MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli APEC O1 chromosome

Total Repeats: 90462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008563	AAT	2	6	274386	274391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162317586
5002	NC_008563	CTG	2	6	274395	274400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162317586
5003	NC_008563	GCA	2	6	274489	274494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162317586
5004	NC_008563	CGA	2	6	274576	274581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162317586
5005	NC_008563	CGC	2	6	274622	274627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162317586
5006	NC_008563	CCA	2	6	274676	274681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162317586
5007	NC_008563	GAT	2	6	274719	274724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162317586
5008	NC_008563	ATCG	2	8	274728	274735	25 %	25 %	25 %	25 %	162317586
5009	NC_008563	CG	3	6	274754	274759	0 %	0 %	50 %	50 %	162317586
5010	NC_008563	CGA	2	6	274798	274803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162317586
5011	NC_008563	GTG	2	6	274822	274827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162317586
5012	NC_008563	TCT	2	6	274858	274863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162317586
5013	NC_008563	CCG	2	6	274867	274872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162317586
5014	NC_008563	CTG	2	6	274977	274982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162317586
5015	NC_008563	GCA	2	6	275138	275143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162317586
5016	NC_008563	GCA	2	6	275216	275221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162317586
5017	NC_008563	CCG	2	6	275254	275259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162317586
5018	NC_008563	T	6	6	275265	275270	0 %	100 %	0 %	0 %	162317586
5019	NC_008563	GAT	2	6	275271	275276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162317586
5020	NC_008563	GAA	2	6	275283	275288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162317586
5021	NC_008563	CGG	2	6	275319	275324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162317586
5022	NC_008563	CTT	2	6	275375	275380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162317586
5023	NC_008563	GGT	2	6	275490	275495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162317586
5024	NC_008563	CTT	2	6	275510	275515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162317586
5025	NC_008563	CGG	2	6	275532	275537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162317586
5026	NC_008563	ATC	2	6	275575	275580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162317586
5027	NC_008563	CTG	2	6	275698	275703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162317586
5028	NC_008563	ATAA	2	8	275704	275711	75 %	25 %	0 %	0 %	162317586
5029	NC_008563	ATC	2	6	275770	275775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162317586
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5031	NC_008563	TTG	2	6	275889	275894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117622526
5032	NC_008563	TGG	2	6	275960	275965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622526
5033	NC_008563	TGAAC	2	10	276040	276049	40 %	20 %	20 %	20 %	117622526
5034	NC_008563	GCG	2	6	276053	276058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622526
5035	NC_008563	GC	3	6	276109	276114	0 %	0 %	50 %	50 %	117622526
5036	NC_008563	CGG	2	6	276172	276177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622526
5037	NC_008563	CTG	2	6	276359	276364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622526
5038	NC_008563	CGG	2	6	276411	276416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622526
5039	NC_008563	CGG	2	6	276460	276465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622526
5040	NC_008563	TGGC	2	8	276471	276478	0 %	25 %	50 %	25 %	117622526
5041	NC_008563	CGG	2	6	276480	276485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622526
5042	NC_008563	TAAG	2	8	276589	276596	50 %	25 %	25 %	0 %	117622526
5043	NC_008563	GTG	3	9	276874	276882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622527
5044	NC_008563	CGGT	2	8	277171	277178	0 %	25 %	50 %	25 %	117622527
5045	NC_008563	GGC	2	6	277256	277261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117622527
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5047	NC_008563	CGC	2	6	277383	277388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622527
5048	NC_008563	GC	3	6	277387	277392	0 %	0 %	50 %	50 %	117622527
5049	NC_008563	ATG	2	6	277459	277464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622527
5050	NC_008563	GT	3	6	277556	277561	0 %	50 %	50 %	0 %	117622527
5051	NC_008563	CGGT	2	8	277640	277647	0 %	25 %	50 %	25 %	117622528
5052	NC_008563	AGT	2	6	277667	277672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622528
5053	NC_008563	TCA	2	6	277822	277827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622528
5054	NC_008563	AGC	2	6	277850	277855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622528
5055	NC_008563	ATC	2	6	277879	277884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117622528
5056	NC_008563	GTA	2	6	277950	277955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622528
5057	NC_008563	GCC	2	6	278043	278048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622528
5058	NC_008563	TTC	2	6	278124	278129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622528
5059	NC_008563	CTG	2	6	278166	278171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622528
5060	NC_008563	CTG	2	6	278206	278211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622528
5061	NC_008563	AAACG	2	10	278226	278235	60 %	0 %	20 %	20 %	117622528
5062	NC_008563	CAA	2	6	278244	278249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117622528
5063	NC_008563	CCA	2	6	278670	278675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117622529
5064	NC_008563	CGC	2	6	278698	278703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622529
5065	NC_008563	TTA	2	6	278732	278737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622529
5066	NC_008563	TGG	2	6	278898	278903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622529
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5071	NC_008563	T	6	6	279042	279047	0 %	100 %	0 %	0 %	117622529
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5074	NC_008563	GC	3	6	279303	279308	0 %	0 %	50 %	50 %	117622529
5075	NC_008563	TCG	2	6	279527	279532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622530
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5078	NC_008563	TCG	2	6	279581	279586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622530
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5092	NC_008563	CAG	2	6	280606	280611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622531
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5094	NC_008563	CGAA	2	8	280658	280665	50 %	0 %	25 %	25 %	117622531
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5100	NC_008563	CGA	2	6	280876	280881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622531
5101	NC_008563	AGGGC	2	10	281106	281115	20 %	0 %	60 %	20 %	117622531
5102	NC_008563	CCG	2	6	281127	281132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622531
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5105	NC_008563	CTGG	2	8	281179	281186	0 %	25 %	50 %	25 %	117622531
5106	NC_008563	GCA	3	9	281223	281231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622531
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5121	NC_008563	CGC	2	6	282076	282081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622532
5122	NC_008563	GGT	2	6	282107	282112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622532
5123	NC_008563	TAAA	2	8	282126	282133	75 %	25 %	0 %	0 %	117622532
5124	NC_008563	A	6	6	282191	282196	100 %	0 %	0 %	0 %	117622532
5125	NC_008563	GC	3	6	282197	282202	0 %	0 %	50 %	50 %	117622532
5126	NC_008563	GAA	3	9	282229	282237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117622532
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5129	NC_008563	TGG	2	6	282423	282428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622532
5130	NC_008563	CTCG	2	8	282448	282455	0 %	25 %	25 %	50 %	117622532
5131	NC_008563	ATT	3	9	282464	282472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622532
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5135	NC_008563	TCG	2	6	282553	282558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622532
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5145	NC_008563	CGTA	2	8	283028	283035	25 %	25 %	25 %	25 %	117622533
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5153	NC_008563	CGC	2	6	283839	283844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117622533
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5231	NC_008563	TTTCTC	2	12	287703	287714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622539
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5238	NC_008563	CTT	2	6	288152	288157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117622539
5239	NC_008563	CAG	2	6	288168	288173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622539
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5241	NC_008563	T	7	7	288340	288346	0 %	100 %	0 %	0 %	117622539
5242	NC_008563	GAC	2	6	288375	288380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117622539
5243	NC_008563	TACC	2	8	288431	288438	25 %	25 %	0 %	50 %	117622539
5244	NC_008563	CAAC	2	8	288475	288482	50 %	0 %	0 %	50 %	117622539
5245	NC_008563	ATT	2	6	288944	288949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117622540
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5247	NC_008563	GGT	2	6	289130	289135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622540
5248	NC_008563	CCGG	2	8	289196	289203	0 %	0 %	50 %	50 %	117622540
5249	NC_008563	TGA	2	6	289216	289221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117622540
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5251	NC_008563	CGT	2	6	289276	289281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117622540
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5273	NC_008563	TGG	2	6	290868	290873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117622542
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5491	NC_008563	AAT	2	6	307859	307864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117622557
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