MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Gardel

Total Repeats: 25749

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006831	AATG	2	8	59	66	50 %	25 %	25 %	0 %	58616728
2	NC_006831	CTC	2	6	113	118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58616728
3	NC_006831	GATT	2	8	154	161	25 %	50 %	25 %	0 %	58616728
4	NC_006831	TAG	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616728
5	NC_006831	ATT	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616728
6	NC_006831	CTC	2	6	247	252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58616728
7	NC_006831	CAT	2	6	375	380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616728
8	NC_006831	AGT	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616728
9	NC_006831	TAC	2	6	465	470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616728
10	NC_006831	ACTA	2	8	601	608	50 %	25 %	0 %	25 %	58616728
11	NC_006831	CA	3	6	708	713	50 %	0 %	0 %	50 %	58616728
12	NC_006831	TCT	2	6	722	727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616728
13	NC_006831	TTAG	2	8	758	765	25 %	50 %	25 %	0 %	58616728
14	NC_006831	TAT	2	6	768	773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616728
15	NC_006831	GTT	2	6	776	781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616728
16	NC_006831	TCT	2	6	803	808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616728
17	NC_006831	ATA	2	6	952	957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616729
18	NC_006831	GTA	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616729
19	NC_006831	TAT	2	6	1021	1026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616729
20	NC_006831	CAA	2	6	1081	1086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616729
21	NC_006831	A	6	6	1097	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	58616729
22	NC_006831	TTA	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616729
23	NC_006831	TTG	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616729
24	NC_006831	ATA	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616729
25	NC_006831	TCT	2	6	1198	1203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616729
26	NC_006831	GCT	2	6	1206	1211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616729
27	NC_006831	CAT	2	6	1220	1225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616729
28	NC_006831	T	6	6	1251	1256	0 %	100 %	0 %	0 %	58616729
29	NC_006831	AGG	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	58616729
30	NC_006831	TATT	2	8	1297	1304	25 %	75 %	0 %	0 %	58616729
31	NC_006831	T	6	6	1325	1330	0 %	100 %	0 %	0 %	58616729
32	NC_006831	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616729
33	NC_006831	T	6	6	1349	1354	0 %	100 %	0 %	0 %	58616729
34	NC_006831	ATC	2	6	1376	1381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616729
35	NC_006831	ATT	3	9	1403	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616729
36	NC_006831	TTA	2	6	1421	1426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616729
37	NC_006831	TAA	3	9	1468	1476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616729
38	NC_006831	TAAA	2	8	1507	1514	75 %	25 %	0 %	0 %	58616729
39	NC_006831	AAAAT	2	10	1519	1528	80 %	20 %	0 %	0 %	58616729
40	NC_006831	T	6	6	1547	1552	0 %	100 %	0 %	0 %	58616730
41	NC_006831	AT	3	6	1605	1610	50 %	50 %	0 %	0 %	58616730
42	NC_006831	AT	3	6	1638	1643	50 %	50 %	0 %	0 %	58616730
43	NC_006831	T	7	7	1699	1705	0 %	100 %	0 %	0 %	58616730
44	NC_006831	AAT	2	6	1727	1732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616730
45	NC_006831	TAG	3	9	1756	1764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616730
46	NC_006831	GCATA	2	10	1775	1784	40 %	20 %	20 %	20 %	58616730
47	NC_006831	TTTA	2	8	1807	1814	25 %	75 %	0 %	0 %	58616730
48	NC_006831	AAT	2	6	1868	1873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616730
49	NC_006831	TTG	2	6	1913	1918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616730
50	NC_006831	ATT	2	6	1936	1941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616730
51	NC_006831	GTT	2	6	1963	1968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616730
52	NC_006831	ACAG	2	8	1976	1983	50 %	0 %	25 %	25 %	58616730
53	NC_006831	TAT	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616730
54	NC_006831	ACAA	2	8	2247	2254	75 %	0 %	0 %	25 %	58616731
55	NC_006831	CAA	2	6	2272	2277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616731
56	NC_006831	TCT	2	6	2316	2321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616731
57	NC_006831	AT	3	6	2429	2434	50 %	50 %	0 %	0 %	58616731
58	NC_006831	TTA	2	6	2559	2564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616731
59	NC_006831	ATA	2	6	2602	2607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616731
60	NC_006831	GTA	2	6	2608	2613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616731
61	NC_006831	A	6	6	2625	2630	100 %	0 %	0 %	0 %	58616731
62	NC_006831	TAA	2	6	2677	2682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616731
63	NC_006831	TA	3	6	2710	2715	50 %	50 %	0 %	0 %	58616731
64	NC_006831	T	7	7	2810	2816	0 %	100 %	0 %	0 %	58616731
65	NC_006831	TTA	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616731
66	NC_006831	CCA	2	6	2867	2872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	58616731
67	NC_006831	AGT	2	6	2916	2921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616731
68	NC_006831	CTA	2	6	3164	3169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616732
69	NC_006831	T	6	6	3237	3242	0 %	100 %	0 %	0 %	58616732
70	NC_006831	ATT	2	6	3253	3258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
71	NC_006831	T	8	8	3257	3264	0 %	100 %	0 %	0 %	58616732
72	NC_006831	CTT	2	6	3281	3286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616732
73	NC_006831	AGTA	2	8	3298	3305	50 %	25 %	25 %	0 %	58616732
74	NC_006831	TAT	2	6	3324	3329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
75	NC_006831	TA	3	6	3416	3421	50 %	50 %	0 %	0 %	58616732
76	NC_006831	ATT	2	6	3487	3492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
77	NC_006831	TAT	2	6	3507	3512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
78	NC_006831	TTA	2	6	3596	3601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
79	NC_006831	TTG	2	6	3611	3616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616732
80	NC_006831	T	6	6	3638	3643	0 %	100 %	0 %	0 %	58616732
81	NC_006831	GTAG	2	8	3711	3718	25 %	25 %	50 %	0 %	58616732
82	NC_006831	TCC	2	6	3732	3737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58616732
83	NC_006831	CTTTAT	2	12	3755	3766	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	58616732
84	NC_006831	CTT	2	6	3782	3787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616732
85	NC_006831	TGT	2	6	3839	3844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	58616732
86	NC_006831	ATT	2	6	3949	3954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616732
87	NC_006831	GCA	2	6	3955	3960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616732
88	NC_006831	T	6	6	4045	4050	0 %	100 %	0 %	0 %	58616732
89	NC_006831	T	6	6	4055	4060	0 %	100 %	0 %	0 %	58616732
90	NC_006831	GGTA	2	8	4069	4076	25 %	25 %	50 %	0 %	58616732
91	NC_006831	T	7	7	4111	4117	0 %	100 %	0 %	0 %	58616732
92	NC_006831	GCCTT	2	10	4118	4127	0 %	40 %	20 %	40 %	58616732
93	NC_006831	ATA	2	6	4590	4595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616733
94	NC_006831	T	7	7	4612	4618	0 %	100 %	0 %	0 %	58616733
95	NC_006831	A	8	8	4654	4661	100 %	0 %	0 %	0 %	58616733
96	NC_006831	A	7	7	4672	4678	100 %	0 %	0 %	0 %	58616733
97	NC_006831	ATTA	2	8	4849	4856	50 %	50 %	0 %	0 %	58616733
98	NC_006831	AAT	2	6	4889	4894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616733
99	NC_006831	ATA	2	6	4904	4909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616733
100	NC_006831	AAT	2	6	4981	4986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616733
101	NC_006831	TCC	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	58616733
102	NC_006831	ATTT	2	8	5016	5023	25 %	75 %	0 %	0 %	58616733
103	NC_006831	TGA	2	6	5065	5070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616733
104	NC_006831	TGG	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616733
105	NC_006831	TAG	2	6	5121	5126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616733
106	NC_006831	GAT	2	6	5135	5140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616733
107	NC_006831	ATA	2	6	5184	5189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	58616733
108	NC_006831	AGA	2	6	5263	5268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	58616733
109	NC_006831	GGT	2	6	5285	5290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616733
110	NC_006831	GTG	2	6	5349	5354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616733
111	NC_006831	GAT	2	6	5378	5383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616733
112	NC_006831	TA	4	8	5389	5396	50 %	50 %	0 %	0 %	58616733
113	NC_006831	GATT	2	8	5428	5435	25 %	50 %	25 %	0 %	58616733
114	NC_006831	ATG	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616734
115	NC_006831	ACTAA	2	10	5561	5570	60 %	20 %	0 %	20 %	58616734
116	NC_006831	T	8	8	5586	5593	0 %	100 %	0 %	0 %	58616734
117	NC_006831	CTT	2	6	5691	5696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	58616734
118	NC_006831	TAG	2	6	5713	5718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616734
119	NC_006831	CTCA	2	8	5752	5759	25 %	25 %	0 %	50 %	58616734
120	NC_006831	TAG	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616734
121	NC_006831	TAT	3	9	5854	5862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616734
122	NC_006831	ACA	2	6	5879	5884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	58616734
123	NC_006831	A	6	6	5907	5912	100 %	0 %	0 %	0 %	58616734
124	NC_006831	T	6	6	5921	5926	0 %	100 %	0 %	0 %	58616734
125	NC_006831	TTA	2	6	5933	5938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616734
126	NC_006831	T	6	6	5958	5963	0 %	100 %	0 %	0 %	58616734
127	NC_006831	GTG	2	6	6362	6367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986614
128	NC_006831	AGC	2	6	6378	6383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161986614
129	NC_006831	T	6	6	6386	6391	0 %	100 %	0 %	0 %	161986614
130	NC_006831	T	6	6	6443	6448	0 %	100 %	0 %	0 %	161986614
131	NC_006831	AAT	2	6	6534	6539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161986614
132	NC_006831	GTA	2	6	6554	6559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161986614
133	NC_006831	TGTT	2	8	6561	6568	0 %	75 %	25 %	0 %	161986614
134	NC_006831	TAT	2	6	6608	6613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986614
135	NC_006831	TGG	2	6	6636	6641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161986614
136	NC_006831	TCC	2	6	6738	6743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	161986614
137	NC_006831	TAA	2	6	6747	6752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161986614
138	NC_006831	GTC	2	6	6789	6794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161986614
139	NC_006831	ATT	2	6	6840	6845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986614
140	NC_006831	T	6	6	6850	6855	0 %	100 %	0 %	0 %	161986614
141	NC_006831	CTATA	2	10	6938	6947	40 %	40 %	0 %	20 %	161986614
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144	NC_006831	T	6	6	7000	7005	0 %	100 %	0 %	0 %	161986614
145	NC_006831	TTA	2	6	7036	7041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986614
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149	NC_006831	TTA	2	6	7162	7167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161986614
150	NC_006831	ATC	2	6	7174	7179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161986614
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153	NC_006831	T	6	6	7288	7293	0 %	100 %	0 %	0 %	161986614
154	NC_006831	T	6	6	7309	7314	0 %	100 %	0 %	0 %	161986614
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160	NC_006831	AAG	2	6	7513	7518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161986614
161	NC_006831	TAT	2	6	7800	7805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616736
162	NC_006831	TGC	2	6	7845	7850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616736
163	NC_006831	GA	3	6	7927	7932	50 %	0 %	50 %	0 %	58616736
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166	NC_006831	TTA	2	6	8117	8122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616736
167	NC_006831	TA	3	6	8207	8212	50 %	50 %	0 %	0 %	58616736
168	NC_006831	TGG	2	6	8237	8242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	58616736
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172	NC_006831	TTTGT	2	10	8346	8355	0 %	80 %	20 %	0 %	58616736
173	NC_006831	A	7	7	8427	8433	100 %	0 %	0 %	0 %	58616736
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175	NC_006831	ATATA	2	10	8451	8460	60 %	40 %	0 %	0 %	58616736
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181	NC_006831	ATT	2	6	8787	8792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	58616737
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265	NC_006831	ATC	2	6	12629	12634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	58616740
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271	NC_006831	CATA	2	8	12751	12758	50 %	25 %	0 %	25 %	58616740
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