MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ehrlichia ruminantium str. Welgevonden chromosome

Total Repeats: 25191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_005295	ATC	2	6	177899	177904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238832
3002	NC_005295	CTT	2	6	178009	178014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238832
3003	NC_005295	AAAG	2	8	178028	178035	75 %	0 %	25 %	0 %	57238832
3004	NC_005295	CATA	2	8	178054	178061	50 %	25 %	0 %	25 %	57238832
3005	NC_005295	TAC	2	6	178067	178072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238832
3006	NC_005295	TGT	2	6	178076	178081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238832
3007	NC_005295	TCT	3	9	178125	178133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238832
3008	NC_005295	TGTTAT	2	12	178186	178197	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	57238832
3009	NC_005295	T	6	6	178197	178202	0 %	100 %	0 %	0 %	57238832
3010	NC_005295	TTC	2	6	178253	178258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238832
3011	NC_005295	CA	3	6	178266	178271	50 %	0 %	0 %	50 %	57238832
3012	NC_005295	CAT	2	6	178274	178279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238832
3013	NC_005295	TGA	2	6	178291	178296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238832
3014	NC_005295	ATT	2	6	178316	178321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238832
3015	NC_005295	TGT	2	6	178329	178334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238832
3016	NC_005295	T	6	6	178338	178343	0 %	100 %	0 %	0 %	57238832
3017	NC_005295	T	8	8	178395	178402	0 %	100 %	0 %	0 %	57238832
3018	NC_005295	GAC	2	6	178444	178449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57238832
3019	NC_005295	GATT	2	8	178521	178528	25 %	50 %	25 %	0 %	57238832
3020	NC_005295	GTA	2	6	178561	178566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238832
3021	NC_005295	AAT	2	6	178571	178576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238832
3022	NC_005295	TTGC	2	8	178629	178636	0 %	50 %	25 %	25 %	57238832
3023	NC_005295	TA	3	6	178678	178683	50 %	50 %	0 %	0 %	57238832
3024	NC_005295	T	7	7	178687	178693	0 %	100 %	0 %	0 %	57238832
3025	NC_005295	GAT	2	6	178695	178700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238832
3026	NC_005295	ATC	2	6	178727	178732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238832
3027	NC_005295	GTA	2	6	178800	178805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238832
3028	NC_005295	TAAA	2	8	178819	178826	75 %	25 %	0 %	0 %	57238832
3029	NC_005295	CAA	2	6	178852	178857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238832
3030	NC_005295	TTG	2	6	179829	179834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238833
3031	NC_005295	TAA	2	6	179918	179923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238833
3032	NC_005295	ATG	2	6	179924	179929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238833
3033	NC_005295	ATT	2	6	179983	179988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238833
3034	NC_005295	GTT	2	6	179993	179998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238833
3035	NC_005295	TATAAT	2	12	180003	180014	50 %	50 %	0 %	0 %	57238833
3036	NC_005295	GAT	2	6	180027	180032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238833
3037	NC_005295	AT	3	6	180031	180036	50 %	50 %	0 %	0 %	57238833
3038	NC_005295	CTTT	2	8	180050	180057	0 %	75 %	0 %	25 %	57238833
3039	NC_005295	T	7	7	180209	180215	0 %	100 %	0 %	0 %	57238833
3040	NC_005295	TAAT	2	8	180220	180227	50 %	50 %	0 %	0 %	57238833
3041	NC_005295	ATT	2	6	180267	180272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238833
3042	NC_005295	TAT	2	6	180275	180280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238833
3043	NC_005295	CAT	2	6	180293	180298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238833
3044	NC_005295	TG	3	6	180330	180335	0 %	50 %	50 %	0 %	57238833
3045	NC_005295	TA	3	6	181542	181547	50 %	50 %	0 %	0 %	57238834
3046	NC_005295	TGT	2	6	181576	181581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238834
3047	NC_005295	TAC	2	6	181599	181604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238834
3048	NC_005295	TTG	2	6	181611	181616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238834
3049	NC_005295	GAT	2	6	181646	181651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238834
3050	NC_005295	GGT	2	6	181678	181683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	57238834
3051	NC_005295	TA	3	6	181722	181727	50 %	50 %	0 %	0 %	57238834
3052	NC_005295	GAG	2	6	181731	181736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	57238834
3053	NC_005295	TAA	2	6	181773	181778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238834
3054	NC_005295	ATA	2	6	181821	181826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238834
3055	NC_005295	TAA	2	6	181887	181892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238834
3056	NC_005295	TAT	2	6	181912	181917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238834
3057	NC_005295	CTT	2	6	181976	181981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238834
3058	NC_005295	TCC	2	6	181984	181989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57238834
3059	NC_005295	TAC	2	6	182010	182015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238834
3060	NC_005295	T	8	8	182022	182029	0 %	100 %	0 %	0 %	57238834
3061	NC_005295	TAT	2	6	182037	182042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238834
3062	NC_005295	ACT	2	6	182069	182074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238834
3063	NC_005295	GTA	2	6	182096	182101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238834
3064	NC_005295	GTT	2	6	182107	182112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238834
3065	NC_005295	TG	3	6	182116	182121	0 %	50 %	50 %	0 %	57238834
3066	NC_005295	AT	3	6	182150	182155	50 %	50 %	0 %	0 %	57238834
3067	NC_005295	CAA	2	6	182202	182207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238834
3068	NC_005295	AT	3	6	182583	182588	50 %	50 %	0 %	0 %	57238835
3069	NC_005295	CTA	2	6	182626	182631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238835
3070	NC_005295	TCT	2	6	182745	182750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	57238835
3071	NC_005295	TAT	2	6	182755	182760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238835
3072	NC_005295	CTTAT	2	10	182765	182774	20 %	60 %	0 %	20 %	57238835
3073	NC_005295	TAC	2	6	182861	182866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238835
3074	NC_005295	ACAAT	2	10	182870	182879	60 %	20 %	0 %	20 %	57238835
3075	NC_005295	TTA	2	6	182887	182892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238835
3076	NC_005295	TAG	2	6	183010	183015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238835
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3079	NC_005295	ATT	2	6	183127	183132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238835
3080	NC_005295	TGA	2	6	183209	183214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238835
3081	NC_005295	AAGT	2	8	183230	183237	50 %	25 %	25 %	0 %	57238835
3082	NC_005295	TTA	2	6	183258	183263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238835
3083	NC_005295	CTA	2	6	183301	183306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238835
3084	NC_005295	TTA	2	6	183316	183321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	57238835
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3087	NC_005295	TATGA	2	10	183438	183447	40 %	40 %	20 %	0 %	57238835
3088	NC_005295	TGA	2	6	183458	183463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238835
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3090	NC_005295	TGAG	2	8	183526	183533	25 %	25 %	50 %	0 %	57238835
3091	NC_005295	CTG	2	6	183580	183585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238835
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3094	NC_005295	ATG	2	6	183709	183714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238835
3095	NC_005295	TAC	2	6	183752	183757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238835
3096	NC_005295	GTA	2	6	183760	183765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238835
3097	NC_005295	T	7	7	183773	183779	0 %	100 %	0 %	0 %	57238835
3098	NC_005295	AAAT	2	8	183796	183803	75 %	25 %	0 %	0 %	57238835
3099	NC_005295	GAA	2	6	183812	183817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238835
3100	NC_005295	GAT	2	6	183834	183839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238835
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3102	NC_005295	GTT	2	6	183882	183887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	57238835
3103	NC_005295	A	6	6	183937	183942	100 %	0 %	0 %	0 %	57238835
3104	NC_005295	ATG	2	6	183991	183996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238835
3105	NC_005295	TAC	2	6	184034	184039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	57238835
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3107	NC_005295	T	7	7	184055	184061	0 %	100 %	0 %	0 %	57238835
3108	NC_005295	AAAT	2	8	184078	184085	75 %	25 %	0 %	0 %	57238835
3109	NC_005295	AAAT	2	8	184090	184097	75 %	25 %	0 %	0 %	57238835
3110	NC_005295	GAA	2	6	184106	184111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	57238835
3111	NC_005295	ATA	2	6	184129	184134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238835
3112	NC_005295	CTG	2	6	184156	184161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57238835
3113	NC_005295	A	7	7	184167	184173	100 %	0 %	0 %	0 %	57238835
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3119	NC_005295	A	6	6	184407	184412	100 %	0 %	0 %	0 %	57238835
3120	NC_005295	CAA	2	6	184449	184454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	57238835
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3122	NC_005295	CATG	2	8	184494	184501	25 %	25 %	25 %	25 %	57238835
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3124	NC_005295	AGT	2	6	184587	184592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238835
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3497	NC_005295	ACATT	2	10	208339	208348	40 %	40 %	0 %	20 %	57238850
3498	NC_005295	TAA	2	6	208370	208375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	57238850
3499	NC_005295	ATG	2	6	208376	208381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57238850
3500	NC_005295	A	6	6	208401	208406	100 %	0 %	0 %	0 %	57238850

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