MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli O104:H4 str. 2009EL-2050 chromosome

Total Repeats: 107796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_018650	AGA	2	6	634762	634767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480760
13003	NC_018650	CAA	2	6	634787	634792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480760
13004	NC_018650	GCT	2	6	634832	634837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480760
13005	NC_018650	CAA	2	6	634883	634888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480760
13006	NC_018650	CCG	2	6	634924	634929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480760
13007	NC_018650	GAA	3	9	634964	634972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480760
13008	NC_018650	CGT	2	6	634976	634981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480760
13009	NC_018650	GAA	3	9	634988	634996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480760
13010	NC_018650	GAA	2	6	635012	635017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480760
13011	NC_018650	CGT	2	6	635021	635026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480760
13012	NC_018650	GAA	2	6	635033	635038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480760
13013	NC_018650	ACT	2	6	635093	635098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480760
13014	NC_018650	GGC	2	6	635147	635152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480760
13015	NC_018650	AGC	2	6	635176	635181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480760
13016	NC_018650	GAA	2	6	635188	635193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480760
13017	NC_018650	AACA	2	8	635198	635205	75 %	0 %	0 %	25 %	410480760
13018	NC_018650	GAA	2	6	635228	635233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480760
13019	NC_018650	GCA	2	6	635240	635245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480760
13020	NC_018650	TTC	2	6	635278	635283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480760
13021	NC_018650	GCA	2	6	635287	635292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480760
13022	NC_018650	TCA	2	6	635397	635402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480760
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13024	NC_018650	CGT	2	6	635504	635509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480760
13025	NC_018650	TGC	2	6	635554	635559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480760
13026	NC_018650	CG	4	8	635568	635575	0 %	0 %	50 %	50 %	410480760
13027	NC_018650	CAT	2	6	635587	635592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480760
13028	NC_018650	CT	3	6	635617	635622	0 %	50 %	0 %	50 %	410480760
13029	NC_018650	GCGG	2	8	635663	635670	0 %	0 %	75 %	25 %	410480760
13030	NC_018650	CGC	2	6	635746	635751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480760
13031	NC_018650	GTG	2	6	635772	635777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480760
13032	NC_018650	GTT	2	6	635804	635809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480760
13033	NC_018650	CGA	2	6	635815	635820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480760
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13036	NC_018650	GAAC	2	8	635935	635942	50 %	0 %	25 %	25 %	410480760
13037	NC_018650	CTG	2	6	636032	636037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480760
13038	NC_018650	CTG	2	6	636047	636052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480760
13039	NC_018650	GCGGT	2	10	636099	636108	0 %	20 %	60 %	20 %	410480760
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13041	NC_018650	TG	3	6	636195	636200	0 %	50 %	50 %	0 %	410480760
13042	NC_018650	GTCC	2	8	636264	636271	0 %	25 %	25 %	50 %	410480760
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13049	NC_018650	ACGT	2	8	636642	636649	25 %	25 %	25 %	25 %	410480760
13050	NC_018650	TAC	2	6	636701	636706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480760
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13052	NC_018650	CAG	2	6	636776	636781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480760
13053	NC_018650	ACG	2	6	637008	637013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480760
13054	NC_018650	ATC	2	6	637046	637051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480760
13055	NC_018650	AATT	2	8	637187	637194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_018650	T	6	6	637217	637222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_018650	TAT	2	6	637235	637240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480761
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13064	NC_018650	GAA	2	6	637599	637604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480761
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13082	NC_018650	CGT	2	6	638240	638245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480762
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13084	NC_018650	CAG	2	6	638321	638326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480762
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13087	NC_018650	TCG	2	6	638554	638559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480762
13088	NC_018650	TGG	2	6	638562	638567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480762
13089	NC_018650	TA	3	6	638712	638717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_018650	CTG	2	6	638823	638828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480763
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13099	NC_018650	TTG	2	6	639083	639088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13100	NC_018650	ATGA	2	8	639091	639098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_018650	CG	3	6	639117	639122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13102	NC_018650	AGA	2	6	639186	639191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_018650	AAGA	2	8	639227	639234	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13104	NC_018650	TCGT	2	8	639262	639269	0 %	50 %	25 %	25 %	410480764
13105	NC_018650	AC	3	6	639287	639292	50 %	0 %	0 %	50 %	410480764
13106	NC_018650	ATG	2	6	639312	639317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480764
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13109	NC_018650	CTT	2	6	639413	639418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480764
13110	NC_018650	GCT	2	6	639453	639458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480764
13111	NC_018650	CTT	2	6	639476	639481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480764
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13114	NC_018650	CG	3	6	639521	639526	0 %	0 %	50 %	50 %	410480764
13115	NC_018650	TCG	2	6	639631	639636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480764
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13117	NC_018650	GCA	2	6	639654	639659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480764
13118	NC_018650	CTGTCT	2	12	639660	639671	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	410480764
13119	NC_018650	TGC	2	6	639698	639703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480764
13120	NC_018650	GTAC	2	8	639728	639735	25 %	25 %	25 %	25 %	410480764
13121	NC_018650	AG	3	6	639761	639766	50 %	0 %	50 %	0 %	410480764
13122	NC_018650	GTT	2	6	639780	639785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480764
13123	NC_018650	CTG	2	6	639831	639836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480764
13124	NC_018650	AGT	2	6	639860	639865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480764
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13130	NC_018650	TGC	2	6	639986	639991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480764
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13132	NC_018650	TCA	2	6	640063	640068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480764
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13155	NC_018650	AAG	2	6	641317	641322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480764
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13159	NC_018650	G	6	6	641411	641416	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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13176	NC_018650	GTT	3	9	642437	642445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13179	NC_018650	TAC	2	6	642551	642556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13225	NC_018650	GTC	3	9	644418	644426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480766
13226	NC_018650	GGT	2	6	644432	644437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480766
13227	NC_018650	ATC	2	6	644446	644451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480766
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13229	NC_018650	TA	3	6	644482	644487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13230	NC_018650	T	7	7	644513	644519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13231	NC_018650	AAC	2	6	644559	644564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13232	NC_018650	GA	3	6	644587	644592	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13233	NC_018650	ACC	3	9	644612	644620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480767
13234	NC_018650	GCT	2	6	644635	644640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480767
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13236	NC_018650	GTG	2	6	644648	644653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480767
13237	NC_018650	CGG	2	6	644659	644664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480767
13238	NC_018650	ATT	2	6	644669	644674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410480767
13239	NC_018650	GGC	2	6	644734	644739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480767
13240	NC_018650	TGC	2	6	644763	644768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480767
13241	NC_018650	TGA	2	6	644778	644783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480767
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13243	NC_018650	GGTTTT	2	12	644990	645001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480767
13244	NC_018650	CTG	2	6	645005	645010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480767
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13249	NC_018650	TGA	2	6	645240	645245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480767
13250	NC_018650	GTACG	2	10	645289	645298	20 %	20 %	40 %	20 %	410480767
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13253	NC_018650	CTG	2	6	645452	645457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480767
13254	NC_018650	GTTC	2	8	645486	645493	0 %	50 %	25 %	25 %	410480767
13255	NC_018650	GTTT	2	8	645510	645517	0 %	75 %	25 %	0 %	410480767
13256	NC_018650	TGT	2	6	645598	645603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480767
13257	NC_018650	GGT	2	6	645605	645610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480767
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13262	NC_018650	CTG	2	6	645869	645874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13263	NC_018650	AC	3	6	645957	645962	50 %	0 %	0 %	50 %	410480768
13264	NC_018650	CAA	2	6	645968	645973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480768
13265	NC_018650	CATC	2	8	645985	645992	25 %	25 %	0 %	50 %	410480768
13266	NC_018650	TGG	2	6	646020	646025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480768
13267	NC_018650	CTG	2	6	646136	646141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480768
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13290	NC_018650	GTT	2	6	647025	647030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13291	NC_018650	AAT	2	6	647052	647057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13292	NC_018650	AG	3	6	647079	647084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13293	NC_018650	TAAG	2	8	647105	647112	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13294	NC_018650	ATGCAG	2	12	647129	647140	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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13302	NC_018650	CAT	2	6	647655	647660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480769
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13307	NC_018650	CCAG	2	8	647900	647907	25 %	0 %	25 %	50 %	410480769
13308	NC_018650	TGC	2	6	647933	647938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480769
13309	NC_018650	GCT	2	6	647970	647975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480769
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13339	NC_018650	TTG	2	6	649191	649196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13340	NC_018650	GAT	2	6	649237	649242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13341	NC_018650	GAT	2	6	649401	649406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480771
13342	NC_018650	GGT	2	6	649481	649486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480771
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13351	NC_018650	GAAGC	2	10	649862	649871	40 %	0 %	40 %	20 %	410480772
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13353	NC_018650	AGGTC	2	10	649933	649942	20 %	20 %	40 %	20 %	410480772
13354	NC_018650	TGA	2	6	650020	650025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480772
13355	NC_018650	GTG	2	6	650105	650110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480772
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13357	NC_018650	TGC	2	6	650485	650490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480773
13358	NC_018650	GCG	2	6	650496	650501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480773
13359	NC_018650	GTG	2	6	650512	650517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480773
13360	NC_018650	CGG	2	6	650540	650545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480773
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13364	NC_018650	GT	3	6	650683	650688	0 %	50 %	50 %	0 %	410480774
13365	NC_018650	GCA	2	6	650689	650694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480774
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13370	NC_018650	TCG	2	6	650932	650937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480774
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13379	NC_018650	GTT	2	6	651580	651585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13421	NC_018650	GCT	2	6	653554	653559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480778
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13465	NC_018650	ACCA	2	8	655988	655995	50 %	0 %	0 %	50 %	410480781
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13469	NC_018650	GC	3	6	656092	656097	0 %	0 %	50 %	50 %	410480781
13470	NC_018650	TGG	2	6	656107	656112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410480781
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13474	NC_018650	GCC	2	6	656265	656270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	410480781
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13476	NC_018650	CAG	2	6	656357	656362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480781
13477	NC_018650	TTG	2	6	656370	656375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480781
13478	NC_018650	GCA	2	6	656419	656424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480781
13479	NC_018650	TCA	2	6	656479	656484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480781
13480	NC_018650	CCAG	2	8	656527	656534	25 %	0 %	25 %	50 %	410480781
13481	NC_018650	TCG	2	6	656550	656555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480781
13482	NC_018650	GGA	2	6	656594	656599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480781
13483	NC_018650	CTG	2	6	656627	656632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480781
13484	NC_018650	TTTC	2	8	656635	656642	0 %	75 %	0 %	25 %	410480781
13485	NC_018650	AGC	2	6	656649	656654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480781
13486	NC_018650	CG	3	6	656672	656677	0 %	0 %	50 %	50 %	410480781
13487	NC_018650	CTGG	2	8	656702	656709	0 %	25 %	50 %	25 %	410480781
13488	NC_018650	TGCC	2	8	656720	656727	0 %	25 %	25 %	50 %	410480781
13489	NC_018650	GC	3	6	656788	656793	0 %	0 %	50 %	50 %	410480781
13490	NC_018650	CAG	2	6	656831	656836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480781
13491	NC_018650	AAC	2	6	656886	656891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480781
13492	NC_018650	CTT	2	6	656914	656919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480781
13493	NC_018650	ATC	2	6	656963	656968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480781
13494	NC_018650	TGC	2	6	656976	656981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480781
13495	NC_018650	CTG	2	6	656984	656989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480781
13496	NC_018650	AAC	2	6	657089	657094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480781
13497	NC_018650	CG	3	6	657105	657110	0 %	0 %	50 %	50 %	410480781
13498	NC_018650	T	7	7	657159	657165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_018650	GAC	2	6	657197	657202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13500	NC_018650	ACA	2	6	657211	657216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410480782

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