MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden

Total Repeats: 25683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_006832	ATC	2	6	56968	56973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578707
1003	NC_006832	ATT	2	6	56981	56986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578707
1004	NC_006832	AGTA	2	8	56996	57003	50 %	25 %	25 %	0 %	58578707
1005	NC_006832	ACA	2	6	57041	57046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578707
1006	NC_006832	T	6	6	57078	57083	0 %	100 %	0 %	0 %	58578707
1007	NC_006832	AAC	2	6	57096	57101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578707
1008	NC_006832	TA	3	6	57110	57115	50 %	50 %	0 %	0 %	58578707
1009	NC_006832	TAA	2	6	57760	57765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578708
1010	NC_006832	ATG	2	6	57768	57773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578708
1011	NC_006832	ATA	2	6	57782	57787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578708
1012	NC_006832	ATGCT	2	10	57797	57806	20 %	40 %	20 %	20 %	58578708
1013	NC_006832	TAT	2	6	57816	57821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578708
1014	NC_006832	ACCT	2	8	57834	57841	25 %	25 %	0 %	50 %	58578708
1015	NC_006832	AGG	2	6	57994	57999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58578708
1016	NC_006832	AT	3	6	58022	58027	50 %	50 %	0 %	0 %	58578708
1017	NC_006832	TAA	2	6	58069	58074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578708
1018	NC_006832	CAT	2	6	58144	58149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578708
1019	NC_006832	TTC	2	6	58240	58245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578708
1020	NC_006832	TGC	2	6	58251	58256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58578708
1021	NC_006832	CAG	2	6	58263	58268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58578708
1022	NC_006832	TAA	2	6	58289	58294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578708
1023	NC_006832	TCT	2	6	58304	58309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578708
1024	NC_006832	CTT	2	6	58319	58324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578708
1025	NC_006832	TGT	2	6	58329	58334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578708
1026	NC_006832	TTC	2	6	58336	58341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578708
1027	NC_006832	CAT	2	6	58344	58349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578708
1028	NC_006832	TTTAAG	2	12	58361	58372	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	58578708
1029	NC_006832	TTGAT	2	10	58381	58390	20 %	60 %	20 %	0 %	58578708
1030	NC_006832	A	7	7	58440	58446	100 %	0 %	0 %	0 %	58578708
1031	NC_006832	ATCTGA	2	12	58465	58476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58578708
1032	NC_006832	TAAT	5	20	58496	58515	50 %	50 %	0 %	0 %	58578709
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1034	NC_006832	TAGA	2	8	58563	58570	50 %	25 %	25 %	0 %	58578709
1035	NC_006832	AGCC	2	8	58628	58635	25 %	0 %	25 %	50 %	58578709
1036	NC_006832	TAT	2	6	58645	58650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578709
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1040	NC_006832	ATC	2	6	58951	58956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578709
1041	NC_006832	CTT	2	6	58992	58997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58578709
1042	NC_006832	TTG	2	6	59337	59342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578710
1043	NC_006832	AT	3	6	59404	59409	50 %	50 %	0 %	0 %	58578710
1044	NC_006832	TATT	2	8	59446	59453	25 %	75 %	0 %	0 %	58578710
1045	NC_006832	TAC	2	6	59457	59462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578710
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1051	NC_006832	AAG	2	6	59708	59713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578710
1052	NC_006832	ACC	2	6	59743	59748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58578710
1053	NC_006832	GAAG	2	8	59827	59834	50 %	0 %	50 %	0 %	58578710
1054	NC_006832	GTA	2	6	59844	59849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578710
1055	NC_006832	ATG	2	6	59860	59865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578710
1056	NC_006832	CAG	2	6	60716	60721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58578711
1057	NC_006832	ATGG	2	8	60793	60800	25 %	25 %	50 %	0 %	58578711
1058	NC_006832	GTT	2	6	60832	60837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578711
1059	NC_006832	TTG	2	6	60920	60925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58578711
1060	NC_006832	ATT	2	6	60940	60945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578711
1061	NC_006832	A	7	7	60988	60994	100 %	0 %	0 %	0 %	58578711
1062	NC_006832	TCA	2	6	61041	61046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58578711
1063	NC_006832	TGATCT	2	12	61071	61082	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	58578711
1064	NC_006832	TTA	2	6	61127	61132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578711
1065	NC_006832	TGG	2	6	61209	61214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58578711
1066	NC_006832	ATA	2	6	61295	61300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578711
1067	NC_006832	AT	3	6	61308	61313	50 %	50 %	0 %	0 %	58578711
1068	NC_006832	AGC	2	6	61316	61321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58578711
1069	NC_006832	TA	3	6	62890	62895	50 %	50 %	0 %	0 %	58578712
1070	NC_006832	T	6	6	62973	62978	0 %	100 %	0 %	0 %	58578712
1071	NC_006832	GTTT	2	8	62984	62991	0 %	75 %	25 %	0 %	58578712
1072	NC_006832	TTGT	2	8	62996	63003	0 %	75 %	25 %	0 %	58578712
1073	NC_006832	TCC	2	6	63005	63010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578712
1074	NC_006832	TTA	2	6	63011	63016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578712
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1076	NC_006832	TAA	2	6	63124	63129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578712
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1082	NC_006832	TA	3	6	63408	63413	50 %	50 %	0 %	0 %	58578712
1083	NC_006832	AT	4	8	63447	63454	50 %	50 %	0 %	0 %	58578712
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1100	NC_006832	TAA	2	6	63998	64003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578713
1101	NC_006832	TGC	2	6	64022	64027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58578713
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1103	NC_006832	GATA	2	8	64068	64075	50 %	25 %	25 %	0 %	58578713
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1107	NC_006832	TAT	2	6	64184	64189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578713
1108	NC_006832	AAT	2	6	64244	64249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578713
1109	NC_006832	TAG	2	6	64268	64273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578713
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1111	NC_006832	ATT	2	6	64393	64398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578713
1112	NC_006832	GA	3	6	64952	64957	50 %	0 %	50 %	0 %	58578714
1113	NC_006832	TG	3	6	64992	64997	0 %	50 %	50 %	0 %	58578714
1114	NC_006832	ACGAT	2	10	65015	65024	40 %	20 %	20 %	20 %	58578714
1115	NC_006832	TTA	2	6	65077	65082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58578714
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1118	NC_006832	CCT	2	6	65222	65227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58578714
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1121	NC_006832	TAA	2	6	65307	65312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58578714
1122	NC_006832	GAA	2	6	65348	65353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578714
1123	NC_006832	CAA	2	6	65357	65362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58578714
1124	NC_006832	AGA	2	6	65371	65376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58578714
1125	NC_006832	CTG	2	6	65439	65444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58578714
1126	NC_006832	TGA	2	6	65497	65502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58578714
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