MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 chromosome

Total Repeats: 95561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011353	TCA	2	6	349004	349009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398292
6002	NC_011353	GGAT	2	8	349046	349053	25 %	25 %	50 %	0 %	209398292
6003	NC_011353	TCA	2	6	349062	349067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209398292
6004	NC_011353	GAT	2	6	349705	349710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209396191
6005	NC_011353	CTG	2	6	349871	349876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209396191
6006	NC_011353	CCT	2	6	349900	349905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209396191
6007	NC_011353	TGC	2	6	349989	349994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209396191
6008	NC_011353	GCT	2	6	350026	350031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209396191
6009	NC_011353	TCT	2	6	350115	350120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209399065
6010	NC_011353	GAC	2	6	350121	350126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209399065
6011	NC_011353	CTG	2	6	350133	350138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399065
6012	NC_011353	CCG	2	6	350243	350248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209399065
6013	NC_011353	CCG	2	6	350282	350287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209399065
6014	NC_011353	AG	3	6	350327	350332	50 %	0 %	50 %	0 %	209399065
6015	NC_011353	GCG	2	6	350448	350453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209399065
6016	NC_011353	TGC	2	6	350457	350462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399065
6017	NC_011353	GCG	2	6	350470	350475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209399065
6018	NC_011353	CCG	2	6	350503	350508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209399065
6019	NC_011353	GCACCT	2	12	350598	350609	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209399065
6020	NC_011353	GCT	2	6	350645	350650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399065
6021	NC_011353	CGGC	2	8	350714	350721	0 %	0 %	50 %	50 %	209399065
6022	NC_011353	CTG	2	6	350745	350750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399065
6023	NC_011353	ATGC	2	8	350764	350771	25 %	25 %	25 %	25 %	209399065
6024	NC_011353	GCT	2	6	350777	350782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399065
6025	NC_011353	TGAC	2	8	350818	350825	25 %	25 %	25 %	25 %	209399065
6026	NC_011353	GAT	2	6	350841	350846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209399065
6027	NC_011353	CTG	2	6	350862	350867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399065
6028	NC_011353	TAA	2	6	350873	350878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209399065
6029	NC_011353	GAAGAC	2	12	350879	350890	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209399065
6030	NC_011353	TGA	2	6	350915	350920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209399065
6031	NC_011353	CATC	2	8	350984	350991	25 %	25 %	0 %	50 %	209399065
6032	NC_011353	TGC	2	6	351022	351027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399065
6033	NC_011353	TGG	2	6	351068	351073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209399065
6034	NC_011353	CTGC	2	8	351085	351092	0 %	25 %	25 %	50 %	209399065
6035	NC_011353	CCG	2	6	351104	351109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209399065
6036	NC_011353	GAA	2	6	351153	351158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209399065
6037	NC_011353	AGC	2	6	351220	351225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209399065
6038	NC_011353	GTT	2	6	351257	351262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209399065
6039	NC_011353	ACA	3	9	351400	351408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209399065
6040	NC_011353	GCGG	2	8	351425	351432	0 %	0 %	75 %	25 %	209399065
6041	NC_011353	TTC	2	6	351459	351464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209399065
6042	NC_011353	TGG	2	6	351476	351481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209399065
6043	NC_011353	CCAG	2	8	352471	352478	25 %	0 %	25 %	50 %	209400765
6044	NC_011353	GTT	2	6	352553	352558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209400765
6045	NC_011353	CAA	2	6	352632	352637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209400765
6046	NC_011353	CTT	2	6	352659	352664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209400765
6047	NC_011353	CTGC	2	8	352712	352719	0 %	25 %	25 %	50 %	209400765
6048	NC_011353	TCAAT	2	10	352734	352743	40 %	40 %	0 %	20 %	209400765
6049	NC_011353	GTAT	2	8	352802	352809	25 %	50 %	25 %	0 %	209400765
6050	NC_011353	C	6	6	352870	352875	0 %	0 %	0 %	100 %	209400765
6051	NC_011353	TTC	2	6	352885	352890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209400765
6052	NC_011353	T	6	6	352946	352951	0 %	100 %	0 %	0 %	209400765
6053	NC_011353	TCC	2	6	352999	353004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209400765
6054	NC_011353	A	6	6	353039	353044	100 %	0 %	0 %	0 %	209400765
6055	NC_011353	CT	3	6	353181	353186	0 %	50 %	0 %	50 %	209400765
6056	NC_011353	TAA	2	6	353226	353231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209400765
6057	NC_011353	TTA	2	6	353264	353269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209400765
6058	NC_011353	GCT	2	6	353321	353326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209400765
6059	NC_011353	GTC	2	6	353353	353358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209400765
6060	NC_011353	TTA	2	6	353418	353423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209400765
6061	NC_011353	GTC	2	6	353504	353509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209400765
6062	NC_011353	ACGAT	2	10	353522	353531	40 %	20 %	20 %	20 %	209400765
6063	NC_011353	T	6	6	353544	353549	0 %	100 %	0 %	0 %	209400765
6064	NC_011353	ATG	2	6	353574	353579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209400765
6065	NC_011353	ATT	2	6	353826	353831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209399836
6066	NC_011353	AATT	2	8	353854	353861	50 %	50 %	0 %	0 %	209399836
6067	NC_011353	AGC	2	6	353950	353955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209399836
6068	NC_011353	AAT	2	6	353962	353967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209399836
6069	NC_011353	CAC	2	6	354013	354018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209399836
6070	NC_011353	ATT	2	6	354023	354028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209399836
6071	NC_011353	ATA	2	6	354142	354147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209399836
6072	NC_011353	ATC	2	6	354220	354225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209399836
6073	NC_011353	TTG	2	6	354262	354267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209399836
6074	NC_011353	TCCACC	2	12	354400	354411	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	209399836
6075	NC_011353	GTAAG	2	10	354448	354457	40 %	20 %	40 %	0 %	209399836
6076	NC_011353	GGTAA	2	10	354460	354469	40 %	20 %	40 %	0 %	209399836
6077	NC_011353	TTG	2	6	354501	354506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209399836
6078	NC_011353	GCT	2	6	354535	354540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209399836
6079	NC_011353	GGC	2	6	354592	354597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209399836
6080	NC_011353	AC	3	6	354603	354608	50 %	0 %	0 %	50 %	209399836
6081	NC_011353	T	7	7	354668	354674	0 %	100 %	0 %	0 %	209399836
6082	NC_011353	CAG	2	6	354705	354710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209399836
6083	NC_011353	GT	3	6	354725	354730	0 %	50 %	50 %	0 %	209399836
6084	NC_011353	TTTCA	2	10	354745	354754	20 %	60 %	0 %	20 %	209399836
6085	NC_011353	ATG	2	6	354907	354912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209396927
6086	NC_011353	AGGA	2	8	355100	355107	50 %	0 %	50 %	0 %	209396927
6087	NC_011353	TGA	2	6	355149	355154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209396927
6088	NC_011353	TCC	2	6	355213	355218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209396927
6089	NC_011353	GCA	2	6	355225	355230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209396927
6090	NC_011353	TTG	2	6	355238	355243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209396927
6091	NC_011353	ATT	2	6	355321	355326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209396927
6092	NC_011353	TTA	2	6	355403	355408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209396927
6093	NC_011353	ATT	2	6	355433	355438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209396927
6094	NC_011353	CT	3	6	355522	355527	0 %	50 %	0 %	50 %	209396927
6095	NC_011353	G	6	6	355551	355556	0 %	0 %	100 %	0 %	209396927
6096	NC_011353	ATG	2	6	355601	355606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209396927
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6099	NC_011353	TGA	2	6	355831	355836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209396927
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6102	NC_011353	GAC	2	6	356201	356206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209396166
6103	NC_011353	TTG	2	6	356228	356233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209396166
6104	NC_011353	CAT	2	6	356249	356254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209396166
6105	NC_011353	TCT	3	9	356416	356424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209396166
6106	NC_011353	AAT	2	6	356443	356448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209396166
6107	NC_011353	CTGA	2	8	356629	356636	25 %	25 %	25 %	25 %	209399148
6108	NC_011353	GCT	2	6	356747	356752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209398421
6109	NC_011353	ACG	2	6	356791	356796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209398421
6110	NC_011353	TTA	2	6	356797	356802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209398421
6111	NC_011353	TGA	2	6	356923	356928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209398421
6112	NC_011353	AG	3	6	356968	356973	50 %	0 %	50 %	0 %	209398421
6113	NC_011353	GTG	2	6	357028	357033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209398421
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6115	NC_011353	CGG	2	6	357107	357112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209398421
6116	NC_011353	CGG	2	6	357167	357172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209398421
6117	NC_011353	CAG	2	6	357201	357206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209398421
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6119	NC_011353	GCGTG	2	10	357872	357881	0 %	20 %	60 %	20 %	209400580
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6121	NC_011353	GCA	2	6	357951	357956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209400580
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6236	NC_011353	T	6	6	365150	365155	0 %	100 %	0 %	0 %	209398991
6237	NC_011353	CATC	2	8	365362	365369	25 %	25 %	0 %	50 %	209399604
6238	NC_011353	ATC	2	6	365388	365393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209399604
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6240	NC_011353	TAT	2	6	365443	365448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209399604
6241	NC_011353	CAA	2	6	365449	365454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209399604
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6491	NC_011353	TGA	2	6	382607	382612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209395783
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