MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 88029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_009801	CTG	2	6	680149	680154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157157595
12502	NC_009801	GTT	2	6	680376	680381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157155816
12503	NC_009801	GGT	2	6	680399	680404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157155816
12504	NC_009801	CTG	2	6	680442	680447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155816
12505	NC_009801	ATG	2	6	680469	680474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155816
12506	NC_009801	TGC	2	6	680492	680497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155816
12507	NC_009801	ACC	2	6	680573	680578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157155816
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12509	NC_009801	TG	3	6	680739	680744	0 %	50 %	50 %	0 %	157155257
12510	NC_009801	GGC	2	6	680784	680789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155257
12511	NC_009801	ACG	2	6	680795	680800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155257
12512	NC_009801	GC	3	6	680833	680838	0 %	0 %	50 %	50 %	157155257
12513	NC_009801	GAT	2	6	680839	680844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155257
12514	NC_009801	ATG	2	6	680846	680851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155257
12515	NC_009801	GCT	2	6	680877	680882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155257
12516	NC_009801	ATG	2	6	680929	680934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155257
12517	NC_009801	GC	3	6	680973	680978	0 %	0 %	50 %	50 %	157155257
12518	NC_009801	TGG	2	6	680990	680995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157155257
12519	NC_009801	CAGG	2	8	681001	681008	25 %	0 %	50 %	25 %	157155257
12520	NC_009801	TCG	2	6	681014	681019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155257
12521	NC_009801	ATG	2	6	681044	681049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155257
12522	NC_009801	GGTC	2	8	681126	681133	0 %	25 %	50 %	25 %	157155257
12523	NC_009801	TGA	2	6	681134	681139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155257
12524	NC_009801	GCTGGC	2	12	681165	681176	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	157155257
12525	NC_009801	GCC	2	6	681214	681219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157155257
12526	NC_009801	CAT	2	6	681244	681249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155257
12527	NC_009801	TTGC	2	8	681259	681266	0 %	50 %	25 %	25 %	157155257
12528	NC_009801	ACC	2	6	681283	681288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157155257
12529	NC_009801	TGG	2	6	681296	681301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157155257
12530	NC_009801	CGG	2	6	681302	681307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155257
12531	NC_009801	GC	4	8	681435	681442	0 %	0 %	50 %	50 %	157155257
12532	NC_009801	AAC	2	6	681457	681462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157155257
12533	NC_009801	GCC	2	6	681474	681479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157155257
12534	NC_009801	ATT	2	6	681483	681488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157155257
12535	NC_009801	ATG	2	6	681489	681494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155257
12536	NC_009801	TAG	2	6	681649	681654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156847
12537	NC_009801	GCG	2	6	681657	681662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156847
12538	NC_009801	CTG	2	6	681672	681677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156847
12539	NC_009801	AAG	2	6	681687	681692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157156847
12540	NC_009801	TACG	2	8	681694	681701	25 %	25 %	25 %	25 %	157156847
12541	NC_009801	AAG	2	6	681738	681743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157156847
12542	NC_009801	ATGA	2	8	681747	681754	50 %	25 %	25 %	0 %	157156847
12543	NC_009801	TGC	2	6	681761	681766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156847
12544	NC_009801	A	6	6	681771	681776	100 %	0 %	0 %	0 %	157156847
12545	NC_009801	CT	3	6	681807	681812	0 %	50 %	0 %	50 %	157156847
12546	NC_009801	AAG	2	6	681966	681971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157156344
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12549	NC_009801	TAACG	2	10	682053	682062	40 %	20 %	20 %	20 %	157156344
12550	NC_009801	GGC	2	6	682080	682085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156344
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12552	NC_009801	TTC	2	6	682159	682164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157156344
12553	NC_009801	CAGAC	2	10	682189	682198	40 %	0 %	20 %	40 %	157156344
12554	NC_009801	CTT	2	6	682221	682226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157156344
12555	NC_009801	CAG	2	6	682237	682242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156344
12556	NC_009801	TGG	2	6	682327	682332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157156344
12557	NC_009801	T	6	6	682413	682418	0 %	100 %	0 %	0 %	157156344
12558	NC_009801	TCA	2	6	682472	682477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156344
12559	NC_009801	CGG	2	6	682601	682606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156344
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12561	NC_009801	CAGA	2	8	682688	682695	50 %	0 %	25 %	25 %	157156344
12562	NC_009801	GCA	2	6	682785	682790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156344
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12565	NC_009801	TGT	2	6	683161	683166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157154784
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12571	NC_009801	TC	3	6	683431	683436	0 %	50 %	0 %	50 %	157154784
12572	NC_009801	TCT	2	6	683442	683447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157154784
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12574	NC_009801	TCG	2	6	683490	683495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157154784
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12579	NC_009801	CCGA	2	8	683670	683677	25 %	0 %	25 %	50 %	157154784
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12583	NC_009801	CTGA	2	8	683759	683766	25 %	25 %	25 %	25 %	157154784
12584	NC_009801	GACT	2	8	683865	683872	25 %	25 %	25 %	25 %	157154784
12585	NC_009801	GAC	2	6	684006	684011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157154784
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12590	NC_009801	ATT	2	6	684384	684389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157155500
12591	NC_009801	GTC	2	6	684391	684396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155500
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12593	NC_009801	TTTTC	2	10	684548	684557	0 %	80 %	0 %	20 %	157155500
12594	NC_009801	CAC	2	6	684624	684629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157155500
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12596	NC_009801	ACAT	2	8	684694	684701	50 %	25 %	0 %	25 %	157155500
12597	NC_009801	CCTG	2	8	684796	684803	0 %	25 %	25 %	50 %	157155500
12598	NC_009801	CCAG	2	8	684833	684840	25 %	0 %	25 %	50 %	157155500
12599	NC_009801	TCA	2	6	684844	684849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155500
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12601	NC_009801	TTC	2	6	685090	685095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157158401
12602	NC_009801	TGATAG	2	12	685131	685142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157158401
12603	NC_009801	TGC	2	6	685164	685169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158401
12604	NC_009801	ACC	2	6	685223	685228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157158401
12605	NC_009801	GTAA	2	8	685267	685274	50 %	25 %	25 %	0 %	157158401
12606	NC_009801	TTAAT	2	10	685450	685459	40 %	60 %	0 %	0 %	157159257
12607	NC_009801	GAA	2	6	685478	685483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157159257
12608	NC_009801	CGA	2	6	685564	685569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157159257
12609	NC_009801	GCG	2	6	685585	685590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157159257
12610	NC_009801	CTG	2	6	685602	685607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157159257
12611	NC_009801	ACCAA	2	10	685703	685712	60 %	0 %	0 %	40 %	157159257
12612	NC_009801	GAA	2	6	685763	685768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157159257
12613	NC_009801	T	6	6	685790	685795	0 %	100 %	0 %	0 %	157159257
12614	NC_009801	CAA	2	6	685876	685881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157159257
12615	NC_009801	GT	3	6	685902	685907	0 %	50 %	50 %	0 %	157159257
12616	NC_009801	TTCTTT	2	12	685991	686002	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	157159257
12617	NC_009801	ATTC	2	8	686014	686021	25 %	50 %	0 %	25 %	157159257
12618	NC_009801	CG	3	6	686064	686069	0 %	0 %	50 %	50 %	157159257
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12620	NC_009801	CAA	2	6	686161	686166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157159257
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12981	NC_009801	CTG	2	6	704637	704642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157157133
12982	NC_009801	CAAG	2	8	704717	704724	50 %	0 %	25 %	25 %	157157133
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12984	NC_009801	AAT	2	6	704928	704933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157157133
12985	NC_009801	GGC	2	6	705042	705047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157157133
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12991	NC_009801	CG	3	6	705417	705422	0 %	0 %	50 %	50 %	157157133
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