MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2071 chromosome

Total Repeats: 108992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_018661	AT	3	6	321047	321052	50 %	50 %	0 %	0 %	407471447
6502	NC_018661	AT	3	6	321100	321105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_018661	AAT	2	6	321109	321114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_018661	TTCAT	2	10	321200	321209	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6505	NC_018661	TAATT	2	10	321228	321237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_018661	CGA	2	6	321309	321314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471446
6507	NC_018661	CT	3	6	321336	321341	0 %	50 %	0 %	50 %	407471446
6508	NC_018661	TGACC	2	10	321431	321440	20 %	20 %	20 %	40 %	407471446
6509	NC_018661	CAAT	2	8	321490	321497	50 %	25 %	0 %	25 %	407471446
6510	NC_018661	TTC	2	6	321517	321522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471446
6511	NC_018661	AAG	2	6	321529	321534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471446
6512	NC_018661	ATT	2	6	321600	321605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471446
6513	NC_018661	ATGG	2	8	321618	321625	25 %	25 %	50 %	0 %	407471446
6514	NC_018661	TGA	2	6	321659	321664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471446
6515	NC_018661	AGG	2	6	321739	321744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407471446
6516	NC_018661	ATC	2	6	321762	321767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471446
6517	NC_018661	TTAC	2	8	321790	321797	25 %	50 %	0 %	25 %	407471446
6518	NC_018661	TGT	2	6	321817	321822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471446
6519	NC_018661	CTG	2	6	321852	321857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471446
6520	NC_018661	A	6	6	321858	321863	100 %	0 %	0 %	0 %	407471446
6521	NC_018661	A	7	7	321866	321872	100 %	0 %	0 %	0 %	407471446
6522	NC_018661	TAC	2	6	321882	321887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471446
6523	NC_018661	AACC	2	8	321898	321905	50 %	0 %	0 %	50 %	407471446
6524	NC_018661	T	6	6	321914	321919	0 %	100 %	0 %	0 %	407471446
6525	NC_018661	CCA	2	6	321949	321954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471446
6526	NC_018661	TGAAA	2	10	321977	321986	60 %	20 %	20 %	0 %	407471446
6527	NC_018661	CTACAC	2	12	322019	322030	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	407471446
6528	NC_018661	TTGCCG	2	12	322222	322233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471446
6529	NC_018661	ATG	2	6	322240	322245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471446
6530	NC_018661	GA	3	6	322331	322336	50 %	0 %	50 %	0 %	407471446
6531	NC_018661	TGC	2	6	322346	322351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471446
6532	NC_018661	C	7	7	322356	322362	0 %	0 %	0 %	100 %	407471446
6533	NC_018661	G	6	6	322403	322408	0 %	0 %	100 %	0 %	407471446
6534	NC_018661	GA	3	6	322468	322473	50 %	0 %	50 %	0 %	407471446
6535	NC_018661	TCC	2	6	322515	322520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407471446
6536	NC_018661	CAG	2	6	322535	322540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471446
6537	NC_018661	TC	3	6	322645	322650	0 %	50 %	0 %	50 %	407471446
6538	NC_018661	GAA	2	6	322690	322695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471446
6539	NC_018661	GACG	2	8	322740	322747	25 %	0 %	50 %	25 %	407471446
6540	NC_018661	TGC	2	6	322843	322848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471446
6541	NC_018661	ATG	2	6	322893	322898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471446
6542	NC_018661	AC	3	6	322970	322975	50 %	0 %	0 %	50 %	407471446
6543	NC_018661	CAG	2	6	323017	323022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471446
6544	NC_018661	GGA	2	6	323099	323104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407471446
6545	NC_018661	ATG	2	6	323105	323110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471446
6546	NC_018661	GTTT	2	8	323154	323161	0 %	75 %	25 %	0 %	407471445
6547	NC_018661	GCG	2	6	323180	323185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471445
6548	NC_018661	CAG	2	6	323241	323246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471445
6549	NC_018661	ATTA	2	8	323381	323388	50 %	50 %	0 %	0 %	407471445
6550	NC_018661	CTG	2	6	323396	323401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471445
6551	NC_018661	CAA	2	6	323434	323439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407471445
6552	NC_018661	GGC	2	6	323530	323535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471445
6553	NC_018661	TGG	2	6	323573	323578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471445
6554	NC_018661	CAGG	2	8	323596	323603	25 %	0 %	50 %	25 %	407471445
6555	NC_018661	GCT	2	6	323633	323638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471445
6556	NC_018661	AGC	2	6	323710	323715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471445
6557	NC_018661	GAG	2	6	323727	323732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407471445
6558	NC_018661	ACG	2	6	323736	323741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471445
6559	NC_018661	GAT	2	6	323801	323806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471445
6560	NC_018661	GACT	2	8	323829	323836	25 %	25 %	25 %	25 %	407471445
6561	NC_018661	TA	3	6	323891	323896	50 %	50 %	0 %	0 %	407471445
6562	NC_018661	GTA	2	6	323969	323974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471445
6563	NC_018661	TAAA	2	8	324036	324043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_018661	TAAA	2	8	324054	324061	75 %	25 %	0 %	0 %	407471444
6565	NC_018661	TCA	2	6	324251	324256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471444
6566	NC_018661	ATT	2	6	324317	324322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407471444
6567	NC_018661	GC	3	6	324364	324369	0 %	0 %	50 %	50 %	407471444
6568	NC_018661	TTC	2	6	324373	324378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471444
6569	NC_018661	TCT	2	6	324461	324466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471443
6570	NC_018661	T	6	6	324501	324506	0 %	100 %	0 %	0 %	407471443
6571	NC_018661	AT	3	6	324510	324515	50 %	50 %	0 %	0 %	407471443
6572	NC_018661	TGT	2	6	324581	324586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471443
6573	NC_018661	CAT	2	6	324593	324598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471443
6574	NC_018661	ATCC	2	8	324665	324672	25 %	25 %	0 %	50 %	407471443
6575	NC_018661	AGA	2	6	324692	324697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407471443
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6577	NC_018661	CCTG	2	8	324790	324797	0 %	25 %	25 %	50 %	407471443
6578	NC_018661	TGA	2	6	324799	324804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471443
6579	NC_018661	GGA	2	6	324843	324848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407471443
6580	NC_018661	CTG	2	6	324957	324962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471443
6581	NC_018661	TTG	2	6	325045	325050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471443
6582	NC_018661	TAACT	2	10	325100	325109	40 %	40 %	0 %	20 %	407471443
6583	NC_018661	TTGC	2	8	325140	325147	0 %	50 %	25 %	25 %	407471443
6584	NC_018661	TGTT	2	8	325159	325166	0 %	75 %	25 %	0 %	407471443
6585	NC_018661	CTT	2	6	325173	325178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407471443
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6588	NC_018661	GTT	2	6	325290	325295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471443
6589	NC_018661	TGCT	2	8	325333	325340	0 %	50 %	25 %	25 %	407471443
6590	NC_018661	A	6	6	325444	325449	100 %	0 %	0 %	0 %	407471442
6591	NC_018661	GCA	2	6	325463	325468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407471442
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6593	NC_018661	ATA	2	6	325557	325562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471442
6594	NC_018661	TGC	2	6	325573	325578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471442
6595	NC_018661	ATC	2	6	325599	325604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407471442
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6598	NC_018661	TGC	3	9	325894	325902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407471442
6599	NC_018661	TGAT	2	8	325981	325988	25 %	50 %	25 %	0 %	407471442
6600	NC_018661	TGA	3	9	326018	326026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471442
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6602	NC_018661	GCCTGA	2	12	326118	326129	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	407471441
6603	NC_018661	T	6	6	326130	326135	0 %	100 %	0 %	0 %	407471441
6604	NC_018661	TGG	2	6	326156	326161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407471441
6605	NC_018661	A	6	6	326307	326312	100 %	0 %	0 %	0 %	407471441
6606	NC_018661	CGATG	2	10	326317	326326	20 %	20 %	40 %	20 %	407471441
6607	NC_018661	A	6	6	326356	326361	100 %	0 %	0 %	0 %	407471441
6608	NC_018661	A	6	6	326373	326378	100 %	0 %	0 %	0 %	407471441
6609	NC_018661	TTG	2	6	326379	326384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407471441
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6611	NC_018661	TAA	2	6	326425	326430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407471441
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6613	NC_018661	CGG	2	6	326498	326503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471441
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6615	NC_018661	GGTCT	2	10	326624	326633	0 %	40 %	40 %	20 %	407471441
6616	NC_018661	GCTG	2	8	326652	326659	0 %	25 %	50 %	25 %	407471441
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6620	NC_018661	CAGT	2	8	326874	326881	25 %	25 %	25 %	25 %	407471441
6621	NC_018661	TGA	2	6	326886	326891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407471441
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6998	NC_018661	GCG	2	6	343570	343575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407471428
6999	NC_018661	ACC	2	6	343678	343683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407471427
7000	NC_018661	ATCA	2	8	343806	343813	50 %	25 %	0 %	25 %	407471427

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