MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 chromosome

Total Repeats: 107796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_018650	GGC	2	6	753559	753564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480871
15502	NC_018650	CCA	2	6	753619	753624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15503	NC_018650	CTTT	2	8	753650	753657	0 %	75 %	0 %	25 %	410480872
15504	NC_018650	GAC	2	6	753685	753690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480872
15505	NC_018650	TGT	2	6	753706	753711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480872
15506	NC_018650	ATG	2	6	753713	753718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480872
15507	NC_018650	GCA	2	6	753721	753726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480872
15508	NC_018650	AG	3	6	753737	753742	50 %	0 %	50 %	0 %	410480872
15509	NC_018650	ACC	2	6	753775	753780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480872
15510	NC_018650	CGA	2	6	753824	753829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480872
15511	NC_018650	TCC	2	6	753932	753937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480872
15512	NC_018650	GAA	2	6	753947	753952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480872
15513	NC_018650	GGC	2	6	753977	753982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480872
15514	NC_018650	GCT	2	6	754083	754088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480872
15515	NC_018650	CA	3	6	754162	754167	50 %	0 %	0 %	50 %	410480872
15516	NC_018650	ATA	2	6	754292	754297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_018650	GCAG	2	8	754337	754344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15518	NC_018650	CAC	2	6	754386	754391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480873
15519	NC_018650	GCG	2	6	754471	754476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480873
15520	NC_018650	TGA	2	6	754482	754487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480873
15521	NC_018650	GGT	2	6	754527	754532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480873
15522	NC_018650	TGG	2	6	754562	754567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480873
15523	NC_018650	GCT	2	6	754593	754598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480873
15524	NC_018650	GCGG	2	8	754659	754666	0 %	0 %	75 %	25 %	410480873
15525	NC_018650	AAT	2	6	754696	754701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480873
15526	NC_018650	GAAA	2	8	754704	754711	75 %	0 %	25 %	0 %	410480873
15527	NC_018650	TAAT	2	8	754713	754720	50 %	50 %	0 %	0 %	410480873
15528	NC_018650	AGT	2	6	754764	754769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_018650	TAA	2	6	754789	754794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_018650	TGA	2	6	754808	754813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480874
15531	NC_018650	GCT	2	6	754827	754832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480874
15532	NC_018650	ATT	2	6	754903	754908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480874
15533	NC_018650	TTG	2	6	754918	754923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480874
15534	NC_018650	GTA	2	6	754987	754992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480874
15535	NC_018650	GGC	2	6	755003	755008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480874
15536	NC_018650	GCC	2	6	755039	755044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480874
15537	NC_018650	GCA	2	6	755049	755054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480874
15538	NC_018650	GAT	2	6	755103	755108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480874
15539	NC_018650	CGG	2	6	755111	755116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480874
15540	NC_018650	CACGA	2	10	755137	755146	40 %	0 %	20 %	40 %	410480874
15541	NC_018650	TTG	2	6	755200	755205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480874
15542	NC_018650	GCC	2	6	755212	755217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480874
15543	NC_018650	TGA	2	6	755256	755261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480874
15544	NC_018650	CCA	2	6	755339	755344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480874
15545	NC_018650	GCT	2	6	755380	755385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480874
15546	NC_018650	CTG	2	6	755401	755406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480874
15547	NC_018650	GAT	3	9	755415	755423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480874
15548	NC_018650	TGG	2	6	755516	755521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480874
15549	NC_018650	GGC	2	6	755601	755606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480874
15550	NC_018650	CGT	2	6	755616	755621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480874
15551	NC_018650	TTGA	2	8	755628	755635	25 %	50 %	25 %	0 %	410480874
15552	NC_018650	GGGGTG	2	12	755690	755701	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
15553	NC_018650	TCAG	2	8	755794	755801	25 %	25 %	25 %	25 %	410480875
15554	NC_018650	GTT	2	6	755814	755819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480875
15555	NC_018650	CGC	2	6	755836	755841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480875
15556	NC_018650	CCG	2	6	755845	755850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480875
15557	NC_018650	CTC	2	6	755860	755865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480875
15558	NC_018650	ACTG	2	8	755915	755922	25 %	25 %	25 %	25 %	410480875
15559	NC_018650	CAAC	2	8	755944	755951	50 %	0 %	0 %	50 %	410480875
15560	NC_018650	CCA	2	6	756129	756134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480875
15561	NC_018650	GTT	2	6	756183	756188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480875
15562	NC_018650	CCG	2	6	756204	756209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480875
15563	NC_018650	ATG	2	6	756220	756225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480875
15564	NC_018650	GGC	2	6	756242	756247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480875
15565	NC_018650	CGC	2	6	756313	756318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480875
15566	NC_018650	GAA	2	6	756451	756456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480875
15567	NC_018650	GTG	2	6	756473	756478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480875
15568	NC_018650	GCA	2	6	756605	756610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480875
15569	NC_018650	ATC	2	6	756772	756777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480875
15570	NC_018650	AACCGG	2	12	756822	756833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480875
15571	NC_018650	CTG	2	6	756910	756915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480875
15572	NC_018650	ACC	3	9	756953	756961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480875
15573	NC_018650	CAC	2	6	757008	757013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480875
15574	NC_018650	CAT	2	6	757035	757040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15575	NC_018650	TAA	3	9	757064	757072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15576	NC_018650	GAA	2	6	757084	757089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_018650	TTTGCG	2	12	757114	757125	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	410480876
15578	NC_018650	AGC	2	6	757157	757162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480876
15579	NC_018650	AAGCC	2	10	757163	757172	40 %	0 %	20 %	40 %	410480876
15580	NC_018650	CATA	2	8	757188	757195	50 %	25 %	0 %	25 %	410480876
15581	NC_018650	ATG	3	9	757205	757213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480876
15582	NC_018650	GGC	2	6	757243	757248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480876
15583	NC_018650	TCT	2	6	757298	757303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480876
15584	NC_018650	TGC	2	6	757343	757348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480876
15585	NC_018650	GTT	2	6	757464	757469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480876
15586	NC_018650	TAA	2	6	757540	757545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480876
15587	NC_018650	TCA	2	6	757625	757630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480876
15588	NC_018650	TTC	2	6	757645	757650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480876
15589	NC_018650	TAG	2	6	757751	757756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15590	NC_018650	A	6	6	757893	757898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15591	NC_018650	GCG	2	6	758037	758042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480877
15592	NC_018650	TAC	2	6	758075	758080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480877
15593	NC_018650	GGC	2	6	758183	758188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480877
15594	NC_018650	CCG	2	6	758283	758288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480877
15595	NC_018650	TGG	2	6	758346	758351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480877
15596	NC_018650	CTGGAA	2	12	758432	758443	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	410480877
15597	NC_018650	GCG	2	6	758451	758456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480877
15598	NC_018650	CG	4	8	758460	758467	0 %	0 %	50 %	50 %	410480877
15599	NC_018650	GCG	2	6	758531	758536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480877
15600	NC_018650	ATC	2	6	758544	758549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480877
15601	NC_018650	ACC	2	6	758585	758590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480877
15602	NC_018650	GCG	2	6	758636	758641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480877
15603	NC_018650	GAA	2	6	758675	758680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480877
15604	NC_018650	GCG	2	6	758702	758707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480877
15605	NC_018650	CACT	2	8	758788	758795	25 %	25 %	0 %	50 %	410480877
15606	NC_018650	CGG	2	6	758853	758858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480877
15607	NC_018650	TCTAC	2	10	758859	758868	20 %	40 %	0 %	40 %	410480877
15608	NC_018650	TGGT	2	8	758903	758910	0 %	50 %	50 %	0 %	410480877
15609	NC_018650	CTGAA	2	10	759009	759018	40 %	20 %	20 %	20 %	410480877
15610	NC_018650	CTG	3	9	759095	759103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480877
15611	NC_018650	GTC	2	6	759122	759127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480877
15612	NC_018650	CTGG	2	8	759136	759143	0 %	25 %	50 %	25 %	410480877
15613	NC_018650	ATTGAA	2	12	759188	759199	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	410480877
15614	NC_018650	CT	3	6	759291	759296	0 %	50 %	0 %	50 %	410480878
15615	NC_018650	CAG	2	6	759306	759311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480878
15616	NC_018650	GTT	2	6	759324	759329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480878
15617	NC_018650	TACT	2	8	759385	759392	25 %	50 %	0 %	25 %	410480878
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15619	NC_018650	CGA	2	6	759470	759475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480878
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15985	NC_018650	CGG	2	6	777004	777009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480892
15986	NC_018650	CTT	2	6	777013	777018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480892
15987	NC_018650	GTA	2	6	777050	777055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480892
15988	NC_018650	TTTG	2	8	777222	777229	0 %	75 %	25 %	0 %	410480893
15989	NC_018650	GTG	2	6	777266	777271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480893
15990	NC_018650	CTGG	2	8	777321	777328	0 %	25 %	50 %	25 %	410480893
15991	NC_018650	CGTCG	2	10	777349	777358	0 %	20 %	40 %	40 %	410480893
15992	NC_018650	GCTG	2	8	777379	777386	0 %	25 %	50 %	25 %	410480893
15993	NC_018650	GAG	2	6	777395	777400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480893
15994	NC_018650	GCT	2	6	777408	777413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480893
15995	NC_018650	CGC	3	9	777426	777434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480893
15996	NC_018650	CAT	2	6	777448	777453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480893
15997	NC_018650	TGCCA	2	10	777520	777529	20 %	20 %	20 %	40 %	410480893
15998	NC_018650	CTG	2	6	777544	777549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480893
15999	NC_018650	CTT	2	6	777618	777623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480893
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