MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 chromosome

Total Repeats: 108171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
103001	NC_018658	GGTCAT	2	12	5021070	5021081	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407484332
103002	NC_018658	TG	3	6	5021193	5021198	0 %	50 %	50 %	0 %	407484332
103003	NC_018658	TCA	2	6	5021264	5021269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484332
103004	NC_018658	TGG	2	6	5021324	5021329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484332
103005	NC_018658	GTG	2	6	5021363	5021368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484332
103006	NC_018658	TGA	2	6	5021376	5021381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484332
103007	NC_018658	CAC	2	6	5021389	5021394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484332
103008	NC_018658	TGT	2	6	5021410	5021415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484332
103009	NC_018658	CCTG	2	8	5021416	5021423	0 %	25 %	25 %	50 %	407484332
103010	NC_018658	CAC	2	6	5021503	5021508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484332
103011	NC_018658	GCA	2	6	5021538	5021543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484332
103012	NC_018658	CGG	2	6	5021549	5021554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484332
103013	NC_018658	GGTGAT	2	12	5021566	5021577	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	407484332
103014	NC_018658	CCCG	2	8	5021637	5021644	0 %	0 %	25 %	75 %	407484332
103015	NC_018658	GTAACG	2	12	5021653	5021664	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	407484332
103016	NC_018658	CCGG	2	8	5021670	5021677	0 %	0 %	50 %	50 %	407484332
103017	NC_018658	CCA	2	6	5021694	5021699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484332
103018	NC_018658	ATC	2	6	5021716	5021721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484332
103019	NC_018658	GTAA	2	8	5021722	5021729	50 %	25 %	25 %	0 %	407484332
103020	NC_018658	ACC	2	6	5021762	5021767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484332
103021	NC_018658	CGC	2	6	5021775	5021780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484332
103022	NC_018658	GCG	2	6	5021805	5021810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484332
103023	NC_018658	CAGA	2	8	5021859	5021866	50 %	0 %	25 %	25 %	407484332
103024	NC_018658	CCG	2	6	5021936	5021941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484332
103025	NC_018658	CTG	2	6	5021950	5021955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484332
103026	NC_018658	CTT	2	6	5021961	5021966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484332
103027	NC_018658	CGC	2	6	5022039	5022044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484332
103028	NC_018658	CGG	2	6	5022054	5022059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484332
103029	NC_018658	TG	3	6	5022077	5022082	0 %	50 %	50 %	0 %	407484332
103030	NC_018658	CCA	2	6	5022096	5022101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484332
103031	NC_018658	CGG	2	6	5022121	5022126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484332
103032	NC_018658	GCG	2	6	5022129	5022134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484332
103033	NC_018658	GCA	2	6	5022138	5022143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484332
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103036	NC_018658	TTC	2	6	5022241	5022246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484332
103037	NC_018658	CGC	3	9	5022300	5022308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484332
103038	NC_018658	GCC	2	6	5022382	5022387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484332
103039	NC_018658	GT	3	6	5022405	5022410	0 %	50 %	50 %	0 %	407484332
103040	NC_018658	CTG	2	6	5022497	5022502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484332
103041	NC_018658	GCGGG	2	10	5022528	5022537	0 %	0 %	80 %	20 %	407484332
103042	NC_018658	AGC	2	6	5022578	5022583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484332
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103044	NC_018658	CGC	2	6	5022715	5022720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484332
103045	NC_018658	AAAT	2	8	5022751	5022758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103046	NC_018658	CAA	2	6	5022783	5022788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103047	NC_018658	A	7	7	5022855	5022861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103048	NC_018658	GCG	2	6	5022869	5022874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103049	NC_018658	T	6	6	5022876	5022881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103050	NC_018658	TGC	2	6	5022900	5022905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484333
103051	NC_018658	TTG	2	6	5022923	5022928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484333
103052	NC_018658	GAA	2	6	5022976	5022981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407484333
103053	NC_018658	TGC	2	6	5022993	5022998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484333
103054	NC_018658	AGC	2	6	5023059	5023064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484333
103055	NC_018658	TTC	2	6	5023075	5023080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407484333
103056	NC_018658	T	6	6	5023099	5023104	0 %	100 %	0 %	0 %	407484333
103057	NC_018658	GAT	2	6	5023301	5023306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103058	NC_018658	TTGCC	2	10	5023326	5023335	0 %	40 %	20 %	40 %	407484334
103059	NC_018658	CTG	2	6	5023364	5023369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484334
103060	NC_018658	CGCGTG	2	12	5023400	5023411	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407484334
103061	NC_018658	CAG	2	6	5023424	5023429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484334
103062	NC_018658	ACTC	2	8	5023529	5023536	25 %	25 %	0 %	50 %	407484334
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103064	NC_018658	ATC	3	9	5023572	5023580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484334
103065	NC_018658	GCG	2	6	5023637	5023642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484334
103066	NC_018658	CAA	2	6	5023721	5023726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484334
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103068	NC_018658	GGCAA	2	10	5023746	5023755	40 %	0 %	40 %	20 %	407484334
103069	NC_018658	ATG	2	6	5023791	5023796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484334
103070	NC_018658	A	6	6	5023817	5023822	100 %	0 %	0 %	0 %	407484334
103071	NC_018658	TG	3	6	5023827	5023832	0 %	50 %	50 %	0 %	407484334
103072	NC_018658	CGAA	2	8	5023868	5023875	50 %	0 %	25 %	25 %	407484334
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103074	NC_018658	GCT	2	6	5023969	5023974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484334
103075	NC_018658	GGCG	2	8	5023975	5023982	0 %	0 %	75 %	25 %	407484334
103076	NC_018658	GCTC	2	8	5024032	5024039	0 %	25 %	25 %	50 %	407484334
103077	NC_018658	AGCG	2	8	5024156	5024163	25 %	0 %	50 %	25 %	407484334
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103079	NC_018658	TGA	2	6	5024266	5024271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484334
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103081	NC_018658	ATT	2	6	5024363	5024368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484334
103082	NC_018658	CAG	2	6	5024411	5024416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484334
103083	NC_018658	A	6	6	5024417	5024422	100 %	0 %	0 %	0 %	407484334
103084	NC_018658	CTG	2	6	5024429	5024434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484334
103085	NC_018658	CGGG	2	8	5024447	5024454	0 %	0 %	75 %	25 %	407484334
103086	NC_018658	GCAG	2	8	5024506	5024513	25 %	0 %	50 %	25 %	407484334
103087	NC_018658	CAA	2	6	5024560	5024565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484334
103088	NC_018658	TCG	2	6	5024587	5024592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407484334
103089	NC_018658	ACT	2	6	5024658	5024663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484334
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103092	NC_018658	CGG	2	6	5024899	5024904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407484334
103093	NC_018658	CA	3	6	5024923	5024928	50 %	0 %	0 %	50 %	407484334
103094	NC_018658	CAC	2	6	5024945	5024950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407484334
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103097	NC_018658	GTG	2	6	5025089	5025094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407484334
103098	NC_018658	ACG	2	6	5025150	5025155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484334
103099	NC_018658	GCTG	2	8	5025172	5025179	0 %	25 %	50 %	25 %	407484334
103100	NC_018658	GAT	2	6	5025187	5025192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407484334
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103102	NC_018658	TGCG	2	8	5025225	5025232	0 %	25 %	50 %	25 %	407484334
103103	NC_018658	CAA	2	6	5025269	5025274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407484334
103104	NC_018658	CTC	2	6	5025287	5025292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407484334
103105	NC_018658	GAC	2	6	5025308	5025313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407484334
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103107	NC_018658	CGCTGG	2	12	5025365	5025376	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	407484334
103108	NC_018658	TTG	2	6	5025383	5025388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407484334
103109	NC_018658	CAT	2	6	5025418	5025423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407484334
103110	NC_018658	TTA	2	6	5025441	5025446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407484334
103111	NC_018658	TCA	2	6	5025547	5025552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103112	NC_018658	GTA	2	6	5025630	5025635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103113	NC_018658	GAG	2	6	5025653	5025658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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103337	NC_018658	T	7	7	5035596	5035602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103338	NC_018658	TCAA	2	8	5035628	5035635	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103339	NC_018658	CCG	2	6	5035744	5035749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407484345
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