MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 chromosome

Total Repeats: 108171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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105002	NC_018658	CTG	2	6	5118871	5118876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484423
105003	NC_018658	AGCC	2	8	5118886	5118893	25 %	0 %	25 %	50 %	407484423
105004	NC_018658	GAA	2	6	5118910	5118915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484423
105005	NC_018658	ATG	2	6	5118931	5118936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484423
105006	NC_018658	GTG	2	6	5118955	5118960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484423
105007	NC_018658	GGA	2	6	5118969	5118974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407484423
105008	NC_018658	CGG	2	6	5118992	5118997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484423
105009	NC_018658	CGG	2	6	5119044	5119049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484423
105010	NC_018658	GCTG	2	8	5119058	5119065	0 %	25 %	50 %	25 %	407484423
105011	NC_018658	TAA	2	6	5119152	5119157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407484423
105012	NC_018658	TCC	2	6	5119182	5119187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484423
105013	NC_018658	AGCC	2	8	5119193	5119200	25 %	0 %	25 %	50 %	407484423
105014	NC_018658	CGTG	2	8	5119311	5119318	0 %	25 %	50 %	25 %	407484424
105015	NC_018658	AGA	2	6	5119320	5119325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484424
105016	NC_018658	TC	3	6	5119326	5119331	0 %	50 %	0 %	50 %	407484424
105017	NC_018658	CTG	2	6	5119351	5119356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484424
105018	NC_018658	GCG	2	6	5119378	5119383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484424
105019	NC_018658	CGA	2	6	5119389	5119394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484424
105020	NC_018658	TG	3	6	5119408	5119413	0 %	50 %	50 %	0 %	407484424
105021	NC_018658	CAG	2	6	5119414	5119419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484424
105022	NC_018658	GCT	2	6	5119458	5119463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484424
105023	NC_018658	CGG	2	6	5119487	5119492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484424
105024	NC_018658	TG	3	6	5119508	5119513	0 %	50 %	50 %	0 %	407484424
105025	NC_018658	GCA	2	6	5119540	5119545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484424
105026	NC_018658	GGC	2	6	5119585	5119590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484424
105027	NC_018658	GCG	2	6	5119666	5119671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484424
105028	NC_018658	ATG	2	6	5119675	5119680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484424
105029	NC_018658	CG	3	6	5119746	5119751	0 %	0 %	50 %	50 %	407484424
105030	NC_018658	GCC	2	6	5119771	5119776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484424
105031	NC_018658	ATC	2	6	5119804	5119809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484424
105032	NC_018658	GGT	2	6	5119816	5119821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484424
105033	NC_018658	ACG	2	6	5119856	5119861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484424
105034	NC_018658	ACC	2	6	5119879	5119884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484424
105035	NC_018658	ACGGT	2	10	5119928	5119937	20 %	20 %	40 %	20 %	407484424
105036	NC_018658	CGG	2	6	5119940	5119945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484424
105037	NC_018658	TCT	2	6	5119951	5119956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484424
105038	NC_018658	TGA	2	6	5119988	5119993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484424
105039	NC_018658	CG	3	6	5120027	5120032	0 %	0 %	50 %	50 %	407484424
105040	NC_018658	GTTG	2	8	5120056	5120063	0 %	50 %	50 %	0 %	407484424
105041	NC_018658	A	6	6	5120116	5120121	100 %	0 %	0 %	0 %	407484424
105042	NC_018658	TGG	2	6	5120244	5120249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484424
105043	NC_018658	CAC	2	6	5120298	5120303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484424
105044	NC_018658	GCT	2	6	5120304	5120309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484424
105045	NC_018658	CGA	2	6	5120348	5120353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484424
105046	NC_018658	GCG	2	6	5120417	5120422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105047	NC_018658	CGT	2	6	5120494	5120499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105048	NC_018658	TTC	2	6	5120559	5120564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105049	NC_018658	T	7	7	5120583	5120589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105050	NC_018658	CCG	2	6	5120741	5120746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484425
105051	NC_018658	GTT	2	6	5120786	5120791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484425
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105053	NC_018658	CAC	2	6	5120802	5120807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484425
105054	NC_018658	TGC	2	6	5120863	5120868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484425
105055	NC_018658	CGCC	2	8	5120875	5120882	0 %	0 %	25 %	75 %	407484425
105056	NC_018658	GCC	2	6	5120961	5120966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484425
105057	NC_018658	ATC	2	6	5120977	5120982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484425
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105063	NC_018658	GTT	2	6	5121357	5121362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484426
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105070	NC_018658	CGG	2	6	5121762	5121767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484426
105071	NC_018658	ACGCC	2	10	5121830	5121839	20 %	0 %	20 %	60 %	407484426
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105075	NC_018658	GC	3	6	5122235	5122240	0 %	0 %	50 %	50 %	407484426
105076	NC_018658	CGC	3	9	5122238	5122246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484426
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105081	NC_018658	GCG	2	6	5122364	5122369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484426
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105083	NC_018658	T	6	6	5122436	5122441	0 %	100 %	0 %	0 %	407484426
105084	NC_018658	CAC	2	6	5122454	5122459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484426
105085	NC_018658	GGC	2	6	5122534	5122539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484426
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105088	NC_018658	CTG	2	6	5122779	5122784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484426
105089	NC_018658	TACTG	2	10	5123018	5123027	20 %	40 %	20 %	20 %	407484427
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105103	NC_018658	TCT	2	6	5123551	5123556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484428
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105115	NC_018658	CTT	2	6	5124044	5124049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484428
105116	NC_018658	GCT	2	6	5124069	5124074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484428
105117	NC_018658	CGCC	2	8	5124089	5124096	0 %	0 %	25 %	75 %	407484428
105118	NC_018658	CTG	2	6	5124138	5124143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484428
105119	NC_018658	TGA	2	6	5124167	5124172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484428
105120	NC_018658	GC	4	8	5124199	5124206	0 %	0 %	50 %	50 %	407484428
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105122	NC_018658	TCA	2	6	5124214	5124219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484428
105123	NC_018658	TTC	2	6	5124314	5124319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484429
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105125	NC_018658	CGT	2	6	5124343	5124348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484429
105126	NC_018658	GAA	2	6	5124392	5124397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484429
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105131	NC_018658	T	6	6	5124512	5124517	0 %	100 %	0 %	0 %	407484429
105132	NC_018658	TCT	2	6	5124525	5124530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484429
105133	NC_018658	CAGCA	2	10	5124549	5124558	40 %	0 %	20 %	40 %	407484429
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105137	NC_018658	CAG	2	6	5124755	5124760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484429
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105143	NC_018658	GCA	2	6	5125145	5125150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484430
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105199	NC_018658	CAT	2	6	5128416	5128421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484434
105200	NC_018658	CAG	2	6	5128468	5128473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484434
105201	NC_018658	GCC	2	6	5128477	5128482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484434
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105210	NC_018658	CTG	2	6	5129072	5129077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484435
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105213	NC_018658	GCT	2	6	5129116	5129121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484435
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105216	NC_018658	AG	3	6	5129258	5129263	50 %	0 %	50 %	0 %	407484435
105217	NC_018658	T	6	6	5129264	5129269	0 %	100 %	0 %	0 %	407484435
105218	NC_018658	CCA	2	6	5129440	5129445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484435
105219	NC_018658	A	6	6	5129526	5129531	100 %	0 %	0 %	0 %	407484435
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105221	NC_018658	CAC	2	6	5129729	5129734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484435
105222	NC_018658	TTCATA	2	12	5129813	5129824	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	407484435
105223	NC_018658	TAC	2	6	5129864	5129869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484435
105224	NC_018658	GC	4	8	5129908	5129915	0 %	0 %	50 %	50 %	407484435
105225	NC_018658	CTT	2	6	5130001	5130006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484435
105226	NC_018658	CGG	2	6	5130030	5130035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484435
105227	NC_018658	GTT	2	6	5130046	5130051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484435
105228	NC_018658	GCG	2	6	5130058	5130063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484435
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105230	NC_018658	TCA	2	6	5130096	5130101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484435
105231	NC_018658	GCT	2	6	5130163	5130168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484435
105232	NC_018658	ATC	2	6	5130177	5130182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484435
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105461	NC_018658	TCA	2	6	5141515	5141520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484445
105462	NC_018658	CGC	3	9	5141561	5141569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484445
105463	NC_018658	TCA	2	6	5141605	5141610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484445
105464	NC_018658	AAC	2	6	5141627	5141632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484445
105465	NC_018658	GAC	2	6	5141702	5141707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484445
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105479	NC_018658	GTTA	2	8	5142921	5142928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105480	NC_018658	CAA	3	9	5142949	5142957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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105494	NC_018658	TAC	2	6	5143615	5143620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484448
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