MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli E24377A chromosome

Total Repeats: 88029

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009801	GACT	2	8	542572	542579	25 %	25 %	25 %	25 %	157158629
10002	NC_009801	ATT	2	6	542604	542609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157158629
10003	NC_009801	GCG	2	6	542612	542617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157158629
10004	NC_009801	CCA	2	6	542628	542633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157158629
10005	NC_009801	TCA	2	6	542636	542641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157158629
10006	NC_009801	GCA	2	6	542648	542653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158629
10007	NC_009801	CAG	2	6	542691	542696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158629
10008	NC_009801	TGT	2	6	542773	542778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157158629
10009	NC_009801	CGC	2	6	542784	542789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157158629
10010	NC_009801	GAA	2	6	542855	542860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157158629
10011	NC_009801	TGC	2	6	542929	542934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157158629
10012	NC_009801	CTC	2	6	542949	542954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157158629
10013	NC_009801	TGG	2	6	543011	543016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157158629
10014	NC_009801	CGA	2	6	543029	543034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157158629
10015	NC_009801	ACA	2	6	543215	543220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157158629
10016	NC_009801	CAA	2	6	543375	543380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157159330
10017	NC_009801	CGA	2	6	543387	543392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157159330
10018	NC_009801	TTC	2	6	543405	543410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157159330
10019	NC_009801	TGC	2	6	543462	543467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157159330
10020	NC_009801	AAT	3	9	543500	543508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157159330
10021	NC_009801	CAC	2	6	543517	543522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157159330
10022	NC_009801	GGC	2	6	543586	543591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157159330
10023	NC_009801	ACA	2	6	543615	543620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157159330
10024	NC_009801	GAA	2	6	543632	543637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157159330
10025	NC_009801	A	6	6	543691	543696	100 %	0 %	0 %	0 %	157159330
10026	NC_009801	GCA	2	6	543840	543845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155513
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10029	NC_009801	TGT	2	6	543969	543974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157155513
10030	NC_009801	AGCG	2	8	544030	544037	25 %	0 %	50 %	25 %	157155513
10031	NC_009801	CGC	2	6	544078	544083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157155513
10032	NC_009801	GCC	2	6	544105	544110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157155513
10033	NC_009801	C	6	6	544109	544114	0 %	0 %	0 %	100 %	157155513
10034	NC_009801	CGT	2	6	544152	544157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155513
10035	NC_009801	CCA	2	6	544170	544175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157155513
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10039	NC_009801	GCC	2	6	544352	544357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157155513
10040	NC_009801	CAGC	2	8	544386	544393	25 %	0 %	25 %	50 %	157155513
10041	NC_009801	CAG	2	6	544420	544425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155513
10042	NC_009801	GCC	3	9	544661	544669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157155513
10043	NC_009801	TCA	2	6	544688	544693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155513
10044	NC_009801	ACG	2	6	544763	544768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155513
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10050	NC_009801	TGC	2	6	545049	545054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155513
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10052	NC_009801	GTC	2	6	545273	545278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155513
10053	NC_009801	GCA	2	6	545283	545288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155513
10054	NC_009801	T	6	6	545322	545327	0 %	100 %	0 %	0 %	157155513
10055	NC_009801	GC	3	6	545347	545352	0 %	0 %	50 %	50 %	157155513
10056	NC_009801	AGA	2	6	545392	545397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	157155513
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10059	NC_009801	GCCAC	2	10	545532	545541	20 %	0 %	20 %	60 %	157155513
10060	NC_009801	CCA	2	6	545556	545561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157155513
10061	NC_009801	TCG	2	6	545571	545576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155513
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10063	NC_009801	TAAC	2	8	545661	545668	50 %	25 %	0 %	25 %	157155513
10064	NC_009801	CAT	2	6	545695	545700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155513
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10067	NC_009801	TGCC	2	8	545758	545765	0 %	25 %	25 %	50 %	157155513
10068	NC_009801	CGG	2	6	545790	545795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155513
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10070	NC_009801	CTG	2	6	546019	546024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155513
10071	NC_009801	GTCATC	2	12	546028	546039	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	157155513
10072	NC_009801	TGA	2	6	546094	546099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157155513
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10074	NC_009801	CAAA	2	8	546596	546603	75 %	0 %	0 %	25 %	157156184
10075	NC_009801	CAG	2	6	546607	546612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156184
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10083	NC_009801	CT	3	6	547042	547047	0 %	50 %	0 %	50 %	157156184
10084	NC_009801	AACA	2	8	547067	547074	75 %	0 %	0 %	25 %	157156184
10085	NC_009801	GCT	2	6	547104	547109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156184
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10087	NC_009801	CTC	2	6	547180	547185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	157156184
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10089	NC_009801	G	6	6	547227	547232	0 %	0 %	100 %	0 %	157156184
10090	NC_009801	TTC	2	6	547259	547264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157156184
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10092	NC_009801	GTC	2	6	547390	547395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156184
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10100	NC_009801	TGG	2	6	547597	547602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157156643
10101	NC_009801	GCT	2	6	547619	547624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156643
10102	NC_009801	GGC	2	6	547743	547748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156643
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10104	NC_009801	TCG	2	6	547763	547768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156643
10105	NC_009801	AGG	2	6	547897	547902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	157156643
10106	NC_009801	TGA	2	6	547942	547947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156643
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10109	NC_009801	ATG	2	6	548013	548018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156643
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10112	NC_009801	TTC	2	6	548103	548108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157156643
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10114	NC_009801	TGG	2	6	548212	548217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157156643
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10118	NC_009801	TCG	2	6	548359	548364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157156643
10119	NC_009801	CAT	2	6	548426	548431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156643
10120	NC_009801	ACA	2	6	548434	548439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157156643
10121	NC_009801	GCGAAC	2	12	548446	548457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157156643
10122	NC_009801	GGC	2	6	548485	548490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157156643
10123	NC_009801	CAT	2	6	548507	548512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156643
10124	NC_009801	GTG	2	6	548517	548522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157156643
10125	NC_009801	TGA	2	6	548533	548538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156643
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10153	NC_009801	GCT	2	6	549870	549875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155972
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10222	NC_009801	CTG	2	6	553863	553868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157155767
10223	NC_009801	GATC	2	8	553896	553903	25 %	25 %	25 %	25 %	157155767
10224	NC_009801	TGT	2	6	553923	553928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157155767
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10226	NC_009801	GC	3	6	553998	554003	0 %	0 %	50 %	50 %	157155767
10227	NC_009801	A	6	6	554213	554218	100 %	0 %	0 %	0 %	157155032
10228	NC_009801	GCA	2	6	554221	554226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155032
10229	NC_009801	GCAG	2	8	554301	554308	25 %	0 %	50 %	25 %	157155032
10230	NC_009801	GGC	2	6	554339	554344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155032
10231	NC_009801	GCC	2	6	554417	554422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157155032
10232	NC_009801	CAG	2	6	554459	554464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157155032
10233	NC_009801	GC	3	6	554474	554479	0 %	0 %	50 %	50 %	157155032
10234	NC_009801	TTG	2	6	554486	554491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157155032
10235	NC_009801	CGC	2	6	554500	554505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157155032
10236	NC_009801	CAA	2	6	554552	554557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157155032
10237	NC_009801	CAGGC	2	10	554560	554569	20 %	0 %	40 %	40 %	157155032
10238	NC_009801	GCG	2	6	554634	554639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	157155032
10239	NC_009801	CAGGAA	2	12	554660	554671	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	157155032
10240	NC_009801	TTG	2	6	554694	554699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157155032
10241	NC_009801	TCA	2	6	554704	554709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157155032
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10345	NC_009801	GCA	2	6	559245	559250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157157827
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10347	NC_009801	ACG	2	6	559307	559312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157157827
10348	NC_009801	GTG	2	6	559324	559329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157157827
10349	NC_009801	TCACCG	2	12	559385	559396	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	157157827
10350	NC_009801	TGC	2	6	559418	559423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157157827
10351	NC_009801	GTG	2	6	559453	559458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157157827
10352	NC_009801	A	6	6	559459	559464	100 %	0 %	0 %	0 %	157157827
10353	NC_009801	GACG	2	8	559527	559534	25 %	0 %	50 %	25 %	157157827
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10476	NC_009801	CCG	2	6	566588	566593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156027
10477	NC_009801	GAT	2	6	566645	566650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157156027
10478	NC_009801	CCG	2	6	566651	566656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	157156027
10479	NC_009801	TTCA	2	8	566826	566833	25 %	50 %	0 %	25 %	157156027
10480	NC_009801	GGT	2	6	566864	566869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	157156027
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10482	NC_009801	CAT	2	6	566912	566917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157156027
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