MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2011C-3493 chromosome

Total Repeats: 108171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018658	ATA	2	6	220298	220303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_018658	AAT	2	6	220313	220318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_018658	TCAT	2	8	220326	220333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_018658	TTA	2	6	220437	220442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_018658	GCTG	2	8	220487	220494	0 %	25 %	50 %	25 %	407479810
4506	NC_018658	GC	3	6	220562	220567	0 %	0 %	50 %	50 %	407479810
4507	NC_018658	TCT	2	6	220645	220650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479810
4508	NC_018658	CTT	2	6	220725	220730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479810
4509	NC_018658	TGA	2	6	220754	220759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479810
4510	NC_018658	GGTC	2	8	220785	220792	0 %	25 %	50 %	25 %	407479810
4511	NC_018658	CTG	2	6	220813	220818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479810
4512	NC_018658	CT	3	6	220822	220827	0 %	50 %	0 %	50 %	407479810
4513	NC_018658	GCT	2	6	220929	220934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479810
4514	NC_018658	A	6	6	220952	220957	100 %	0 %	0 %	0 %	407479810
4515	NC_018658	TGA	2	6	220988	220993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479810
4516	NC_018658	TGGTG	2	10	221052	221061	0 %	40 %	60 %	0 %	407479810
4517	NC_018658	CTGC	2	8	221132	221139	0 %	25 %	25 %	50 %	407479810
4518	NC_018658	GTC	2	6	221255	221260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479810
4519	NC_018658	GGC	2	6	221340	221345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479810
4520	NC_018658	CTG	2	6	221347	221352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479810
4521	NC_018658	CAC	2	6	221357	221362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407479810
4522	NC_018658	GGC	2	6	221413	221418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479810
4523	NC_018658	TTC	2	6	221452	221457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479810
4524	NC_018658	TCGGTA	2	12	221504	221515	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	407479810
4525	NC_018658	CTG	2	6	221584	221589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479810
4526	NC_018658	ACG	2	6	221611	221616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479810
4527	NC_018658	AAAT	2	8	221678	221685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_018658	T	6	6	221713	221718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4529	NC_018658	AAT	2	6	221740	221745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_018658	AT	3	6	221759	221764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_018658	TA	3	6	221775	221780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_018658	TAAATA	2	12	221786	221797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_018658	A	6	6	221805	221810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_018658	T	6	6	221826	221831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_018658	AATT	2	8	221838	221845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_018658	TTG	2	6	221867	221872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_018658	AAT	2	6	221894	221899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_018658	T	6	6	221904	221909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_018658	AAC	2	6	221944	221949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_018658	TA	3	6	221966	221971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_018658	TGCGCT	2	12	222011	222022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479811
4542	NC_018658	TTG	2	6	222085	222090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479811
4543	NC_018658	CGC	2	6	222092	222097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479811
4544	NC_018658	TTGTG	2	10	222098	222107	0 %	60 %	40 %	0 %	407479811
4545	NC_018658	AAG	2	6	222127	222132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479811
4546	NC_018658	ACA	2	6	222277	222282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407479811
4547	NC_018658	AAG	2	6	222400	222405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479811
4548	NC_018658	ATC	2	6	222527	222532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_018658	TC	3	6	222531	222536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_018658	ATT	2	6	222561	222566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_018658	TGCTG	2	10	222610	222619	0 %	40 %	40 %	20 %	407479812
4552	NC_018658	TGG	2	6	222652	222657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479812
4553	NC_018658	ACG	2	6	222671	222676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479812
4554	NC_018658	TTAT	2	8	222681	222688	25 %	75 %	0 %	0 %	407479812
4555	NC_018658	GGC	2	6	222692	222697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479812
4556	NC_018658	AAGA	2	8	222698	222705	75 %	0 %	25 %	0 %	407479812
4557	NC_018658	ATA	2	6	222729	222734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407479812
4558	NC_018658	TGA	2	6	222766	222771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479812
4559	NC_018658	A	7	7	222785	222791	100 %	0 %	0 %	0 %	407479812
4560	NC_018658	TAT	2	6	222799	222804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479812
4561	NC_018658	ATT	2	6	222814	222819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479812
4562	NC_018658	TACCT	2	10	222871	222880	20 %	40 %	0 %	40 %	407479812
4563	NC_018658	TGAAAA	2	12	222937	222948	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	407479812
4564	NC_018658	GTT	2	6	222988	222993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479812
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4566	NC_018658	CGGG	2	8	223142	223149	0 %	0 %	75 %	25 %	407479812
4567	NC_018658	GAAAG	2	10	223162	223171	60 %	0 %	40 %	0 %	407479812
4568	NC_018658	ATT	2	6	223226	223231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479812
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4571	NC_018658	GAA	2	6	223525	223530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479813
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4573	NC_018658	AGCGA	2	10	223567	223576	40 %	0 %	40 %	20 %	407479813
4574	NC_018658	TGCCT	2	10	223604	223613	0 %	40 %	20 %	40 %	407479813
4575	NC_018658	GAA	2	6	223630	223635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407479813
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4579	NC_018658	CTTTC	2	10	223759	223768	0 %	60 %	0 %	40 %	407479813
4580	NC_018658	GGC	2	6	223773	223778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407479813
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4584	NC_018658	TAA	2	6	223971	223976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407479813
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4592	NC_018658	GGT	2	6	224518	224523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479813
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4602	NC_018658	GC	3	6	225359	225364	0 %	0 %	50 %	50 %	407479813
4603	NC_018658	GTG	2	6	225365	225370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479813
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4607	NC_018658	TGA	2	6	225581	225586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479813
4608	NC_018658	TGA	2	6	225642	225647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407479813
4609	NC_018658	CAG	2	6	225660	225665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479813
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4615	NC_018658	AT	3	6	226193	226198	50 %	50 %	0 %	0 %	407479814
4616	NC_018658	AC	3	6	226203	226208	50 %	0 %	0 %	50 %	407479814
4617	NC_018658	GGCAC	2	10	226247	226256	20 %	0 %	40 %	40 %	407479814
4618	NC_018658	AGAA	2	8	226257	226264	75 %	0 %	25 %	0 %	407479814
4619	NC_018658	GGT	2	6	226298	226303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407479814
4620	NC_018658	TTG	2	6	226338	226343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407479814
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4622	NC_018658	A	6	6	226390	226395	100 %	0 %	0 %	0 %	407479814
4623	NC_018658	ACC	2	6	226549	226554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407479814
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4625	NC_018658	TTA	2	6	226751	226756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407479814
4626	NC_018658	CTG	2	6	226933	226938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479815
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4995	NC_018658	CAG	2	6	245820	245825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407479829
4996	NC_018658	GC	3	6	245850	245855	0 %	0 %	50 %	50 %	407479829
4997	NC_018658	CAC	2	6	245894	245899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407479829
4998	NC_018658	CTG	2	6	245997	246002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407479829
4999	NC_018658	CTT	2	6	246055	246060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407479829
5000	NC_018658	CGC	2	6	246123	246128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407479829

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