MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 chromosome

Total Repeats: 108992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_018661	GGA	2	6	682787	682792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_018661	GCA	2	6	682866	682871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471087
14003	NC_018661	TGC	2	6	682981	682986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471087
14004	NC_018661	ATC	2	6	683006	683011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471087
14005	NC_018661	TCA	2	6	683025	683030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471087
14006	NC_018661	CCA	2	6	683049	683054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471087
14007	NC_018661	TTC	2	6	683075	683080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471087
14008	NC_018661	ACCCG	2	10	683100	683109	20 %	0 %	20 %	60 %	407471087
14009	NC_018661	TG	3	6	683114	683119	0 %	50 %	50 %	0 %	407471087
14010	NC_018661	AATG	2	8	683322	683329	50 %	25 %	25 %	0 %	407471086
14011	NC_018661	TTA	2	6	683368	683373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471086
14012	NC_018661	CGA	2	6	683378	683383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471086
14013	NC_018661	TGT	2	6	683487	683492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471086
14014	NC_018661	TGA	2	6	683496	683501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471086
14015	NC_018661	GCGG	2	8	683534	683541	0 %	0 %	75 %	25 %	407471086
14016	NC_018661	TTG	2	6	683567	683572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471086
14017	NC_018661	CGG	3	9	683694	683702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471086
14018	NC_018661	GAA	3	9	683713	683721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471086
14019	NC_018661	CAG	2	6	683774	683779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471086
14020	NC_018661	CTG	2	6	683785	683790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471086
14021	NC_018661	TG	3	6	683795	683800	0 %	50 %	50 %	0 %	407471086
14022	NC_018661	TGA	2	6	683828	683833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471086
14023	NC_018661	TGC	2	6	683942	683947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471086
14024	NC_018661	CGT	2	6	683968	683973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471086
14025	NC_018661	CGT	2	6	683986	683991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471086
14026	NC_018661	GAA	2	6	684073	684078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471086
14027	NC_018661	GGCG	2	8	684088	684095	0 %	0 %	75 %	25 %	407471086
14028	NC_018661	GTGC	2	8	684119	684126	0 %	25 %	50 %	25 %	407471086
14029	NC_018661	ATT	2	6	684130	684135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471086
14030	NC_018661	TTA	2	6	684150	684155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471086
14031	NC_018661	CGT	2	6	684166	684171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471086
14032	NC_018661	GC	3	6	684224	684229	0 %	0 %	50 %	50 %	407471086
14033	NC_018661	GGC	3	9	684303	684311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471086
14034	NC_018661	ACT	2	6	684324	684329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471086
14035	NC_018661	GGC	2	6	684331	684336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471086
14036	NC_018661	GCG	2	6	684358	684363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471086
14037	NC_018661	CGC	2	6	684471	684476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471086
14038	NC_018661	GGA	2	6	684589	684594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407471086
14039	NC_018661	T	8	8	684664	684671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_018661	GAAT	2	8	684691	684698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_018661	TAG	2	6	684717	684722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14042	NC_018661	CG	3	6	684782	684787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14043	NC_018661	TAA	2	6	684804	684809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_018661	A	7	7	684856	684862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_018661	TAA	2	6	684863	684868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_018661	CGG	2	6	684942	684947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471085
14047	NC_018661	TGAG	2	8	684960	684967	25 %	25 %	50 %	0 %	407471085
14048	NC_018661	GTT	2	6	685147	685152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471085
14049	NC_018661	TGG	2	6	685392	685397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471085
14050	NC_018661	GCT	2	6	685459	685464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471085
14051	NC_018661	GGT	2	6	685465	685470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471085
14052	NC_018661	TGG	2	6	685491	685496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471085
14053	NC_018661	CCG	2	6	685529	685534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471085
14054	NC_018661	GCT	2	6	685540	685545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471085
14055	NC_018661	ATT	2	6	685559	685564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471085
14056	NC_018661	TCGC	2	8	685630	685637	0 %	25 %	25 %	50 %	407471085
14057	NC_018661	TTTG	2	8	685702	685709	0 %	75 %	25 %	0 %	407471085
14058	NC_018661	TTA	2	6	685815	685820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471085
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14060	NC_018661	CAT	2	6	685999	686004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471085
14061	NC_018661	TTG	2	6	686189	686194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471085
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14063	NC_018661	CTGGCG	2	12	686351	686362	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407471084
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14065	NC_018661	TGC	2	6	686371	686376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471084
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14067	NC_018661	TGG	2	6	686472	686477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471084
14068	NC_018661	GCG	3	9	686489	686497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471084
14069	NC_018661	CTG	2	6	686582	686587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471084
14070	NC_018661	GCG	2	6	686588	686593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471084
14071	NC_018661	GT	3	6	686677	686682	0 %	50 %	50 %	0 %	407471084
14072	NC_018661	TCG	2	6	686688	686693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471084
14073	NC_018661	TGGTG	2	10	686731	686740	0 %	40 %	60 %	0 %	407471084
14074	NC_018661	CAG	2	6	686747	686752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471084
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14076	NC_018661	ACG	2	6	686804	686809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471084
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14079	NC_018661	GCG	2	6	687036	687041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471084
14080	NC_018661	CAA	2	6	687093	687098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471084
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14084	NC_018661	GCC	3	9	687248	687256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471084
14085	NC_018661	ATGGC	2	10	687260	687269	20 %	20 %	40 %	20 %	407471084
14086	NC_018661	TGG	2	6	687270	687275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471084
14087	NC_018661	CAG	2	6	687307	687312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471084
14088	NC_018661	GAT	2	6	687422	687427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471084
14089	NC_018661	CCG	2	6	687429	687434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407471084
14090	NC_018661	ATG	2	6	687462	687467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471084
14091	NC_018661	TG	3	6	687489	687494	0 %	50 %	50 %	0 %	407471084
14092	NC_018661	GCA	2	6	687514	687519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471084
14093	NC_018661	CGC	2	6	687604	687609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14094	NC_018661	CGA	2	6	687670	687675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471083
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14101	NC_018661	ATG	2	6	687927	687932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471082
14102	NC_018661	CG	3	6	687972	687977	0 %	0 %	50 %	50 %	407471082
14103	NC_018661	GGCGA	2	10	688078	688087	20 %	0 %	60 %	20 %	407471082
14104	NC_018661	TGC	2	6	688093	688098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471082
14105	NC_018661	TC	3	6	688136	688141	0 %	50 %	0 %	50 %	407471082
14106	NC_018661	AG	3	6	688233	688238	50 %	0 %	50 %	0 %	407471082
14107	NC_018661	TCCA	2	8	688302	688309	25 %	25 %	0 %	50 %	407471082
14108	NC_018661	GGC	2	6	688356	688361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471082
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14110	NC_018661	GTA	2	6	688504	688509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471082
14111	NC_018661	CT	3	6	688525	688530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14112	NC_018661	AAAG	2	8	688625	688632	75 %	0 %	25 %	0 %	407471081
14113	NC_018661	CGAT	2	8	688668	688675	25 %	25 %	25 %	25 %	407471081
14114	NC_018661	GCG	4	12	688691	688702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471081
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14118	NC_018661	GGC	2	6	688975	688980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471081
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14120	NC_018661	GCGG	2	8	689050	689057	0 %	0 %	75 %	25 %	407471081
14121	NC_018661	TCG	2	6	689093	689098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471081
14122	NC_018661	TCA	2	6	689164	689169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471081
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14124	NC_018661	GCT	2	6	689263	689268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471081
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14363	NC_018661	AT	3	6	701106	701111	50 %	50 %	0 %	0 %	407471065
14364	NC_018661	CAGA	2	8	701144	701151	50 %	0 %	25 %	25 %	407471065
14365	NC_018661	GAA	2	6	701155	701160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471065
14366	NC_018661	TGG	2	6	701170	701175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471065
14367	NC_018661	TTC	2	6	701276	701281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471065
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14371	NC_018661	AGGG	2	8	701493	701500	25 %	0 %	75 %	0 %	407471065
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14376	NC_018661	TAC	2	6	701729	701734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471065
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14378	NC_018661	T	6	6	701807	701812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14379	NC_018661	TA	3	6	701814	701819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14380	NC_018661	ACG	2	6	701821	701826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14387	NC_018661	TGG	2	6	702153	702158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471064
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14483	NC_018661	GAA	2	6	706391	706396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471062
14484	NC_018661	A	6	6	706395	706400	100 %	0 %	0 %	0 %	407471062
14485	NC_018661	GAA	2	6	706461	706466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471062
14486	NC_018661	AAAC	2	8	706500	706507	75 %	0 %	0 %	25 %	407471062
14487	NC_018661	GCG	2	6	706552	706557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471062
14488	NC_018661	GTT	2	6	706580	706585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14489	NC_018661	A	6	6	706589	706594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14491	NC_018661	AGC	2	6	706745	706750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471061
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14493	NC_018661	GTGCCA	2	12	706811	706822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407471061
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