	2	6	1032508	1032513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260854146
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18279	NC_013361	GCT	2	6	1032952	1032957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854147
18280	NC_013361	GCT	2	6	1032985	1032990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854147
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18286	NC_013361	GC	3	6	1033338	1033343	0 %	0 %	50 %	50 %	260854147
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18289	NC_013361	TCGGT	2	10	1033554	1033563	0 %	40 %	40 %	20 %	260854147
18290	NC_013361	A	6	6	1033704	1033709	100 %	0 %	0 %	0 %	260854147
18291	NC_013361	GCC	2	6	1033726	1033731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260854147
18292	NC_013361	GAT	2	6	1033825	1033830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260854147
18293	NC_013361	CATCGT	2	12	1033853	1033864	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	260854147
18294	NC_013361	CGA	2	6	1033885	1033890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854147
18295	NC_013361	TG	3	6	1033919	1033924	0 %	50 %	50 %	0 %	260854147
18296	NC_013361	CTG	2	6	1033965	1033970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854148
18297	NC_013361	CCG	2	6	1033982	1033987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260854148
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18299	NC_013361	CTG	2	6	1034081	1034086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854148
18300	NC_013361	GC	4	8	1034126	1034133	0 %	0 %	50 %	50 %	260854148
18301	NC_013361	CGA	2	6	1034218	1034223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854148
18302	NC_013361	TAC	2	6	1034355	1034360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260854148
18303	NC_013361	CGT	2	6	1034373	1034378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854148
18304	NC_013361	A	6	6	1034422	1034427	100 %	0 %	0 %	0 %	260854148
18305	NC_013361	AAT	2	6	1034441	1034446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260854148
18306	NC_013361	CTG	2	6	1034450	1034455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854148
18307	NC_013361	TTC	2	6	1034487	1034492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260854148
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18309	NC_013361	TGG	2	6	1034589	1034594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260854148
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18312	NC_013361	CAT	2	6	1034749	1034754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260854148
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18315	NC_013361	TGC	3	9	1034832	1034840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854148
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18317	NC_013361	AAT	2	6	1034902	1034907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260854148
18318	NC_013361	GTTC	2	8	1034917	1034924	0 %	50 %	25 %	25 %	260854149
18319	NC_013361	TGC	2	6	1034945	1034950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854149
18320	NC_013361	ATGCTG	2	12	1034977	1034988	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	260854149
18321	NC_013361	GAT	2	6	1035078	1035083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260854149
18322	NC_013361	GGTT	2	8	1035090	1035097	0 %	50 %	50 %	0 %	260854149
18323	NC_013361	TGC	2	6	1035111	1035116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854149
18324	NC_013361	CGG	3	9	1035128	1035136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260854149
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18327	NC_013361	CGC	2	6	1035221	1035226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260854149
18328	NC_013361	TCA	2	6	1035242	1035247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260854149
18329	NC_013361	TGT	2	6	1035260	1035265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260854149
18330	NC_013361	TAT	2	6	1035266	1035271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260854149
18331	NC_013361	TCG	2	6	1035272	1035277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854149
18332	NC_013361	TGGC	2	8	1035294	1035301	0 %	25 %	50 %	25 %	260854149
18333	NC_013361	CTGG	2	8	1035327	1035334	0 %	25 %	50 %	25 %	260854149
18334	NC_013361	TTC	2	6	1035375	1035380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260854149
18335	NC_013361	AGA	2	6	1035408	1035413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260854149
18336	NC_013361	AGC	2	6	1035414	1035419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854149
18337	NC_013361	CGC	2	6	1035437	1035442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260854149
18338	NC_013361	GAT	2	6	1035471	1035476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260854149
18339	NC_013361	CTGG	2	8	1035494	1035501	0 %	25 %	50 %	25 %	260854149
18340	NC_013361	TGA	2	6	1035525	1035530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260854149
18341	NC_013361	CCGGG	2	10	1035554	1035563	0 %	0 %	60 %	40 %	260854149
18342	NC_013361	CCA	2	6	1035566	1035571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260854149
18343	NC_013361	T	6	6	1035825	1035830	0 %	100 %	0 %	0 %	260854150
18344	NC_013361	GGC	2	6	1035884	1035889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260854150
18345	NC_013361	ATT	2	6	1035897	1035902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260854150
18346	NC_013361	TGA	2	6	1035925	1035930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260854150
18347	NC_013361	TTCA	2	8	1035966	1035973	25 %	50 %	0 %	25 %	260854150
18348	NC_013361	GC	3	6	1036080	1036085	0 %	0 %	50 %	50 %	260854150
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18464	NC_013361	TTA	2	6	1042012	1042017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260854157
18465	NC_013361	TGC	2	6	1042088	1042093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854157
18466	NC_013361	CCT	2	6	1042141	1042146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260854157
18467	NC_013361	GAG	2	6	1042212	1042217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	260854157
18468	NC_013361	ATC	2	6	1042421	1042426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260854158
18469	NC_013361	GTG	2	6	1042442	1042447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260854158
18470	NC_013361	CGT	2	6	1042612	1042617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854158
18471	NC_013361	CGG	2	6	1042686	1042691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260854158
18472	NC_013361	TCT	2	6	1042715	1042720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260854159
18473	NC_013361	CAGGCG	2	12	1042810	1042821	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	260854159
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18475	NC_013361	ACC	2	6	1042935	1042940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260854159
18476	NC_013361	CTGGC	2	10	1042990	1042999	0 %	20 %	40 %	40 %	260854159
18477	NC_013361	TGGC	2	8	1043073	1043080	0 %	25 %	50 %	25 %	260854159
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18479	NC_013361	ATT	2	6	1043241	1043246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260854159
18480	NC_013361	GCA	2	6	1043253	1043258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854159
18481	NC_013361	GCA	2	6	1043265	1043270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854159
18482	NC_013361	GC	4	8	1043322	1043329	0 %	0 %	50 %	50 %	260854159
18483	NC_013361	CA	3	6	1043332	1043337	50 %	0 %	0 %	50 %	260854159
18484	NC_013361	GC	3	6	1043371	1043376	0 %	0 %	50 %	50 %	260854159
18485	NC_013361	CG	3	6	1043408	1043413	0 %	0 %	50 %	50 %	260854159
18486	NC_013361	AGC	2	6	1043414	1043419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260854159
18487	NC_013361	TA	3	6	1043462	1043467	50 %	50 %	0 %	0 %	260854159
18488	NC_013361	GGC	2	6	1043565	1043570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260854160
18489	NC_013361	TGA	2	6	1043597	1043602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260854160
18490	NC_013361	GCG	2	6	1043687	1043692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260854160
18491	NC_013361	TGC	2	6	1043726	1043731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854160
18492	NC_013361	TCG	2	6	1043791	1043796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854160
18493	NC_013361	TGC	2	6	1043813	1043818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260854160
18494	NC_013361	TGT	2	6	1043846	1043851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260854160
18495	NC_013361	AC	3	6	1043852	1043857	50 %	0 %	0 %	50 %	260854160
18496	NC_013361	GCCA	2	8	1043893	1043900	25 %	0 %	25 %	50 %	260854160
18497	NC_013361	TAG	2	6	1043923	1043928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260854160
18498	NC_013361	GCC	2	6	1043949	1043954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260854160
18499	NC_013361	GTG	2	6	1043979	1043984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260854160
18500	NC_013361	CAT	2	6	1043985	1043990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260854160

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