MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Erwinia pyrifoliae Ep1/96 chromosome

Total Repeats: 74362

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012214	CCGG	2	8	35	42	0 %	0 %	50 %	50 %	259906683
2	NC_012214	CAG	2	6	115	120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906683
3	NC_012214	TCG	2	6	122	127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906683
4	NC_012214	GCT	2	6	210	215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906683
5	NC_012214	GTG	2	6	338	343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259906683
6	NC_012214	GAT	2	6	378	383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259906683
7	NC_012214	TAATG	2	10	424	433	40 %	40 %	20 %	0 %	259906683
8	NC_012214	TTG	2	6	716	721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259906684
9	NC_012214	ATCG	3	12	742	753	25 %	25 %	25 %	25 %	259906684
10	NC_012214	TAA	2	6	765	770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259906684
11	NC_012214	GGT	2	6	787	792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259906684
12	NC_012214	CCA	2	6	804	809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259906684
13	NC_012214	CTT	2	6	810	815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259906684
14	NC_012214	GCT	2	6	819	824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906684
15	NC_012214	ATG	2	6	869	874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259906684
16	NC_012214	AGC	2	6	882	887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906684
17	NC_012214	CGT	2	6	891	896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906684
18	NC_012214	ATG	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259906684
19	NC_012214	CCTG	2	8	944	951	0 %	25 %	25 %	50 %	259906684
20	NC_012214	T	6	6	957	962	0 %	100 %	0 %	0 %	259906684
21	NC_012214	GC	3	6	1261	1266	0 %	0 %	50 %	50 %	259906685
22	NC_012214	CGG	2	6	1320	1325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259906685
23	NC_012214	CAG	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906685
24	NC_012214	GCC	2	6	1381	1386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259906685
25	NC_012214	AG	3	6	1435	1440	50 %	0 %	50 %	0 %	259906685
26	NC_012214	CGC	2	6	1449	1454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259906685
27	NC_012214	ATC	2	6	1463	1468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259906685
28	NC_012214	CGGC	2	8	1595	1602	0 %	0 %	50 %	50 %	259906685
29	NC_012214	TGG	2	6	1640	1645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259906685
30	NC_012214	CAC	2	6	1692	1697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259906685
31	NC_012214	GC	3	6	1726	1731	0 %	0 %	50 %	50 %	259906685
32	NC_012214	ACC	2	6	1748	1753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259906685
33	NC_012214	GCTG	2	8	1827	1834	0 %	25 %	50 %	25 %	259906685
34	NC_012214	GC	3	6	1949	1954	0 %	0 %	50 %	50 %	259906685
35	NC_012214	TGC	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906685
36	NC_012214	GAA	2	6	2002	2007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259906685
37	NC_012214	GCC	2	6	2068	2073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259906685
38	NC_012214	TCA	2	6	2076	2081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259906685
39	NC_012214	ATC	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259906685
40	NC_012214	GCG	2	6	2387	2392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259906685
41	NC_012214	CTT	2	6	2439	2444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259906685
42	NC_012214	CAG	2	6	2449	2454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906685
43	NC_012214	GCT	2	6	2475	2480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906685
44	NC_012214	CCAGCC	2	12	2530	2541	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	259906685
45	NC_012214	CCA	2	6	2551	2556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259906685
46	NC_012214	GCC	2	6	2572	2577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259906685
47	NC_012214	GGC	2	6	2578	2583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259906685
48	NC_012214	A	6	6	2593	2598	100 %	0 %	0 %	0 %	259906685
49	NC_012214	ATC	2	6	2686	2691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259906685
50	NC_012214	CAGG	2	8	2777	2784	25 %	0 %	50 %	25 %	259906685
51	NC_012214	CTG	2	6	2929	2934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906685
52	NC_012214	GGC	2	6	2993	2998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259906685
53	NC_012214	TCG	2	6	3057	3062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906685
54	NC_012214	GTC	2	6	3073	3078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906685
55	NC_012214	GC	3	6	3082	3087	0 %	0 %	50 %	50 %	259906685
56	NC_012214	GCC	2	6	3097	3102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259906685
57	NC_012214	TTG	2	6	3113	3118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259906685
58	NC_012214	AGA	2	6	3147	3152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259906685
59	NC_012214	GC	3	6	3191	3196	0 %	0 %	50 %	50 %	259906685
60	NC_012214	TCG	2	6	3197	3202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906685
61	NC_012214	TGT	2	6	3275	3280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259906685
62	NC_012214	TGT	2	6	3335	3340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259906685
63	NC_012214	ATG	2	6	3352	3357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259906685
64	NC_012214	ATA	2	6	3509	3514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	259906686
65	NC_012214	GCT	2	6	3555	3560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906686
66	NC_012214	TGC	3	9	3563	3571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906686
67	NC_012214	CAT	2	6	3648	3653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259906686
68	NC_012214	AGGC	2	8	3692	3699	25 %	0 %	50 %	25 %	259906686
69	NC_012214	ACC	2	6	3785	3790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259906686
70	NC_012214	TGA	2	6	3791	3796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259906686
71	NC_012214	ATG	2	6	3806	3811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259906686
72	NC_012214	GCG	2	6	3817	3822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259906686
73	NC_012214	GGCAA	2	10	3850	3859	40 %	0 %	40 %	20 %	259906686
74	NC_012214	CGTT	2	8	3875	3882	0 %	50 %	25 %	25 %	259906686
75	NC_012214	GAC	2	6	3958	3963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906686
76	NC_012214	GTGAT	2	10	3974	3983	20 %	40 %	40 %	0 %	259906686
77	NC_012214	CAG	2	6	4015	4020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906686
78	NC_012214	CCA	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259906686
79	NC_012214	CGG	2	6	4087	4092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259906686
80	NC_012214	CAG	2	6	4093	4098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906686
81	NC_012214	GCT	2	6	4167	4172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906686
82	NC_012214	TGT	2	6	4235	4240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259906686
83	NC_012214	CAG	2	6	4249	4254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906686
84	NC_012214	CTGG	3	12	4257	4268	0 %	25 %	50 %	25 %	259906686
85	NC_012214	CGC	2	6	4305	4310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259906686
86	NC_012214	CGC	2	6	4320	4325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259906686
87	NC_012214	CGC	2	6	4348	4353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259906686
88	NC_012214	TCG	2	6	4358	4363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906686
89	NC_012214	CAG	2	6	4423	4428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906686
90	NC_012214	AGC	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906686
91	NC_012214	CAG	2	6	4609	4614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906686
92	NC_012214	CTG	2	6	4660	4665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906686
93	NC_012214	GCG	2	6	4692	4697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259906686
94	NC_012214	CGT	2	6	4739	4744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906686
95	NC_012214	CG	3	6	4752	4757	0 %	0 %	50 %	50 %	259906686
96	NC_012214	AGA	2	6	4791	4796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	259906686
97	NC_012214	CAG	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906686
98	NC_012214	CCA	2	6	4839	4844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259906686
99	NC_012214	CTG	2	6	4926	4931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906687
100	NC_012214	TTC	2	6	4938	4943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259906687
101	NC_012214	GCCA	2	8	4951	4958	25 %	0 %	25 %	50 %	259906687
102	NC_012214	ACAG	2	8	4973	4980	50 %	0 %	25 %	25 %	259906687
103	NC_012214	GCTG	2	8	4988	4995	0 %	25 %	50 %	25 %	259906687
104	NC_012214	TGCGC	2	10	5003	5012	0 %	20 %	40 %	40 %	259906687
105	NC_012214	CTG	2	6	5067	5072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906687
106	NC_012214	GCA	2	6	5084	5089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906687
107	NC_012214	GTC	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906687
108	NC_012214	CGG	2	6	5309	5314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259906687
109	NC_012214	GCG	2	6	5320	5325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259906687
110	NC_012214	GCC	2	6	5358	5363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259906687
111	NC_012214	TGC	4	12	5398	5409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906687
112	NC_012214	GGC	2	6	5417	5422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259906687
113	NC_012214	TTG	2	6	5433	5438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	259906687
114	NC_012214	GCT	3	9	5456	5464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906687
115	NC_012214	CAG	2	6	5547	5552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906687
116	NC_012214	GCA	2	6	5681	5686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906687
117	NC_012214	CTGA	2	8	5724	5731	25 %	25 %	25 %	25 %	259906687
118	NC_012214	CTG	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906687
119	NC_012214	CTC	2	6	5754	5759	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	259906687
120	NC_012214	GATTTT	2	12	5789	5800	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	259906687
121	NC_012214	CTG	2	6	5805	5810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906687
122	NC_012214	CAG	2	6	5937	5942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906687
123	NC_012214	TTC	2	6	5958	5963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259906687
124	NC_012214	CGTT	2	8	5986	5993	0 %	50 %	25 %	25 %	259906687
125	NC_012214	CAG	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906687
126	NC_012214	GCCGG	2	10	6022	6031	0 %	0 %	60 %	40 %	259906687
127	NC_012214	TCA	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259906687
128	NC_012214	TGGA	2	8	6121	6128	25 %	25 %	50 %	0 %	259906687
129	NC_012214	TCA	2	6	6167	6172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259906687
130	NC_012214	GCGA	2	8	6216	6223	25 %	0 %	50 %	25 %	259906687
131	NC_012214	CGG	2	6	6243	6248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259906687
132	NC_012214	CAG	2	6	6285	6290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906687
133	NC_012214	ATG	2	6	6306	6311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259906687
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140	NC_012214	GGT	2	6	6991	6996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259906688
141	NC_012214	CGG	2	6	7005	7010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	259906688
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253	NC_012214	TCTT	2	8	12723	12730	0 %	75 %	0 %	25 %	259906689
254	NC_012214	T	7	7	12752	12758	0 %	100 %	0 %	0 %	259906689
255	NC_012214	AT	3	6	12759	12764	50 %	50 %	0 %	0 %	259906689
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259	NC_012214	TTA	2	6	12874	12879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259906689
260	NC_012214	ATT	2	6	12889	12894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259906689
261	NC_012214	CCG	2	6	12895	12900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259906689
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393	NC_012214	TA	3	6	19491	19496	50 %	50 %	0 %	0 %	259906690
394	NC_012214	CTTT	3	12	19546	19557	0 %	75 %	0 %	25 %	259906690
395	NC_012214	TCTG	2	8	19611	19618	0 %	50 %	25 %	25 %	259906690
396	NC_012214	CTT	2	6	19660	19665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259906690
397	NC_012214	TGA	2	6	19671	19676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259906690
398	NC_012214	GCA	2	6	19697	19702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906690
399	NC_012214	TACC	2	8	19718	19725	25 %	25 %	0 %	50 %	259906690
400	NC_012214	TCT	2	6	19731	19736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259906690
401	NC_012214	GTAA	2	8	19745	19752	50 %	25 %	25 %	0 %	259906690
402	NC_012214	TTTC	2	8	19761	19768	0 %	75 %	0 %	25 %	259906690
403	NC_012214	AT	4	8	19797	19804	50 %	50 %	0 %	0 %	259906690
404	NC_012214	TC	3	6	19819	19824	0 %	50 %	0 %	50 %	259906690
405	NC_012214	T	6	6	19883	19888	0 %	100 %	0 %	0 %	259906690
406	NC_012214	TC	3	6	19908	19913	0 %	50 %	0 %	50 %	259906690
407	NC_012214	T	9	9	19916	19924	0 %	100 %	0 %	0 %	259906690
408	NC_012214	T	7	7	20024	20030	0 %	100 %	0 %	0 %	259906690
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410	NC_012214	GAAA	2	8	20108	20115	75 %	0 %	25 %	0 %	259906690
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414	NC_012214	TTC	2	6	20197	20202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259906690
415	NC_012214	TAT	2	6	20207	20212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	259906690
416	NC_012214	CTC	2	6	20232	20237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	259906690
417	NC_012214	TTC	2	6	20245	20250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259906690
418	NC_012214	CT	3	6	20311	20316	0 %	50 %	0 %	50 %	259906690
419	NC_012214	A	6	6	20326	20331	100 %	0 %	0 %	0 %	259906690
420	NC_012214	GTG	2	6	20374	20379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	259906690
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425	NC_012214	TGA	2	6	20496	20501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	259906690
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427	NC_012214	GCC	2	6	20543	20548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259906690
428	NC_012214	CCG	2	6	20562	20567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259906690
429	NC_012214	GCA	2	6	20599	20604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906690
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431	NC_012214	CCG	2	6	20747	20752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259906690
432	NC_012214	GA	3	6	20820	20825	50 %	0 %	50 %	0 %	259906690
433	NC_012214	CCG	2	6	20830	20835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259906690
434	NC_012214	G	9	9	20922	20930	0 %	0 %	100 %	0 %	259906690
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438	NC_012214	G	6	6	21361	21366	0 %	0 %	100 %	0 %	259906691
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442	NC_012214	GCA	2	6	21545	21550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	259906691
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453	NC_012214	GC	3	6	21935	21940	0 %	0 %	50 %	50 %	259906692
454	NC_012214	AGGC	2	8	21941	21948	25 %	0 %	50 %	25 %	259906692
455	NC_012214	TCT	2	6	22080	22085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	259906692
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461	NC_012214	TCAG	2	8	22403	22410	25 %	25 %	25 %	25 %	259906692
462	NC_012214	CG	3	6	22419	22424	0 %	0 %	50 %	50 %	259906692
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472	NC_012214	CAC	3	9	22820	22828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	259906693
473	NC_012214	CTG	2	6	22839	22844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906693
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479	NC_012214	AT	3	6	23246	23251	50 %	50 %	0 %	0 %	259906693
480	NC_012214	GCT	2	6	23613	23618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906694
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497	NC_012214	ATC	2	6	24167	24172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	259906694
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499	NC_012214	CTG	2	6	24295	24300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	259906694
500	NC_012214	CCG	2	6	24404	24409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	259906694

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