MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli UTI89 chromosome

Total Repeats: 92487

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007946	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91209056
2	NC_007946	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91209056
3	NC_007946	CGG	2	6	353	358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91209057
4	NC_007946	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	91209057
5	NC_007946	CT	3	6	444	449	0 %	50 %	0 %	50 %	91209057
6	NC_007946	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	91209057
7	NC_007946	GAT	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209057
8	NC_007946	A	6	6	490	495	100 %	0 %	0 %	0 %	91209057
9	NC_007946	CGC	3	9	569	577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91209057
10	NC_007946	TCG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91209057
11	NC_007946	TTG	2	6	663	668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91209057
12	NC_007946	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	91209057
13	NC_007946	CCG	2	6	848	853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91209057
14	NC_007946	TGG	2	6	931	936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91209057
15	NC_007946	ACT	2	6	958	963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209057
16	NC_007946	GGC	2	6	977	982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91209057
17	NC_007946	TTG	2	6	998	1003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91209057
18	NC_007946	GTT	2	6	1067	1072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91209057
19	NC_007946	TTC	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91209057
20	NC_007946	TGA	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209057
21	NC_007946	GGC	2	6	1328	1333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91209057
22	NC_007946	GC	3	6	1332	1337	0 %	0 %	50 %	50 %	91209057
23	NC_007946	GTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91209057
24	NC_007946	ATC	2	6	1388	1393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209057
25	NC_007946	TG	3	6	1434	1439	0 %	50 %	50 %	0 %	91209057
26	NC_007946	AAG	2	6	1483	1488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91209057
27	NC_007946	GGT	2	6	1535	1540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91209057
28	NC_007946	TCT	2	6	1635	1640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91209057
29	NC_007946	GAT	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209057
30	NC_007946	TCA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209057
31	NC_007946	GCT	2	6	1772	1777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91209057
32	NC_007946	GAA	2	6	1808	1813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91209057
33	NC_007946	GAA	2	6	1902	1907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91209057
34	NC_007946	ATC	2	6	1966	1971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209057
35	NC_007946	TTG	2	6	1987	1992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91209057
36	NC_007946	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	91209057
37	NC_007946	GTT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91209057
38	NC_007946	TCG	2	6	2085	2090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91209057
39	NC_007946	TAC	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209057
40	NC_007946	GCG	2	6	2118	2123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91209057
41	NC_007946	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209057
42	NC_007946	TGA	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209057
43	NC_007946	GAT	2	6	2349	2354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209057
44	NC_007946	ATTGAA	2	12	2430	2441	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	91209057
45	NC_007946	TGC	2	6	2446	2451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91209057
46	NC_007946	CGC	2	6	2480	2485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91209057
47	NC_007946	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91209057
48	NC_007946	CG	3	6	2525	2530	0 %	0 %	50 %	50 %	91209057
49	NC_007946	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209057
50	NC_007946	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209057
51	NC_007946	TAT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91209057
52	NC_007946	GCG	2	6	2863	2868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91209058
53	NC_007946	GGC	2	6	2916	2921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91209058
54	NC_007946	CAA	2	6	2937	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91209058
55	NC_007946	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	91209058
56	NC_007946	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	91209058
57	NC_007946	GCA	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91209058
58	NC_007946	TGG	2	6	3243	3248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91209058
59	NC_007946	TGA	2	6	3257	3262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209058
60	NC_007946	GAA	2	6	3265	3270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91209058
61	NC_007946	CAT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209058
62	NC_007946	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209058
63	NC_007946	CGC	2	6	3385	3390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91209058
64	NC_007946	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	91209058
65	NC_007946	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	91209058
66	NC_007946	TGA	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209058
67	NC_007946	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	91209058
68	NC_007946	TCCGGC	2	12	3577	3588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	91209058
69	NC_007946	TG	3	6	3605	3610	0 %	50 %	50 %	0 %	91209058
70	NC_007946	CGG	2	6	3704	3709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91209058
71	NC_007946	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	91209059
72	NC_007946	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209059
73	NC_007946	TGA	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209059
74	NC_007946	CG	3	6	3961	3966	0 %	0 %	50 %	50 %	91209059
75	NC_007946	CGG	2	6	4059	4064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91209059
76	NC_007946	GGC	2	6	4252	4257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91209059
77	NC_007946	TGA	3	9	4323	4331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209059
78	NC_007946	CTA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209059
79	NC_007946	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	91209059
80	NC_007946	CGG	2	6	4493	4498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91209059
81	NC_007946	CTG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91209059
82	NC_007946	TGC	2	6	4542	4547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91209059
83	NC_007946	ACG	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91209059
84	NC_007946	GATG	2	8	4632	4639	25 %	25 %	50 %	0 %	91209059
85	NC_007946	AGCC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	91209059
86	NC_007946	AAC	2	6	4651	4656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91209059
87	NC_007946	GTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91209059
88	NC_007946	CCG	2	6	4680	4685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91209059
89	NC_007946	GAT	2	6	4726	4731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209059
90	NC_007946	AG	3	6	4881	4886	50 %	0 %	50 %	0 %	91209059
91	NC_007946	CCG	2	6	4973	4978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91209059
92	NC_007946	TGC	2	6	4983	4988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91209059
93	NC_007946	TGA	3	9	5000	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209059
94	NC_007946	ATC	2	6	5009	5014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209059
95	NC_007946	TGG	2	6	5398	5403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91209060
96	NC_007946	ACA	2	6	5406	5411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91209060
97	NC_007946	CCG	2	6	5449	5454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91209060
98	NC_007946	CGC	2	6	5459	5464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91209060
99	NC_007946	ATC	2	6	5483	5488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209060
100	NC_007946	ATC	2	6	5495	5500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209060
101	NC_007946	CAT	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209060
102	NC_007946	GCT	2	6	5574	5579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91209062
103	NC_007946	GGA	2	6	5611	5616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91209062
104	NC_007946	TCA	2	6	5621	5626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209062
105	NC_007946	AAG	2	6	5627	5632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91209062
106	NC_007946	CAGT	2	8	5652	5659	25 %	25 %	25 %	25 %	91209062
107	NC_007946	AAT	2	6	5686	5691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91209062
108	NC_007946	TCA	2	6	5700	5705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209062
109	NC_007946	TTC	2	6	5753	5758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91209062
110	NC_007946	TTC	2	6	5798	5803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91209062
111	NC_007946	CAC	2	6	5845	5850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91209062
112	NC_007946	TGC	2	6	5863	5868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91209062
113	NC_007946	TTG	2	6	5885	5890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91209062
114	NC_007946	TGA	2	6	5892	5897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91209062
115	NC_007946	AAATCG	2	12	6038	6049	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	91209062
116	NC_007946	AGCG	2	8	6156	6163	25 %	0 %	50 %	25 %	91209062
117	NC_007946	GCT	2	6	6246	6251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91209062
118	NC_007946	GTG	2	6	6287	6292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91209062
119	NC_007946	CAT	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209063
120	NC_007946	ACGC	2	8	6496	6503	25 %	0 %	25 %	50 %	91209063
121	NC_007946	GCC	2	6	6646	6651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91209063
122	NC_007946	GTT	2	6	6700	6705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91209063
123	NC_007946	AGA	2	6	6717	6722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91209063
124	NC_007946	ATC	2	6	6944	6949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209063
125	NC_007946	GCTGCC	2	12	6992	7003	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	91209063
126	NC_007946	CGC	2	6	7090	7095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91209063
127	NC_007946	GCC	2	6	7096	7101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91209063
128	NC_007946	GCCA	2	8	7113	7120	25 %	0 %	25 %	50 %	91209063
129	NC_007946	CAGG	2	8	7186	7193	25 %	0 %	50 %	25 %	91209063
130	NC_007946	CAG	2	6	7273	7278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91209063
131	NC_007946	AAT	2	6	7294	7299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91209063
132	NC_007946	CG	3	6	7440	7445	0 %	0 %	50 %	50 %	91209063
133	NC_007946	AGA	2	6	7566	7571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91209063
134	NC_007946	CGG	2	6	7587	7592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91209063
135	NC_007946	CG	3	6	7632	7637	0 %	0 %	50 %	50 %	91209063
136	NC_007946	CAA	2	6	7766	7771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91209063
137	NC_007946	TAA	2	6	7821	7826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91209063
138	NC_007946	A	6	6	7832	7837	100 %	0 %	0 %	0 %	91209063
139	NC_007946	GCAT	2	8	7842	7849	25 %	25 %	25 %	25 %	91209063
140	NC_007946	ACC	2	6	8157	8162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162138515
141	NC_007946	CAAC	2	8	8221	8228	50 %	0 %	0 %	50 %	162138515
142	NC_007946	TC	3	6	8232	8237	0 %	50 %	0 %	50 %	162138515
143	NC_007946	CGCAG	2	10	8246	8255	20 %	0 %	40 %	40 %	162138515
144	NC_007946	TTGA	2	8	8274	8281	25 %	50 %	25 %	0 %	162138515
145	NC_007946	CAG	2	6	8304	8309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162138515
146	NC_007946	CG	3	6	8319	8324	0 %	0 %	50 %	50 %	162138515
147	NC_007946	CAG	2	6	8325	8330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162138515
148	NC_007946	CGAC	2	8	8341	8348	25 %	0 %	25 %	50 %	162138515
149	NC_007946	TGC	2	6	8546	8551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162138515
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152	NC_007946	TTG	2	6	8656	8661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162138515
153	NC_007946	AAGA	2	8	8697	8704	75 %	0 %	25 %	0 %	162138515
154	NC_007946	AGA	2	6	8717	8722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162138515
155	NC_007946	TAC	2	6	8757	8762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162138515
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157	NC_007946	GTGAA	2	10	8923	8932	40 %	20 %	40 %	0 %	162138515
158	NC_007946	GCA	2	6	8972	8977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162138515
159	NC_007946	A	6	6	9052	9057	100 %	0 %	0 %	0 %	162138515
160	NC_007946	CTG	2	6	9069	9074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162138515
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163	NC_007946	GAA	2	6	9276	9281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91209065
164	NC_007946	ATC	2	6	9348	9353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91209065
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166	NC_007946	TGG	2	6	9373	9378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91209065
167	NC_007946	CAC	2	6	9404	9409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91209065
168	NC_007946	CGT	2	6	9429	9434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91209065
169	NC_007946	CGTAC	2	10	9674	9683	20 %	20 %	20 %	40 %	91209065
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177	NC_007946	AGAA	2	8	10325	10332	75 %	0 %	25 %	0 %	91209066
178	NC_007946	T	6	6	10371	10376	0 %	100 %	0 %	0 %	91209066
179	NC_007946	CAG	2	6	10383	10388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91209066
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395	NC_007946	TGA	2	6	22012	22017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162138514
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397	NC_007946	TGA	2	6	22026	22031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162138514
398	NC_007946	GAT	2	6	22171	22176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162138514
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