MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O26:H11 str. 11368 chromosome

Total Repeats: 99348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013361	ATG	2	6	30299	30304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853241
502	NC_013361	G	6	6	30334	30339	0 %	0 %	100 %	0 %	260853241
503	NC_013361	GCC	2	6	30347	30352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853241
504	NC_013361	GGC	2	6	30363	30368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853241
505	NC_013361	GCG	2	6	30397	30402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853241
506	NC_013361	TCT	2	6	30418	30423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853241
507	NC_013361	GCTG	2	8	30447	30454	0 %	25 %	50 %	25 %	260853241
508	NC_013361	AGC	2	6	30484	30489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853241
509	NC_013361	GAT	2	6	30505	30510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853241
510	NC_013361	CGC	3	9	30642	30650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853241
511	NC_013361	GCC	2	6	30670	30675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853241
512	NC_013361	GCT	2	6	30708	30713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853241
513	NC_013361	AGC	2	6	30720	30725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853241
514	NC_013361	ATT	2	6	30757	30762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853241
515	NC_013361	CAT	2	6	30769	30774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853241
516	NC_013361	CGTG	2	8	30924	30931	0 %	25 %	50 %	25 %	260853241
517	NC_013361	CGG	2	6	31645	31650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853242
518	NC_013361	TCCT	2	8	31706	31713	0 %	50 %	0 %	50 %	260853242
519	NC_013361	CTTA	2	8	31734	31741	25 %	50 %	0 %	25 %	260853242
520	NC_013361	GAA	2	6	31779	31784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853242
521	NC_013361	TCT	2	6	31785	31790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853242
522	NC_013361	CT	3	6	31863	31868	0 %	50 %	0 %	50 %	260853242
523	NC_013361	GCG	2	6	31989	31994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853242
524	NC_013361	CG	3	6	32013	32018	0 %	0 %	50 %	50 %	260853242
525	NC_013361	ACC	2	6	32058	32063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853242
526	NC_013361	CGG	2	6	32105	32110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853242
527	NC_013361	A	6	6	32124	32129	100 %	0 %	0 %	0 %	260853242
528	NC_013361	CGT	2	6	32150	32155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853242
529	NC_013361	TGG	2	6	32197	32202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853242
530	NC_013361	TCA	2	6	32384	32389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853242
531	NC_013361	GCT	2	6	32390	32395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853242
532	NC_013361	CAC	2	6	32439	32444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853242
533	NC_013361	GGC	2	6	32445	32450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853242
534	NC_013361	GTG	2	6	32481	32486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853242
535	NC_013361	AGCC	2	8	32636	32643	25 %	0 %	25 %	50 %	260853242
536	NC_013361	ACG	2	6	32653	32658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853242
537	NC_013361	GTT	2	6	32666	32671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	260853242
538	NC_013361	ACT	2	6	32817	32822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853243
539	NC_013361	GC	3	6	32826	32831	0 %	0 %	50 %	50 %	260853243
540	NC_013361	CAT	2	6	32896	32901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853243
541	NC_013361	GACC	2	8	32902	32909	25 %	0 %	25 %	50 %	260853243
542	NC_013361	ATT	2	6	32966	32971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853243
543	NC_013361	TGC	2	6	32994	32999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853243
544	NC_013361	GC	3	6	33030	33035	0 %	0 %	50 %	50 %	260853243
545	NC_013361	TGGAGC	2	12	33036	33047	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	260853243
546	NC_013361	CCG	2	6	33093	33098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853243
547	NC_013361	AGA	2	6	33115	33120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853243
548	NC_013361	CCG	2	6	33121	33126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853243
549	NC_013361	GAA	2	6	33145	33150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853243
550	NC_013361	CG	3	6	33166	33171	0 %	0 %	50 %	50 %	260853243
551	NC_013361	CA	3	6	33183	33188	50 %	0 %	0 %	50 %	260853243
552	NC_013361	GAA	2	6	33194	33199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853243
553	NC_013361	ATT	2	6	33236	33241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	260853243
554	NC_013361	GCG	3	9	33267	33275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853243
555	NC_013361	GAA	2	6	33302	33307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853243
556	NC_013361	TC	4	8	33328	33335	0 %	50 %	0 %	50 %	260853243
557	NC_013361	TGAT	2	8	33351	33358	25 %	50 %	25 %	0 %	260853243
558	NC_013361	GTG	2	6	33395	33400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853243
559	NC_013361	CAT	2	6	33421	33426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853243
560	NC_013361	TGC	2	6	33549	33554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853243
561	NC_013361	GGT	2	6	33575	33580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853243
562	NC_013361	CG	3	6	33642	33647	0 %	0 %	50 %	50 %	260853243
563	NC_013361	TTC	2	6	33655	33660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	260853243
564	NC_013361	GGC	2	6	33703	33708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853243
565	NC_013361	CGA	2	6	33733	33738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853243
566	NC_013361	TGA	2	6	33741	33746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853243
567	NC_013361	CCT	2	6	33774	33779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	260853243
568	NC_013361	CGCA	2	8	33902	33909	25 %	0 %	25 %	50 %	260853243
569	NC_013361	CTGT	2	8	34076	34083	0 %	50 %	25 %	25 %	260853243
570	NC_013361	GAA	2	6	34136	34141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853243
571	NC_013361	GGCG	2	8	34252	34259	0 %	0 %	75 %	25 %	260853243
572	NC_013361	GAA	2	6	34379	34384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853243
573	NC_013361	GCGAA	2	10	34389	34398	40 %	0 %	40 %	20 %	260853243
574	NC_013361	ACCG	2	8	34406	34413	25 %	0 %	25 %	50 %	260853243
575	NC_013361	A	6	6	34416	34421	100 %	0 %	0 %	0 %	260853243
576	NC_013361	CGG	3	9	34432	34440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853243
577	NC_013361	ACT	2	6	34473	34478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853243
578	NC_013361	CGG	2	6	34663	34668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853243
579	NC_013361	GC	5	10	34688	34697	0 %	0 %	50 %	50 %	260853243
580	NC_013361	GCT	2	6	34703	34708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853243
581	NC_013361	AGA	2	6	34753	34758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853243
582	NC_013361	CTGAAA	2	12	34790	34801	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	260853243
583	NC_013361	TGG	2	6	34872	34877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853243
584	NC_013361	CGTC	2	8	34880	34887	0 %	25 %	25 %	50 %	260853243
585	NC_013361	CGG	2	6	34897	34902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853243
586	NC_013361	CGG	2	6	34956	34961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853243
587	NC_013361	TGA	2	6	35005	35010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853243
588	NC_013361	GGC	2	6	35063	35068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853243
589	NC_013361	GGCG	2	8	35089	35096	0 %	0 %	75 %	25 %	260853243
590	NC_013361	CAG	2	6	35168	35173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853243
591	NC_013361	TGA	2	6	35211	35216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853243
592	NC_013361	AAC	2	6	35237	35242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	260853243
593	NC_013361	GCG	2	6	35273	35278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853243
594	NC_013361	CCGTT	2	10	35283	35292	0 %	40 %	20 %	40 %	260853243
595	NC_013361	GGC	2	6	35329	35334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853243
596	NC_013361	TGGC	2	8	35343	35350	0 %	25 %	50 %	25 %	260853243
597	NC_013361	GCTG	2	8	35356	35363	0 %	25 %	50 %	25 %	260853243
598	NC_013361	AAG	2	6	35379	35384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853243
599	NC_013361	TAC	2	6	35396	35401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853243
600	NC_013361	GTG	2	6	35414	35419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853243
601	NC_013361	GCA	2	6	35538	35543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	260853243
602	NC_013361	CCA	2	6	35547	35552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853243
603	NC_013361	GAA	2	6	35554	35559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	260853243
604	NC_013361	GTG	2	6	35606	35611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853243
605	NC_013361	GGC	2	6	35617	35622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	260853243
606	NC_013361	CTG	2	6	35627	35632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853243
607	NC_013361	CACGG	2	10	35660	35669	20 %	0 %	40 %	40 %	260853243
608	NC_013361	CAT	2	6	35773	35778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	260853243
609	NC_013361	CG	3	6	35798	35803	0 %	0 %	50 %	50 %	260853243
610	NC_013361	ACC	2	6	35861	35866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	260853243
611	NC_013361	GGT	2	6	35873	35878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	260853243
612	NC_013361	ATA	2	6	35956	35961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853243
613	NC_013361	TGA	2	6	36021	36026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853244
614	NC_013361	T	8	8	36033	36040	0 %	100 %	0 %	0 %	260853244
615	NC_013361	TGA	2	6	36077	36082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853244
616	NC_013361	AT	3	6	36134	36139	50 %	50 %	0 %	0 %	260853244
617	NC_013361	TG	3	6	36221	36226	0 %	50 %	50 %	0 %	260853245
618	NC_013361	GAT	2	6	36270	36275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853245
619	NC_013361	GGTG	2	8	36287	36294	0 %	25 %	75 %	0 %	260853245
620	NC_013361	AG	3	6	36301	36306	50 %	0 %	50 %	0 %	260853245
621	NC_013361	GAT	2	6	36399	36404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853245
622	NC_013361	TAA	2	6	36408	36413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	260853245
623	NC_013361	TGCCAG	2	12	36430	36441	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	260853245
624	NC_013361	CG	3	6	36480	36485	0 %	0 %	50 %	50 %	260853245
625	NC_013361	AAGA	2	8	36522	36529	75 %	0 %	25 %	0 %	260853245
626	NC_013361	CGC	2	6	36530	36535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	260853245
627	NC_013361	GAT	2	6	36585	36590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	260853245
628	NC_013361	CGT	2	6	36607	36612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853245
629	NC_013361	CGT	2	6	36722	36727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	260853246
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